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小果野蕉(Musa acuminata)全基因组NBS抗病基因的鉴定与分析被引量：5: 1; 作者刘梦雅李伟明 +1 位作者吴伟葛学军《热带亚热带植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第5期486-494,共9页; 为探讨小果野蕉(Musa acuminata)中NBS基因的功能,基于新近发表的小果野蕉全基因组序列,对NBS基因家族进行鉴定、分类和染色体定位,解析基因的复制特征、系统发育关系及上游启动子调控元件类别,推测这些基因在小果野蕉中可能的功能。结... 展开更多; 关键词小果野蕉生物信息学基因组 nbs抗病基因; 在线阅读下载PDF 职称材料

向日葵全基因组NBS抗病基因密码子使用偏好性分析被引量：3: 2; 作者刘洋路妍景岚《江苏农业科学》北大核心 2021年第10期43-47,共5页; 为分析了解向日葵(Helianthus annuus L.)核苷酸结合位点(nucleotide binding site,简称NBS)型抗病基因编码时各密码子的使用情况,以向日葵全基因组NBS型抗病基因的255条基因序列为来源,利用CodonW软件对每个基因序列进行密码子统计分... 展开更多; 关键词向日葵 nbs抗病基因密码子偏好性密码子相关参数相关性分析; 在线阅读下载PDF 职称材料

樟树NBS-LRR类抗病基因家族分析与CcRNL基因克隆被引量：7: 3; 作者郑永杰伍艳芳 +2 位作者李江章挺汪信东《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第2期142-149,共8页; 樟树(Cinnamomum camphora L.Presl.)是自然界中较少受病原体侵害的优良抗性种质资源。利用生物信息的方法对樟树叶组织转录组数据中NBS类抗病基因进行了鉴定,对其编码的假定蛋白的理化性质、保守基序及系统发生关系等进行分析。结果表... 展开更多; 关键词樟树 nbs类抗病基因樟树白粉病诱导表达; 在线阅读下载PDF 职称材料

亚麻NBS类抗病基因家族全基因组分析被引量：7: 4; 作者谢冬微路颖 +3 位作者赵德宝杨学粟建光孙健《中国麻业科学》 2015年第3期113-119,125,共8页; 亚麻基因组测序完成为全基因组水平分析抗病基因提供了前提条件，而NBS类抗病基因是植物中最大的抗病基因家族之一。本研究利用生物信息学方法对亚麻全基因组中NBS类抗病基因进行了鉴定，对NBS类抗病蛋白的理化性质、基因结构、保守基... 展开更多; 关键词亚麻 nbs类抗病基因全基因组生物信息学; 在线阅读下载PDF 职称材料

植物NBS类抗病基因的进化被引量：6: 5; 作者罗莎《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2014年第12期1219-1225,共7页; NBS(Nucleotide-binding site)类抗病基因是植物中最重要的一类抗病基因,其进化模式、结构特点和功能调控一直是抗病基因研究领域的热点。这类基因具有保守的结构域,广泛存在于植物基因组中,在不同植物基因组中数目差异较大且具有较低... 展开更多; 关键词 nbs类抗病基因进化模式序列多样性线性关系; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名小果野蕉(Musa acuminata)全基因组NBS抗病基因的鉴定与分析被引量：5: 1; 作者刘梦雅李伟明吴伟葛学军; 机构中国科学院华南植物园中国科学院大学中国热带农业科学院南亚热带作物研究所; 出处《热带亚热带植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第5期486-494,共9页; 基金国家自然科学基金项目(31261140366 31101535) 中国科学院植物资源保护与可持续利用实验室青年基金项目(Y2013720108014)资助; 文摘为探讨小果野蕉(Musa acuminata)中NBS基因的功能,基于新近发表的小果野蕉全基因组序列,对NBS基因家族进行鉴定、分类和染色体定位,解析基因的复制特征、系统发育关系及上游启动子调控元件类别,推测这些基因在小果野蕉中可能的功能。结果表明,在小果野蕉全基因组中鉴定出125个NBS基因,包括78个标准和47个非标准NBS基因。多数NBS基因在染色体上以基因簇形式存在,串联复制是NBS基因家族扩张的主要动力。系统发育分析表明标准NBS基因形成两大分支,77个标准NBS基因有EST表达支持。这为群体水平的抗病基因型筛选提供了本底信息,促进栽培香蕉分子抗病育种进程。; 关键词小果野蕉生物信息学基因组 nbs抗病基因; Keywords Musa acuminata Bioinformatics Genome nbs-encoding disease resistance gene; 分类号 Q943.2 [生物学—植物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名向日葵全基因组NBS抗病基因密码子使用偏好性分析被引量：3: 2; 作者刘洋路妍景岚; 机构内蒙古农业大学园艺与植物保护学院; 出处《江苏农业科学》北大核心 2021年第10期43-47,共5页; 基金国家自然科学基金(编号:31760509) 内蒙古自然科学基金(编号:2020MS03046)。; 文摘为分析了解向日葵(Helianthus annuus L.)核苷酸结合位点(nucleotide binding site,简称NBS)型抗病基因编码时各密码子的使用情况,以向日葵全基因组NBS型抗病基因的255条基因序列为来源,利用CodonW软件对每个基因序列进行密码子统计分析。结果表明,向日葵NBS型抗病基因使用A/T(U)结尾的密码子占比大于G/C结尾的密码子,且有效密码子数(effective number of codon,简称ENC)平均值为51.40,整体偏好性较弱,但第3位碱基偏好使用以A/T(U)结尾的密码子。从同义密码子相对使用频率(relative synonymous codonw usage,简称RSCU)分析得到第3位为A、T结尾的密码子占密码子总数(RSCU>1)的比例最高。ENC-GC3s分布图表明,碱基突变是影响密码子偏好性的关键因素。同时相关性分析结果还表明,ENC与A3s、T3s呈极显著负相关关系,多种不同分析都印证了向日葵NBS型抗病基因序列偏好于以A/T(U)结尾的密码子。分析向日葵NBS型抗病基因密码子偏好性,通过优化密码子来提高NBS抗病基因在向日葵中的表达,可为向日葵分子改造和抗病育种提供理论依据。; 关键词向日葵 nbs抗病基因密码子偏好性密码子相关参数相关性分析; 分类号 S565.501 [农业科学—作物学] Q943.2 [生物学—植物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名樟树NBS-LRR类抗病基因家族分析与CcRNL基因克隆被引量：7: 3; 作者郑永杰伍艳芳李江章挺汪信东; 机构江西省林业科学院国家林业局樟树工程技术研究中心; 出处《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第2期142-149,共8页; 基金江西省科技计划项目(20143ACF60014) 江西省林业科学院博士启动项目; 文摘樟树(Cinnamomum camphora L.Presl.)是自然界中较少受病原体侵害的优良抗性种质资源。利用生物信息的方法对樟树叶组织转录组数据中NBS类抗病基因进行了鉴定,对其编码的假定蛋白的理化性质、保守基序及系统发生关系等进行分析。结果表明,在樟树叶组织转录组中共找到28个具有完整编码框的NBS类抗病基因,大小在2 118-3 378 bp之间,编码蛋白等电点在5.35-9.03之间;在NBS区域内鉴定获得8个保守motifs,系统发育树将28个成员分为5个亚组。通过PCR法克隆获得2个RNL类抗病基因全长,分别命名为CcRNL1和CcRNL2,在氨基酸序列水平二者相似性为71%,在多肽N端都具有RPW8-like保守序列,暗示它们可能具有拟南芥RPW8基因所具有的广谱抗白粉病功能。采集感白粉病和正常樟树幼叶进行表达分析,结果显示CcRNL1可被樟树白粉病菌诱导表达,推测其可能参与了响应白粉病菌胁迫反应过程。; 关键词樟树 nbs类抗病基因樟树白粉病诱导表达; Keywords Cinnamomum camphora nbs-like disease-resistant gene powdery mildew expression analysis; 分类号 S763.7 [农业科学—森林保护学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名亚麻NBS类抗病基因家族全基因组分析被引量：7: 4; 作者谢冬微路颖赵德宝杨学粟建光孙健; 机构黑龙江省农业科学院经济作物研究所中国农业科学院麻类研究所东北农业大学农学院; 出处《中国麻业科学》 2015年第3期113-119,125,共8页; 基金黑龙江省农业科技创新工程项目(QN012) 国家科技支撑计划"经济作物种质资源发掘与创新利用" +2 种基金 2013BAD01B03 国家自然基因面上项目(31471546); 文摘亚麻基因组测序完成为全基因组水平分析抗病基因提供了前提条件，而NBS类抗病基因是植物中最大的抗病基因家族之一。本研究利用生物信息学方法对亚麻全基因组中NBS类抗病基因进行了鉴定，对NBS类抗病蛋白的理化性质、基因结构、保守基序及其系统发生荚系进行了分析。结果表明：在亚麻全基因组中共找到137个NBS类抗病基因，其中分子量大于100kDa序列比例在50％以上，等电点值在5～8的范围内比例为70．07％。系统进化树将NBS类基因分成7个亚组，且同一亚组内基因的结构和保守基序保持着较高的一致性。本研究的结果将为亚麻NBS类抗病基因家族的基因定位以及相关抗病基因克隆等深入研究提供参考。; 关键词亚麻 nbs类抗病基因全基因组生物信息学; Keywords flax nbs type disease - resistant gene Genome - wide Bioinformatics; 分类号 S563.2 [农业科学—作物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名植物NBS类抗病基因的进化被引量：6: 5; 作者罗莎; 机构江西农业大学农学院园艺系; 出处《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2014年第12期1219-1225,共7页; 基金国家自然科学基金项目(编号:31360050)资助; 文摘 NBS(Nucleotide-binding site)类抗病基因是植物中最重要的一类抗病基因,其进化模式、结构特点和功能调控一直是抗病基因研究领域的热点。这类基因具有保守的结构域,广泛存在于植物基因组中,在不同植物基因组中数目差异较大且具有较低的表达量。此外,同源NBS类抗病基因之间通过频繁的序列交换产生广泛的序列多样性,且抗病基因位点具有较差的线性。依据基因之间序列交换的频率,抗病基因可分为TypeⅠ和TypeⅡ两类。文章从抗病基因的结构、数量、分布、序列多样性、进化模式以及表达调控等方面进行了综述,旨在为后续NBS类抗病基因的相关研究提供参考。; 关键词 nbs类抗病基因进化模式序列多样性线性关系; Keywords nbs encoding gene evolutionary pattern sequence diversity synteny; 分类号 Q943 [生物学—植物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	小果野蕉(Musa acuminata)全基因组NBS抗病基因的鉴定与分析	刘梦雅李伟明吴伟葛学军	《热带亚热带植物学报》 CAS CSCD 北大核心	2014	5	在线阅读下载PDF 职称材料
2	向日葵全基因组NBS抗病基因密码子使用偏好性分析	刘洋路妍景岚	《江苏农业科学》北大核心	2021	3	在线阅读下载PDF 职称材料
3	樟树NBS-LRR类抗病基因家族分析与CcRNL基因克隆	郑永杰伍艳芳李江章挺汪信东	《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心	2018	7	在线阅读下载PDF 职称材料
4	亚麻NBS类抗病基因家族全基因组分析	谢冬微路颖赵德宝杨学粟建光孙健	《中国麻业科学》	2015	7	在线阅读下载PDF 职称材料
5	植物NBS类抗病基因的进化	罗莎	《遗传》 CAS CSCD 北大核心	2014	6	在线阅读下载PDF 职称材料