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微孢子虫O-甘露糖糖基化通路相关酶基因序列的比较分析
被引量：
2
1
作者
耿莉娜
党晓群
+3 位作者
吴海晶
李田
潘国庆
周泽扬
《蚕业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第3期512-522,共11页
糖蛋白在免疫识别、信号转导等生命进程中扮演重要角色。为研究微孢子虫糖蛋白及其糖基化类型,采用比较基因组学方法对微孢子虫O-甘露糖糖基化通路进行分析。真核生物的O-甘露糖糖基化通路中有6种主要酶类,包括己糖激酶、磷酸甘露糖酶、...
糖蛋白在免疫识别、信号转导等生命进程中扮演重要角色。为研究微孢子虫糖蛋白及其糖基化类型,采用比较基因组学方法对微孢子虫O-甘露糖糖基化通路进行分析。真核生物的O-甘露糖糖基化通路中有6种主要酶类,包括己糖激酶、磷酸甘露糖酶、GDP甘露糖磷酸化酶、Dol-P甘露糖合成酶、甘露糖转移酶、Dol-P甘露糖蛋白甘露糖转移酶。通过生物信息学方法分析家蚕微孢子虫(Nosema bombycis)、蜜蜂微孢子虫(Nosema ceranae)、兔脑炎微孢子虫(Encephalitozoon cuniculi)、肠脑炎微孢子虫(Encephalitozoon intestinalis)、比氏肠道微孢子虫(Encephalitozoon bieneusi)和柞蚕微孢子虫(Nosema antheraea)的这6种酶基因编码氨基酸序列特征及结构域类型,发现这些酶的垂直同源基因比较保守,多重序列比对表明在6种微孢子虫之间,6种酶的氨基酸序列相似性比较高,系统进化分析显示同属的微孢子虫多聚为一簇。研究结果表明,N.bombycis、N.ceranae、E.cuniculi、E.intestinalis和N.antheraea 5种微孢子虫的O-甘露糖糖基化的蛋白质修饰通路是完整、保守的,然而在E.bieneusi中,其关键酶Dol-P甘露糖蛋白甘露糖转移酶的氨基酸序列比较短,只有342个氨基酸,缺失了关键结构域PMT,因此可能无法完成O-甘露糖糖基化修饰。以上微孢子虫的O-甘露糖糖基化通路中6种主要酶的序列信息,为后续解析家蚕微孢子虫糖基化通路及对糖蛋白糖基化类型与功能的研究提供了线索。
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关键词
微孢子虫
糖蛋白
o-甘露糖糖基化通路
酶种类
序列特征
结构域类型
比较基因组学
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职称材料
藻类Dol-P甘露糖转移酶的系统进化分析
2
作者
王珊珊
池姗
+3 位作者
张磊
刘涛
吕娜娜
唐学玺
《中国海洋大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第2期56-63,共8页
蛋白质O-甘露糖基化是一种广泛存在于生物体内的蛋白质翻译后修饰过程,即在Dol-P甘露糖转移酶(PMT)催化下将长萜酰甘露糖上的甘露糖连接到肽链上丝氨酸或者苏氨酸羟基的过程。本文对国际千种植物转录组计划(1KP)中22种海洋红藻及19种海...
蛋白质O-甘露糖基化是一种广泛存在于生物体内的蛋白质翻译后修饰过程,即在Dol-P甘露糖转移酶(PMT)催化下将长萜酰甘露糖上的甘露糖连接到肽链上丝氨酸或者苏氨酸羟基的过程。本文对国际千种植物转录组计划(1KP)中22种海洋红藻及19种海洋褐藻的转录组数据库进行搜索,获得了6条来自海萝(Gloiopeltis furcata)的PMT基因序列。通过对其序列特征的分析发现藻类PMT序列与真菌及动物具有相似的亲疏水性列谱,表明真核生物PMT间具有相似的跨膜区。藻类PMT的N端较为保守,但较其他真核生物PMT的loop5存在222个氨基酸的缺失,导致其loop5处缺少了3个MIR结构域使得loop5明显减小。此外,利用贝叶斯法构建系统进化树表明藻类的PMT基因来自于内共生过程的质体基因转移。
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关键词
藻类
o-
甘露
糖糖
基化
Dol-P
甘露
糖蛋白
甘露
糖转移酶
系统进化
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职称材料
题名
微孢子虫O-甘露糖糖基化通路相关酶基因序列的比较分析
被引量：
2
1
作者
耿莉娜
党晓群
吴海晶
李田
潘国庆
周泽扬
机构
西南大学
重庆师范大学动物生物学重点实验室
出处
《蚕业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第3期512-522,共11页
基金
国家自然科学基金重点项目(No.30930067)
国家重点基础研究发展计划"973"项目(No.2012CB114604)
文摘
糖蛋白在免疫识别、信号转导等生命进程中扮演重要角色。为研究微孢子虫糖蛋白及其糖基化类型,采用比较基因组学方法对微孢子虫O-甘露糖糖基化通路进行分析。真核生物的O-甘露糖糖基化通路中有6种主要酶类,包括己糖激酶、磷酸甘露糖酶、GDP甘露糖磷酸化酶、Dol-P甘露糖合成酶、甘露糖转移酶、Dol-P甘露糖蛋白甘露糖转移酶。通过生物信息学方法分析家蚕微孢子虫(Nosema bombycis)、蜜蜂微孢子虫(Nosema ceranae)、兔脑炎微孢子虫(Encephalitozoon cuniculi)、肠脑炎微孢子虫(Encephalitozoon intestinalis)、比氏肠道微孢子虫(Encephalitozoon bieneusi)和柞蚕微孢子虫(Nosema antheraea)的这6种酶基因编码氨基酸序列特征及结构域类型,发现这些酶的垂直同源基因比较保守,多重序列比对表明在6种微孢子虫之间,6种酶的氨基酸序列相似性比较高,系统进化分析显示同属的微孢子虫多聚为一簇。研究结果表明,N.bombycis、N.ceranae、E.cuniculi、E.intestinalis和N.antheraea 5种微孢子虫的O-甘露糖糖基化的蛋白质修饰通路是完整、保守的,然而在E.bieneusi中,其关键酶Dol-P甘露糖蛋白甘露糖转移酶的氨基酸序列比较短,只有342个氨基酸,缺失了关键结构域PMT,因此可能无法完成O-甘露糖糖基化修饰。以上微孢子虫的O-甘露糖糖基化通路中6种主要酶的序列信息,为后续解析家蚕微孢子虫糖基化通路及对糖蛋白糖基化类型与功能的研究提供了线索。
关键词
微孢子虫
糖蛋白
o-甘露糖糖基化通路
酶种类
序列特征
结构域类型
比较基因组学
Keywords
Microsporidian Glycoprotein
o-
mannosylation pathway Enzyme type Sequence feature
Domain type
Comparative genomics
分类号
S884.21 [农业科学—特种经济动物饲养]
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
藻类Dol-P甘露糖转移酶的系统进化分析
2
作者
王珊珊
池姗
张磊
刘涛
吕娜娜
唐学玺
机构
中国海洋大学海洋生命学院
青岛海大蓝科生物科技有限公司
出处
《中国海洋大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第2期56-63,共8页
基金
广东省省级科技计划项目(2013B021100008)
青岛市应用基础研究计划项目(14-2-4-102-jch)
青岛创业创新领军人才计划项目资助~~
文摘
蛋白质O-甘露糖基化是一种广泛存在于生物体内的蛋白质翻译后修饰过程,即在Dol-P甘露糖转移酶(PMT)催化下将长萜酰甘露糖上的甘露糖连接到肽链上丝氨酸或者苏氨酸羟基的过程。本文对国际千种植物转录组计划(1KP)中22种海洋红藻及19种海洋褐藻的转录组数据库进行搜索,获得了6条来自海萝(Gloiopeltis furcata)的PMT基因序列。通过对其序列特征的分析发现藻类PMT序列与真菌及动物具有相似的亲疏水性列谱,表明真核生物PMT间具有相似的跨膜区。藻类PMT的N端较为保守,但较其他真核生物PMT的loop5存在222个氨基酸的缺失,导致其loop5处缺少了3个MIR结构域使得loop5明显减小。此外,利用贝叶斯法构建系统进化树表明藻类的PMT基因来自于内共生过程的质体基因转移。
关键词
藻类
o-
甘露
糖糖
基化
Dol-P
甘露
糖蛋白
甘露
糖转移酶
系统进化
Keywords
algae
o-
mannosylation
dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase
phylogenetic analyses
分类号
Q178.53 [生物学—水生生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
微孢子虫O-甘露糖糖基化通路相关酶基因序列的比较分析
耿莉娜
党晓群
吴海晶
李田
潘国庆
周泽扬
《蚕业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2012
2
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
藻类Dol-P甘露糖转移酶的系统进化分析
王珊珊
池姗
张磊
刘涛
吕娜娜
唐学玺
《中国海洋大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2018
0
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