期刊文献+
共找到317篇文章
< 1 2 16 >
每页显示 20 50 100
基于高通量测序技术的寒地苹果根际土壤微生物群落组成及功能预测
1
作者 杨悦 顾广军 +7 位作者 于文全 卜海东 胡颖慧 刘畅 程显敏 高洪娜 董航 汤佳翰 《经济林研究》 北大核心 2025年第2期31-42,共12页
【目的】改善寒地苹果园土壤环境,为提高果树产量和果品质量提供参考。【方法】以寒地小苹果‘龙丰’为试验材料,利用高通量测序技术测定其根际土壤微生物群落组成与功能,分析不同种植年限(3、5、8、12 a)苹果根际土壤微生物群落结构及... 【目的】改善寒地苹果园土壤环境,为提高果树产量和果品质量提供参考。【方法】以寒地小苹果‘龙丰’为试验材料,利用高通量测序技术测定其根际土壤微生物群落组成与功能,分析不同种植年限(3、5、8、12 a)苹果根际土壤微生物群落结构及其与酶活性之间的关系,预测土壤细菌与真菌功能特征。【结果】土壤酶活性均高于空地土壤。种植园中,随种植年限增加,土壤脲酶活性呈降低趋势;蔗糖酶和碱性磷酸酶总体呈先升高后降低的趋势,均为5 a最高;蔗糖酶3、8、12 a之间差异不显著,碱性磷酸酶12 a最低;过氧化氢酶也呈先升高后降低的趋势,8 a最高,3 a最低。土壤样品中细菌和真菌的OTU数目均表现为空地土壤最高,8 a最低。门水平上,放线菌门、绿弯菌门、变形菌门和酸杆菌门为‘龙丰’苹果的优势细菌门;与空地土壤相比,绿弯菌门和酸杆菌门有所减少;随着苹果种植年限的延长,放线菌门、绿弯菌门和酸杆菌门呈降低趋势,变形菌门先降低再升高(8 a最低),疣微菌门呈增加趋势。真菌土壤中,子囊菌门是占绝对优势的真菌门,其次是担子菌门;子囊菌门相对丰度均小于空地,且随种植年限延长先降低再升高;担子菌门高于空地,且随种植年限延长先升高再降低。相关性分析表明,土壤细菌群落受碱性磷酸酶、脲酶、过氧化氢酶影响较大,土壤真菌群落受碱性磷酸酶、蔗糖酶、过氧化氢酶影响较大。功能预测分析显示,土壤细菌以代谢为主,涉及全局概览通路、碳水化合物代谢和氨基酸代谢等46个二级功能;真菌群落以腐生及病理-腐生-共生营养型为主,包括未定义腐生菌等细分功能22类。【结论】12 a的土壤酶活性均较8 a有所降低。土壤细菌群落受碱性磷酸酶、脲酶、过氧化氢酶影响较大,土壤真菌群落受碱性磷酸酶、蔗糖酶、过氧化氢酶影响较大。苹果园根际土壤细菌和真菌群落结构和功能均随种植年限的延长产生差异。8 a的细菌和真菌类群OTU数目均为最低,是土壤发生变化的转折点。种植苹果树显著降低了腐生营养型真菌的占比;12 a的苹果树根际土壤细菌代谢功能减弱。综上,苹果园根际土壤微生物群落受土壤酶活性的影响,不同种植年限对土壤微生物群落结构和功能均有影响。 展开更多
关键词 寒地苹果 土壤微生物 群落组成 群落功能 高通量技术
在线阅读 下载PDF
基于MiSeq高通量测序和纯培养技术解析窖泥微生物多样性
2
作者 黄怡 胡操正 +3 位作者 詹福安 张海波 郭壮 赵慧君 《中国酿造》 北大核心 2025年第8期95-99,共5页
该研究使用MiSeq高通量测序技术对老河口光化特酒业有限公司窖泥微生物多样性进行解析,同时通过纯培养技术对其蕴含的芽孢杆菌(Bacillus)进行分离鉴定。结果表明,窖泥细菌菌群丰富度和多样性均极显著高于真菌(P<0.01),从中共鉴定出1... 该研究使用MiSeq高通量测序技术对老河口光化特酒业有限公司窖泥微生物多样性进行解析,同时通过纯培养技术对其蕴含的芽孢杆菌(Bacillus)进行分离鉴定。结果表明,窖泥细菌菌群丰富度和多样性均极显著高于真菌(P<0.01),从中共鉴定出15个优势细菌属(平均相对丰度>1%),包括沉淀杆菌属(Sedimentibacter)(15.62%)、理研菌属(Petrimonas)(14.58%)和热量杆菌属(Caloribacterium)(10.28%)等;共鉴定出12个优势真菌属,包括复膜孢酵母属(Saccharomycopsis)(35.40%)、嗜热子囊菌属(Thermoascus)(11.86%)、根霉菌属(Rhizopus)(9.81%)和曲霉菌属(Aspergillus)(7.45%)等。采用纯培养技术从窖泥中共分离鉴定得到7株芽孢杆菌,分别为3株解淀粉芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)、2株澳洲芽孢杆菌(Bacillus australimaris)和2株枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)。该研究结果为窖泥微生物的多样性解析及功能微生物的筛选提供一定的数据支撑。 展开更多
关键词 窖泥 高通量 纯培养技术 微生物多样性 芽孢杆菌
在线阅读 下载PDF
高通量测序技术在骨关节结核诊疗中的研究进展
3
作者 徐子安 浦飞飞 +1 位作者 冯晶 夏平 《中国防痨杂志》 北大核心 2025年第2期224-230,共7页
骨关节结核约占肺外结核的10%,传统的诊断方法如分枝杆菌培养和免疫学检测存在敏感度低、误诊率和漏诊率高等问题。GeneXpert MTB/RIF在骨关节结核的诊断中具有重要作用,但存在无法检测其他病原菌、肺外结核检测敏感度有限等不足。高通... 骨关节结核约占肺外结核的10%,传统的诊断方法如分枝杆菌培养和免疫学检测存在敏感度低、误诊率和漏诊率高等问题。GeneXpert MTB/RIF在骨关节结核的诊断中具有重要作用,但存在无法检测其他病原菌、肺外结核检测敏感度有限等不足。高通量测序技术不仅提供了快速和精确的病原体检测方法,还在骨关节结核治疗指导和耐药性检测方面显示出巨大的潜力。作者就高通量测序技术在骨关节结核中的应用进行综述,以期为该疾病的诊断和治疗提供参考。 展开更多
关键词 结核 骨关节 高通量技术 药物耐受性
在线阅读 下载PDF
基于Illumina MiSeq高通量测序技术分析高温大曲发酵过程中真菌群落结构演替规律
4
作者 李娜 崔梦君 +4 位作者 倪慧 田龙新 叶明波 郭壮 侯强川 《中国酿造》 北大核心 2025年第5期169-174,共6页
该研究利用Illumina Mi Seq测序技术研究高温大曲发酵过程中真菌群落的演替规律。α多样性分析结果表明,高温大曲发酵过程中真菌群落的丰富度和多样性均呈先上升后下降的趋势,在第二次翻曲时,发现物种数(369.16)和辛普森指数(0.75)均达... 该研究利用Illumina Mi Seq测序技术研究高温大曲发酵过程中真菌群落的演替规律。α多样性分析结果表明,高温大曲发酵过程中真菌群落的丰富度和多样性均呈先上升后下降的趋势,在第二次翻曲时,发现物种数(369.16)和辛普森指数(0.75)均达到最大,且极显著高于拆曲出库时(P<0.01);优势真菌属包括嗜热子囊菌属(Thermoascus)、嗜热真菌属(Thermomyces)、曲霉属(Aspergillus)、罗萨氏菌属(Rasamsonia)和丝衣霉菌属(Byssochlamys)。β多样性分析结果表明,高温大曲发酵过程中真菌群落结构发生了较大变化。线性判别分析效应值大小(LEfSe)分析结果表明,不同发酵阶段呈现出特征性优势菌,Phialosimplex、Thermoascus和Thermomyces可分别为第一次翻曲、第二次翻曲和拆曲出库阶段的生物标志物。相关性分析结果表明,真菌群落结构的变化可能与菌群间的互作关系密切相关。该研究结果为后续优化大曲发酵过程和提高产品品质奠定了基础。 展开更多
关键词 高温大曲 发酵过程 高通量技术 真菌群落结构 群落演替
在线阅读 下载PDF
基于形态学和高通量测序技术的巴里坤湖浮游生物多样性比较研究
5
作者 刘昌财 韩家难 +3 位作者 王智超 王晨悦 史楠楠 穆罕默德·萨利姆·常 《塔里木大学学报》 2025年第5期9-18,共10页
高通量测序技术已广泛应用于淡水、海水等常见水体的生物多样性调查,但其在盐湖浮游生物多样性监测中的应用研究相对缺乏。本研究以新疆巴里坤湖为对象,联合应用高通量测序技术与形态学鉴定技术,对浮游生物多样性进行了比较分析。结果显... 高通量测序技术已广泛应用于淡水、海水等常见水体的生物多样性调查,但其在盐湖浮游生物多样性监测中的应用研究相对缺乏。本研究以新疆巴里坤湖为对象,联合应用高通量测序技术与形态学鉴定技术,对浮游生物多样性进行了比较分析。结果显示:两种方法总计鉴定出10门110属的浮游生物,其中共有鉴定7门14属。在蓝藻门(原核浮游生物)中,通过形态学特征鉴定的物种中66.67%可被16S rDNA测序可检出;而经16S rDNA测序所获得的物种中有89.66%无法依据形态学鉴定方法识别。对于真核浮游生物而言,仅有14.04%的形态学鉴定物种可被18S rDNA测序检出,而18S rDNA测序所获物种中无法通过形态学方法鉴定的占63.64%;但是两种方法在优势物种的鉴定上存在一致性。其中,在浮游生物分类组成和相对丰度鉴定中高通量测序技术具有明显的优势,鉴定效率高、成本低等优点,但也存在部分类群无法鉴定的情况;而形态学鉴定耗时且容易遗漏小型物种。因此,建议采用高通量测序技术与形态学鉴定相结合的方法全面准确地揭示盐湖浮游生物多样性。 展开更多
关键词 形态学鉴定 高通量技术 浮游生物 16S rDNA 18S rDNA
在线阅读 下载PDF
高通量测序技术在动物疫病检疫中的应用
6
作者 哈斯巴特尔 《中国畜牧业》 2025年第12期123-124,共2页
高通量测序技术(High-Throughput Sequencing Technology,HTS)作为现代分子生物学的重要突破,已在动物疫病检疫领域得到日益广泛且深入的应用。该技术凭借其高效、快速、准确的特点,不仅实现了病原微生物的快速鉴定与分型,还为疫病的早... 高通量测序技术(High-Throughput Sequencing Technology,HTS)作为现代分子生物学的重要突破,已在动物疫病检疫领域得到日益广泛且深入的应用。该技术凭借其高效、快速、准确的特点,不仅实现了病原微生物的快速鉴定与分型,还为疫病的早期预警、传播途径追溯、遗传变异分析及疫苗研发提供了有力的技术支持。通过构建病原体参考基因组数据库并结合HTS数据进行比对分析,能够迅速定位未知病原体,解析其致病机制,为疫病的精准防控奠定了坚实基础。此外,HTS技术在揭示病原体遗传多样性和进化关系方面展现出独特优势,有助于制定更具针对性的疫病预防与控制策略。然而,尽管HTS技术在动物疫病检疫中展现出巨大潜力,但仍面临测序数据准确性和数据处理复杂性等方面的挑战。笔者全面剖析了高通量测序技术在动物疫病检疫中的应用现状,并对其未来发展前景进行展望。 展开更多
关键词 检疫 高通量技术 病原微生物
在线阅读 下载PDF
高通量测序在柑橘病毒鉴定与种群多样性分析中的应用 被引量:1
7
作者 李向 杨进 +2 位作者 黄爱军 周俊 易龙 《果树学报》 北大核心 2025年第3期651-661,共11页
中国柑橘产业在全球占据至关重要的地位,然而,柑橘病毒病却给该产业带来了严重的经济损失。随着病毒种类的不断增多,快速、准确地对病毒进行鉴定及遗传多样性分析变得愈发关键。高通量测序(High-Throughput Sequencing,HTS)技术,具有高... 中国柑橘产业在全球占据至关重要的地位,然而,柑橘病毒病却给该产业带来了严重的经济损失。随着病毒种类的不断增多,快速、准确地对病毒进行鉴定及遗传多样性分析变得愈发关键。高通量测序(High-Throughput Sequencing,HTS)技术,具有高通量、高效快速以及效益高的优势,逐渐成为了鉴定柑橘病毒的核心技术手段。HTS技术的应用不仅成功揭示了多种新病毒的存在,还深入挖掘了已知病毒的全基因组信息,提供了大量的基因序列数据,极大地推动了柑橘病毒在遗传变异、进化关系以及生态系统作用等方面的研究。展望未来,随着技术的发展和优化,HTS将在柑橘病毒鉴定与种群多样性分析中发挥更为重要的作用,为柑橘产业的可持续发展提供坚实的支撑。综述了HTS技术在柑橘病毒检测与鉴定,以及种群多样性分析方面的最新进展,并深入探讨了当前面临的挑战、未来的发展前景及其意义。 展开更多
关键词 柑橘 高通量技术 柑橘病毒 种群多样性分析
在线阅读 下载PDF
高通量测序技术在低频突变检测中的应用 被引量:2
8
作者 栾洋 尤馨悦 杨劲 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期126-139,共14页
体细胞突变的累积与衰老、肿瘤及多种疾病的发生密切相关。在正常组织细胞中,基因组中自发突变和诱发突变的变异等位基因频率极低,对这类低频突变的检测一直面临挑战。第二代和第三代高通量测序(next-generation sequencing,NGS)技术的... 体细胞突变的累积与衰老、肿瘤及多种疾病的发生密切相关。在正常组织细胞中,基因组中自发突变和诱发突变的变异等位基因频率极低,对这类低频突变的检测一直面临挑战。第二代和第三代高通量测序(next-generation sequencing,NGS)技术的出现,可以实现任意物种全基因组上变异的直接检测,克服传统突变检测技术的诸多局限性。但是常规NGS由于测序错误率较高从而限制了其在低频突变检测上的应用,基于分子一致性测序策略进行错误矫正的高准确性NGS测序技术作为有效的低频突变检测工具,有望在环境诱变剂的评价与研究、细胞与基因治疗药物风险评估、人群健康风险监测和生命科学基础研究领域发挥重要作用。本文对比经典突变检测方法,对基于NGS的低频突变检测技术研究进展进行综述,并对应用前景进行展望,以期为该技术的进一步开发、研究和在相关领域的应用提供参考。 展开更多
关键词 高通量技术 低频突变 分子一致性 致突变 风险评估
在线阅读 下载PDF
基于高通量测序的枇杷花药微生物多样性研究
9
作者 高枫 邓国翠 +2 位作者 张伍 张野驰 龚燕兵 《植物科学学报》 北大核心 2025年第1期32-40,共9页
果树具有较高的经济价值,并大多依赖传粉者实现繁殖成功以保证产量。花药微生物能影响植物的花粉活力,其组成也可能受到传粉者访问的影响;理解花药微生物的多样性和群落构建模式对于提高果树的繁殖适合度具有潜在意义,但目前相关研究仍... 果树具有较高的经济价值,并大多依赖传粉者实现繁殖成功以保证产量。花药微生物能影响植物的花粉活力,其组成也可能受到传粉者访问的影响;理解花药微生物的多样性和群落构建模式对于提高果树的繁殖适合度具有潜在意义,但目前相关研究仍相对缺乏。本研究基于高通量测序技术分析了传粉者访问前(套袋组)与访问后(访问组)枇杷(Eriobotrya japonica(Thunb.)Lindl.)花药中真菌与细菌的组成及差异。结果显示,传粉者访问未显著改变花药微生物的多样性及组成,套袋组中优势真菌科为枝孢菌科与球腔菌科,访问组优势真菌科则为枝孢菌科与梅奇酵母科。此外,两组中优势细菌科均为产碱杆菌科与欧文菌科。研究结果表明,枇杷花药微生物具有相对稳定的群落结构,传粉者不是驱动花药微生物群落构建的主要因素。 展开更多
关键词 传粉者访问 花药微生物 高通量技术 微生物组成
在线阅读 下载PDF
高通量测序技术与电镜技术在RNA表观修饰研究中的应用
10
作者 卜芋芬 苏钰莹 +1 位作者 荆艳萍 林金星 《电子显微学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期724-732,共9页
RNA表观遗传学是继DNA表观遗传学和蛋白表观遗传学的发展而兴起的新兴研究领域。已有的研究结果表明,RNA表观遗传修饰对RNA的加工代谢和生物学过程具有调控作用,在生命科学的多个领域已显示出巨大的应用潜力和商业前景。RNA表观遗传修... RNA表观遗传学是继DNA表观遗传学和蛋白表观遗传学的发展而兴起的新兴研究领域。已有的研究结果表明,RNA表观遗传修饰对RNA的加工代谢和生物学过程具有调控作用,在生命科学的多个领域已显示出巨大的应用潜力和商业前景。RNA表观遗传修饰的研究有助于进一步阐明生命活动调控的复杂机制。本文将关注于RNA表观遗传修饰研究中各种技术手段的应用,特别聚焦于高通量测序技术和电镜技术在RNA表观修饰研究中的应用情况以及相关局限性,并对这两种技术在未来可能的联合应用提出了展望。 展开更多
关键词 RNA表观修饰 高通量技术 电镜技术 应用
在线阅读 下载PDF
高通量测序文库质量控制技术研究进展 被引量:1
11
作者 崔梦楠 郭彦 +2 位作者 武雅蓉 裴广倩 崔玉军 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期140-148,共9页
作为生命科学和医学领域中的关键性支撑技术,高通量测序已得到快速发展并日趋成熟。该技术工作流程可分为核酸提取、文库构建、上机测序、数据分析等,其中文库构建是承上启下的关键步骤,文库构建的效果受制于上游样品质量,同时会对测序... 作为生命科学和医学领域中的关键性支撑技术,高通量测序已得到快速发展并日趋成熟。该技术工作流程可分为核酸提取、文库构建、上机测序、数据分析等,其中文库构建是承上启下的关键步骤,文库构建的效果受制于上游样品质量,同时会对测序数据产出后的数据分析造成影响。对文库构建质量控制技术的选择和实施是提高结果可靠性、降低测序数据误差的重要保证。本文对文库构建质量控制技术进行深入综述,总结评价其原理、优缺点、适用范围,并对实际应用场景中相关技术的选择进行了论述,以期为科研人员、疾病预防控制人员等在选择文库质量控制技术时提供理论依据与参考,从而促进高通量测序工作的质量和效率。 展开更多
关键词 高通量文库 文库浓度 文库大小分布 质量控制 技术评价
在线阅读 下载PDF
基于高通量测序技术老面酵头微生物菌群多样性分析
12
作者 安香玉 郝建雄 +4 位作者 王成祥 赵鑫燕 马淑红 刘玉红 郭海云 《中国酿造》 CAS 北大核心 2024年第10期35-41,共7页
通过高通量测序技术对不同活化时间及活化次数老面酵头的微生物菌群多样性进行研究。结果表明,随着活化时间的增加,老面酵头的细菌菌群丰富度无显著变化(P>0.05),多样性呈先降低后升高的趋势,真菌菌群丰富度呈先升高后下降的趋势,多... 通过高通量测序技术对不同活化时间及活化次数老面酵头的微生物菌群多样性进行研究。结果表明,随着活化时间的增加,老面酵头的细菌菌群丰富度无显著变化(P>0.05),多样性呈先降低后升高的趋势,真菌菌群丰富度呈先升高后下降的趋势,多样性呈下降趋势;随着活化次数的增加,老面酵头的细菌菌群丰富度无显著变化(P>0.05),真菌菌群丰富度及细菌和真菌菌群多样性均呈下降趋势,说明活化对于老面酵头的菌群多样性具有不利的影响。不同老面酵头样品中相对丰度较高的微生物属具有一定差异。在门水平上,共检测出16个细菌门,优势细菌门分别为厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidota)和变形菌门(Proteobacteria);共检测出4个真菌门,优势真菌门分别为子囊菌门(Ascomycota)、担子菌门(Basidiomycota)和球囊菌门(Glomeromycota)。在属水平,共检测出195个细菌属,优势细菌属分别为乳杆菌属(Lactobacillus)和魏斯氏菌属(Weissella);共检测出46个真菌属,优势真菌属分别为哈萨克斯坦酵母属(Kazachstania)、交链孢霉属(Alternaria)和曲霉属(Aspergillus)。 展开更多
关键词 高通量技术 老面酵头 活化时间 活化次数 微生物多样性
在线阅读 下载PDF
基于高通量转录组测序技术筛选吉林黑鸡与卵泡发育相关基因及验证
13
作者 陈晓霞 杨辉 +1 位作者 张连江 周会敏 《饲料研究》 北大核心 2024年第24期80-88,共9页
试验旨在筛选吉林黑鸡3个不同发育阶段的卵泡组织大白泡(LWF)、小黄泡(SYF)、大黄泡(LYF)与卵泡发育相关的差异表达基因(DEGs)。试验选取健康、体重和饲养管理环境一致的21周龄的吉林黑鸡3只,采用高通量转录组测序技术对吉林黑鸡不同发... 试验旨在筛选吉林黑鸡3个不同发育阶段的卵泡组织大白泡(LWF)、小黄泡(SYF)、大黄泡(LYF)与卵泡发育相关的差异表达基因(DEGs)。试验选取健康、体重和饲养管理环境一致的21周龄的吉林黑鸡3只,采用高通量转录组测序技术对吉林黑鸡不同发育阶段的卵泡组织的mRNA差异表达基因进行筛选和分析,构建了9个cDNA文库。从中选取13个共表达的差异表达基因:黄嘌呤脱氢酶(XDH)、同源域蛋白同源盒(HOPX)、溶质载体家族26成员1(SLC26A1)、CUB和SUSHI多域1(CSMD1)、脂肪酸结合蛋白3(FABP3)、嘌呤能受体(P2RX7)、主要组织相容性复合体B(BF2)、催乳素受体(PRLR)、17β-羟类固醇脱氢酶2(HSD17B2)、细胞色素P450家族19亚家族A成员1(CYP19A1)、谷氨酸离子型受体AMPA型亚基2(GRIA2)、神经肽Y受体Y4(NPY4R)、血管活性肠肽受体2(VIPR2)进行实时荧光定量PCR(RT-qPCR)验证。结果显示,高通量转录组测序结果准确。京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析结果表明,核因子κB(NF-κB)信号通路、细胞黏附分子(CAMs)、类固醇激素生物合成、过氧化物酶体增殖物激活受体(PPAR)信号通路、神经活性配体-受体相互作用、环磷腺苷酸(CAMP)信号通路、JAK-STAT信号通路与卵泡发育调控有关。研究表明,试验结果可为进一步研究产蛋性状形成的分子机制奠定基础。 展开更多
关键词 高通量转录组技术 吉林黑鸡 卵泡发育
在线阅读 下载PDF
利用Illumina MiSeq高通量测序技术分析原料乳的菌群分布 被引量:19
14
作者 于国萍 陈媛 +3 位作者 姚宇秀 范美婧 刘鹏 董良伟 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2018年第16期186-191,共6页
为测定原料乳中的菌群分布情况,应用Illumina MiSeq高通量测序方法,主要对14个奶牛场的原料乳进行采集,通过DNA测序确定菌群的多样性及致病菌的分布情况,进行操作分类单元聚类分析、Alpha多样性分析、物种分类分析3方面的测定。结果表... 为测定原料乳中的菌群分布情况,应用Illumina MiSeq高通量测序方法,主要对14个奶牛场的原料乳进行采集,通过DNA测序确定菌群的多样性及致病菌的分布情况,进行操作分类单元聚类分析、Alpha多样性分析、物种分类分析3方面的测定。结果表明不同牧场的菌群存在多样性,位于前列的分别是肠球菌属(Enterococcus)、芽孢杆菌属(Bacillus)、不动杆菌属(Acinetobacter)、乳球菌属(Lactococcus),同时表明,个别牛场原料乳中有金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)和志贺菌(Shigella)的存在。 展开更多
关键词 illuminamiseq高通量 原料乳 菌群分布情况
在线阅读 下载PDF
高通量测序技术的发展及其在生命科学中的应用 被引量:25
15
作者 杜玲 刘刚 +2 位作者 陆健 刘丑生 哈福 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2014年第12期109-116,共8页
DNA测序技术从以Sanger法为代表的第一代测序技术到如今的高通量测序(HTS)技术,经历了漫长而曲折的发展过程,如今该技术在动植物基因组的研究中获得了很大的成功,它的问世可以使人们以更低廉的价格,更全面、更深入地对全基因组进行分析... DNA测序技术从以Sanger法为代表的第一代测序技术到如今的高通量测序(HTS)技术,经历了漫长而曲折的发展过程,如今该技术在动植物基因组的研究中获得了很大的成功,它的问世可以使人们以更低廉的价格,更全面、更深入地对全基因组进行分析。作者阐述了几种关于HTS的测序技术平台:Roche/454测序技术、ABI/SOLID测序技术、Illumina/Solexa测序技术、单分子测序技术及Ion Torrent测序技术,并且还归纳了HTS在基因组学、转录组学及表观基因组学等方面的应用。 展开更多
关键词 高通量技术 基因组学 转录组学 应用
在线阅读 下载PDF
基于Miseq高通量测序技术对细菌型豆豉细菌类群的评价 被引量:20
16
作者 董蕴 许小玲 +3 位作者 代凯文 尚雪娇 沈馨 郭壮 《食品工业科技》 CAS CSCD 北大核心 2018年第13期150-154,247,共6页
采用Miseq高通量测序技术对6个细菌型豆豉细菌多样性进行了评价,同时使用电子舌对不同样品各滋味指标的相对强度进行了测定,进而探讨了细菌类群对产品滋味品质的影响。结果表明,Bacillus(芽孢杆菌)是细菌型豆豉中的优势细菌,其相对含量... 采用Miseq高通量测序技术对6个细菌型豆豉细菌多样性进行了评价,同时使用电子舌对不同样品各滋味指标的相对强度进行了测定,进而探讨了细菌类群对产品滋味品质的影响。结果表明,Bacillus(芽孢杆菌)是细菌型豆豉中的优势细菌,其相对含量为95.26%。在分类操作单元(Operational taxonomic units,OTU)水平上,发现5个核心OTU相对含量大于0.1%,其中4个隶属于Bacillus,OTU2133(隶属于芽孢杆菌)的平均相对含量为91.91%。酸味是豆豉间差异最大的滋味指标,且Bacillus、Staphylococcus(葡萄球菌)和Lactobacillus(乳酸杆菌)与豆豉酸味的形成均呈正相关。由此可见,鲊广椒中细菌微生物主要是由Bacillus组成,且Lactobacillus和Staphylococcus对豆豉滋味的形成具有影响。 展开更多
关键词 细菌型豆豉 Miseq高通量技术 细菌 电子舌
在线阅读 下载PDF
高通量测序技术在新生儿地中海贫血基因筛查中的应用 被引量:34
17
作者 谭梅 卢森 +3 位作者 吴柳松 靳大卫 彭智宇 陈艳 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期1404-1409,共6页
目的:探讨高通量测序(NGS)技术在新生儿地中海贫血基因筛查中的可行性。方法:随机采集我院出生的206例新生儿足底血,制成干血片,用高通量测序(NGS)技术进行地中海贫血基因筛查,根据其结果进行进一步的分析。结果:206例受检新生儿中筛查... 目的:探讨高通量测序(NGS)技术在新生儿地中海贫血基因筛查中的可行性。方法:随机采集我院出生的206例新生儿足底血,制成干血片,用高通量测序(NGS)技术进行地中海贫血基因筛查,根据其结果进行进一步的分析。结果:206例受检新生儿中筛查出地中海贫血基因突变的有22例,其中α-地中海贫血11例,β-地中海贫血11例,新发5例。11例α-地中海贫血以基因缺失为主,共7例,所占比例达到64%(7/11),具体基因型分布:右侧缺失型(αα/-α3.7)4例,东南亚型(αα/-SEA)2例,左侧缺失型(αα/-α4.2)1例,其余4例为基因点突变所致,占36%(4/11),分别为:Hb Part-Dieu杂合、Hb Quong Sze杂合、Hb Westmead杂合、HBA1:c.95+9C>T(新发突变);11例β-地中海贫血主要为β-链基因点突变所致,共检出7种突变基因型;以CD17(A→T)位点的突变最多见,占27%(3/11),-50 G>A杂合2例、Hb Hamilton杂合1例、IVS-II-654(C→T)1例,其余4种为新的基因位点突变,分别为:HBB:c.316-116C>A、HBB:c.316-248G>T、HBB:c.315+63T>C、HBB:c.-23 A>G。结论:高通量测序技术对新生儿足底干血片进行地中海贫血基因筛查是可行的,不仅能有效地检出地中海贫血的基因类型,而且还能发现新的基因突变。本方法具有采集标本简单、结果精确度高等优点,可广泛应用于临床,为地中海贫血的早期诊断提供保障。 展开更多
关键词 地中海贫血 高通量技术 新生儿足底干血片 基因筛查
在线阅读 下载PDF
高通量测序技术在农业研究中的应用 被引量:19
18
作者 张全芳 李军 +2 位作者 范仲学 杨连群 步迅 《山东农业科学》 2013年第1期137-140,共4页
随着高通量测序技术的不断发展和测序成本不断降低,高通量测序近几年在现代农业研究领域中得到了充分应用,为新品种选育和品质改良带来了新的科研方法和解决方案,加快了新品种的育种进程。高通量测序技术的主要应用方向包括对农作物和... 随着高通量测序技术的不断发展和测序成本不断降低,高通量测序近几年在现代农业研究领域中得到了充分应用,为新品种选育和品质改良带来了新的科研方法和解决方案,加快了新品种的育种进程。高通量测序技术的主要应用方向包括对农作物和栽培品种进行全基因组从头测序和深度重测序、遗传差异分析、分子标记开发、遗传连锁分析、表观遗传分析和转录组分析等。本文系统阐述了近几年高通量测序技术在农业研究中的应用进展,展示高通量测序在现代农业研究领域的广泛应用前景。 展开更多
关键词 高通量 农业生物技术 全基因组
在线阅读 下载PDF
基于Miseq高通量测序技术的古襄阳酒窖泥细菌多样性评价 被引量:13
19
作者 杨小丽 尚雪娇 +3 位作者 余海忠 刘文汇 杨少勇 郭壮 《中国酿造》 CAS 北大核心 2018年第7期26-30,共5页
使用Miseq高通量测序技术对4份古襄阳酒业浓香型白酒窖泥样品的细菌多样性进行了评价,同时通过选择性培养分离出窖泥中的优势乳酸菌,再利用16S r DNA序列分析方法,对其进行初步鉴定。结果表明,乳酸杆菌是古襄阳酒窖池中的优势细菌,其相... 使用Miseq高通量测序技术对4份古襄阳酒业浓香型白酒窖泥样品的细菌多样性进行了评价,同时通过选择性培养分离出窖泥中的优势乳酸菌,再利用16S r DNA序列分析方法,对其进行初步鉴定。结果表明,乳酸杆菌是古襄阳酒窖池中的优势细菌,其相对含量高达92.02%。在分类操作单元(OTU)水平上,发现8个核心OTU相对含量>1.0%,其中7个隶属于乳酸杆菌属(Lactobacillus)。4份古襄阳酒业浓香型白酒窖泥样品中共分离到12株菌株,初步鉴定其全部为副干酪乳杆菌(Lactobacillus paracasei)。 展开更多
关键词 浓香型白酒 窖泥 Miseq高通量技术 细菌 乳酸菌
在线阅读 下载PDF
高通量测序技术的发展及其在畜禽上的应用 被引量:5
20
作者 曹婷 张立岭 +3 位作者 侯冠彧 周汉林 施力光 荀文娟 《家畜生态学报》 北大核心 2013年第1期6-10,共5页
高通量测序技术是测序技术发展历程中的一个里程碑,具有可一次同时对几十万甚至到几百万条DNA分子测序和一般的读长较短等功能。这些功能实现了对某种物种的基因组或转录组更深入细致的研究和分析,所以高通量测序技术也被称为深度测序... 高通量测序技术是测序技术发展历程中的一个里程碑,具有可一次同时对几十万甚至到几百万条DNA分子测序和一般的读长较短等功能。这些功能实现了对某种物种的基因组或转录组更深入细致的研究和分析,所以高通量测序技术也被称为深度测序技术或者下一代测序技术。论文主要针对高通量技术的种类、发展、应用以及在畜禽上的使用价值和前景进行介绍。 展开更多
关键词 高通量技术 基因组 进展 应用 畜禽
在线阅读 下载PDF
上一页 1 2 16 下一页 到第
使用帮助 返回顶部