胶质瘤细胞中上皮剪接调控蛋白1(ESRP1)对人髓细胞白血病基因(MCL1)剪接的调控 被引量：1

1

作者 宋大勇 李志强 +3 位作者 权哲 赵军 许大远 张宁 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第11期1463-1467,共5页

目的研究胶质瘤细胞系U251中上皮剪接调控蛋白1(ESRP1)对人髓细胞白血病基因1(MCL1)转录本剪接的调控作用。方法对胶质瘤患者数据库中MCL1的测序结果进行数据挖掘,寻找关键位点。构建pc DNA-ESRP1外源表达载体并在U251细胞中进行过表达... 目的研究胶质瘤细胞系U251中上皮剪接调控蛋白1(ESRP1)对人髓细胞白血病基因1(MCL1)转录本剪接的调控作用。方法对胶质瘤患者数据库中MCL1的测序结果进行数据挖掘,寻找关键位点。构建pc DNA-ESRP1外源表达载体并在U251细胞中进行过表达,通过反转录PCR和Western blot法检测MCL1不同异构体的表达情况。结果 ESRP1在U251细胞中的蛋白表达水平较正常胶质细胞低,MCL1异构体1在U251细胞中的表达高于正常胶质细胞,而异构体2和异构体3的表达则低于正常胶质细胞;在U251细胞中过表达ESRP1以后,发现异构体1表达较未转染组下降,而异构体3表达则显著升高,异构体2表达无明显变化。此外,第801G、802A缺失的MCL1无法被ESRP1正确剪切,异构体1和异构体3的表达与ESRP1转染前后无显著差异。结论抑制ESRP1表达或RNA识别位点突变可以引起肿瘤中癌基因转录本剪接异常。 展开更多

关键词 上皮剪接调控蛋白1(ESRP1) 人髓细胞白血病基因1(mcl1) 胶质瘤 U251细胞 剪接异构体

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降钙素基因相关肽对脂多糖诱导的巨噬细胞表达髓样细胞触发受体-1的影响(英文) 被引量：2

2

作者 李云超 管茶香 +4 位作者 周漾 孙国瑛 施萌 邬晶 李文杰 《中南大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期100-106,共7页

目的:探讨降钙素基因相关肽(CGRP)对脂多糖(LPS)诱导的小鼠巨噬细胞表达髓样细胞触发受体-1(TREM-1)的影响及其信号转导途径。方法:采用反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)观察巨噬细胞TREM-1mRNA表达量的变化,应用流式细胞术检测巨噬细胞... 目的:探讨降钙素基因相关肽(CGRP)对脂多糖(LPS)诱导的小鼠巨噬细胞表达髓样细胞触发受体-1(TREM-1)的影响及其信号转导途径。方法:采用反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)观察巨噬细胞TREM-1mRNA表达量的变化,应用流式细胞术检测巨噬细胞膜表面TREM-1蛋白的表达。结果:CGRP对未受刺激的巨噬细胞表达TREM-1无明显影响,LPS可诱导巨噬细胞表达TREM-1;CGRP预处理呈剂量和时间依赖性上调LPS所致的巨噬细胞TREM-1mRNA的表达;同时,CGRP上调LPS所致的巨噬细胞膜表面TREM-1蛋白的表达;上述作用均可被PKC阻断剂H-7和PKA阻断剂H-89部分逆转(P<0.05)。结论:CGRP上调LPS诱导的巨噬细胞表达TREM-1,其胞内信号转导途径与PKA和PKC有关。 展开更多

关键词 降钙素基因相关肽 髓样细胞触发受体-1 脂多糖 巨噬细胞

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APP、Fis1、KLRF1和PDCD7基因在急性髓系白血病中的表达及临床意义 被引量：4

3

作者 王巍 孟凡义 +3 位作者 黄走方 李利 蔡艳霞 孙启鑫 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第11期2259-2261,2265,共4页

目的探讨淀粉样前体蛋白(APP)、裂殖1同源物(Fis1)、杀伤细胞凝集素样受体亚家族F成员1(KLRF1)和细胞程序性死亡7(PDCD7) mRNA在急性髓系白血病(AML)细胞中的表达及其预后意义。方法抽取34例AML及10例非恶性血液病患者骨髓,提取总RNA并... 目的探讨淀粉样前体蛋白(APP)、裂殖1同源物(Fis1)、杀伤细胞凝集素样受体亚家族F成员1(KLRF1)和细胞程序性死亡7(PDCD7) mRNA在急性髓系白血病(AML)细胞中的表达及其预后意义。方法抽取34例AML及10例非恶性血液病患者骨髓,提取总RNA并逆转录成cDNA,SYBR Green I实时定量PCR法检测各基因 mRNA表达水平,采用2-△Ct公式计算基因 mRNA相对表达量。结果AML患者组PDCD7 mRNA表达水平均显著高于对照组(Z=-2.213,P=0.027)。除M1(1例)、M2a(2例)外的AML各亚型基因表达同对照组比较,APP mRNA在伴有t(8,21)染色体异常的M2表达显著高于对照组(Z=-2.197,P=0.028),而在M4b和M5b中的表达则显著低于对照组(Z=-2.368,P=0.018)。APP mRNA在AML亚型间表达有差异,M2显著高于M4和M5(Z=-2.430,P=0.015;Z=-3.175,P=0.001)。结论AML患者高表达PDCD7基因,单核细胞白血病患者低表达APP基因。 展开更多

关键词 白血病 髓系 急性 基因表达 淀粉样前体蛋白 裂殖1同源物 细胞程序性死亡7

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靶向沉默巨噬细胞中 Mcl-1基因 shRNA表达质粒的构建与鉴定 被引量：2

4

作者 王婵 王新敏 +6 位作者 王飞雨 张雨晴 曹旭东 吴江东 吴芳 张万江 章乐 《西安交通大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2015年第4期558-564,共7页

目的研究髓样细胞白血病-1(myeloid cell leukemia-1,Mcl-1)基因在小鼠巨噬细胞Raw264.7和人巨噬细胞THP-1中的表达情况,筛选出表达含量高的细胞株作为实验用细胞,根据筛选的结果构建靶向小鼠Mcl-1基因的短发夹RNA(shRNA)真核表达质粒... 目的研究髓样细胞白血病-1(myeloid cell leukemia-1,Mcl-1)基因在小鼠巨噬细胞Raw264.7和人巨噬细胞THP-1中的表达情况,筛选出表达含量高的细胞株作为实验用细胞,根据筛选的结果构建靶向小鼠Mcl-1基因的短发夹RNA(shRNA)真核表达质粒进行转染,最后筛选出沉默Mcl-1基因效果最明显的shRNA表达质粒。方法利用半定量RT-PCR和蛋白质免疫印迹(Western blotting)分别检测两种巨噬细胞中Mcl-1mRNA和蛋白表达情况。采用小分子干扰RNA(siRNA)软件设计3个针对Mcl-1基因不同位点的shRNA片段,由公司构建携带此shRNA片段的真核表达质粒(Mcl-1shRNA1-3),然后通过脂质体将真核表达质粒载体转染到小鼠巨噬细胞株Raw264.7中,24、48h后通过倒置荧光显微镜观察转染效果,并分别采用实时定量PCR和Western blot检测Mcl-1mRNA和蛋白表达情况。结果小鼠巨噬细胞Raw264.7中Mcl-1的mRNA及蛋白质的表达显著高于人巨噬细胞,差异有统计学意义(P<0.05);构建的shRNA表达载体在24、48h均能降低Raw264.7细胞内mcl-1mRNA和蛋白水平,尤其在48h沉默效果最为明显;转染48h后与正常组、脂质体组和阴性对照组相比,差异有统计学意义(P<0.05);与Mcl-1shRNA1和Mcl-1shRNA2相比,Mcl-1shRNA3对Mcl-1mRNA和蛋白的沉默作用最强。结论成功筛选出了实验所用细胞Raw264.7及对小鼠巨噬细胞Raw264.7内Mcl-1具有明显沉默效果的靶向Mcl-1shRNA3真核表达质粒。 展开更多

关键词 髓细胞白血病-1基因 RAW264.7细胞 THP-1细胞 结核分枝杆菌 短发夹RNA

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lncRNA HCG18调控miR-324-5p/GLI1轴在急性髓系白血病细胞增殖和侵袭中的作用机制 被引量：4

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作者 刘敏 雷荟融 +2 位作者 成延娟 唐元艳 黄知平 《医学研究生学报》 CAS 北大核心 2022年第5期485-492,共8页

目的长链非编码RNA人类白细胞抗原复合体18(lncRNA HCG18)调对急性髓系白血病(AML)的作用机制尚不清楚。探讨lncRNA HCG18控微小RNA-324-5p(miR-324-5p)/胶质瘤相关基因同源蛋白1(GLI1)轴对AML细胞增殖、迁移与侵袭的影响。方法选择2017... 目的长链非编码RNA人类白细胞抗原复合体18(lncRNA HCG18)调对急性髓系白血病(AML)的作用机制尚不清楚。探讨lncRNA HCG18控微小RNA-324-5p(miR-324-5p)/胶质瘤相关基因同源蛋白1(GLI1)轴对AML细胞增殖、迁移与侵袭的影响。方法选择2017年1月-2021年3月在本院血液科住院治疗的AML患者35例作为研究对象(AML组),另选取同期在本院治疗并进行骨髓穿刺检查的非血液系统肿瘤性疾病患者30例作为对照组,实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测所有入选人员骨髓单个核细胞中lncRNA HCG18与miR-324-5p的表达。体外培养AML细胞HL-60,将细胞分为对照组、si-NC组、lncRNA HCG18 siRNA组、miR-NC组、miR-324-5p mimics组、miR-324-5p mimics+GLI1 NC组、miR-324-5p mimics+GLI1组、lncRNA HCG18 siRNA+NC inhibitor组、lncRNA HCG18 siRNA+miR-324-5p inhibitor组,分别检测检测HL-60细胞中lncRNA HCG18、miR-324-5p表达、HL-60细胞增殖、迁移与侵袭及GLI1、细胞周期蛋白D1(Cyclin D1)、基质金属蛋白酶(MMP)-2和MMP-9蛋白表达。双荧光素酶报告系统分析miR-324-5p与lncRNA HCG18、GLI1的靶向关系。结果与对照组比较,AML组患者骨髓单个核细胞中lncRNA HCG18表达水平(2.85±0.32)较对照组(1.03±0.11)显著升高(P<0.01),而miR-324-5p表达水平(0.47±0.05)较对照组(1.05±0.09)显著降低(P<0.01);沉默lncRNA HCG18表达或过表达miR-324-5p后HL-60细胞增殖、细胞迁移与侵袭数、Cyclin D1、MMP-2、MMP-9蛋白表达显著降低(P<0.05);双荧光素酶报告基因实验显示,miR-324-5p与lncRNA HCG18、GLI1均有靶向关系;抑制miR-324-5p表达可逆转沉默lncRNA HCG18表达对HL-60细胞增殖、迁移与侵袭的抑制作用;GLI1过表达可逆转过表达miR-324-5p对HL-60细胞增殖、迁移与侵袭的抑制作用。结论lncRNA HCG18在AML细胞中高表达,抑制lncRNA HCG18表达可通过调控miR-324-5p/GLI1轴抑制AML细胞增殖、迁移与侵袭。 展开更多

关键词 长链非编码RNA人类白细胞抗原复合体18 微小RNA-324-5p 胶质瘤相关基因同源蛋白1 急性髓系白血病 增殖 侵袭

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shRNA干扰沉默Mcl-1基因对淋巴瘤细胞系增殖的影响 被引量：1

6

作者 岳光星 张明智 +6 位作者 张旭东 许伟朋 陈新峰 陈昱丞 曹玲 杨黎 盛誉乔 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第12期1210-1213,共4页

目的研究慢病毒介导的髓细胞白血病基因(Mcl-1)短发夹状RNA(shRNA)干扰对淋巴瘤细胞系SNK-6增殖和凋亡的影响。方法设计以Mcl-1为靶点的shRNA并构建携带此shRNA的慢病毒载体,转染淋巴瘤细胞系SNK-6,荧光定量PCR(qPCR)及Western blot方... 目的研究慢病毒介导的髓细胞白血病基因(Mcl-1)短发夹状RNA(shRNA)干扰对淋巴瘤细胞系SNK-6增殖和凋亡的影响。方法设计以Mcl-1为靶点的shRNA并构建携带此shRNA的慢病毒载体,转染淋巴瘤细胞系SNK-6,荧光定量PCR(qPCR)及Western blot方法检测病毒感染前后Mcl-1 mRNA及蛋白表达变化,四甲基偶氮唑盐法(MTT法)和流式细胞仪分析细胞增殖和凋亡变化的情况。结果成功构建Mcl-1-shRNA慢病毒表达载体,并可有效感染淋巴瘤细胞株SNK-6,感染后SNK-6细胞Mcl-1基因的mRNA水平及蛋白水平表达明显下调,MTT法检测显示慢病毒介导的Mcl-1基因shRNA干扰与对照病毒组相比可明显抑制SNK-6细胞增殖[(31.6±3.3)%vs(5.8±2.7)%,P<0.01],流式细胞仪测定感染后细胞凋亡明显高于对照病毒组[(28.9±2.1)%vs(5.3±1.5)%,P<0.01]。结论慢病毒介导的Mcl-1基因shRNA干扰技术可特异性阻断SNK-6细胞Mcl-1基因的表达,抑制细胞的增殖并促进细胞的凋亡。 展开更多

关键词 淋巴瘤 髓细胞白血病基因-1 短发夹RNA 凋亡 慢病毒载体

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人髓样细胞触发性受体-1在急性梗阻性化脓性胆管炎外周血单核细胞中的表达 被引量：6

7

作者 廖锐 刘作金 +3 位作者 龚建平 魏思东 徐发良 陈蓁臻 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第11期2179-2181,共3页

目的研究髓样细胞触发性受体(TREM)-1在急性梗阻性化脓性胆管炎(AOSC)患者外周血单核细胞(PBMC)中表达的规律及其临床意义。方法分别收集36例AOSC患者(实验组)和40例正常人(对照组)外周血单核细胞,以半定量RT-PCR检测单核细胞中TREM-1 m... 目的研究髓样细胞触发性受体(TREM)-1在急性梗阻性化脓性胆管炎(AOSC)患者外周血单核细胞(PBMC)中表达的规律及其临床意义。方法分别收集36例AOSC患者(实验组)和40例正常人(对照组)外周血单核细胞,以半定量RT-PCR检测单核细胞中TREM-1 mRNA表达;免疫细胞化学检测单核细胞中TREM-1蛋白表达;ELISA检测患者外周血中TNF-表达水平,免疫透射比浊法测C反应蛋白。结果对照组和实验组TREM-1 mRNA半定量比值分别为0.457±0.053和1.007±0.252(P<0.05)。免疫细胞化学观察结果示实验组TREM-1蛋白阳性表达率与对照组之间差异显著(P<0.01)。实验组TNF-和C反应蛋白水平均高于对照组(P<0.01)。结论人TREM-1在急性梗阻性化脓性胆管炎发病初表达明显升高,提示TREM-1在急性梗阻性化脓性胆管炎的发生中可能起重要作用。 展开更多

关键词 髓样细胞触发性受体-1 急性梗阻性化脓性胆管炎 外周血单核细胞 基因表达

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人MCL1基因表达载体的构建及在293细胞中的表达

8

作者 郭维维 杨卫平 +2 位作者 马龙 许阳 胡博华 《中华耳科学杂志》 CSCD 2010年第4期466-469,共4页

目的构建含有人髓细胞白血病基因-1(myeloid cell leukemia-1,MCL1)和绿色荧光蛋白基因(pEGFP)的真核共表达载体,为聋病的基因治疗奠定实验基础。方法应用基因重组技术和限制性内切酶酶切,及基因测序方法,构建并鉴定pEGFP-MCL1真核表达... 目的构建含有人髓细胞白血病基因-1(myeloid cell leukemia-1,MCL1)和绿色荧光蛋白基因(pEGFP)的真核共表达载体,为聋病的基因治疗奠定实验基础。方法应用基因重组技术和限制性内切酶酶切,及基因测序方法,构建并鉴定pEGFP-MCL1真核表达质粒。经脂质体介导转染293细胞系,荧光显微镜下观察pEGFP-MCL1真核表达质粒在293细胞系中的表达,利用逆转录-聚合酶链反应(Reverse transcription polymerase chain reaction,RT-PCR)检测MCL1mRNA的表达,Western Blot(蛋白质印迹)方法检测MCL1蛋白的表达。结果阳性重组子经酶切鉴定含有MCL1基因片段,基因测序结果与GenBank中MCL1序列相同。重组pEGFP-MCL1真核表达质粒转入293细胞系后24小时,荧光显微镜下可见绿色荧光表达,RT-PCR能够扩增出MCL1的条带,Western Blot检测出40kDa大小的蛋白。结论成功地构建了含有人全长MCL1基因和pEGFP基因的真核共表达载体,且能在哺乳动物293细胞系中表达。 展开更多

关键词 mcl1基因(髓样细胞白血病-1基因) 质粒 基因治疗

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结直肠癌中MCL-1基因的研究进展 被引量：1

9

作者 罗灵芝 张雨涛 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第5期595-598,共4页

髓样细胞白血病-1(myeloid cell leukemia-1,MCL-1)广泛表达于人类正常组织中,在细胞分化和凋亡中起重要作用,主要功能是维持线粒体膜稳定,抑制细胞色素C释放,从而阻止凋亡发生,促进细胞生存。MCL-1在一些恶性肿瘤中高表达,促进肿瘤发... 髓样细胞白血病-1(myeloid cell leukemia-1,MCL-1)广泛表达于人类正常组织中,在细胞分化和凋亡中起重要作用,主要功能是维持线粒体膜稳定,抑制细胞色素C释放,从而阻止凋亡发生,促进细胞生存。MCL-1在一些恶性肿瘤中高表达,促进肿瘤发生、发展并诱导肿瘤细胞对化疗药物产生抵抗作用。MCL-1在结直肠癌(colorectal cancer,CRC)中的表达高于正常肠黏膜和腺瘤组织,抑制肿瘤细胞凋亡和促进血管生成,并与CRC的预后和远处转移等相关。多种抗肿瘤药物通过调节MCL-1的表达,影响其疗效及耐药性。 展开更多

关键词 结直肠肿瘤 髓样细胞白血病-1基因 病理机制 文献综述

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丙戊酸钠诱导K562细胞周期阻滞和凋亡并上调p^21WAF1基因mRNA的表达 被引量：6

10

作者 张祥忠 尹爱华 +4 位作者 刘建华 朱小玉 何敏 丁倩 陈运贤 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第9期1726-1729,共4页

目的:探讨丙戊酸钠(VPA)对慢性粒细胞白血病急变期细胞株(K562细胞)细胞周期和凋亡的影响及其可能机制。方法:利用流式细胞仪检测药物处理后的细胞周期和细胞凋亡情况;利用RT-PCR方法检测p21WAF1基因的mRNA的表达。结果:VPA引起K562细... 目的:探讨丙戊酸钠(VPA)对慢性粒细胞白血病急变期细胞株(K562细胞)细胞周期和凋亡的影响及其可能机制。方法:利用流式细胞仪检测药物处理后的细胞周期和细胞凋亡情况;利用RT-PCR方法检测p21WAF1基因的mRNA的表达。结果:VPA引起K562细胞凋亡增加[(11.47±0.25)%vs(4.77±0.40)%,(P<0.05)]和细胞周期阻滞在G0/G1期[(82.30±9.41)%vs(40.13±2.12)%,(P<0.05)]。同时处理后的细胞中p21WAF1基因mRNA的表达增加[(1.65±0.91)vs(0.25±0.04),P<0.05]。结论:VPA可能通过上调p21WAF1基因,导致K562细胞周期阻滞并引起细胞凋亡。 展开更多

关键词 丙戊酸 白血病 髓样 慢性 K562细胞 细胞周期 细胞凋亡 基因 P^21WAF1

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靶向Mcl-1的shRNA重组质粒的构建及其对HepG2细胞增殖和凋亡的影响 被引量：2

11

作者 余琴 陈琼 +4 位作者 黄焕军 宋宇虎 常莹 田德安 林菊生 《华中科技大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期158-161,共4页

目的设计以髓细胞白血病基因-1(Mcl-1)为靶点的短发夹状RNA(shRNA),构建携带此shRNA的重组质粒,探讨脂质体转染该重组质粒对肝癌细胞HepG2增殖及凋亡的影响。方法设计3对针对Mcl-1基因不同位点的shRNA片段的真核表达载体psi RNA-hH1neo-... 目的设计以髓细胞白血病基因-1(Mcl-1)为靶点的短发夹状RNA(shRNA),构建携带此shRNA的重组质粒,探讨脂质体转染该重组质粒对肝癌细胞HepG2增殖及凋亡的影响。方法设计3对针对Mcl-1基因不同位点的shRNA片段的真核表达载体psi RNA-hH1neo-Mcl,用阳离子脂质体法将重组质粒转染至人肝癌细胞株HepG2中,通过RT-PCR及Western blot方法检测转染前后Mcl-1 mRNA及蛋白表达情况,筛选能高效抑制Mcl-1基因表达的shRNA重组质粒并应用MTT和流式细胞仪分析转染后细胞增殖和凋亡变化的情况。结果成功构建含shRNA片段的重组质粒,依次命名为pMclsi-1、pMclsi-2、pMclsi-3。经测序证实,插入的DNA片段的序列与设计序列完全一致。重组质粒转染HepG2细胞后,Mcl-1基因的mRNA水平及蛋白水平明显下调,其中以pMclsi-1重组质粒下调效应最强。MTT检测显示pMclsi-1可明显抑制HepG2细胞增殖,流式细胞仪测定转染后24 h细胞凋亡率为6.5%,48 h细胞凋亡率为15.6%,显著高于对照组(3.9%,P<0.05)。结论采用RNAi技术可特异阻断Mcl-1基因的表达,Mcl-1基因有促进细胞增生及抑制凋亡的作用。 展开更多

关键词 髓细胞白血病基因-1 短发夹状RNA 细胞增殖 细胞凋亡

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慢病毒介导的mcl-1-shRNA对食管癌细胞生长和化疗敏感性影响 被引量：3

12

作者 林锐 张旭东 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第1期23-28,共6页

目的观察慢病毒介导的shRNA沉默mcl-1基因对食管癌细胞生长作用以及化疗敏感性影响。方法利用已构建的携带mcl-1-shRNA的慢病毒载体lenti-mcl-1-shRNA感染食管癌细胞EC9706细胞系,应用RT-PCR和Western blot技术检测其对食管癌细胞mcl-1... 目的观察慢病毒介导的shRNA沉默mcl-1基因对食管癌细胞生长作用以及化疗敏感性影响。方法利用已构建的携带mcl-1-shRNA的慢病毒载体lenti-mcl-1-shRNA感染食管癌细胞EC9706细胞系,应用RT-PCR和Western blot技术检测其对食管癌细胞mcl-1表达水平的影响;应用MTT和流式细胞技术检测其对食管癌细胞的生长作用、增殖和凋亡及化疗敏感性影响。结果感染慢病毒lenti-mcl-1-shRNA后,mcl-1 mRNA和蛋白表达水平明显下降;MTT结果显示,重组慢病毒lenti-mcl-1-shRNA可以有效抑制EC9706细胞的生长增殖,抑制率为50%,明显高于对照组(P<0.05)。流式细胞分析显示,mcl-1-shRNA可以诱导EC9706细胞凋亡,从而影响食管癌细胞的生长。另外与对照组相比,感染重组慢病毒lenti-mcl-1-shRNA后,可以明显增加顺铂对食管癌细胞的生长抑制率,提高药物敏感性(P<0.05)。结论慢病毒载体lenti-mcl-1-shRNA可有效抑制mcl-1在食管癌细胞中的表达,诱导细胞凋亡,抑制细胞生长增殖,并增加食管癌细胞对顺铂的药物敏感性。 展开更多

关键词 食管肿瘤 髓细胞白血病-1基因 RNA干扰 慢病毒 化疗敏感性

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成人与儿童急性髓系白血病患者肿瘤免疫相关的差异表达基因分析 被引量：1

13

作者 李玲玲 李倩 +2 位作者 李明玉 刘峥 沈倩诚 《上海交通大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2021年第5期579-587,共9页

目的·分析成人与儿童急性髓系白血病(acute myeloid leukemia,AML)患者骨髓中肿瘤免疫相关的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)。方法·从GEO(Gene Expression Omnibus)数据库下载GSE134589数据集,选取初次确... 目的·分析成人与儿童急性髓系白血病(acute myeloid leukemia,AML)患者骨髓中肿瘤免疫相关的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)。方法·从GEO(Gene Expression Omnibus)数据库下载GSE134589数据集,选取初次确诊/复发状态的患者,按年龄分为儿童组(0~16岁,34例)、中青年组(17~59岁,62例)和老年组(60~80岁,62例),用R语言程序包筛选不同组患者骨髓样本中肿瘤免疫相关的DEGs。选取中青年组与儿童组,老年组与儿童组共同的DEGs,与完全缓解状态的成人与儿童患者的DEGs进行比对,并进行功能富集分析。利用Kaplan-Meier法筛选与预后显著相关的基因,通过构建蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络筛选核心调控基因,将以上2种方法筛选出的基因视为关键基因。用GEPIA服务器对比关键基因在AML、弥漫大B细胞淋巴瘤(diffuse large B cell lymphoma,DLBCL)和胸腺癌的肿瘤样本与正常人样本的表达量,在GEXC网站分析关键基因在AML患者肿瘤干细胞和健康人的原始造血细胞中mRNA的表达情况。结果·GSE134589数据集中,中青年组与儿童组比,上调的DEGs有51个,下调的有21个;老年组与儿童组比,上调的DEGs有47个,下调的有20个;而中青年组与老年组比,没有发现DEG。筛选了中青年组和老年组共同的肿瘤免疫相关DEGs 57个,其中上调有39个,下调有18个,仅有3个基因的表达水平差异在疾病完全缓解时仍有统计学意义。57个共同DEGs主要富集在白细胞迁移和细胞因子介导的信号通路,其中白细胞介素2受体α亚基(interleukin-2 receptor subunit alpha,IL2RA)、FMS-样酪氨酸激酶3(FMS-like tyrosine kinase 3,FLT3)高表达的患者与低表达的患者相比总体生存期显著缩短(均P<0.05),补体成分3a受体1(complement component 3a receptor 1,C3AR1)是PPI网络的核心调控基因。这3个基因作为关键基因,均在AML肿瘤样本特异性高表达(均P<0.05),IL2RA还在DLBCL患者样本中显著高表达(P<0.05)。IL2RA在AML肿瘤干细胞和健康人的原始造血细胞中均低表达,FLT3均高表达,而C3AR1的表达在AML肿瘤干细胞特异性升高。结论·成人与儿童AML患者预后的差异可能与骨髓中肿瘤免疫相关基因表达的差异有关,其中IL2RA、FLT3和C3AR1可能是发挥重要作用的关键基因。 展开更多

关键词 急性髓系白血病 肿瘤免疫 差异表达基因 白细胞介素2受体α亚基 FMS-样酪氨酸激酶3 补体成分3a受体1

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C3AR1基因对K562细胞增殖及侵袭影响的机制研究

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作者 李娟 封忠昕 《中国全科医学》 CAS 北大核心 2017年第A01期81-83,共3页

目的探讨C3AR1基因对慢性髓性白血病细胞株K562细胞增殖及侵袭的影响和作用机制。方法构建HL-60-C3AR1过表达的K562细胞株并使其稳转表达,通过反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)和Western blotting检测C3AR1的mRNA和蛋白表达水平,采用CCK8... 目的探讨C3AR1基因对慢性髓性白血病细胞株K562细胞增殖及侵袭的影响和作用机制。方法构建HL-60-C3AR1过表达的K562细胞株并使其稳转表达,通过反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)和Western blotting检测C3AR1的mRNA和蛋白表达水平,采用CCK8法检测转染后细胞的增殖,通过trans well实验评估其侵袭性,通过PCR芯片表达对比分析其可能的机制。结果 K562-C3AR1的C3AR1 mRNA表达和C3AR1蛋白表达量均显著高于K562和K562-Scramble组(P<0.05),过表达C3AR1的细胞增殖性和细胞侵袭性显著高于K562和K562-Scramble组(P<0.05),PCR芯片检测显示共有7个基因表达增高和4个基因表达下调可能参与K562-C3AR1相对K562发生增殖及侵袭的相关基因。结论本研究表明了C3AR1基因对K562细胞具有重要的调控作用,过表达C3AR1基因能促进K562细胞增殖及侵袭,其具体机制可能与DBH和EPS8等基因有关。 展开更多

关键词 白血病 髓样 C3AR1基因 细胞增殖 肿瘤侵润

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日本蟾蜍MCL-1 cDNA的克隆及生物信息学分析 被引量：6

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作者 张姝芳 袁进强 +3 位作者 黄慧 诸葛慧 徐跃 杨仙玉 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期179-184,共6页

克隆日本蟾蜍(Bufo japonicus formosus)髓细胞白血病基因-1(myeloid cell leukemia-1,mcl-1),并进行序列分析。通过菌落PCR对日本蟾蜍皮肤cDNA质粒文库筛选获得目的基因。运用生物信息学方法对该基因进行分析,预测其编码蛋白的结构和... 克隆日本蟾蜍(Bufo japonicus formosus)髓细胞白血病基因-1(myeloid cell leukemia-1,mcl-1),并进行序列分析。通过菌落PCR对日本蟾蜍皮肤cDNA质粒文库筛选获得目的基因。运用生物信息学方法对该基因进行分析,预测其编码蛋白的结构和功能。序列分析表明mcl-1基因(GenBank登录号为JX219482)的cDNA全长为1 090 bp,5′端和3′端非翻译区域分别为19bp和432 bp,ORF由639个碱基组成,编码由212个氨基酸残基组成的蛋白质。经氨基酸序列同源性比对发现,日本蟾蜍与非洲爪蟾(Xenopus laevis)的同源性为60%,与其他7种动物的同源性在38%-55%之间。MCL-1氨基酸序列构建的进化树与传统动物分类学相符。日本蟾蜍MCL-1与人类同源蛋白具有相似的结构特征,对其cDNA序列的进一步分析,将为研究其生物学功能和药物研发奠定基础。 展开更多

关键词 日本蟾蜍 髓细胞白血病基因-1 基因克隆 序列分析

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干扰素α、5-AZA-CdR对白血病细胞HL-60和K562的作用 被引量：6

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作者 黄云燕 夏焱 +1 位作者 郭海霞 李文益 《中山大学学报（医学科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2007年第3期274-278,共5页

【目的】探讨细胞因子干扰素α(INFα)和甲基化抑制剂5-杂氮脱氧胞嘧啶核苷(5-AZA-CdR)对白血病细胞HL-60和K562的作用机制。【方法】1000U/mL INFα和不同剂量的5-AZA-CdR作用于HL-60和K562 48h,通过RT-PCR检测Xaf1和XIAP mRNA的表达,... 【目的】探讨细胞因子干扰素α(INFα)和甲基化抑制剂5-杂氮脱氧胞嘧啶核苷(5-AZA-CdR)对白血病细胞HL-60和K562的作用机制。【方法】1000U/mL INFα和不同剂量的5-AZA-CdR作用于HL-60和K562 48h,通过RT-PCR检测Xaf1和XIAP mRNA的表达,流式细胞技术检测Bcl-2家族成员、线粒体膜电位(Δψm)和细胞凋亡的情况。【结果】INFα和5-AZA-CdR使HL-60和K562 Xaf1 mRNA表达增加,且与5-AZA-CdR呈剂量依赖性,其中5-AZA-CdR(5μmol/L)的作用最明显;XIAP mRNA表达无变化。INFα使HL-60和K562 Bax表达增加,Bcl-2和Bcl-xl表达无改变;5-AZA-CdR降低HL-60 Bcl-2、Bcl-xl、Bax表达,增加K562 Bax表达,不影响K562 Bcl-2和Bcl-xl。INFα和5-AZA-CdR都能使线粒体膜电位降低、细胞凋亡增加。除细胞凋亡外INFα和5-AZA-CdR对HL-60和K562的Xaf1 mRNA、Bcl-2家族成员以及Δψm无协同作用。【结论】INFα和5-AZA-CdR促进HL-60和K562细胞凋亡,其作用机制可能与上调Xaf1 mRNA的表达,下调Bcl-2(Bcl-xl)/Bax和降低线粒体膜电位有关。 展开更多

关键词 白血病 髓样 干扰素刺激基因 5-杂氮脱氧胞嘧啶核苷 甲基化 XAF1

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人类肺癌组织中COX-2的表达及其与K-ras和Mcl-1表达的关系 被引量：4

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作者 宋文静 王新允 郑宏伟 《中国肺癌杂志》 CAS 2009年第3期216-221,共6页

背景与目的环氧化酶-2(Cyclooxygenase-2,COX-2)是花生四烯酸代谢限速酶的一个亚型,已发现COX-2与肿瘤的发生、发展和转移有关。本文旨在探讨肺癌组织中COX-2表达的临床病理学意义,及其与K-ras和Mcl-1表达的相互关系。方法应用免疫组织... 背景与目的环氧化酶-2(Cyclooxygenase-2,COX-2)是花生四烯酸代谢限速酶的一个亚型,已发现COX-2与肿瘤的发生、发展和转移有关。本文旨在探讨肺癌组织中COX-2表达的临床病理学意义,及其与K-ras和Mcl-1表达的相互关系。方法应用免疫组织化学染色及图像分析系统检测COX-2、K-ras和Mcl-1在101例肺癌及7例正常肺组织中的表达。结果COX-2在非小细胞肺癌组织中高表达(P<0.05),以腺癌表达最高;在周围型肺癌(P<0.05)及中晚期肺癌组织中高表达(P<0.05);并且COX-2的表达与K-ras和Mcl-1的表达呈正相关。结论COX-2的表达与K-ras的基因突变和Mcl-1的表达上调有关,在肺癌的分化、进展过程中具有重要作用。 展开更多

关键词 肺肿瘤 环氧化酶-2 K-ras癌基因 髓细胞白血病因子-1 免疫组织化学 图像分析

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