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基于DNA条形码对浙南岛屿日本花棘石鳖的遗传特征分析
被引量：
3
1
作者
吴晓雯
张华伟
+2 位作者
余海
彭欣
张永普
《海洋渔业》
CSCD
北大核心
2018年第3期265-278,共14页
采用COⅠ、16S rRNA两种分子标记对中国浙江南部沿海岛屿岩相潮间带日本花棘石鳖(Liolophura japonica)13个群体遗传特征和亲缘关系进行了探讨。结果显示:COⅠ基因片段长度为675 bp,16S rRNA基因长度为517 bp,A+T比例分别为62.5%和64.9%...
采用COⅠ、16S rRNA两种分子标记对中国浙江南部沿海岛屿岩相潮间带日本花棘石鳖(Liolophura japonica)13个群体遗传特征和亲缘关系进行了探讨。结果显示:COⅠ基因片段长度为675 bp,16S rRNA基因长度为517 bp,A+T比例分别为62.5%和64.9%。COⅠ基因总多态位点数为41个,单倍型多样性指数0.847,核苷酸多态性指数为0.006 01,平均核苷酸差异数为4.057 8;16S rRNA基因的总多态位点数为9个,单倍型多样性指数0.665,核苷酸多态性指数为0.001 69,平均核苷酸差异数为0.871 2。以Acanthopleura brevispinosa和A.granulata为外群构建了ML和BI系统发育树,其拓扑结构显示,基于COⅠ基因的日本花棘石鳖形成2个分支;基于16S rRNA基因的日本花棘石鳖群体仅聚合为一支。不同地理群体单倍型散乱分布,没有出现明显的地理结构和遗传谱系结构,表明各岛屿的日本花棘石鳖为近期分化并存在基因交流。
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关键词
日本花棘石鳖
COⅠ基因
16S
RRNA基因
遗传特征
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职称材料
题名
基于DNA条形码对浙南岛屿日本花棘石鳖的遗传特征分析
被引量：
3
1
作者
吴晓雯
张华伟
余海
彭欣
张永普
机构
温州大学生命与环境科学学院
浙江省海洋水产养殖研究所
苍南县水产研究所
出处
《海洋渔业》
CSCD
北大核心
2018年第3期265-278,共14页
基金
浙江省科技计划项目(2016F50031
2016F50036)
温州大学研究生创新基金项目(46)
文摘
采用COⅠ、16S rRNA两种分子标记对中国浙江南部沿海岛屿岩相潮间带日本花棘石鳖(Liolophura japonica)13个群体遗传特征和亲缘关系进行了探讨。结果显示:COⅠ基因片段长度为675 bp,16S rRNA基因长度为517 bp,A+T比例分别为62.5%和64.9%。COⅠ基因总多态位点数为41个,单倍型多样性指数0.847,核苷酸多态性指数为0.006 01,平均核苷酸差异数为4.057 8;16S rRNA基因的总多态位点数为9个,单倍型多样性指数0.665,核苷酸多态性指数为0.001 69,平均核苷酸差异数为0.871 2。以Acanthopleura brevispinosa和A.granulata为外群构建了ML和BI系统发育树,其拓扑结构显示,基于COⅠ基因的日本花棘石鳖形成2个分支;基于16S rRNA基因的日本花棘石鳖群体仅聚合为一支。不同地理群体单倍型散乱分布,没有出现明显的地理结构和遗传谱系结构,表明各岛屿的日本花棘石鳖为近期分化并存在基因交流。
关键词
日本花棘石鳖
COⅠ基因
16S
RRNA基因
遗传特征
Keywords
liolophura japonica
CO I gene
16S rRNA gene
genetic polymorphisms
分类号
S913 [农业科学—水产科学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
基于DNA条形码对浙南岛屿日本花棘石鳖的遗传特征分析
吴晓雯
张华伟
余海
彭欣
张永普
《海洋渔业》
CSCD
北大核心
2018
3
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