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东亚钳蝎毒素BmKT四个同源基因的克隆及基因组织分析
1
作者
罗锋
刘辉
李文鑫
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第5期365-372,共8页
BmKT是从本室构建的cDNA文库中筛选到的1个α钠通道毒素,根据其全长cDNA序列设计引物,采用PCR法以蝎总基因组DNA为模板,获得4个BmKT的同源基因,分别命名为BmKT′和BmKTa、BmKTb、BmKTb′.序列分析表明:BmKT′和BmKTa基因含有大小分别为5...
BmKT是从本室构建的cDNA文库中筛选到的1个α钠通道毒素,根据其全长cDNA序列设计引物,采用PCR法以蝎总基因组DNA为模板,获得4个BmKT的同源基因,分别命名为BmKT′和BmKTa、BmKTb、BmKTb′.序列分析表明:BmKT′和BmKTa基因含有大小分别为509bp和506bp的内含子,位于信号肽编码区内,插入信号肽-4位残基Gly密码子的第一个碱基G之后;而BmKTb和BmKTb′的内含子大小均为418bp.这4个BmKT的同源基因内含子符合GTAG拼接规律,其中BmKT′和BmKTa的内含子A+T含量分别为61.7%和61.9%,低于目前已报导的大多数蝎毒素基因A+T含量,大大低于它们第一外显子A+T含量(71.7%),略高于第二外显子A+T含量(55.5%);而BmKTb,BmKTb′的内含子A+T含量分别为75.8%和76.1%,与目前已报导的大多数蝎毒素基因A+T含量相似.BmKT′基因的外显子与BmKT基因cDNA所对应氨基酸序列仅在信号肽中-7位有一个氨基残基的差异(BmKT:Leu→BmKTa:Val);而BmKTa基因外显子所推断的氨基酸序列与BmKT前体比较,则在成熟肽的+54位发生了突变(BmKT:Lys→BmKTa:Asn),是与BmKT同源的一个新基因.BmKTb基因和BmKTb′基因所编码的前体肽与BmKT基因对应的前体肽同源性约为65%,显然BmKTb和BmKTb′是不同于BmKT的2个新基因(GenBank登录号:BmKT′,AY786186;BmKTa,AY676142;BmKTb,AY676140;BmKTb′,AY676141).
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关键词
东亚钳蝎
BmKT'
BmKTa
BmKTb
BmKTb'
基因组织
Na^+
通道
毒素
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职称材料
东亚钳蝎蝎毒素BmKBT基因组序列的克隆及其分析
被引量：
5
2
作者
盛继群
曹志贱
+5 位作者
刘万红
徐秀玲
蒋达和
毛歆
刘辉
李文鑫
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2004年第4期491-496,共6页
东亚钳蝎 (ButhusmartensiiKarsch ,BmK)蝎毒素BmKBT(又名BmKabT)是一个在初级结构上相似于β类哺乳动物毒素和功能接近于α类哺乳动物毒素的Na+ 通道毒素 .基于从毒腺cDNA文库中筛选得到的全长BmKBT前体核苷酸序列设计引物 ,以蝎基因组...
东亚钳蝎 (ButhusmartensiiKarsch ,BmK)蝎毒素BmKBT(又名BmKabT)是一个在初级结构上相似于β类哺乳动物毒素和功能接近于α类哺乳动物毒素的Na+ 通道毒素 .基于从毒腺cDNA文库中筛选得到的全长BmKBT前体核苷酸序列设计引物 ,以蝎基因组总DNA为模板进行聚合酶链式反应 (PCR) ,将PCR产物克隆至T载体、测序 .序列分析表明 :在BmKBT信号肽编码区的 3′端的- 4位Gly密码子的第 1位与第 2位碱基中有 1个长 2 2 5nt的内含子 ,插入位点距离该基因的起始密码子 4 6nt ,AT含量为 78 7% ,其内含子可能的剪接分枝位点距离 3′剪接受体位点 4 7nt.内含子的大小及其基因组织结构分析表明 :BmKBT具有与α类哺乳动物毒素类似的基因组织结构 ,进一步说明BmKBT是一个介于α类和β类Na+ 通道毒素之间的中间型蝎毒素 。
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关键词
东亚钳蝎
BmKBT
基因组织结构
Na^+离子
通道
毒素
进化
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职称材料
题名
东亚钳蝎毒素BmKT四个同源基因的克隆及基因组织分析
1
作者
罗锋
刘辉
李文鑫
机构
武汉大学生命科学学院生物技术系
出处
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第5期365-372,共8页
基金
国家自然科学基金重点项目(No.30530140)
国家科技部重点攻关项目(No.2002BA49C)
国家自然科学基金(No.30370349)资助项目~~
文摘
BmKT是从本室构建的cDNA文库中筛选到的1个α钠通道毒素,根据其全长cDNA序列设计引物,采用PCR法以蝎总基因组DNA为模板,获得4个BmKT的同源基因,分别命名为BmKT′和BmKTa、BmKTb、BmKTb′.序列分析表明:BmKT′和BmKTa基因含有大小分别为509bp和506bp的内含子,位于信号肽编码区内,插入信号肽-4位残基Gly密码子的第一个碱基G之后;而BmKTb和BmKTb′的内含子大小均为418bp.这4个BmKT的同源基因内含子符合GTAG拼接规律,其中BmKT′和BmKTa的内含子A+T含量分别为61.7%和61.9%,低于目前已报导的大多数蝎毒素基因A+T含量,大大低于它们第一外显子A+T含量(71.7%),略高于第二外显子A+T含量(55.5%);而BmKTb,BmKTb′的内含子A+T含量分别为75.8%和76.1%,与目前已报导的大多数蝎毒素基因A+T含量相似.BmKT′基因的外显子与BmKT基因cDNA所对应氨基酸序列仅在信号肽中-7位有一个氨基残基的差异(BmKT:Leu→BmKTa:Val);而BmKTa基因外显子所推断的氨基酸序列与BmKT前体比较,则在成熟肽的+54位发生了突变(BmKT:Lys→BmKTa:Asn),是与BmKT同源的一个新基因.BmKTb基因和BmKTb′基因所编码的前体肽与BmKT基因对应的前体肽同源性约为65%,显然BmKTb和BmKTb′是不同于BmKT的2个新基因(GenBank登录号:BmKT′,AY786186;BmKTa,AY676142;BmKTb,AY676140;BmKTb′,AY676141).
关键词
东亚钳蝎
BmKT'
BmKTa
BmKTb
BmKTb'
基因组织
Na^+
通道
毒素
Keywords
Buthus Martensii Karsch
BmKT＇
BmKTa
BmKTb
BmKTb＇
genomic organization
sodium channel toxin
分类号
Q71 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
东亚钳蝎蝎毒素BmKBT基因组序列的克隆及其分析
被引量：
5
2
作者
盛继群
曹志贱
刘万红
徐秀玲
蒋达和
毛歆
刘辉
李文鑫
机构
武汉大学生命科学学院
出处
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2004年第4期491-496,共6页
基金
国家自然科学基金 (No:3 9970 897和 3 0 3 70 3 49)资助项目~~
文摘
东亚钳蝎 (ButhusmartensiiKarsch ,BmK)蝎毒素BmKBT(又名BmKabT)是一个在初级结构上相似于β类哺乳动物毒素和功能接近于α类哺乳动物毒素的Na+ 通道毒素 .基于从毒腺cDNA文库中筛选得到的全长BmKBT前体核苷酸序列设计引物 ,以蝎基因组总DNA为模板进行聚合酶链式反应 (PCR) ,将PCR产物克隆至T载体、测序 .序列分析表明 :在BmKBT信号肽编码区的 3′端的- 4位Gly密码子的第 1位与第 2位碱基中有 1个长 2 2 5nt的内含子 ,插入位点距离该基因的起始密码子 4 6nt ,AT含量为 78 7% ,其内含子可能的剪接分枝位点距离 3′剪接受体位点 4 7nt.内含子的大小及其基因组织结构分析表明 :BmKBT具有与α类哺乳动物毒素类似的基因组织结构 ,进一步说明BmKBT是一个介于α类和β类Na+ 通道毒素之间的中间型蝎毒素 。
关键词
东亚钳蝎
BmKBT
基因组织结构
Na^+离子
通道
毒素
进化
Keywords
BmK ( Buthus martensii Karsch), sodium ion channel toxin, BmKBT, genomic organization, evolution
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
东亚钳蝎毒素BmKT四个同源基因的克隆及基因组织分析
罗锋
刘辉
李文鑫
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2006
0
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职称材料
2
东亚钳蝎蝎毒素BmKBT基因组序列的克隆及其分析
盛继群
曹志贱
刘万红
徐秀玲
蒋达和
毛歆
刘辉
李文鑫
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2004
5
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