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题名西瓜NPR基因家族的鉴定及其在盐胁迫下的表达分析
被引量：1
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作者
贾云鹤
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机构
黑龙江省农业科学院园艺分院
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出处
《中国瓜菜》
北大核心
2025年第1期16-24,共9页
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基金
黑龙江省重点研发计划(SC2022ZX02C0202)
国家西甜瓜产业技术体系哈尔滨综合试验站(CARS-25)
+1 种基金
黑龙江省西甜瓜现代农业产业技术协同创新推广体系项目
黑龙江省农业科技创新跨越工程项目(CX23GG05)。
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文摘
以拟南芥NPR基因家族成员蛋白序列为查询序列,在西瓜基因组数据库中鉴定西瓜NPR基因家族成员,并对其进行生物信息学分析及盐胁迫下的表达分析。共鉴定到4个成员,将其命名为ClNPR1~ClNPR4,其编码蛋白的理化性质、保守功能结构域、重要氨基酸残基及motif分析结果与其他物种有较高的一致性,顺式作用元件分析显示,ClNPRs与非生物胁迫相关。300 mmol·L^(-1)NaCl处理耐盐材料和盐敏感材料,分别取盐胁迫0、8、24 h的叶片进行4个NPR基因的表达模式分析,结果表明,ClNPR1在盐敏感和耐盐材料中都显著上调表达,但盐胁迫24 h,ClNPR1在盐敏感材料中显著下调表达,在耐盐材料中虽然下调但还保持较高的表达水平,且在耐盐材料中的表达量显著高于盐敏感材料;盐胁迫24 h,ClNPR2和ClNPR3在盐敏感和耐盐材料中都显著上调表达,在耐盐材料中的表达量均显著高于盐敏感材料。推测ClNPRs基因在西瓜响应盐胁迫的过程中扮演重要角色。
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关键词
西瓜
npr家族蛋白
盐胁迫
表达
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Keywords
Watermelon
npr family protein
Salt stress
Expression
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分类号
S651
[农业科学—果树学]
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