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O^6-甲基鸟嘌呤-DNA-甲基转移酶基因表达与胃癌发生的关系 被引量:4
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作者 曾桃英 孙幼芳 +3 位作者 段家华 周祖良 王君 刘俐敏 《华中科技大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2006年第1期84-86,共3页
目的研究人胃癌组织O6-甲基鸟嘌呤-DNA-甲基转移酶(MGMT)基因的表达特点及其与胃癌发生的关系。方法应用加强型原位杂交方法及寡核苷酸探针高效标记技术对76例胃癌组织、73例癌旁组织、20例正常胃组织进行MGMT基因标记检测,同时应用自... 目的研究人胃癌组织O6-甲基鸟嘌呤-DNA-甲基转移酶(MGMT)基因的表达特点及其与胃癌发生的关系。方法应用加强型原位杂交方法及寡核苷酸探针高效标记技术对76例胃癌组织、73例癌旁组织、20例正常胃组织进行MGMT基因标记检测,同时应用自动图像分析系统进行定量分析。结果胃癌组织MGMT基因阳性表达率为40.8%(31/76),低于正常胃组织的60.0%(12/20),MGMT表达强阳性率为32.3%(10/31),也明显低于正常组织的83.3%(10/12),差异均有显著性意义(P<0.01或P<0.05);癌旁组织MGMT基因阳性表达率为46.6%(34/73),MG-MT表达强阳性率为41.1%(14/34),与胃癌组织差异无显著性意义。定量分析示,胃癌组织MGMT阳性表达的积分吸光度、阳性单位值明显低于正常组织(P<0.05)。胃癌组织与癌旁组织、早期胃癌与进展期胃癌组织、癌旁不同程度不典型增生之间MGMT表达无明显差异。结论人体胃组织存在高度表达的MGMT基因,胃癌发生与MGMT基因表达水平降低有关,MGMT基因异常表达是胃癌形态学改变出现之前的早期行为。 展开更多
关键词 O^6-甲基鸟嘌呤-dna-甲基转移 基因表达 胃癌
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不同级别胶质瘤中P53蛋白与O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶表达的区别与联系 被引量:1
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作者 李响 韩圣 +1 位作者 秦晓飞 吴安华 《中国医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第6期499-501,522,共4页
目的探讨不同级别胶质瘤中P53蛋白与O6.甲基鸟嘌呤.DNA甲基转移酶(MGMT)表达的关系。方法2013年1月至2013年12月在我院进行神经外科手术切除的98例脑胶质瘤组织作为研究对象,采用免疫组织化学的方法分析不同级别胶质瘤组织中P53蛋白与M... 目的探讨不同级别胶质瘤中P53蛋白与O6.甲基鸟嘌呤.DNA甲基转移酶(MGMT)表达的关系。方法2013年1月至2013年12月在我院进行神经外科手术切除的98例脑胶质瘤组织作为研究对象,采用免疫组织化学的方法分析不同级别胶质瘤组织中P53蛋白与MGMT表达的关系。结果在不同级别胶质瘤组织间,MGMT阳性表达无统计学差异(P=0.462),但表达强度差异明显(P=0.019)。MGMT表达强度与肿瘤分级呈负相关(r=-0.629,P<0.05)。MGMT与P53在阳性表达强度上呈负相关(r=-0.750,P<0.05)。结论P53蛋白与MGMT在不同级别的胶质瘤中的表达有一定的关系,而且P53表达增强和MGMT表达减弱均会对胶质瘤的发生及其恶性程度产生影响。 展开更多
关键词 胶质瘤 P53蛋白 O6-甲基鸟嘌呤-dna甲基转移
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O-6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶在顺铂激活的胃癌细胞自噬中的作用 被引量:4
3
作者 雷媛媛 张建伟 +3 位作者 唐波 汪苏敏 吴玉云 杨仕明 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第4期290-295,共6页
目的探讨DNA修复酶O-6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶(O-6-methylguanine-DNA methyltransferase,MGMT)在顺铂(cisplatin)激活的胃癌SGC-7901细胞自噬中的作用。方法 Western blot法检测自噬底物蛋白p62水平、自噬标志分子Ⅱ型和Ⅰ型微管相... 目的探讨DNA修复酶O-6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶(O-6-methylguanine-DNA methyltransferase,MGMT)在顺铂(cisplatin)激活的胃癌SGC-7901细胞自噬中的作用。方法 Western blot法检测自噬底物蛋白p62水平、自噬标志分子Ⅱ型和Ⅰ型微管相关蛋白轻链3(mircotuble-associated protein light chain 3,LC3)的比值变化、MGMT蛋白水平;GFP-LC3表达质粒转染胃癌SGC-7901细胞后用激光共聚焦显微镜观察顺铂对细胞自噬小体形成的影响。qRT-PCR法检测MGMT基因mRNA表达水平。结果顺铂剂量依赖性激活胃癌SGC-7901细胞自噬水平,显著增加SGC-7901细胞中自噬小体数量;MGMT mRNA及蛋白水平随顺铂浓度的增加而降低(P<0.05);过表达MGMT抑制胃癌SGC-7901细胞的基础自噬水平;过表达MGMT抑制顺铂激活的胃癌SGC-7901细胞自噬。结论 DNA修复酶O-6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶抑制顺铂激活的胃癌SGC-7901细胞自噬。 展开更多
关键词 顺铂 自噬 DNA修复O-6-甲基鸟嘌呤-dna甲基转移 胃癌
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一体化^(18)F-FET PET/MR术前评估成人胶质瘤患者MGMT基因启动子甲基化状态
4
作者 韩青青 李拓 +7 位作者 林增萍 李恩慧 杨阳 刘家惠 邢浩 王裕 程欣 霍力 《磁共振成像》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期21-26,共6页
目的 旨在研究一体化^(18)F-氟乙基酪氨酸(^(18)F-fluoroethyltyrosine, ^(18)F-FET)正电子发射断层成像(positron emission tomography, PET)/MR对成人胶质瘤的O6-甲基鸟嘌呤DNA甲基转移酶(O6-methylguanine DNA methyltransferase, MG... 目的 旨在研究一体化^(18)F-氟乙基酪氨酸(^(18)F-fluoroethyltyrosine, ^(18)F-FET)正电子发射断层成像(positron emission tomography, PET)/MR对成人胶质瘤的O6-甲基鸟嘌呤DNA甲基转移酶(O6-methylguanine DNA methyltransferase, MGMT)基因启动子甲基化状态的鉴别能力。材料与方法 回顾性分析未经活检或治疗的胶质瘤患者资料16例,均完成一体化PET/MR扫描,包括^(18)F-FET PET、常规MRI及体素内不相干运动(intravoxel incoherent motion, IVIM)成像。以靶本比(target-background ratio, TBR)=1.6为阈值对PET图像进行感兴趣体积(volume of interest, VOI)分割,通过刚性配准获得肿瘤VOI对应的IVIM图及其参数表观扩散系数(apparent diffusion coefficient, ADC)、真实扩散系数(true diffusion coefficient, D)、伪扩散系数(pseudo diffusion coefficient, D^(*))、灌注分数(perfusion fraction, f)、分布扩散系数(distributed diffusion coefficient, DDC)和异质性指数(heterogeneity index, α),使用pyradiomics对各参数进行特征提取,获得对应的一阶灰度直方图特征。计算每个IVIM参数图对应的特征值与^(18)F-FET PET参数的关系,并利用组间比较和受试者工作特征(receive operating characteristic, ROC)曲线分析探究PET和IVIM参数对MGMT启动子甲基化的区分能力。结果 IVIM-α的两个特征值90分位值(r=0.526,P<0.05)和最大值(r=0.520, P<0.05)与PET参数平均标准摄取值(meanstandarduptakevalue,SUVmean)呈正相关;IVIM-α和SUVmean在MGMT启动子甲基化状态阳性和阴性两组之间的差异有统计学意义(P<0.05),阳性组的IVIM-α均值和SUVmean显著高于阴性组;融合IVIM-α均值和SUVmean对MGMT启动子甲基化状态进行区分的曲线下面积(area under the curve, AUC)为0.77。结论 基于一体化PET/MR的^(18)F-FET PET和IVIM参数能够有效预测胶质瘤的MGMT启动子甲基化状态。 展开更多
关键词 胶质瘤 O6-甲基鸟嘌呤-dna甲基转移启动子甲基 ^(18)F-氟乙基酪氨酸正电子发射断层成像 正电子发射断层成像/磁共振 体素内不相干运动 磁共振成像
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HIF-1、MGMT、CD133在人胶质母细胞瘤中表达的相关性研究 被引量:2
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作者 邢鹏辉 吕中强 +5 位作者 张学新 刘海英 佟静 刘英姿 张磊 袁江伟 《中国神经精神疾病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第9期523-527,共5页
目的研究HIF-1、MGMT、CD133在人低级别胶质瘤及胶质母细胞瘤细胞中的表达差异及三者在胶质瘤母细胞瘤中表达的相关性。方法收集自2010年12月至2012年12月手术切除病理证实的胶质母细胞瘤(WHOⅣ级)33例作为实验组,同期收集低级别胶质瘤2... 目的研究HIF-1、MGMT、CD133在人低级别胶质瘤及胶质母细胞瘤细胞中的表达差异及三者在胶质瘤母细胞瘤中表达的相关性。方法收集自2010年12月至2012年12月手术切除病理证实的胶质母细胞瘤(WHOⅣ级)33例作为实验组,同期收集低级别胶质瘤25例(WHOI-II级)作为对照组,收集脑深部肿瘤皮层造瘘正常脑组织5例作为阴性对照组。检测不同组别组织中HIF-1、MGMT、CD133的表达,应用SPSS 13.0进行分析。相关统计分析采用Spearman等级相关分析。结果在正常脑组织中HIF-1、MGMT、CD133不表达,在低级别胶质瘤组和胶质母细胞瘤组中其阳性表达率差异具有统计学意义(P<0.05)。通过RT-PCR法分别测定HIF-1、MGMT、CD133在正常脑组织、低级别胶质瘤及胶质母细胞瘤中mRNA的相对定量表达,进行相关性分析,三者均存在正相关(HIF-1与MGMT r=0.91,P<0.05;HIF-1与CD133 r=0.85,P<0.05;MGMT与CD133 r=0.80,P<0.05)。结论 HIF-1、MGMT、CD133阳性表达率随肿瘤级别增高呈显著升高,在胶质母细胞瘤中其表达呈正相关,提示三者在胶质母细胞瘤的发生、发展过程中存在协同作用,为胶质母细胞瘤的治疗提供新的方向。 展开更多
关键词 胶质母细胞瘤低氧诱导因子1 O^6-甲基鸟嘌呤-dna甲基转移cd133 相关性
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5-氮杂-2′-脱氧胞苷对肺癌SPC-A1细胞增殖及SFRP1、MGMT甲基化蛋白表达的影响 被引量:1
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作者 华丛书 叶静 +2 位作者 陈海 葛腾飞 陈晓宇 《中国药理学通报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第3期367-371,共5页
目的观察甲基化抑制剂5-氮杂-2′-脱氧胞苷(5-aza-2′-deoxycytidine,5-Aza-CdR)对肺癌SPC-A1细胞增殖、细胞划痕和凋亡的影响,探讨抑癌基因分泌型卷曲相关蛋白1(secreted frizzled related protein 1,SFRP1)和O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转... 目的观察甲基化抑制剂5-氮杂-2′-脱氧胞苷(5-aza-2′-deoxycytidine,5-Aza-CdR)对肺癌SPC-A1细胞增殖、细胞划痕和凋亡的影响,探讨抑癌基因分泌型卷曲相关蛋白1(secreted frizzled related protein 1,SFRP1)和O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶(O6-methylguanine-DNA-methyltransferase,MGMT)基因启动子区DNA甲基化mRNA和蛋白在其中的表达和意义。方法CCK-8法检测不同浓度的5-Aza-CdR对人肺癌SPC-A1细胞增殖影响,划痕实验测定5-Aza-CdR对SPC-A1细胞迁移能力的影响,Hoechst 33258染色检测(0、3、10、30μmol·L^(-1))5-Aza-CdR处理肺癌SPC-A1细胞24h后细胞凋亡情况,RT-PCR、Western blot法检测SPC-A1细胞中SFRP1和MGMT的mRNA、蛋白表达。结果5-Aza-CdR可以浓度梯度的抑制肺癌SPC-A1细胞增殖,IC 50为21.2μmol·L^(-1);5-Aza-CdR(3、10、30μmol·L^(-1))作用48 h后,肺癌SPC-A1细胞划痕愈合分别为对照组的(92.4±2.6)%、(83.6±4.2)%、(76.7±4.5)%;5-Aza-CdR处理肺癌SPC-A1细胞后,出现典型的细胞凋亡形态学改变;不同浓度5-Aza-CdR(3、10、30μmol·L^(-1))处理SPC-A1细胞24 h后,SFRP1、MGMT mRNA和蛋白表达增加(P<0.05)。结论5-Aza-CdR可抑制肺癌SPC-A1细胞增殖,抑制肺癌细胞划痕修复和促进凋亡,可能与升高MGMT和SFRPl的甲基化表达有关。 展开更多
关键词 肺癌SPC-A1细胞 5-氮杂-2′-脱氧胞苷 O6-甲基鸟嘌呤-dna甲基转移 分泌型卷曲相关蛋白1 细胞增殖 细胞凋亡
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Sy-MRI联合DWI在预测胶质瘤MGMT甲基化中的应用 被引量:1
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作者 马文富 葛鑫 +5 位作者 党佩 黄雪莹 吕瑞瑞 郑佳瑞 张伟 王晓东 《磁共振成像》 CAS CSCD 北大核心 2023年第7期18-24,48,共8页
目的探讨集成MRI(synthetic MRI,Sy-MRI)联合扩散加权成像(diffusion weighted imaging,DWI)在预测胶质瘤O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶(O^(6)-methylguanine-DNA methyltransferase,MGMT)启动子甲基化状态中的应用价值。材料与方法前瞻... 目的探讨集成MRI(synthetic MRI,Sy-MRI)联合扩散加权成像(diffusion weighted imaging,DWI)在预测胶质瘤O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶(O^(6)-methylguanine-DNA methyltransferase,MGMT)启动子甲基化状态中的应用价值。材料与方法前瞻性纳入2020年10月至2021年12月在宁夏医科大学总医院行肿瘤切除术并具有完整病理结果及免疫组化的胶质瘤患者47例,所有患者术前均在GE Architect 3.0 T超导型磁共振扫描仪接受Sy-MRI及DWI序列扫描,根据术后MGMT启动子甲基化的病理结果分为甲基化组和非甲基化组。对增强前后的Sy-MRI各参数图(pre-T1、post-T1、pre-T2、post-T2、pre-PD及post-PD)与基于DWI的表观扩散系数(apparent diffusion coefficient,ADC)图进行配准,随后测量胶质瘤实质部分在上述参数图的信号。采用独立样本t检验或Mann-Whitney U检验对比MGMT启动子甲基化组和非甲基化组各参数的差异,对差异有统计学意义的参数采用多因素logistic回归分析。采用受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线评估各参数独立及其联合诊断MGMT启动子甲基化的效能,并采用DeLong检验对比ROC曲线下面积(area under the curve,AUC)的差异。结果MGMT启动子甲基化组post-T1、pre-T2、post-T2、post-PD值低于非甲基化组,差异有统计学意义(P<0.05),pre-T1、pre-PD值两组间差异无统计学意义(P>0.05),甲基化组ADC值低于非甲基化组,差异有统计学意义(P<0.05)。多因素logistic回归分析显示,pre-T2[OR=1.031,95%置信区间(confidence interval,CI):1.002~1.062,P=0.038]、post-T1(OR=1.003,95%CI:1.001~1.007,P=0.015)、ADC(OR=1.041,95%CI:1.008~1.072,P=0.047)是预测胶质瘤MGMT甲基化的独立影响因素。ROC曲线分析结果显示,pre-T2、post-T1及ADC值独立诊断MGMT启动子甲基化的AUC值分别为0.722、0.808及0.685,上述三参数联合模型诊断MGMT启动子甲基化的AUC为0.815。DeLong检验结果显示联合参数模型的诊断效能高于ADC值,差异有统计学意义(P=0.03),pre-T2、post-T1与联合参数模型的AUC值差异无统计学意义(P>0.05)。结论Sy-MRI技术能够良好地诊断胶质瘤MGMT启动子甲基化,诊断效能显著高于DWI。当Sy-MRI参数联合DWI的ADC值时诊断效能更高。 展开更多
关键词 胶质瘤 磁共振成像 集成磁共振成像 扩散加权成像 O^(6)-甲基鸟嘌呤-dna甲基转移 甲基 预测 诊断
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基于多模态MRI影像组学模型预测MGMT甲基化阳性高级别胶质瘤1p/19q缺失状态
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作者 赵伟 黄海燕 +3 位作者 丁爽 罕迦尔别克·库锟 徐蕊 王云玲 《放射学实践》 CSCD 北大核心 2024年第12期1545-1550,共6页
目的:基于多模态MRI构建影像组学模型,无创性预测MGMT甲基化阳性高级别胶质瘤的1p/19q缺失状态。方法:回顾性分析2021年9月-2023年9月在本院经手术病理证实的106例高级别胶质瘤患者的完整临床和影像资料。所有肿瘤为MGMT甲基化阳性,其... 目的:基于多模态MRI构建影像组学模型,无创性预测MGMT甲基化阳性高级别胶质瘤的1p/19q缺失状态。方法:回顾性分析2021年9月-2023年9月在本院经手术病理证实的106例高级别胶质瘤患者的完整临床和影像资料。所有肿瘤为MGMT甲基化阳性,其中合并1p19q共缺失者33例,非1p19q共缺失者73例。将所有患者按照7∶3的比例随机分为训练集和测试集。分别在T_(1)WI、T_(2)WI、T_(2)-FLAIR和CE-T_(1)WI四个序列的图像上,沿着肿瘤边缘逐层勾画ROI并生成容积感兴趣区(VOI)后提取影像组学特征。应用主成分分析(PCA)方法进行特征降维,并应用方差分析方法进行特征筛选,随后分别采用自编码器(AE)、逻辑回归(LR)、随机森林(RF)和支持向量机(SVM)四种机器学习算法构建预测MGMT甲基化阳性合并1p/19q共缺失状态的影像组学模型。采用受试者工作特征曲线评估各模型的诊断效能。结果:AE影像组学模型在预测高级别胶质瘤MGMT甲基化阳性合并1p/19q缺失状态表现出较高的AUC,其在训练集和测试集中的AUC分别为0.924和0.864;而LR、RF和SVM影像组学模型在训练集中的AUC分别为0.950、1.000和0.951,在测试集中的AUC分别为0.777、0.773和0.786。结论:基于多模态MRI影像组学模型可以有效预测MGMT甲基化阳性高级别胶质瘤的1p/19q缺失状态。 展开更多
关键词 脑胶质瘤 影像组学 磁共振成像 O6-甲基鸟嘌呤-dna甲基转移 1p/19q
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凋亡外囊泡传递LncRNA-XIST在胶质瘤细胞耐药性作用机制研究
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作者 薛箕山 赵媛媛 +3 位作者 邱浩 阿衣希塔·奴尔江 刘正 杜鹏 《重庆医科大学学报》 北大核心 2025年第7期931-939,共9页
目的:探讨胶质瘤细胞来源的凋亡外囊泡(apoptotic cell-derived extracellular vesicles,apoEVs)对胶质瘤肿瘤发生和替莫唑胺(temozolomide,TMZ)耐药性的影响及作用机制。方法:经提取的apoEVs经纳米颗粒跟踪分析和透射电子显微镜表征,... 目的:探讨胶质瘤细胞来源的凋亡外囊泡(apoptotic cell-derived extracellular vesicles,apoEVs)对胶质瘤肿瘤发生和替莫唑胺(temozolomide,TMZ)耐药性的影响及作用机制。方法:经提取的apoEVs经纳米颗粒跟踪分析和透射电子显微镜表征,并通过Western blot、流式细胞术、CCK-8实验、细胞克隆形成实验和Transwell实验等方法评估其对细胞增殖、迁移、侵袭及凋亡的影响。结果:apoEVs促进胶质瘤细胞的TMZ耐药性,显著提高TMZ半数抑制浓度(IC50)(t=9.326,P=0.001),抑制细胞凋亡,并通过外泌体抑制剂GW4869逆转该效应。apoEVs促进胶质瘤细胞的迁移和侵袭,增加波形蛋白(Vimentin)和Twist蛋白的表达(t=8.762,P=0.002和t=7.941,P=0.004),抑制裂解型半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶-3(leaved-Caspase-3)的表达(t=9.217,P=0.002)。进一步机制研究表明,apoEVs通过调控LncRNA-XIST/miR-29c/O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶(O6-methylguanineDNA methyltransferase,MGMT)轴,影响胶质瘤细胞对TMZ的耐药性。沉默LncRNA-XIST降低MGMT表达、增加miR-29c表达,从而增强TMZ敏感性,抑制细胞迁移和侵袭。结论:胶质瘤细胞来源的凋亡外囊泡通过传递LncRNA-XIST调节miR-29c/MGMT轴从而促进胶质瘤恶性进展和替莫唑胺耐药。 展开更多
关键词 胶质瘤 凋亡外囊泡 长链非编码RNA-X染色体失活转录物 上皮-间质转化 miR-29c/O6-甲基鸟嘌呤-dna甲基转移
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DNA修复相关基因启动子甲基化和肿瘤化疗耐药的进展 被引量:5
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作者 韩婧 李江 《上海交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期95-98,共4页
肿瘤细胞DNA修复能力与化疗药物敏感性密切相关,而DNA启动子甲基化可导致DNA修复相关基因转录失活、基因沉默、蛋白表达量改变等影响DNA的修复能力,继而导致肿瘤对化疗药物的固有性或获得性耐药。该文着重阐述DNA修复相关基因O6-甲基鸟... 肿瘤细胞DNA修复能力与化疗药物敏感性密切相关,而DNA启动子甲基化可导致DNA修复相关基因转录失活、基因沉默、蛋白表达量改变等影响DNA的修复能力,继而导致肿瘤对化疗药物的固有性或获得性耐药。该文着重阐述DNA修复相关基因O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶(MGMT)、人类mut1同源物(hMLH1)和范科尼贫血互补基团F(FANCF)启动子甲基化与肿瘤化疗耐药之间的关系。 展开更多
关键词 启动子甲基 DNA修复 耐药 烷化剂 O6-甲基鸟嘌呤-dna甲基转移 人类mut1同源物 范科尼贫血互补基团F
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MRI不同影像组学模型预测胶质瘤MGMT启动子甲基化状态的研究 被引量:8
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作者 陈思璇 许悦 +6 位作者 叶梅萍 李扬 于芷轩 青钊 王正阁 张冰 张鑫 《磁共振成像》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期1-5,36,共6页
目的 探讨MRI的不同影像组学模型预测术前脑胶质瘤O^(6)-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶(O^(6)-methylguanine-DNA methyltransferase,MGMT)启动子甲基化状态的效能。材料与方法 回顾性分析经手术病理证实的114例大脑胶质瘤患者的MRI影像资料... 目的 探讨MRI的不同影像组学模型预测术前脑胶质瘤O^(6)-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶(O^(6)-methylguanine-DNA methyltransferase,MGMT)启动子甲基化状态的效能。材料与方法 回顾性分析经手术病理证实的114例大脑胶质瘤患者的MRI影像资料,包括T1WI、T2WI、ADC及T1WI增强序列。其中MGMT启动子甲基化阳性58例,阴性56例,按8∶2比例分为训练组(91例)与验证组(23例),在T2WI及T1WI增强序列分别对肿瘤加水肿区及肿瘤核心区进行三维手工分割,提取总共688个影像组学特征,采用主成分分析进行特征降维,方差分析用于特征筛选,应用逻辑回归(Logistic regression,LR)算法、Lasso的逻辑回归算法(Logistic regression via Lasso, LR-Lasso)、支持向量机(support vector machine, SVM)、贝叶斯分类器(native Bayes,NB)构建诊断模型,5倍交叉验证方法用于训练模型,验证组数据用于评估模型的预测性能,ROC曲线用于计算模型的准确率、敏感度和特异度,ROC曲线下面积(area under curve,AUC)用于评估模型的预测性能。结果 LR模型的AUC值、准确率为0.90和91%,敏感度和特异度为92%和91%,LR-Lasso模型的AUC值、准确率为0.80和74%,敏感度和特异度为67%和82%,SVM模型的AUC值、准确率为0.89和87%,敏感度和特异度为83%和91%,NB模型的AUC值、准确率为0.69和74%,敏感度和特异度为75%和72%。基于LR模型预测效能最高。结论 MRI影像组学模型对预测术前脑胶质瘤MGMT启动子甲基化的状态具有一定应用价值,4种模型预测效能中LR模型预测效能最高。 展开更多
关键词 胶质瘤 O^(6)-甲基鸟嘌呤-dna甲基转移启动子甲基 影像组学 磁共振成像
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基于多模态MRI影像组学的胶质母细胞瘤生境亚区预测MGMT启动子甲基化表达 被引量:4
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作者 焦凯剑 杨波 +3 位作者 陈文 方钰辉 陈亚琳 吴磊 《磁共振成像》 CAS CSCD 北大核心 2023年第11期25-30,76,共7页
目的探讨胶质母细胞瘤(glioblastoma,GBM)不同肿瘤生境亚区多模态影像组学模型用于术前预测GBM O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶(O6-methylguanine-DNA methyltransferase,MGMT)启动子甲基化的效能。材料与方法回顾性分析来自湖北医药学院... 目的探讨胶质母细胞瘤(glioblastoma,GBM)不同肿瘤生境亚区多模态影像组学模型用于术前预测GBM O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶(O6-methylguanine-DNA methyltransferase,MGMT)启动子甲基化的效能。材料与方法回顾性分析来自湖北医药学院附属太和医院、宾法尼西亚大学、加州大学弗朗西斯科分校的600例GBM患者的术前MRI图像、临床和基因信息。自动分割预处理后的图像,得到GBM的三个肿瘤生境亚区(增强区域、坏死区域和水肿区域)。从术前MRI图像[对比增强T1加权成像(contrast enhanced T1-weighted imaging,T1WI-CE)序列、T2液体衰减反转恢复(T2 fluid attenuation inversion recovery,T2-FLAIR)序列和弥散张量成像(diffusion tensor imaging,DTI)的各向异性分数(fractional anisotropy,FA)参数图]上分别提取三个亚区的2153个影像组学特征。通过相关性分析、最小冗余最大相关算法(minimum redundancy maximum relevance,MRMR)和Boruta算法进行特征筛选,使用XGBoost算法构建模型。以受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线及其曲线下面积(area under the curve,AUC)、准确度、敏感度和特异度等指标评价模型诊断效能,DeLong检验对比模型差异性。结果在训练集和测试集两个亚型的不同临床特征的组间比较差异无统计学意义(P>0.05)。特征筛选后获得10个来自多模态生境亚区的特征。多模态生境亚区影像组学模型在训练集和测试集上的AUC分别为0.874和0.899。结论术前MRI影像组学模型可以预测GBM患者MGMT基因启动子甲基化状态,多序列组合模型的诊断效能更具鲁棒性,肿瘤生境亚区的研究为GBM患者的分子分型的精确诊断、替莫唑胺(temozolomide,TMZ)使用的决策、生存期预测提供了重要的临床辅助价值。 展开更多
关键词 胶质母细胞瘤 影像组学 磁共振成像 O6-甲基鸟嘌呤-dna甲基转移 生境成像
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多参数MRI影像组学预测IDH野生型胶质母细胞瘤的MGMT启动子甲基化表达 被引量:5
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作者 张馨月 刘国莉 +1 位作者 张君 马林 《中国医学影像学杂志》 CSCD 北大核心 2023年第5期433-441,共9页
目的 结合多参数MRI影像组学与机器学习,无创预测异柠檬酸脱氢酶(IDH)野生型胶质母细胞瘤的O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶(MGMT)启动子甲基化表达。资料与方法 回顾性收集2016年10月—2022年8月解放军总医院第一医学中心112例IDH野生型... 目的 结合多参数MRI影像组学与机器学习,无创预测异柠檬酸脱氢酶(IDH)野生型胶质母细胞瘤的O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶(MGMT)启动子甲基化表达。资料与方法 回顾性收集2016年10月—2022年8月解放军总医院第一医学中心112例IDH野生型胶质母细胞瘤的术前多参数MRI数据及患者年龄、性别,按7∶3随机分为训练集80例与验证集32例。选取表观扩散系数、增强T1WI及T2WI序列进行感兴趣区分割,并从每个感兴趣区中提取1 013个影像特征。采用组内相关系数(ICC)进行一致性检验并过滤ICC<0.85的影像特征。依次通过ICC、t检验及最小绝对收缩和选择算子筛选出最佳特征。在7种分类器中对3个单序列特征组与1个多序列特征组进行训练及验证。绘制受试者工作特征曲线评估模型的诊断效能。结果随机森林分类器与多序列特征组的组合模型为预测IDH野生型胶质母细胞瘤MGMT启动子甲基化表达的最优模型,训练集与验证集中的曲线下面积分别为0.933与0.915,准确度分别为0.868、0.822。结论 无创提取多参数MRI特征结合机器学习算法可以有效预测IDH野生型胶质母细胞瘤MGMT启动子甲基化的表达,为制订个体化治疗方案提供支持。 展开更多
关键词 胶质母细胞瘤 磁共振成像 O6-甲基鸟嘌呤-dna甲基转移 异柠檬酸脱氢 影像组学 机器学习
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脑胶质瘤MGMT启动子甲基化影像学研究进展 被引量:8
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作者 宋双双 卢洁 《中国医学影像技术》 CSCD 北大核心 2019年第5期782-785,共4页
O^6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶(MGMT)启动子甲基化是脑胶质瘤的重要分子生物学标志物,与脑胶质瘤的发生、诊断及预后关系密切。MRI、PET等影像学检查及影像组学方法能够获得反映脑胶质瘤结构、功能、代谢甚至分子水平改变的重要信息,有... O^6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶(MGMT)启动子甲基化是脑胶质瘤的重要分子生物学标志物,与脑胶质瘤的发生、诊断及预后关系密切。MRI、PET等影像学检查及影像组学方法能够获得反映脑胶质瘤结构、功能、代谢甚至分子水平改变的重要信息,有望于术前无创、准确预测MGMT启动子甲基化状态。本文就脑胶质瘤影像学特征与MGMT启动子甲基化关系的研究进展进行综述。 展开更多
关键词 神经胶质瘤 O^6-甲基鸟嘌呤DNA甲基转移 磁共振成像 影像组学
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智能影像预测高级别脑胶质瘤MGMT启动子甲基化状态的研究进展 被引量:3
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作者 赵慧敏 张辉 《磁共振成像》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期130-132,136,共4页
胶质瘤是颅内最常见的原发性恶性肿瘤,具有高度异质性,即使组织学分级相同,有时预后也具有显著差异,而基因分型则可以从本质上更好地阐述肿瘤的生物学行为,其中O^(6)-甲基鸟嘌呤甲基转移酶(O^(6)-methylguanine-DNA methyltransferase,M... 胶质瘤是颅内最常见的原发性恶性肿瘤,具有高度异质性,即使组织学分级相同,有时预后也具有显著差异,而基因分型则可以从本质上更好地阐述肿瘤的生物学行为,其中O^(6)-甲基鸟嘌呤甲基转移酶(O^(6)-methylguanine-DNA methyltransferase,MGMT)与高级别脑胶质瘤(high-grade glioma,HGGs)的预后和治疗决策紧密相关。它是一种关键的DNA修复酶,不仅与脑胶质瘤的发生发展相关,还与烷化剂化疗的敏感性以及放疗反应相关。而MGMT启动子甲基化会沉默MGMT的转录表达,是MGMT表达减少的重要机制。近年来随着科学技术的飞速进步,放射学也逐渐向人工智能的方向发展,本文对智能影像对高级别脑胶质瘤MGMT启动子甲基化状态的预测性能进行了综述。 展开更多
关键词 高级别脑胶质瘤 O^(6)-甲基鸟嘌呤甲基转移 磁共振成像 智能影像
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磁共振影像组学预测脑胶质瘤MGMT启动子甲基化状态的研究进展 被引量:2
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作者 李鼎 王效春 《磁共振成像》 CAS CSCD 北大核心 2023年第12期146-150,171,共6页
脑胶质瘤是最常见的原发恶性中枢神经系统(central nervous system,CNS)肿瘤,约占CNS原发恶性肿瘤的75%,且预后较差。替莫唑胺(temozolomide,TMZ)作为脑胶质瘤化疗一线药物,其治疗敏感性与O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶(O6-methylguanine... 脑胶质瘤是最常见的原发恶性中枢神经系统(central nervous system,CNS)肿瘤,约占CNS原发恶性肿瘤的75%,且预后较差。替莫唑胺(temozolomide,TMZ)作为脑胶质瘤化疗一线药物,其治疗敏感性与O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶(O6-methylguanine-DNA methyltransferase,MGMT)甲基化状态密切相关。目前检测MGMT启动子甲基化状态主要基于焦磷酸测序,此活检取样耗时长,并且会受肿瘤异质性的影响。近年来,MRI影像组学以及深度学习(deep learning,DL)都得到了极大的发展,其高通量的数据挖掘在一定程度上克服了肿瘤异质性的影响。本文就MRI影像组学和基于DL的MRI影像组学的最新研究进展及其局限性展开综述,旨在为后续的相关研究拓展思路,从而更好地实现脑胶质瘤患者的个性化精准诊疗。 展开更多
关键词 脑胶质瘤 O6-甲基鸟嘌呤-dna甲基转移 磁共振成像 影像组学 深度学习 替莫唑胺
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导入外源MGMT cDNA增加K562细胞对尼氮芥的耐药性
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作者 季守平 吴英 +2 位作者 由英 毛宁 章扬培 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 1997年第4期399-404,共6页
骨髓抑制是限制氯乙基亚硝脲类药物(CENUs)化疗剂量的关键因素。本实验以K562细胞作为骨髓细胞的转基因模型,把人MGMT cDNA构建到逆转录病毒载体并转导K562细胞,观察细胞在转导前后的MGMT基因表达水平及其对尼氮芥[1-(4-amino-2-methyl-... 骨髓抑制是限制氯乙基亚硝脲类药物(CENUs)化疗剂量的关键因素。本实验以K562细胞作为骨髓细胞的转基因模型,把人MGMT cDNA构建到逆转录病毒载体并转导K562细胞,观察细胞在转导前后的MGMT基因表达水平及其对尼氮芥[1-(4-amino-2-methyl-5-pyrimidinyl)methyl-3(2-chloroethyl)-3-nitrosourea,ACNU]耐药性的变化。结果表明转导细胞K562-MGMT^+的MGMT基因表达水平有显著的提高,对ACNU的耐药性也较转导前的K562细胞有大幅度提高。实验提示,用基因转移的方法使骨髓细胞大量表达MGMT基因,有可能增加骨髓细胞对CENUs的耐药性,防止CENUs引起的骨髓抑制。 展开更多
关键词 O^6-甲基鸟嘌呤-dna甲基转移 基因表达 K562细胞 尼氮芥耐药性 骨髓抑制
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食管鳞状细胞癌组织中COX-2和MGMT蛋白的表达 被引量:2
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作者 朱辉 王慧娟 +6 位作者 贺春语 王启鸣 李鹏 闫相涛 张国伟 王生 马智勇 《郑州大学学报(医学版)》 CAS 北大核心 2011年第1期125-128,共4页
关键词 食管肿瘤 鳞状细胞癌 环氧合-2 6--甲基鸟嘌呤-dna甲基转移
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DVC1在氮芥致人支气管上皮细胞DNA-蛋白交联损伤修复中的作用
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作者 程晋 余文珮 +4 位作者 叶枫 董训虎 赵远鹏 但国蓉 邹仲敏 《陆军军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第21期2214-2221,共8页
目的探讨蛋白水解酶DVC1在氮芥诱导人支气管上皮细胞DNA-蛋白交联损伤修复中的作用。方法利用siRNA干预DVC1表达,50μmol/L氮芥染毒细胞后,采用Western blot检测DNA损伤修复蛋白的表达;荧光酶标仪测定1~24 h DNA-蛋白交联总量;Slot blo... 目的探讨蛋白水解酶DVC1在氮芥诱导人支气管上皮细胞DNA-蛋白交联损伤修复中的作用。方法利用siRNA干预DVC1表达,50μmol/L氮芥染毒细胞后,采用Western blot检测DNA损伤修复蛋白的表达;荧光酶标仪测定1~24 h DNA-蛋白交联总量;Slot blot检测DNA与O 6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶(O^(6)-methylguanine-DNA methyltransferase,MGMT)的共价交联;免疫沉淀检测MGMT泛素化水平。构建GST-DVC1融合蛋白,GST下拉实验检测DVC1与MGMT、泛素的结合。结果si-DVC1干预后,DNA-蛋白交联总量升高。氮芥降低交联蛋白MGMT原型的水平,但增强其泛素化水平;DVC1可结合泛素,si-DVC1可进一步增强MGMT的泛素化及DNA-MGMT的交联量,与泛素结合酶抑制剂NSC697923和蛋白酶体抑制剂MG132引起的交联结果类似。si-DVC1引起DNA损伤修复蛋白Rad51表达降低、Ku70表达升高。结论DNA-蛋白交联的清除依赖于交联蛋白的泛素化;DVC1通过与泛素相互作用,促进氮芥诱导的DNA-蛋白交联的清除,并维持DNA以同源重组方式修复损伤的能力。 展开更多
关键词 氮芥 DVC1 DNA蛋白交联 O 6-甲基鸟嘌呤-dna甲基转移 人支气管上皮细胞
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MGMT介导的人脑胶质瘤耐药细胞系的建立 被引量:6
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作者 金澎 张庆林 +4 位作者 刘福生 王保安 魏麟 王成伟 孔建新 《中国医学科学院学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第6期596-600,共5页
目的建立由O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶(MGMT)介导的人脑胶质瘤耐药细胞株U251/BCNU。方法模拟卡氮芥(BCNU)的临床用药程序,采取恒定药物浓度、周期性作用的方式诱导U251的抗药性。检测U251/BCNU的耐药指数及MGMTmRNA的表达;比较U251及... 目的建立由O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶(MGMT)介导的人脑胶质瘤耐药细胞株U251/BCNU。方法模拟卡氮芥(BCNU)的临床用药程序,采取恒定药物浓度、周期性作用的方式诱导U251的抗药性。检测U251/BCNU的耐药指数及MGMTmRNA的表达;比较U251及U251/BCNU细胞的体外增殖变化。结果经过反复总共5次的用药过程,历时4个月,成功地建立了对BCNU具有稳定抗药性的U251/BCNU,其对BCNU的耐受程度约为U251的17倍。RT-PCR显示,U251/BCNU细胞有MGMTmRNA的表达。U251及U251/BCNU细胞的体外群体倍增时间差异无显著性。结论在体外成功地建立了一株由MGMT介导的人脑胶质瘤耐药细胞系,为进一步探讨胶质瘤的耐药机制及逆转方式奠定了基础。 展开更多
关键词 脑胶质瘤 MGMT 抗药性 细胞系 O^6-甲基鸟嘌呤-dna甲基转移 逆转录聚合链反应 MTT法
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