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MYB转录因子在水稻胁迫响应中的研究进展
被引量:
3
1
作者
吴秀菊
张新颖
+2 位作者
许敏
卜庆云
王臻昱
《东北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第3期83-96,共14页
水稻是重要的粮食作物之一,不利环境条件及病虫害等严重影响水稻产量和品质。MYB家族转录因子是植物中最大转录因子家族之一,参与植物多种生长发育途径调控,对植物响应生物和非生物胁迫发挥重要作用。文章总结近年来MYB家族转录因子在...
水稻是重要的粮食作物之一,不利环境条件及病虫害等严重影响水稻产量和品质。MYB家族转录因子是植物中最大转录因子家族之一,参与植物多种生长发育途径调控,对植物响应生物和非生物胁迫发挥重要作用。文章总结近年来MYB家族转录因子在水稻生物和非生物胁迫响应中的功能及调控机制,为水稻抗逆育种提供参考。
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关键词
水稻
myb家族转录因子
转录
调控
非生物胁迫
生物胁迫
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职称材料
小麦MYB转录因子家族的生物信息学分析
被引量:
3
2
作者
黄建国
张超群
+4 位作者
张驰
卞云迪
刘晓颖
范宝莉
王振英
《天津师范大学学报(自然科学版)》
CAS
北大核心
2021年第5期38-45,共8页
为了探究MYB转录因子家族在小麦生长发育过程中的作用,利用小麦全基因组数据库和生物信息学软件对小麦中的MYB转录因子家族进行全基因组鉴定,分析了基因结构、顺式作用元件以及种内和种间的共线性.共鉴定出76个MYB转录因子,其中亲缘关...
为了探究MYB转录因子家族在小麦生长发育过程中的作用,利用小麦全基因组数据库和生物信息学软件对小麦中的MYB转录因子家族进行全基因组鉴定,分析了基因结构、顺式作用元件以及种内和种间的共线性.共鉴定出76个MYB转录因子,其中亲缘关系较近的MYB转录因子的基因结构和保守结构域基本一致.顺式作用元件分析结果表明,小麦中MYB转录因子家族包含多个顺式作用元件,如脱落酸、赤霉素、厌氧诱导、干旱诱导等相关元件,参与激素调控、逆境响应等生长发育过程.与大麦和二穗短柄草的种间共线性分析中,发现了28个在进化上更为保守的转录因子.种内的共线性分析发现53个基因呈现家族内共线性.
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关键词
小麦全基因组鉴定
myb
转录
因子
家族
基因结构
顺式作用元件
共线性分析
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职称材料
滇牡丹MYB家族成员鉴定及PdMYB2的功能验证
被引量:
5
3
作者
邹红竹
韩璐璐
+3 位作者
周琳
吕纪杭
贾莹华
王雁
《林业科学研究》
CSCD
北大核心
2022年第5期1-13,共13页
[目的]研究MYB转录因子家族在滇牡丹黄色花花色变黄过程中的重要作用,为牡丹花色改良和分子育种提供候选基因。[方法]本研究基于滇牡丹花瓣的转录组数据,对滇牡丹MYB家族进行了成员鉴定及分类。依据系统进化树、同源序列比对、基因差异...
[目的]研究MYB转录因子家族在滇牡丹黄色花花色变黄过程中的重要作用,为牡丹花色改良和分子育种提供候选基因。[方法]本研究基于滇牡丹花瓣的转录组数据,对滇牡丹MYB家族进行了成员鉴定及分类。依据系统进化树、同源序列比对、基因差异表达筛选到候选基因PdMYB2,利用亚细胞定位、实时荧光定量PCR、转基因烟草及液相色谱等方法对PdMYB2进行功能验证。[结果]在滇牡丹转录组中共鉴定到64个MYB基因家族成员,分别为R2R3-MYB成员25个,R1R2R3-MYB 1个,4R-MYB 2个,MYB-related 36个。筛选到1个R2R3-MYB转录因子PdMYB2,定位在细胞核和细胞质中,在烟草中过表达PdMYB2会引起烟草花青素积累量的增加,在花瓣中与花青素相关的结构基因NtCHS和NtCHI的表达量均上调。[结论]MYB转录因子家族中的Pd MYB2在类黄酮合成途径中具有正调控作用,可以促进花青素的积累,提高类黄酮途径上结构基因的表达量。
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关键词
滇牡丹
花色
myb
转录
因子
家族
Pd
myb
2
功能验证
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职称材料
莲雾果实采后木质素合成相关MYB基因家族及其作用分析
被引量:
2
4
作者
聂珂
匡凤元
+2 位作者
张珅
吴光斌
陈发河
《保鲜与加工》
CAS
2022年第1期92-101,109,共11页
MYB转录因子在植物苯丙烷代谢的调控中具有重要调节作用,对木质素的合成有影响。为解析MYB基因家族在调控采后莲雾果实絮状绵软的分子机制,利用莲雾转录组数据库测序结果和生物信息学方法,对莲雾果实木质素合成相关的20个MYB转录因子基...
MYB转录因子在植物苯丙烷代谢的调控中具有重要调节作用,对木质素的合成有影响。为解析MYB基因家族在调控采后莲雾果实絮状绵软的分子机制,利用莲雾转录组数据库测序结果和生物信息学方法,对莲雾果实木质素合成相关的20个MYB转录因子基因(MYB基因)的理化性质和结构功能进行预测,并选择在贮藏期间差异表达的1个基因进行克隆和表达,分析其对莲雾果实木质素合成的影响。生物信息学分析表明:20个MYB基因包含91~591个不等的氨基酸残基,定位于细胞核,不存在跨膜结构;二级结构主要由α-螺旋和随机卷曲组成,在所有莲雾果实MYB蛋白中均有分布,20条莲雾MYB蛋白的三级结构绝大部分相似。系统发育树结果表明,莲雾MYB蛋白与番樱桃、巨桉和玫瑰木的亲缘性较近。从莲雾果实中成功克隆得到SsMYB48基因,GenBank登录号为MK204557.1;拟南芥的组织表达结果表明,SsMYB48基因对木质素合成关键酶基因AtF5H和AtPOD的影响较大,说明SsMYB48基因对木质素的合成可能起抑制作用。该研究结果为莲雾MYB基因家族功能的进一步研究提供了理论依据。
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关键词
莲雾
myb
转录
因子
家族
木质素
生物信息学
表达分析
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职称材料
题名
MYB转录因子在水稻胁迫响应中的研究进展
被引量:
3
1
作者
吴秀菊
张新颖
许敏
卜庆云
王臻昱
机构
东北农业大学生命科学学院
中国科学院东北地理与农业生态研究所
出处
《东北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第3期83-96,共14页
基金
国家自然科学基金项目(32171989,U20A2025)。
文摘
水稻是重要的粮食作物之一,不利环境条件及病虫害等严重影响水稻产量和品质。MYB家族转录因子是植物中最大转录因子家族之一,参与植物多种生长发育途径调控,对植物响应生物和非生物胁迫发挥重要作用。文章总结近年来MYB家族转录因子在水稻生物和非生物胁迫响应中的功能及调控机制,为水稻抗逆育种提供参考。
关键词
水稻
myb家族转录因子
转录
调控
非生物胁迫
生物胁迫
Keywords
rice
myb
transcription factor
transcriptional regulation
abiotic stress
biotic stres
分类号
S511 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
小麦MYB转录因子家族的生物信息学分析
被引量:
3
2
作者
黄建国
张超群
张驰
卞云迪
刘晓颖
范宝莉
王振英
机构
天津师范大学生命科学学院
天津师范大学天津市动植物抗性重点实验室
出处
《天津师范大学学报(自然科学版)》
CAS
北大核心
2021年第5期38-45,共8页
基金
国家自然科学基金资助项目(31071671)
天津市科技支撑项目(18YFZCNC01100,17JCZDJC34100).
文摘
为了探究MYB转录因子家族在小麦生长发育过程中的作用,利用小麦全基因组数据库和生物信息学软件对小麦中的MYB转录因子家族进行全基因组鉴定,分析了基因结构、顺式作用元件以及种内和种间的共线性.共鉴定出76个MYB转录因子,其中亲缘关系较近的MYB转录因子的基因结构和保守结构域基本一致.顺式作用元件分析结果表明,小麦中MYB转录因子家族包含多个顺式作用元件,如脱落酸、赤霉素、厌氧诱导、干旱诱导等相关元件,参与激素调控、逆境响应等生长发育过程.与大麦和二穗短柄草的种间共线性分析中,发现了28个在进化上更为保守的转录因子.种内的共线性分析发现53个基因呈现家族内共线性.
关键词
小麦全基因组鉴定
myb
转录
因子
家族
基因结构
顺式作用元件
共线性分析
Keywords
genome-wide identification of wheat
myb
transcription factors family
gene structure
cis-acting element
collinearity analysis
分类号
Q945.8 [农业科学—植物病理学]
在线阅读
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职称材料
题名
滇牡丹MYB家族成员鉴定及PdMYB2的功能验证
被引量:
5
3
作者
邹红竹
韩璐璐
周琳
吕纪杭
贾莹华
王雁
机构
中国林业科学研究院林业研究所
出处
《林业科学研究》
CSCD
北大核心
2022年第5期1-13,共13页
基金
国家重点研发计划项目(2018YFD1000405)
国家自然科学基金项目(31972456)。
文摘
[目的]研究MYB转录因子家族在滇牡丹黄色花花色变黄过程中的重要作用,为牡丹花色改良和分子育种提供候选基因。[方法]本研究基于滇牡丹花瓣的转录组数据,对滇牡丹MYB家族进行了成员鉴定及分类。依据系统进化树、同源序列比对、基因差异表达筛选到候选基因PdMYB2,利用亚细胞定位、实时荧光定量PCR、转基因烟草及液相色谱等方法对PdMYB2进行功能验证。[结果]在滇牡丹转录组中共鉴定到64个MYB基因家族成员,分别为R2R3-MYB成员25个,R1R2R3-MYB 1个,4R-MYB 2个,MYB-related 36个。筛选到1个R2R3-MYB转录因子PdMYB2,定位在细胞核和细胞质中,在烟草中过表达PdMYB2会引起烟草花青素积累量的增加,在花瓣中与花青素相关的结构基因NtCHS和NtCHI的表达量均上调。[结论]MYB转录因子家族中的Pd MYB2在类黄酮合成途径中具有正调控作用,可以促进花青素的积累,提高类黄酮途径上结构基因的表达量。
关键词
滇牡丹
花色
myb
转录
因子
家族
Pd
myb
2
功能验证
Keywords
Paeonia delavayi
flower color
myb
transcription factor family
Pd
myb
2
Functional verification
分类号
S685.11 [农业科学—观赏园艺]
在线阅读
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职称材料
题名
莲雾果实采后木质素合成相关MYB基因家族及其作用分析
被引量:
2
4
作者
聂珂
匡凤元
张珅
吴光斌
陈发河
机构
集美大学食品与生物工程学院
出处
《保鲜与加工》
CAS
2022年第1期92-101,109,共11页
基金
国家自然科学基金面上项目(31171777)
福建省自然科学基金项目(2018J01448)。
文摘
MYB转录因子在植物苯丙烷代谢的调控中具有重要调节作用,对木质素的合成有影响。为解析MYB基因家族在调控采后莲雾果实絮状绵软的分子机制,利用莲雾转录组数据库测序结果和生物信息学方法,对莲雾果实木质素合成相关的20个MYB转录因子基因(MYB基因)的理化性质和结构功能进行预测,并选择在贮藏期间差异表达的1个基因进行克隆和表达,分析其对莲雾果实木质素合成的影响。生物信息学分析表明:20个MYB基因包含91~591个不等的氨基酸残基,定位于细胞核,不存在跨膜结构;二级结构主要由α-螺旋和随机卷曲组成,在所有莲雾果实MYB蛋白中均有分布,20条莲雾MYB蛋白的三级结构绝大部分相似。系统发育树结果表明,莲雾MYB蛋白与番樱桃、巨桉和玫瑰木的亲缘性较近。从莲雾果实中成功克隆得到SsMYB48基因,GenBank登录号为MK204557.1;拟南芥的组织表达结果表明,SsMYB48基因对木质素合成关键酶基因AtF5H和AtPOD的影响较大,说明SsMYB48基因对木质素的合成可能起抑制作用。该研究结果为莲雾MYB基因家族功能的进一步研究提供了理论依据。
关键词
莲雾
myb
转录
因子
家族
木质素
生物信息学
表达分析
Keywords
wax apple
myb
transcription factor family
lignin
bioinformatics
expression analysis
分类号
S667.9 [农业科学—果树学]
在线阅读
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
MYB转录因子在水稻胁迫响应中的研究进展
吴秀菊
张新颖
许敏
卜庆云
王臻昱
《东北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
小麦MYB转录因子家族的生物信息学分析
黄建国
张超群
张驰
卞云迪
刘晓颖
范宝莉
王振英
《天津师范大学学报(自然科学版)》
CAS
北大核心
2021
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
滇牡丹MYB家族成员鉴定及PdMYB2的功能验证
邹红竹
韩璐璐
周琳
吕纪杭
贾莹华
王雁
《林业科学研究》
CSCD
北大核心
2022
5
在线阅读
下载PDF
职称材料
4
莲雾果实采后木质素合成相关MYB基因家族及其作用分析
聂珂
匡凤元
张珅
吴光斌
陈发河
《保鲜与加工》
CAS
2022
2
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职称材料
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