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题名芒果NBS类抗病基因同源序列克隆与分析
被引量：8
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作者
刘洋
姚全胜
苏俊波
洪亚楠
雷新涛
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机构
中国热带农业科学院湛江实验站
中国热带农业科学院热带旱作农业研究中心
中国热带农业科学院南亚热带作物研究所
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出处
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第3期571-576,共6页
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基金
国家自然科学基金项目(30760147)
海南省自然科学基金项目(311092)
中央公益性科研基本业务费项目(ITBB120504)
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文摘
根据已知物种NBS抗病类基因(RGAs)保守序列设计引物,从芒果品种金煌基因组DNA中分离得到了10条同源序列(pp-1～10,GenBank登录号为HM446507～16)。DNA序列分析表明,这些RGAs在200～300 bp区间存在较大变异,Pi值都在0.4以上。同源性分析表明这些序列的同源性差异范围从11.0%～98.4%,离散值范围为1.6～100.7,10条RGAs可以分为2大类。蛋白序列分析表明,pp-01～10都具有开放读码框,编码的蛋白含有典型的NBS抗病类基因所拥有的P-loop和Kinase-2a结构域,通过同源进化分析可将其分为TIR-NBS-LRR和CC-NBS-LRR 2类,与已知物种同源性范围为20%～60.2%。
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关键词
芒果
NBS
抗病类基因
同源克隆
聚类分析
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Keywords
Mango （ mangifera indica linn. ）
NBS
RGAs
homologous clone
cluster analysis
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分类号
S667.7
[农业科学—果树学]
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题名我国芒果主要栽培品种等位酶分析
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作者
姜成东
蔡胜忠
王家保
李绍鹏
卢业凌
谭金红
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机构
热带园艺植物资源与遗传改良教育部重点实验室
海南大学园艺园林学院
中国热带农业科学院环境与植物保护研究所
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出处
《热带作物学报》
CSCD
2008年第6期715-719,共5页
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基金
海南省重点学科建设项目(热带园艺教育部重点实验室及重点学科建设项目
编号:xkxm0813)
+1 种基金
海南省自然科学基金项目(批准号:80663)
海南大学自然科学基金项目(批准号:Rnd0414)资助。
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文摘
应用垂直平板聚丙烯酰胺凝胶电泳技术,对25个主栽芒果品种的过氧化氢酶(CAT)、还原型辅酶Ⅰ心肌黄酶(DIA)、酯酶(EST)、谷氨酸脱氢酶(GDH)、葡萄糖-6-磷酸变位酶(6-PGM)和过氧化物酶(POD)6种酶系统的9个位点及其中一些品种的遗传差异进行分析。利用UPGMA聚类分析将25份材料分为3类,红芒品种聚类于第1类和第2类中,第3类多属于菲律宾印支品种群。分类结果与按品种生态类型及来源分类基本一致。一些在形态上难以区分或易混淆的品种可以根据酶系统的差异进行区分。
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关键词
芒果
等位酶
聚类分析
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Keywords
mangifera indica linn. allozyme classification cluster analysis
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分类号
S667.7
[农业科学—果树学]
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