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基于NCⅡ遗传交配设计的籼稻抽穗期全基因组关联分析
1
作者 徐凯 郑兴飞 +3 位作者 张红燕 胡中立 宁子岚 李兰芝 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期86-96,共11页
抽穗期受光温资源和基因网络的共同调控,影响作物产量和品种的地域适应性,通过关联分析鉴定与抽穗期性状相关的显著位点和基因,对解析抽穗期的遗传基础具有重要意义。本研究按照双因素交叉式遗传设计(North Carolina design Ⅱ,NCⅡ)将... 抽穗期受光温资源和基因网络的共同调控,影响作物产量和品种的地域适应性,通过关联分析鉴定与抽穗期性状相关的显著位点和基因,对解析抽穗期的遗传基础具有重要意义。本研究按照双因素交叉式遗传设计(North Carolina design Ⅱ,NCⅡ)将115份籼稻品种作为父本,5份不育系作为母本,进行测交,得到了575个F_(1)代的测交群体。对亲本和F_(1)代抽穗期的表型值、亲本品种群体的一般配合力、F_(1)代群体的特殊配合力和超亲优势值进行全基因组关联分析,(1)共定位到104个关联位点,分布在12条染色体上。其中,第4条染色体上检测到的显著位点最多,为16个。在亲本的抽穗期表型、一般配合力、F_(1)代的抽穗期表型、特殊配合力、超亲优势值5个数据集中分别检测到6、5、15、57和21个。对这5个数据集中的显著关联位点进行表型变异分析,发现在亲本抽穗期表型、一般配合力、F_(1)代抽穗期表型、特殊配合力和超亲优势值这5个数据集中的显著关联位点对表型变异的总贡献率(phenotypic variation explained,PVE)分别为79.57%、10.51%、33.35%、56.42%和54.86%。其中,25个位点在多个数据集中被检测到,可能为抽穗期相关的热点区域。(2)通过关联分析得到的显著位点与日本晴参考基因组注释信息比对,共检测到5个已克隆抽穗期基因,其中3个基因与显著关联位点的基因组距离小于200 kb,对这3个基因中的单倍型组合与单个基因的优异单倍型进行比较发现,亲本品种群体中单倍型组合SDG724(Hap.A)_Hd17(Hap.E)_Ghd7(Hap.A)的对应的水稻单株籽粒产量较高,抽穗期较长,该组合中各基因的单倍型对应于单个克隆基因的优异单倍型,表明优异单倍型的聚合的常规稻,具有更高的产量和更长的抽穗期。测交子代未见此情形,测交子代群体中SDG724(Hap.I)_Hd17(Hap.K)_Ghd7(Hap.I)的单倍型组合形式的水稻有适中的抽穗期和较高的产量,说明测交子代的抽穗期遗传机制较父本(常规水稻品种)复杂。全基因组关联分析和单倍型分析相结合,能利用到多个SNP提供的连锁不平衡信息,提高了基因检测效率,对培育高产的水稻品种具有重要的指导意义。 展开更多
关键词 水稻 抽穗期 全基因组关联分析 单倍型 ncⅱ遗传设计
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北疆棉花三系主要选育指标的遗传效应分析 被引量：4
2
作者 代勇强 张新宇 孙杰 《新疆农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期1-9,共9页
【目的】分析北疆棉花三系主要选育指标的遗传效应,研究三系杂交棉主要选育指标的遗传规律,筛选出高优势的杂交组合。【方法】自育的棉花7个不育系和6个恢复系采用7×6NCⅡ遗传交配设计,配制42个杂交组合,对F_1代产量、衣分和纤维... 【目的】分析北疆棉花三系主要选育指标的遗传效应,研究三系杂交棉主要选育指标的遗传规律,筛选出高优势的杂交组合。【方法】自育的棉花7个不育系和6个恢复系采用7×6NCⅡ遗传交配设计,配制42个杂交组合,对F_1代产量、衣分和纤维品质进行遗传方差和配合力的统计分析。【结果】(1)棉花产量同时受显性效应和加性效应的影响,并且可能存在超显性;衣分、上半部平均长度、马克隆值、断裂比强度主要受加性效应的影响,部分显性。(2)不育系一般配合力最高的为3-248A,较高的为2-20A、6-89A,其余的一般配合力较低或负值;恢复系一般配合力最高的为12-278R,较高的为8-420R、9-186R,其余的一般配合力较低或负值。(3)特殊配合力最高的为2×9,较高的为6×12、4×9、3×8、6×8,分别比对照增产23.33%、16.67%、15%、10.83%、5%,其余的一般配合力较低或负值。【结论】自育的棉花7个不育系和6个恢复系采用NCⅡ遗传交配设计,对F_1代的产量、衣分和纤维品质进行遗传效应分析,筛选出高优势的杂交组合2×9,比对照增产23.33%。 展开更多
关键词 三系杂交棉 ncⅱ遗传设计 遗传效应
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9个甜糯双隐基因型玉米自交系配合力效应分析 被引量：1
3
作者 刘亚利 杨耀迥 +4 位作者 苏琪 陈坤 卢生乔 滕辉升 张述宽 《安徽农业科学》 CAS 2016年第5期24-26,29,共4页
[目的]对9个甜糯双隐性基因型玉米自交系进行配合力测定和分析,为甜糯双隐性基因型玉米自交系的利用和强优势组合的选配提供一定的理论依据。[方法]以3个糯玉米自交系为测验种,9个甜糯双隐基因型玉米自交系为被测验种,按NCⅡ遗传交配设... [目的]对9个甜糯双隐性基因型玉米自交系进行配合力测定和分析,为甜糯双隐性基因型玉米自交系的利用和强优势组合的选配提供一定的理论依据。[方法]以3个糯玉米自交系为测验种,9个甜糯双隐基因型玉米自交系为被测验种,按NCⅡ遗传交配设计配制27个测交组合,通过配合力测定,筛选优良甜糯双隐基因型玉米自交系,用于选育甜糯玉米杂交种。[结果]9个自交系的产量配合力差异显著,M104、M105、M98、M100和F114的一般配合力较高;组合A25(291.77)、A14(263.07)、A07(182.54)、A15(163.19)、A11(150.15)、A13(148.13)、A18(131.65)、A09(82.15)、A27(75.60)、A05(48.68)的配合力总效应较高,为较强优势组合。[结论]自交系M104、M105、M98、M100和F114具有较高的利用价值,用其作亲本较容易组配出高产组合。 展开更多
关键词 ncⅱ遗传交配设计 甜糯玉米 自交系 配合力
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