为探究枣抗缩果的相关调控机制,以蟠枣(京沧1号)果实为试验材料,对其进行转录组测序,分析蟠枣不同缩果程度之间的差异基因表达情况,筛选与蟠枣缩果相关的基因。转录组测序结果表明,3个比较组(ck vs CZS、ck vs QZS、CZS vs QZS)分别筛选...为探究枣抗缩果的相关调控机制,以蟠枣(京沧1号)果实为试验材料,对其进行转录组测序,分析蟠枣不同缩果程度之间的差异基因表达情况,筛选与蟠枣缩果相关的基因。转录组测序结果表明,3个比较组(ck vs CZS、ck vs QZS、CZS vs QZS)分别筛选出3156个、2007个和2858个差异表达基因(DEGs);GO富集分析表明,差异表达基因主要与对创伤的反应、对氧水平降低的反应、细胞对氧水平的反应、细胞对氧含量降低的反应等相关;KEGG通路分析表明,代谢途径、次生代谢产物的生物合成、植物-病原菌互作、植物激素信号转导、MAPK信号通路-植物及内质网的蛋白质加工在3个处理组中共同富集,蟠枣缩果果实的差异表达基因在植物病原互作和植物激素信号转导途径中富集数量最多。展开更多
文摘为探究枣抗缩果的相关调控机制,以蟠枣(京沧1号)果实为试验材料,对其进行转录组测序,分析蟠枣不同缩果程度之间的差异基因表达情况,筛选与蟠枣缩果相关的基因。转录组测序结果表明,3个比较组(ck vs CZS、ck vs QZS、CZS vs QZS)分别筛选出3156个、2007个和2858个差异表达基因(DEGs);GO富集分析表明,差异表达基因主要与对创伤的反应、对氧水平降低的反应、细胞对氧水平的反应、细胞对氧含量降低的反应等相关;KEGG通路分析表明,代谢途径、次生代谢产物的生物合成、植物-病原菌互作、植物激素信号转导、MAPK信号通路-植物及内质网的蛋白质加工在3个处理组中共同富集,蟠枣缩果果实的差异表达基因在植物病原互作和植物激素信号转导途径中富集数量最多。
文摘红枣(Ziziphus jujuba Mill.)是具有极高营养价值和药用价值的山西特色果品,但关于不同菌种发酵枣汁中的差异代谢物的研究还较少。为揭示不同菌种发酵骏枣汁的代谢产物差异性,该文以交城骏枣为研究对象,通过添加植物乳植杆菌(Lactiplantibacillus plantarum)、嗜酸乳杆菌(Lactobacillus acidophilus)以及两菌联用协同发酵骏枣汁,采用超高效技术,对骏枣原汁及不同菌种发酵骏枣汁进行非靶向代谢组学研究。结果表明,联用协同菌种发酵的骏枣汁效果最佳。不同发酵菌种骏枣汁与原汁之间及不同发酵菌种骏枣汁之间的主要差异代谢物有6类,分别为有机酸类、有机碱类、氨基酸类、糖类、酚类和核苷类。京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)代谢通路发现,只有单菌与联用协同发酵骏枣汁的主要差异代谢物有不重合的代谢通路,为氨基酸代谢通路。该研究分析了不同菌种发酵骏枣汁之间以及发酵骏枣汁同骏枣原汁之间的代谢产物差异性,所检测到的物质可为发酵骏枣汁的分析及相应生物学功能研究提供一定的数据支持。
