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猪MYNN基因可变剪接体的克隆及表达特性研究
被引量：
2
1
作者
郭晓红
李萌
+7 位作者
高鹏飞
曹果清
成志敏
张宁芳
乐宝玉
刘剑锋
刘小军
李步高
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第3期477-487,共11页
旨在克隆猪MYNN基因的可变剪接体,并预测编码蛋白的结构与功能,研究各转录本的时空表达特性。本研究以马身猪为试验动物,采用RT-PCR技术对猪MYNN基因全长CDS区进行克隆,并采用生物信息学技术分析其编码蛋白的生物学特性;在心、肝、脾、...
旨在克隆猪MYNN基因的可变剪接体,并预测编码蛋白的结构与功能,研究各转录本的时空表达特性。本研究以马身猪为试验动物,采用RT-PCR技术对猪MYNN基因全长CDS区进行克隆,并采用生物信息学技术分析其编码蛋白的生物学特性;在心、肝、脾、肺、肾、小脑、小肠、胰、胃、肌肉和脂肪组织中,采用实时荧光定量PCR技术对MYNN基因的表达谱进行研究,并在胃和肌肉组织中进行发育性表达规律的研究。结果表明,本研究成功克隆出猪MYNN基因的两个转录本MYNN-1(GenBank登录号:KY470829)和MYNN-2(GenBank登录号:KY670835)。MYNN-1的CDS区全长1 830bp,编码609个氨基酸,编码的蛋白质属于碱性可溶性稳定蛋白质;MYNN-2的CDS区全长1 746bp,编码581个氨基酸,编码的蛋白质属于碱性可溶性不稳定蛋白质;与MYNN-1相比,MYNN-2少了84bp,缺失第6外显子,且通过功能结构域预测发现,MYNN-2比MYNN-1少一个C2H2类型的锌指蛋白结构域;同源性及进化树分析发现,猪MYNN基因的两个转录本所编码的氨基酸序列与北极熊、山羊、马、家犬等物种的同源性较高,遗传距离较近,说明MYNN基因在进化过程中十分保守。MYNN-1和MYNN-2在马身猪的各个组织中均有表达,且各组织之间表达差异显著(P<0.05);在马身猪胃、小肠和胰中高表达,脂肪组织中表达量最低。在各组织(除肾)中MYNN-1的表达量均显著或极显著高于MYNN-2(P<0.05;P<0.01),说明MYNN-1为主要亚型;随着日龄的增加,MYNN-1和MYNN-2在胃中的表达量均呈现逐渐降低的趋势,在背最长肌中,呈现先上升后下降的趋势。本试验成功克隆了猪MYNN基因的两个可变剪接体,并推测MYNN在猪的消化吸收以及骨骼肌的生长发育过程中有重要作用,但其作用的具体机制还需进一步研究。
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关键词
猪
mynn
可变剪接
生物信息学
表达特性
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职称材料
MYNN基因在猪不同组织及肌肉中的表达规律
被引量：
3
2
作者
李萌
靳玉舒
+7 位作者
张旗
成志敏
张宁芳
乐宝玉
高鹏飞
曹果清
李步高
郭晓红
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2017年第10期2957-2964,共8页
试验旨在研究myoneurin(MYNN)基因在猪不同组织中的表达特征及其在肌肉(背最长肌、股二头肌和腰大肌)、小脑、肝脏、胰脏、肾脏、胃、脾脏、肺脏组织中的发育性表达规律。采用实时荧光定量PCR技术研究猪MYNN mRNA在90日龄大白猪和马身...
试验旨在研究myoneurin(MYNN)基因在猪不同组织中的表达特征及其在肌肉(背最长肌、股二头肌和腰大肌)、小脑、肝脏、胰脏、肾脏、胃、脾脏、肺脏组织中的发育性表达规律。采用实时荧光定量PCR技术研究猪MYNN mRNA在90日龄大白猪和马身猪的心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、小脑、小肠、胰脏、胃、股二头肌及脂肪共11个组织中的表达谱,以及在大白猪和马身猪1、90、180日龄3个发育阶段的肌肉、小脑、肝脏、胰脏、肾脏、胃、脾脏、肺脏组织中的发育性表达规律。结果表明,MYNN在猪的各种组织中广泛表达,且各组织间表达差异显著或极显著(P<0.05;P<0.01);MYNN在大白猪和马身猪的肌肉、小脑、肝脏、胰脏、肾脏、胃、脾脏、肺脏组织中的不同发育阶段表达差异显著或极显著(P<0.05;P<0.01),并具有特定规律,由此推测其可能在猪的这几种组织中发挥重要作用。MYNN基因的表达与组织、日龄及品种的遗传背景有关。本试验为研究猪MYNN基因的生物学功能提供了依据,但还需要深入的研究来探索其作用的具体机制,尤其是在骨骼肌发育中的调节机制。
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关键词
猪
mynn
基因
表达谱
发育性表达
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职称材料
边界层湍流参数化改进对雾的模拟影响
被引量：
11
3
作者
黄翊
彭新东
《大气科学》
CSCD
北大核心
2017年第3期533-543,共11页
为了提高边界层参数化在我国复杂下垫面上的描述能力,改善边界层能量和物质输送计算和检验其数值模拟效果,本文选取WRF三维模式,采用基于我国不同下垫面上的边界层观测资料改进的新MYNN(Mellor-Yamada-Nakanishi-Niino)参数化方案对2009...
为了提高边界层参数化在我国复杂下垫面上的描述能力,改善边界层能量和物质输送计算和检验其数值模拟效果,本文选取WRF三维模式,采用基于我国不同下垫面上的边界层观测资料改进的新MYNN(Mellor-Yamada-Nakanishi-Niino)参数化方案对2009年3月17日黄海海雾以及2011年12月4日华北地区两次大雾过程进行模拟检验,探讨边界层参数化方案对雾和边界层结构模拟的影响。参照卫星云图和探空资料,边界层内云水混合比垂直积分的水平分布的模拟能力明显提高,反映了改进的MYNN方案能够更好地模拟出两次雾过程的发生、移动和雾区空间分布,更精确的云水混合比和温度的垂直分布能更好地给出雾区的垂直结构和稳定层结,同时可改善雾区低层位温以及比湿垂直分布的模拟。
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关键词
mynn
(Mellor-Yamada-Nakanishi-Niino)方案
湍流通量
边界层参数化
稳定层结
雾
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职称材料
题名
猪MYNN基因可变剪接体的克隆及表达特性研究
被引量：
2
1
作者
郭晓红
李萌
高鹏飞
曹果清
成志敏
张宁芳
乐宝玉
刘剑锋
刘小军
李步高
机构
山西农业大学动物科技学院
中国农业大学动物科技学院农业部动物遗传育种与繁殖国家重点实验室
河南农业大学牧医工程学院
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第3期477-487,共11页
基金
山西省科技创新重点团队项目(201605D131045-24
201705D131028-19)
+1 种基金
三晋学者项目(2016
2017)
文摘
旨在克隆猪MYNN基因的可变剪接体,并预测编码蛋白的结构与功能,研究各转录本的时空表达特性。本研究以马身猪为试验动物,采用RT-PCR技术对猪MYNN基因全长CDS区进行克隆,并采用生物信息学技术分析其编码蛋白的生物学特性;在心、肝、脾、肺、肾、小脑、小肠、胰、胃、肌肉和脂肪组织中,采用实时荧光定量PCR技术对MYNN基因的表达谱进行研究,并在胃和肌肉组织中进行发育性表达规律的研究。结果表明,本研究成功克隆出猪MYNN基因的两个转录本MYNN-1(GenBank登录号:KY470829)和MYNN-2(GenBank登录号:KY670835)。MYNN-1的CDS区全长1 830bp,编码609个氨基酸,编码的蛋白质属于碱性可溶性稳定蛋白质;MYNN-2的CDS区全长1 746bp,编码581个氨基酸,编码的蛋白质属于碱性可溶性不稳定蛋白质;与MYNN-1相比,MYNN-2少了84bp,缺失第6外显子,且通过功能结构域预测发现,MYNN-2比MYNN-1少一个C2H2类型的锌指蛋白结构域;同源性及进化树分析发现,猪MYNN基因的两个转录本所编码的氨基酸序列与北极熊、山羊、马、家犬等物种的同源性较高,遗传距离较近,说明MYNN基因在进化过程中十分保守。MYNN-1和MYNN-2在马身猪的各个组织中均有表达,且各组织之间表达差异显著(P<0.05);在马身猪胃、小肠和胰中高表达,脂肪组织中表达量最低。在各组织(除肾)中MYNN-1的表达量均显著或极显著高于MYNN-2(P<0.05;P<0.01),说明MYNN-1为主要亚型;随着日龄的增加,MYNN-1和MYNN-2在胃中的表达量均呈现逐渐降低的趋势,在背最长肌中,呈现先上升后下降的趋势。本试验成功克隆了猪MYNN基因的两个可变剪接体,并推测MYNN在猪的消化吸收以及骨骼肌的生长发育过程中有重要作用,但其作用的具体机制还需进一步研究。
关键词
猪
mynn
可变剪接
生物信息学
表达特性
Keywords
pig
mynn
alternative splicing
bioinformatics
expression pattern
分类号
S828.2 [农业科学—畜牧学]
Q344 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
MYNN基因在猪不同组织及肌肉中的表达规律
被引量：
3
2
作者
李萌
靳玉舒
张旗
成志敏
张宁芳
乐宝玉
高鹏飞
曹果清
李步高
郭晓红
机构
山西农业大学动物科技学院
出处
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2017年第10期2957-2964,共8页
基金
山西省科技创新重点团队项目(201605D131045-24)
三晋学者项目(2016)
山西省农业科技攻关项目(20140311020-5)
文摘
试验旨在研究myoneurin(MYNN)基因在猪不同组织中的表达特征及其在肌肉(背最长肌、股二头肌和腰大肌)、小脑、肝脏、胰脏、肾脏、胃、脾脏、肺脏组织中的发育性表达规律。采用实时荧光定量PCR技术研究猪MYNN mRNA在90日龄大白猪和马身猪的心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、小脑、小肠、胰脏、胃、股二头肌及脂肪共11个组织中的表达谱,以及在大白猪和马身猪1、90、180日龄3个发育阶段的肌肉、小脑、肝脏、胰脏、肾脏、胃、脾脏、肺脏组织中的发育性表达规律。结果表明,MYNN在猪的各种组织中广泛表达,且各组织间表达差异显著或极显著(P<0.05;P<0.01);MYNN在大白猪和马身猪的肌肉、小脑、肝脏、胰脏、肾脏、胃、脾脏、肺脏组织中的不同发育阶段表达差异显著或极显著(P<0.05;P<0.01),并具有特定规律,由此推测其可能在猪的这几种组织中发挥重要作用。MYNN基因的表达与组织、日龄及品种的遗传背景有关。本试验为研究猪MYNN基因的生物学功能提供了依据,但还需要深入的研究来探索其作用的具体机制,尤其是在骨骼肌发育中的调节机制。
关键词
猪
mynn
基因
表达谱
发育性表达
Keywords
pig
mynn
gene
expression characteristic
developmental expression
分类号
Q344.13 [生物学—遗传学]
在线阅读
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职称材料
题名
边界层湍流参数化改进对雾的模拟影响
被引量：
11
3
作者
黄翊
彭新东
机构
中国气象科学研究院灾害天气国家重点实验室
出处
《大气科学》
CSCD
北大核心
2017年第3期533-543,共11页
基金
国家重点基础研究发展计划(973计划)项目2012CB417204
国家自然科学基金项目41175095
41575103~~
文摘
为了提高边界层参数化在我国复杂下垫面上的描述能力,改善边界层能量和物质输送计算和检验其数值模拟效果,本文选取WRF三维模式,采用基于我国不同下垫面上的边界层观测资料改进的新MYNN(Mellor-Yamada-Nakanishi-Niino)参数化方案对2009年3月17日黄海海雾以及2011年12月4日华北地区两次大雾过程进行模拟检验,探讨边界层参数化方案对雾和边界层结构模拟的影响。参照卫星云图和探空资料,边界层内云水混合比垂直积分的水平分布的模拟能力明显提高,反映了改进的MYNN方案能够更好地模拟出两次雾过程的发生、移动和雾区空间分布,更精确的云水混合比和温度的垂直分布能更好地给出雾区的垂直结构和稳定层结,同时可改善雾区低层位温以及比湿垂直分布的模拟。
关键词
mynn
(Mellor-Yamada-Nakanishi-Niino)方案
湍流通量
边界层参数化
稳定层结
雾
Keywords
mynn
（Mellor-Yamada-Nakanishi-Niino） scheme, Turbulent flux, PBL （Planetary Boundary Layer） parameterization, Stable stratification, Fog
分类号
P456.6 [天文地球—大气科学及气象学]
在线阅读
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
猪MYNN基因可变剪接体的克隆及表达特性研究
郭晓红
李萌
高鹏飞
曹果清
成志敏
张宁芳
乐宝玉
刘剑锋
刘小军
李步高
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018
2
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
MYNN基因在猪不同组织及肌肉中的表达规律
李萌
靳玉舒
张旗
成志敏
张宁芳
乐宝玉
高鹏飞
曹果清
李步高
郭晓红
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2017
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
边界层湍流参数化改进对雾的模拟影响
黄翊
彭新东
《大气科学》
CSCD
北大核心
2017
11
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职称材料
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