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大肠杆菌O85 O-抗原基因簇序列破译和特异分子标识的筛选
1
作者
王威
刘斌
+3 位作者
刘雪倩
冯露
孙丹
王磊
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第1期39-44,共6页
目的测定大测肝菌O85的O-抗原基因簇的序列,对其基因进行功能和进化的分析,筛选并鉴定可用于快速分子分型的特异分子标识。方法利用鸟枪法对大肠杆菌O85的O-抗原基因簇进行测序,生物信息学方法进行序列拼接与分析,确定针对大肠杆菌O85...
目的测定大测肝菌O85的O-抗原基因簇的序列,对其基因进行功能和进化的分析,筛选并鉴定可用于快速分子分型的特异分子标识。方法利用鸟枪法对大肠杆菌O85的O-抗原基因簇进行测序,生物信息学方法进行序列拼接与分析,确定针对大肠杆菌O85的特异基因并设计引物,PCR方法进行模拟环境样品的检测。结果大肠杆菌O85的O-抗原基因簇序列全长为11 203 bp。发现8个开放阅读框架(orf)并确定功能,分别为:UDP-N-乙酰葡萄糖-2-异构酶基因(orf1),吡喃型UDP-半乳糖变位酶基因(glf),糖基转移酶基因(orf3、orf5、orf6和orf8),O-抗原转运酶基因(wzx)和O-抗原聚合酶基因(wzy)。鉴定出针对大肠杆菌O85的特异基因2个和引物4对。结论本文筛选的特异分子标识和PCR检测方法可用于对环境样品中的大肠杆菌O85进行快速、灵敏的检测。
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关键词
大肠杆菌O85
o-抗原基因簇
分子分型
分子标识
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职称材料
大肠杆菌O116 O-抗原基因簇的破译及PCR检测方法的建立
被引量：
1
2
作者
韩巍青
王威
王磊
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第7期667-671,共5页
目的测定大肠肝菌O116的O-抗原基因簇序列,鉴定其中的特异基因,建立PCR检测方法,替代传统的血清学检测。方法用长距离PCR方法扩增O116的O-抗原基因簇,PCR产物用鸟枪法建立测序文库进行测序,通过与GenBank中功能已知的蛋白的序列比较,进...
目的测定大肠肝菌O116的O-抗原基因簇序列,鉴定其中的特异基因,建立PCR检测方法,替代传统的血清学检测。方法用长距离PCR方法扩增O116的O-抗原基因簇,PCR产物用鸟枪法建立测序文库进行测序,通过与GenBank中功能已知的蛋白的序列比较,进行基因功能的分析。用PCR方法证明基因簇中寡糖单位处理酶基因的特异性,以寡糖单位处理酶基因为靶基因建立PCR检测方法,并进行灵敏度测试。结果和结论基因簇全长为14323bp,共有11个基因,其中寡糖单位处理酶基因wzx和wzy具有高度特异性。所建立的PCR方法可检测2pg的基因组DNA、0.4CFU/g(猪肉样品)或4×102CFU/g(粪便样品)。可以代替传统的血清学检测。
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关键词
大肠肝菌O116
o-抗原基因簇
特异
基因
PCR检测
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职称材料
大肠杆菌O110 O-抗原基因簇序列的破译及特异基因鉴定
3
作者
夏秋雨
王威
+4 位作者
王岩
李雅玥
郭宏杰
王磊
耿运琪
《中国人兽共患病杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2005年第2期125-128,118,共5页
目的定大肠杆菌O110标准株的O-抗原基因簇序列,对其基因结构进行遗传学分析,鉴定可用于快速分型的特异DNA序列。方法用长距离PCR扩增O-抗原基因簇序列,建立鸟枪法文库进行随机测序,用生物信息学的方法进行序列拼接与分析,根据测定的序...
目的定大肠杆菌O110标准株的O-抗原基因簇序列,对其基因结构进行遗传学分析,鉴定可用于快速分型的特异DNA序列。方法用长距离PCR扩增O-抗原基因簇序列,建立鸟枪法文库进行随机测序,用生物信息学的方法进行序列拼接与分析,根据测定的序列设计引物,用PCR的方法确定针对大肠杆菌O110的特异基因。结果与结论确定了大肠杆菌O110标准株的O-抗原基因簇序列以及该基因簇中7个开放阅读框架(openreadingframe,orf)的功能,分别为糖基转移酶基因(orf1,orf2,orf7),小分子修饰酶基因(orf3,orf5),O-抗原转运酶基因(wzx)和O-抗原聚合酶基因(wzy)。鉴定出了可以用于PCR方法对大肠杆菌O110快速检测的特异基因。
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关键词
大肠杆菌
o-抗原基因簇
特异
基因
分子分型
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职称材料
题名
大肠杆菌O85 O-抗原基因簇序列破译和特异分子标识的筛选
1
作者
王威
刘斌
刘雪倩
冯露
孙丹
王磊
机构
南开大学泰达生物技术学院
南开大学生命科学学院
出处
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第1期39-44,共6页
基金
国家"863计划"(2002AA2Z2051)资助项目
文摘
目的测定大测肝菌O85的O-抗原基因簇的序列,对其基因进行功能和进化的分析,筛选并鉴定可用于快速分子分型的特异分子标识。方法利用鸟枪法对大肠杆菌O85的O-抗原基因簇进行测序,生物信息学方法进行序列拼接与分析,确定针对大肠杆菌O85的特异基因并设计引物,PCR方法进行模拟环境样品的检测。结果大肠杆菌O85的O-抗原基因簇序列全长为11 203 bp。发现8个开放阅读框架(orf)并确定功能,分别为:UDP-N-乙酰葡萄糖-2-异构酶基因(orf1),吡喃型UDP-半乳糖变位酶基因(glf),糖基转移酶基因(orf3、orf5、orf6和orf8),O-抗原转运酶基因(wzx)和O-抗原聚合酶基因(wzy)。鉴定出针对大肠杆菌O85的特异基因2个和引物4对。结论本文筛选的特异分子标识和PCR检测方法可用于对环境样品中的大肠杆菌O85进行快速、灵敏的检测。
关键词
大肠杆菌O85
o-抗原基因簇
分子分型
分子标识
Keywords
E. coli O85
o-
antigen gene cluster
genotyping
molecular marker
分类号
R382.5 [医药卫生—医学寄生虫学]
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职称材料
题名
大肠杆菌O116 O-抗原基因簇的破译及PCR检测方法的建立
被引量：
1
2
作者
韩巍青
王威
王磊
机构
南开大学泰达生物技术学院
出处
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第7期667-671,共5页
基金
国家"863计划"(2002AA2Z2051)
国家杰出青年科学基金资助项目(30125001)
文摘
目的测定大肠肝菌O116的O-抗原基因簇序列,鉴定其中的特异基因,建立PCR检测方法,替代传统的血清学检测。方法用长距离PCR方法扩增O116的O-抗原基因簇,PCR产物用鸟枪法建立测序文库进行测序,通过与GenBank中功能已知的蛋白的序列比较,进行基因功能的分析。用PCR方法证明基因簇中寡糖单位处理酶基因的特异性,以寡糖单位处理酶基因为靶基因建立PCR检测方法,并进行灵敏度测试。结果和结论基因簇全长为14323bp,共有11个基因,其中寡糖单位处理酶基因wzx和wzy具有高度特异性。所建立的PCR方法可检测2pg的基因组DNA、0.4CFU/g(猪肉样品)或4×102CFU/g(粪便样品)。可以代替传统的血清学检测。
关键词
大肠肝菌O116
o-抗原基因簇
特异
基因
PCR检测
Keywords
E. coli O116
o-
antigen gene cluster
specific gene
PCR assay
分类号
R378.2 [医药卫生—病原生物学]
在线阅读
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职称材料
题名
大肠杆菌O110 O-抗原基因簇序列的破译及特异基因鉴定
3
作者
夏秋雨
王威
王岩
李雅玥
郭宏杰
王磊
耿运琪
机构
南开大学生命科学学院
南开大学泰达生物技术学院
天津市第四医院
出处
《中国人兽共患病杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2005年第2期125-128,118,共5页
基金
国家"863计划"(2002AA2Z2051)
文摘
目的定大肠杆菌O110标准株的O-抗原基因簇序列,对其基因结构进行遗传学分析,鉴定可用于快速分型的特异DNA序列。方法用长距离PCR扩增O-抗原基因簇序列,建立鸟枪法文库进行随机测序,用生物信息学的方法进行序列拼接与分析,根据测定的序列设计引物,用PCR的方法确定针对大肠杆菌O110的特异基因。结果与结论确定了大肠杆菌O110标准株的O-抗原基因簇序列以及该基因簇中7个开放阅读框架(openreadingframe,orf)的功能,分别为糖基转移酶基因(orf1,orf2,orf7),小分子修饰酶基因(orf3,orf5),O-抗原转运酶基因(wzx)和O-抗原聚合酶基因(wzy)。鉴定出了可以用于PCR方法对大肠杆菌O110快速检测的特异基因。
关键词
大肠杆菌
o-抗原基因簇
特异
基因
分子分型
Keywords
Escherichia coli O110,
o-
antigen gene cluster, specific gene
分类号
R378.2 [医药卫生—病原生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
大肠杆菌O85 O-抗原基因簇序列破译和特异分子标识的筛选
王威
刘斌
刘雪倩
冯露
孙丹
王磊
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
大肠杆菌O116 O-抗原基因簇的破译及PCR检测方法的建立
韩巍青
王威
王磊
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
大肠杆菌O110 O-抗原基因簇序列的破译及特异基因鉴定
夏秋雨
王威
王岩
李雅玥
郭宏杰
王磊
耿运琪
《中国人兽共患病杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2005
0
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职称材料
已选择
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