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基于NC Ⅲ和TTC设计的胚乳性状QTL区间作图方法
被引量:
3
1
作者
王学枫
汤在祥
+2 位作者
王亚民
宋雯
徐辰武
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第10期1734-1743,共10页
根据三倍体胚乳性状的遗传模型,提出基于NCIII以及TTC两种遗传设计的胚乳性状QTL作图新方法,并通过计算机模拟数据,对该方法的可行性和有效性进行了分析验证。模拟研究供试因素包括QTL遗传力、F2群体植株数和每家系混合样品测定的胚乳...
根据三倍体胚乳性状的遗传模型,提出基于NCIII以及TTC两种遗传设计的胚乳性状QTL作图新方法,并通过计算机模拟数据,对该方法的可行性和有效性进行了分析验证。模拟研究供试因素包括QTL遗传力、F2群体植株数和每家系混合样品测定的胚乳数。考察指标包括QTL的统计功效以及QTL位置和效应估计的准确度与精确度。结果表明,2种设计均有较高的QTL统计功效,在供试的大多数处理中,即使QTL的遗传力只有5%,其被发现能力也可达100%。两种设计均可有效区分胚乳QTL的各种遗传效应。基于TTC设计的胚乳QTL作图方法,在QTL的统计功效、位置估计和效应估计上,均优于NCIII设计,虽然这一优势随着QTL遗传力的提高以及样本容量的增大而有降低的趋势。
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关键词
胚乳性状
QTL作图
ncⅲ设计
TTC
设计
极大似然估计
EM算法
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职称材料
题名
基于NC Ⅲ和TTC设计的胚乳性状QTL区间作图方法
被引量:
3
1
作者
王学枫
汤在祥
王亚民
宋雯
徐辰武
机构
扬州大学江苏省作物遗传生理重点实验室/教育部植物功能基因组学重点实验室
出处
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第10期1734-1743,共10页
基金
国家重点基础研究发展计划(973计划)项目(2006CB101700)
教育部"新世纪优秀人才支持计划"项目(NCET2005-05-0502)
江苏省自然科学基金项目(BK2006066)
文摘
根据三倍体胚乳性状的遗传模型,提出基于NCIII以及TTC两种遗传设计的胚乳性状QTL作图新方法,并通过计算机模拟数据,对该方法的可行性和有效性进行了分析验证。模拟研究供试因素包括QTL遗传力、F2群体植株数和每家系混合样品测定的胚乳数。考察指标包括QTL的统计功效以及QTL位置和效应估计的准确度与精确度。结果表明,2种设计均有较高的QTL统计功效,在供试的大多数处理中,即使QTL的遗传力只有5%,其被发现能力也可达100%。两种设计均可有效区分胚乳QTL的各种遗传效应。基于TTC设计的胚乳QTL作图方法,在QTL的统计功效、位置估计和效应估计上,均优于NCIII设计,虽然这一优势随着QTL遗传力的提高以及样本容量的增大而有降低的趋势。
关键词
胚乳性状
QTL作图
ncⅲ设计
TTC
设计
极大似然估计
EM算法
Keywords
Endosperm trait
QTL mapping
North Carolina Design
ⅲ
Triple Test Cross
Maximum likelihood estimation
EM algorithm
分类号
S330 [农业科学—作物遗传育种]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于NC Ⅲ和TTC设计的胚乳性状QTL区间作图方法
王学枫
汤在祥
王亚民
宋雯
徐辰武
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008
3
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