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北京油鸡Lmbr1基因第16外显子SNPs与多趾性状的相关性研究
被引量：
3
1
作者
杨艳
刘华贵
赵兴波
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2011年第5期114-117,共4页
将Lmbr1基因作为鸡多趾研究的候选基因,寻找与多趾有关的SNPs并进行相关性分析研究。通过PCR-SSCP及直接测序,在北京油鸡(四趾/五趾)Lmbr1基因第16外显子检测到2个位点存在同义突变(c.1326A>G和c.1360C>A),5种基因型(AABB、aaBB、...
将Lmbr1基因作为鸡多趾研究的候选基因,寻找与多趾有关的SNPs并进行相关性分析研究。通过PCR-SSCP及直接测序,在北京油鸡(四趾/五趾)Lmbr1基因第16外显子检测到2个位点存在同义突变(c.1326A>G和c.1360C>A),5种基因型(AABB、aaBB、AABb、AaBb、AaBB)。对c.1326A>G、c.1360C>A两位点在不同趾型的基因频率及基因型进行统计分析,结果发现,在c.1326A>G位点,双五趾和混合趾中a为优势等位基因(0.83、0.81),双四趾中A为优势等位基因(0.53),双五趾和混合趾中aa为优势基因型(0.650、0.625),双四趾中Aa为优势基因型(0.420),AA基因型仅出现在双四趾中,在双五趾和混合趾中没有发现。在c.1360C>A位点,双五趾、混合趾和双四趾中B均为优势等位基因(0.85、0.88、0.76);双五趾、混合趾和双四趾中BB均为优势基因型(0.692、0.750、0.516),在试验鸡群中没有发现bb基因型。在北京油鸡群体中,c.1326A>G等位基因处于Hardy-Weinberg非平衡状态(P<0.01),c.1360C>A等位基因处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。研究结果表明,c.1326A>G位点与鸡趾型密切相关,有望用于标记辅助选择。
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关键词
北京油鸡
多趾
lmbr1基因
单核苷酸多态性
相关性
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职称材料
猪Lmbr1基因部分cDNA序列的克隆及序列分析
2
作者
王金勇
白小青
+3 位作者
赵献之
范守城
李琴
刘文
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第11期1616-1620,共5页
利用RT—PCR和RACE方法克隆了正常猪和全同胞多趾猪Lmbr1基因部分cDNA序列并进行了序列分析。结果表明，正常猪该序列长1797bp，其中CDS序列1178bp，3’UTR序列619bp。全同胞多趾猪该序列长1069bp，其中CDS序列768bp，3’UTR序列301bp...
利用RT—PCR和RACE方法克隆了正常猪和全同胞多趾猪Lmbr1基因部分cDNA序列并进行了序列分析。结果表明，正常猪该序列长1797bp，其中CDS序列1178bp，3’UTR序列619bp。全同胞多趾猪该序列长1069bp，其中CDS序列768bp，3’UTR序列301bp。正常猪与多趾猪Lmbr1基因的CDS序列相似性近77％，而3’UTR序列相似性不足20％。两者的CDS序列在755～768bp间，共发生13个核苷酸突变：G755C、A756T、A757G、T758C、C759A、A760G、C761T、T762G、A763C、G764T、A765G、T767G、T768A。其中，前11个突变属于错义突变，导致相应的氨基酸序列中4个氨基酸发生变化：G突变为A、I突变为A、T突变为V、R突变为L；后2个突变属于无义突变，导致阅读框提前终止。猪Lmbrl基因发生突变能引起SHH的异常表达，这可能是导致猪多趾发生的根本原因。
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关键词
猪
lmbr1基因
RACE
突变
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职称材料
题名
北京油鸡Lmbr1基因第16外显子SNPs与多趾性状的相关性研究
被引量：
3
1
作者
杨艳
刘华贵
赵兴波
机构
北京市农林科学院畜牧兽医研究所
江西省畜牧技术推广站
江西农业大学动物科技学院
中国农业大学动物科技学院
出处
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2011年第5期114-117,共4页
基金
北京市科技合同项目"北京油鸡育种及其关键技术研究"
文摘
将Lmbr1基因作为鸡多趾研究的候选基因,寻找与多趾有关的SNPs并进行相关性分析研究。通过PCR-SSCP及直接测序,在北京油鸡(四趾/五趾)Lmbr1基因第16外显子检测到2个位点存在同义突变(c.1326A>G和c.1360C>A),5种基因型(AABB、aaBB、AABb、AaBb、AaBB)。对c.1326A>G、c.1360C>A两位点在不同趾型的基因频率及基因型进行统计分析,结果发现,在c.1326A>G位点,双五趾和混合趾中a为优势等位基因(0.83、0.81),双四趾中A为优势等位基因(0.53),双五趾和混合趾中aa为优势基因型(0.650、0.625),双四趾中Aa为优势基因型(0.420),AA基因型仅出现在双四趾中,在双五趾和混合趾中没有发现。在c.1360C>A位点,双五趾、混合趾和双四趾中B均为优势等位基因(0.85、0.88、0.76);双五趾、混合趾和双四趾中BB均为优势基因型(0.692、0.750、0.516),在试验鸡群中没有发现bb基因型。在北京油鸡群体中,c.1326A>G等位基因处于Hardy-Weinberg非平衡状态(P<0.01),c.1360C>A等位基因处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。研究结果表明,c.1326A>G位点与鸡趾型密切相关,有望用于标记辅助选择。
关键词
北京油鸡
多趾
lmbr1基因
单核苷酸多态性
相关性
Keywords
Beijing-fatty chicken
polydactyly
lmbr
1
gene
SNP
association
分类号
S813.3 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
猪Lmbr1基因部分cDNA序列的克隆及序列分析
2
作者
王金勇
白小青
赵献之
范守城
李琴
刘文
机构
重庆市畜牧科学院
重庆市科学技术信息中心
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第11期1616-1620,共5页
基金
重庆市重点自然基金(CSTC2005BA1009)
重庆市科技攻关重大项目(CSTC2006AA1008)
文摘
利用RT—PCR和RACE方法克隆了正常猪和全同胞多趾猪Lmbr1基因部分cDNA序列并进行了序列分析。结果表明，正常猪该序列长1797bp，其中CDS序列1178bp，3’UTR序列619bp。全同胞多趾猪该序列长1069bp，其中CDS序列768bp，3’UTR序列301bp。正常猪与多趾猪Lmbr1基因的CDS序列相似性近77％，而3’UTR序列相似性不足20％。两者的CDS序列在755～768bp间，共发生13个核苷酸突变：G755C、A756T、A757G、T758C、C759A、A760G、C761T、T762G、A763C、G764T、A765G、T767G、T768A。其中，前11个突变属于错义突变，导致相应的氨基酸序列中4个氨基酸发生变化：G突变为A、I突变为A、T突变为V、R突变为L；后2个突变属于无义突变，导致阅读框提前终止。猪Lmbrl基因发生突变能引起SHH的异常表达，这可能是导致猪多趾发生的根本原因。
关键词
猪
lmbr1基因
RACE
突变
Keywords
pig
lmbr
l gene
RACE
mutation
分类号
S828 [农业科学—畜牧学]
Q591.3 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
北京油鸡Lmbr1基因第16外显子SNPs与多趾性状的相关性研究
杨艳
刘华贵
赵兴波
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2011
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
猪Lmbr1基因部分cDNA序列的克隆及序列分析
王金勇
白小青
赵献之
范守城
李琴
刘文
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008
0
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职称材料
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