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分子模拟在筛选HLA-A2.1高亲和性MART-1 CTL表位中的应用研究 被引量:2
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作者 王莉 吴玉章 +1 位作者 林治华 石统东 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第10期1166-1168,共3页
目的 探讨计算机分子模拟在CTL表位与HLA A2 1亲和力特性研究中的应用价值。方法 应用SiliconGraphics图像工作站及InsightⅡ软件 ,分别建立MART 16个CTL预测表位与HLA A2 1结合的三维结构 ,并进行分子动力学模拟 ,通过对各结合特... 目的 探讨计算机分子模拟在CTL表位与HLA A2 1亲和力特性研究中的应用价值。方法 应用SiliconGraphics图像工作站及InsightⅡ软件 ,分别建立MART 16个CTL预测表位与HLA A2 1结合的三维结构 ,并进行分子动力学模拟 ,通过对各结合特征性参数的计算 ,对各表位肽与HLA A2 1结合稳定性进行了比较。应用Merrifield固相多肽合成技术合成上述小肽 ,通过HLA A2 1与各肽亲和力分析试验 ,证实分子模拟结果的可靠性。结果 通过分子模拟手段计算所得 6个表位与HLA A2 1结合特性结果 ,基本与通过实验手段所得结果相符。结论 计算机分子模拟在CTL表位与MHC Ⅰ类分子的亲和力研究中 ,具有简单、直观、快速、准确等优点 ,该方法在筛选MHC Ⅰ类分子高亲和性CTL表位的研究中具有诱人的应用前景。 展开更多
关键词 mart-1 CTL表位 分子动力学模拟 结合亲和力分析 肿瘤免疫治疗 肿瘤抗原
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MART-1HLA-A2限制性CTL表位的预测
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作者 王莉 吴玉章 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第10期931-933,共3页
目的 预测黑色素瘤分化抗原MART 1的HLA A2限制性细胞毒性T淋巴细胞 (CTL)表位。方法 采用超基序与量化基序多项式方案相结合的办法 ,对目的抗原MART 1的HLA A2限制性CTL表位进行预测。结果 预测出了 6个九肽表位。结论 两种方法预... 目的 预测黑色素瘤分化抗原MART 1的HLA A2限制性细胞毒性T淋巴细胞 (CTL)表位。方法 采用超基序与量化基序多项式方案相结合的办法 ,对目的抗原MART 1的HLA A2限制性CTL表位进行预测。结果 预测出了 6个九肽表位。结论 两种方法预测结果的一致性较好 ,所预测出的 6个MART 1的HLA A2限制性CTL表位经后续实验筛选、鉴定后 ,可望用于新型MART 1肿瘤治疗性多肽疫苗的设计研究 。 展开更多
关键词 mart-1 HLA-A2 CTL表位 多肽疫苗 黑色素瘤
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Brn-2在人脉络膜黑色素瘤细胞系中的表达及其对MART-1基因启动子活性的影响
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作者 王应利 周玉梅 +2 位作者 陶俊 靳扬扬 陈冉 《眼科新进展》 CAS 北大核心 2018年第9期837-841,共5页
目的探讨黑色素抗原转录子Brn-2在人脉络膜黑色素瘤细胞系中的表达及其对T细胞可识别抗原-1(melanoma antigen recognized by T cells 1,MART-1)启动子活性的影响。方法采用RT-PCR和Western blot检测人脉络膜黑色素瘤细胞系92-1、92-2、... 目的探讨黑色素抗原转录子Brn-2在人脉络膜黑色素瘤细胞系中的表达及其对T细胞可识别抗原-1(melanoma antigen recognized by T cells 1,MART-1)启动子活性的影响。方法采用RT-PCR和Western blot检测人脉络膜黑色素瘤细胞系92-1、92-2、Me1285和Ocm3细胞中Brn-2的mRNA和蛋白表达水平。将含不同长度MART-1基因启动子序列和荧光素酶报告基因的表达质粒p GL3-Luc构建成融合表达载体p GL3-p286-Luc及p GL3-p2956-Luc,与p EV-Brn-2融合表达质粒共转染脉络膜黑色素瘤细胞系细胞。分别测量四种细胞系中p286组、p2956组、p286+Brn-2组、p2956+Brn-2组细胞荧光素酶表达变化,并观察Brn-2对上述细胞MART-1基因启动子活性的影响。结果人脉络膜黑色素瘤细胞系92-1、92-2、Me1285、Ocm3细胞系均可检测到Brn-2 mRNA和蛋白的表达,Brn-2蛋白电泳带大致在相对分子质量47 000处。p GL3-p2956-Luc及p GL3-p286-Luc重组质粒经Apa I和Nhe I双酶切可切出2956 bp和286 bp 2个条带,p EV-Brn-2重组质粒经EcoRI和Bam HI双酶切可切出1329 bp条带。p EV-Brn-2重组质粒分别对人脉络膜黑色素瘤细胞系Ocm3、Mel285、92-2、92-1进行磷酸钙法转染,Western blot检测可见四种细胞系均表达Brn-2蛋白。缺乏Brn-2时,所有细胞的MART-1的p286均显示出活性,MART-1阳性细胞系(92-1、92-2、Ocm3)p286活性高于阴性细胞系(Mel285)。p2956活性不同细胞系表现不同,92-1、92-2中较高,Ocm3中其活性与细胞密度相关,MART-1阴性细胞系中p2956近乎无活性。共转染Brn-2后明显下调92-1、92-2、Ocm3中启动子p286及p2956活性(P<0.05);阴性细胞系Mel285中,Brn-2对启动子活性无影响(P>0.05)。结论 Brn-2表达于人脉络膜黑色素瘤细胞,并下调阳性细胞系MART-1启动子活性。 展开更多
关键词 Brn-2 mart-1基因启动子 脉络膜黑色素瘤细胞系
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分子模拟用于HLA-A2.1限制性CTL表位的高通量筛选 被引量:1
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作者 林治华 全学军 周跃钢 《重庆工学院学报》 2003年第2期6-9,共4页
应用SiliconGraphics图像工作站及InsightⅡ软件,分别建立MART 1的6个CTL预测表位与HLA A2.1结合的三维结构,并进行分子动力学模拟,通过对各结合特征性参数的计算,对各表位肽与HLA A2.1结合稳定性进行了比较。应用Merrifield固相多肽合... 应用SiliconGraphics图像工作站及InsightⅡ软件,分别建立MART 1的6个CTL预测表位与HLA A2.1结合的三维结构,并进行分子动力学模拟,通过对各结合特征性参数的计算,对各表位肽与HLA A2.1结合稳定性进行了比较。应用Merrifield固相多肽合成技术合成上述小肽,通过HLA A2.1与各肽亲和力分析试验,证实分子模拟结果的可靠性。结果发现通过分子模拟手段计算所得6个表位与HLA A2.1结合特性结果,基本与通过实验手段所得结果相符。故计算机分子模拟在CTL表位与MHC Ⅰ类分子的亲合力研究中,具有简单、直观、快速、准确等优点,该方法在筛选MHC Ⅰ类分子高亲合性CTL表位的研究中具有诱人的应用前景。 展开更多
关键词 分子动力学模拟 mart-1 三维结构 CTL表位 HLA-A2.1 亲和力 MHC-I类分子 细腻毒性T细腻 肿瘤特异性免疫治疗 抗原
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硬化型上皮样血管肌脂肪瘤
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作者 Matsuyama A Hisaoka M +1 位作者 Ichikawa K 张仁亚(摘译) 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期190-190,共1页
关键词 血管周上皮样 血管肌脂肪瘤 硬化型 HMB-45 腹膜后肿瘤 结节性硬化症 DESMIN mart-1
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