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Genetic Diversity Analysis Among Populations of Mink from China by Inter-simple Sequence Repeat(ISSR) Markers 被引量:2
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作者 Yang Hong-yan Fu Jing +2 位作者 Ning Fang-yong Du Zhi-heng Bai Xiu-juan 《Journal of Northeast Agricultural University(English Edition)》 CAS 2013年第3期47-54,共8页
Inter-simple Sequence Repeat (ISSR) analysis was applied to assess the genetic diversity within and among five populations of mink from Liaoning Province. A total of 20 primers were screened, five selected primers p... Inter-simple Sequence Repeat (ISSR) analysis was applied to assess the genetic diversity within and among five populations of mink from Liaoning Province. A total of 20 primers were screened, five selected primers produced 35 discernible bands, with 30 (85.71%) being polymorphic, indicating high genetic diversity at the species level. The highest genetic diversity was observed in the brown mink population, whereas the lowest diversity was found in the standard-pitchy mink population. Based on genetic distance (1972), a dendrogram was constructed by using UPGMA algorithm, and five populations were divided into two major groups. Group I consisted of only the standard-pitchy mink population, and Group II included other four populations, in Group II, sapphire mink was close to brown mink population. The results of genetic differentiation indicated that the genetic differentiation degree between populations was lower and the genetic variation primarily came from within populations. This paper showed that ISSR technique was a reliable tool that could be used to study genetic diversity in the mink. 展开更多
关键词 MINK issr genetic diversity
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连翘居群遗传多样性的ISSR分析
2
作者 汤正辉 代子闻 《中南林业科技大学学报》 北大核心 2025年第5期132-140,153,共10页
【目的】分析连翘Forsythia suspensa自然居群的遗传多样性,为野生连翘种质资源收集、保存和良种选育等研究提供理论依据。【方法】应用ISSR分子标记对分布广泛的9个连翘自然居群138个野生单株进行遗传多样性分析。【结果】12条引物共得... 【目的】分析连翘Forsythia suspensa自然居群的遗传多样性,为野生连翘种质资源收集、保存和良种选育等研究提供理论依据。【方法】应用ISSR分子标记对分布广泛的9个连翘自然居群138个野生单株进行遗传多样性分析。【结果】12条引物共得到4485个重复性好的位点,平均每条引物扩增条带的数目为373.8条,使用POPGENE 32软件进行分析,在物种水平上,多态位点百分率为100%;总遗传多样性指数(Nei’s基因多样性指数H)为0.1091,Shannon信息多样性指数(I)为0.2010;居群间遗传分化系数(Gst)为0.1255,居群间的遗传变异占了总遗传变异的12.55%,87.45%的遗传变异来自居群内部;9个自然居群间的遗传距离为0.0018~0.0214,连翘居群间的遗传距离非常小,遗传相似度很高。使用NTSYS-pc 2.10e软件,根据遗传一致度进行样本间亲缘关系的UPGMA聚类分析,138个样本可划分为5个组,各山系的样本基本能够聚为一组,各组样本又存在连翘居群彼此交叉的情形,但地理位置近的样本因遗传距离较近会分入同一个组。【结论】连翘种质资源具有很高的遗传多样性,群体间存在高度的遗传分化,遗传变异主要来源于居群内的个体。人为因素干扰会造成居群规模变小、遗传多样性降低的情况。居群间遗传距离与地理距离在大区域尺度上具有相关性,而较小区域的居群间二者无相关性。 展开更多
关键词 连翘 遗传多样性 issr 聚类分析
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基于ISSR和ITS分子标记的海南砂仁种质资源遗传多样性评价 被引量:1
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作者 罗凡 瞿云苹 +3 位作者 陈振夏 杨涛 范宇光 潘坤 《核农学报》 北大核心 2025年第5期886-896,I0001,共12页
为了对海南砂仁资源进行保护和管理,利用简单序列重复区间(ISSR)和核糖体RNA基因转录间隔区(ITS)技术,使用NTSYS、POPGENE、BioEdit和Clustalx等软件,分析了12个海南砂仁地理居群,共118份种质材料的遗传多样性和遗传分化程度。结果发现,... 为了对海南砂仁资源进行保护和管理,利用简单序列重复区间(ISSR)和核糖体RNA基因转录间隔区(ITS)技术,使用NTSYS、POPGENE、BioEdit和Clustalx等软件,分析了12个海南砂仁地理居群,共118份种质材料的遗传多样性和遗传分化程度。结果发现,ISSR引物筛选共获得25条多态性较高的引物,扩增获得132个位点,其中多态性位点93个,多态性比率达70.45%。通过对观测到的等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、居群内Nei’s基因多样性(H)、Shannon多样性信息指数(I)和基因流(Nm)统计,其平均值分别为1.164、1.103、0.059、0.087和0.271。基于海南砂ITS序列比对信息,检测出了11个单倍型,但在不同的居群中这些单倍型的分布不均匀,多个居群中仅检测出一种单倍型。上述结果表明,居群内的遗传多样性较低,不同地理居群的海南砂基因交流较少、遗传分化明显,居群间的遗传变异是其总遗传多样性的来源,由于居群间基因交流匮乏,已经导致海南砂居群内出现近交衰退。本研究可为海南砂种质资源的保护、利用和可持续开发提供科学依据。 展开更多
关键词 海南砂仁 遗传多样性 遗传分化 issr ITS 单倍型
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基于ISSR分子标记的新疆西天山栒子属种质资源遗传多样性分析 被引量:1
4
作者 阿克居力得孜·努尔改里得 李茹雪 +2 位作者 杨禧雨 陆彪 周龙 《植物遗传资源学报》 北大核心 2025年第5期905-915,共11页
为探究新疆西天山栒子属各居群之间的遗传多样性水平及亲缘关系,利用ISSR分子标记对新疆西天山15个野生居群112份栒子属植物进行遗传多样性分析。研究发现,15条ISSR引物共扩增出166个条带,其中多态性条带143个,平均多态性条带比例为86.2... 为探究新疆西天山栒子属各居群之间的遗传多样性水平及亲缘关系,利用ISSR分子标记对新疆西天山15个野生居群112份栒子属植物进行遗传多样性分析。研究发现,15条ISSR引物共扩增出166个条带,其中多态性条带143个,平均多态性条带比例为86.29%,新疆西天山15个野生居群112份栒子属植物的Nei′s基因多样性指数和香农信息指数分别为0.2124和0.3254,各居群间遗传分化系数为0.4259,基因流为0.6740,表明栒子属野生居群水平的遗传分化程度极大且各居群间存在一定的基因交流。新疆西天山栒子属植物在整体水平上的遗传差异明显,遗传多样性较高。在居群水平上,特克斯县北山毛溜沟居群的遗传多样性最为丰富。聚类结果显示,绝大部分地理位置相近的居群聚为一类,但也有部分地理位置相近的居群并没有聚在一起。本研究结果可为新疆西天山栒子属种质资源的有效保护及开发利用提供重要参考依据。 展开更多
关键词 新疆西天山 栒子属 遗传多样性 issr分子标记
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基于农艺性状及ISSR标记的铁皮石斛种质资源遗传多样性分析
5
作者 董蓉娇 李桂琳 +4 位作者 周侯光 贾敏 姚志军 茶文彪 李泽生 《种子》 北大核心 2025年第6期130-138,共9页
为探索铁皮石斛种质遗传多样性,以云南地区70份铁皮石斛种质资源为试验材料,对15个农艺性状进行测量统计,并用6条ISSR引物进行PCR扩增。结果表明,铁皮石斛种质资源农艺性状变异丰富,变异系数为14.18%~53.16%,遗传多样性指数为1.83~2.29... 为探索铁皮石斛种质遗传多样性,以云南地区70份铁皮石斛种质资源为试验材料,对15个农艺性状进行测量统计,并用6条ISSR引物进行PCR扩增。结果表明,铁皮石斛种质资源农艺性状变异丰富,变异系数为14.18%~53.16%,遗传多样性指数为1.83~2.29;主成分分析结果表明,6个主成分因子累积贡献率为72.44%,能反映铁皮石斛资源的大部分遗传信息;70份材料在遗传距离60.0处时被分为5个亚类群;6个ISSR引物在70份铁皮石斛材料中共检测到50个多态性位点,ISSR引物扩增DNA条带数为2~12,多态性比率100%,平均有效等位基因数目为1.45个,群体多态性信息指数范围为0.08~0.54,群体多样性指数范围为0.03~0.37;在遗传距离为0.30处时,将铁皮石斛资源划分为2个类群,第一类群66份材料,第二类群4份材料。研究表明,铁皮石斛种质资源具有丰富的遗传多样性。 展开更多
关键词 铁皮石斛 种质资源 农艺性状 issr标记 遗传多样性
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月季黑斑病菌ISSR遗传多样性分析
6
作者 郭加启 陈锋 +6 位作者 吕博 杨园园 过聪 宋居荣 杨捷 向发云 林建国 《南方农业学报》 北大核心 2025年第2期496-507,共12页
【目的】探讨我国月季黑斑病病原菌的种类、遗传多样性及其亲缘关系,为月季种质黑斑病抗性鉴定及病害防控提供理论依据。【方法】分离来自全国7个大区15个省(区)27个市(县)的月季黑斑病病原菌,扩增菌株ITS序列确定病原菌种类,并经柯赫... 【目的】探讨我国月季黑斑病病原菌的种类、遗传多样性及其亲缘关系,为月季种质黑斑病抗性鉴定及病害防控提供理论依据。【方法】分离来自全国7个大区15个省(区)27个市(县)的月季黑斑病病原菌,扩增菌株ITS序列确定病原菌种类,并经柯赫氏法则验证其致病性。采用ISSR分子标记技术研究病原菌的遗传多样性;将扩增的条带数据记为0-1矩阵,并使用PopGene 32.0计算遗传多样性指数和遗传距离等指标;利用NTsys-pc 2.1进行非加权平均法(UPGMA)聚类分析。【结果】分离得到107株病原菌,按不同市(县)可划分为27个居群;经鉴定107株菌株均为蔷薇盘二孢(Marssonina rosae)。经筛选确定了ISSR-PCR扩增的3条引物,分别为UBC884、UBC885和UBC886,3条引物共扩增出84条条带,多态性条带数为84条,多态性比率为100%,显示出高多态性,可用于蔷薇盘二孢菌株的扩增。107株菌株群体的遗传多样性分析结果显示,菌株居群间的平均观测等位基因数(Na)为1.3369、平均有效等位基因数(Ne)为1.2431,平均Nei’s多样性指数(H)为0.1367,平均Shannon’s信息指数(I)为0.1993,平均总基因多样性(Ht)为0.2827,平均居群内基因多样性(Hs)为0.1368,平均遗传分化系数(Gst)为0.5163,平均基因流(Nm)为0.4684。基于UPGMA聚类分析,107株蔷薇盘二孢菌株在遗传相似性系数为0.57时划分为8个类群,类群Ⅰ~Ⅶ中来自各个地区的菌株相互混杂,Ⅷ中的部分菌株大致根据市(县)的地理位置聚在一起。【结论】107株来自不同地理区域的蔷薇盘二孢菌株表现出丰富的遗传多样性,居群间基因流动水平较低,遗传分化程度较高,且菌株遗传多样性与地理来源之间关联性不强。 展开更多
关键词 月季黑斑病 蔷薇盘二孢 issr分子标记 遗传多样性
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基于SRAP和ISSR标记的花椒种质资源遗传多样性及群体结构分析
7
作者 李晋华 汪志燚 +4 位作者 王少铭 冷家归 侯颖辉 罗莉斯 李德文 《种子》 北大核心 2025年第1期10-18,30,共10页
为探究国内花椒种质资源遗传多样性及群体结构,本研究采用ISSR和SRAP分子标记技术对48份花椒资源进行遗传多样性、亲缘关系及群体结构分析。结果表明,利用筛选的6对SRAP、7条ISSR引物分别扩增出43条、56条多态性条带,多态性比率分别为87... 为探究国内花椒种质资源遗传多样性及群体结构,本研究采用ISSR和SRAP分子标记技术对48份花椒资源进行遗传多样性、亲缘关系及群体结构分析。结果表明,利用筛选的6对SRAP、7条ISSR引物分别扩增出43条、56条多态性条带,多态性比率分别为87.73%、88.89%;48份花椒种质材料的平均Nei's遗传多样性指数为0.4372,平均Shannon's信息指数为0.6217。根据不同来源地,对8个花椒群体进行遗传多样性分析,遗传多样性排序表现为贵州省遵义市群体>陕西省群体>四川省群体>贵州省黔西南州群体>江西省群体>贵州省铜仁市群体>贵州省黔东南州群体>贵州省贵阳市群体;分子遗传变异分析表明,在花椒种质资源总遗传变异中,92%的变异发生在种源内,只有8%的变异发生在种源间;Structure群体遗传结构和UPGMA聚类结果表明,种源间存在中等程度的基因交流现象。利用SRAP和ISSR标记可以对花椒种质资源进行较高效的多态性检出,花椒种质资源的种间遗传分化明显,而同一种类不同来源地资源的遗传分化较小。 展开更多
关键词 花椒 SRAP分子标记 issr分子标记 遗传多样性 群体结构分析
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基于ISSR标记的朝鲜淫羊藿种质资源遗传多样性分析
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作者 王英哲 武靖涵 +4 位作者 任璇璇 周敏 牛元 姜大成 国坤 《植物遗传资源学报》 北大核心 2025年第11期2181-2192,共12页
朝鲜淫羊藿(Epimedium koreanum Nakai)作为中国东北地区重要的药用植物,因过度采挖导致野生资源锐减,因此研究其种质资源的遗传多样性,并解析其居群间的亲缘关系对其保护策略的制定具有重要意义。采用ISSR(Inter simple sequence repe... 朝鲜淫羊藿(Epimedium koreanum Nakai)作为中国东北地区重要的药用植物,因过度采挖导致野生资源锐减,因此研究其种质资源的遗传多样性,并解析其居群间的亲缘关系对其保护策略的制定具有重要意义。采用ISSR(Inter simple sequence repeat)标记技术,前期通过优化反应体系筛选出7条高多态性引物,对采集自东北地区14个居群的128份样本进行了遗传多样性分析。结果表明,7条ISSR引物共扩增出80个条带,其中74个条带表现出多态性,多态性条带比例达到92.60%;平均等位基因数为1.6438,平均有效等位基因数为1.3747,平均Nei′s基因多样性指数为0.2189,平均Shannon′s信息指数为0.3290,其中WNS居群(辽宁省桓仁县五女山景区)遗传多样性最高,而DLZC居群(吉林省临江市大栗子村)最低;与同属植物进行比较后发现朝鲜淫羊藿种质资源具有中等水平的遗传多样性。居群间的遗传相似系数范围在0.7441~0.9700之间,遗传距离在0.0304~0.2955;Mantel检验显示遗传距离与地理距离无显著相关性,表明居群分化可能受生境隔离或繁殖特性影响。遗传结构分析(Gst=0.2784)表明,72.16%的遗传变异发生在群体内。此外,通过聚类分析将14个居群划分为5个类群。本研究为朝鲜淫羊藿的遗传多样性保护及种质资源管理提供了数据基础。 展开更多
关键词 朝鲜淫羊藿 issr 遗传多样性 亲缘关系 保护措施
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基于果实性状和ISSR分子标记的荔枝种质遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建
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作者 刘小英 吴碧君 +3 位作者 曾丽兰 张游南 林革 刘国强 《南方农业学报》 北大核心 2025年第7期2216-2229,共14页
【目的】基于果实性状和ISSR分子标记对34份荔枝种质开展遗传多样性及聚类分析,并构建DNA指纹图谱,以期为荔枝种质资源分类鉴定、评价和创新利用提供理论参考。【方法】以我国34份荔枝种质资源为研究对象,对其平均单果重、可溶性固形物... 【目的】基于果实性状和ISSR分子标记对34份荔枝种质开展遗传多样性及聚类分析,并构建DNA指纹图谱,以期为荔枝种质资源分类鉴定、评价和创新利用提供理论参考。【方法】以我国34份荔枝种质资源为研究对象,对其平均单果重、可溶性固形物含量、果形、龟裂片形状、缝合线是否明显等果实性状进行观测,并进行变异分析、多样性分析及相关分析,分别基于果实形状和ISSR分子标记进行聚类分析。最后基于ISSR分子标记检测结果构建DNA指纹图谱。【结果】34份荔枝种质的单果重17.0~57.5 g,可溶性固形物含量13.0%~20.7%,果形有心形、近圆球形、卵圆形、椭圆形、歪心形,龟裂片形状有隆起、锥尖状突起、平滑,缝合线明显或不明显。果实性状的Shannon-Weaver多样性指数为0.67~1.97,其中缝合线是否明显最低,可溶性固形物含量最高。单果重与可溶性固形物含量呈极显著负相关(P<0.01),果形与龟裂片形状呈显著正相关(P<0.05)。基于果实性状的聚类结果显示,在欧氏距离为8时,供试材料被分为四大类,果实性状聚类结果与荔枝种质的果实缝合线是否明显相关性较强,其次是按果形和龟裂片形状进行聚类,且各类群包含不同地区的种质,说明聚类结果与地理分布无明显相关性。17条ISSR引物共扩增出191条条带,其中多态性条带165条,平均多态性比率86.39%,引物UBC835、UBC846和UBC879多态性比率高达100.00%;等位基因数(Na)为1.6875~2.0000,平均为1.8422,有效等位基因数(Ne)为1.2498~1.7177,平均为1.4470,Nei’s基因多样性指数(H')为0.16~0.40,平均为0.26,Shannon’s信息指数(I)为0.2616~0.5746,平均为0.4015。基于ISSR分子标记的聚类结果显示,34份荔枝种质的遗传相似系数为0.5916~0.8691,平均为0.7359,在遗传相似系数0.7100时,供试材料被分成四大类,各类群均包含多个地区的荔枝种质,聚类结果与地理分布无明显相关性,而与果实成熟期存在一定的相关性。ISSR引物UBC857可用于构建34份荔枝种质资源的DNA指纹图谱。【结论】34份荔枝种质果实性状遗传多样性较丰富,但遗传相似系数较高,遗传基础较狭窄。基于果实性状的聚类结果与ISSR分子标记的聚类结果仅部分相同,均与地理分布无明显相关性,分别与荔枝种质的果实缝合线是否明显和果实成熟期存在相关性。引物UBC857可鉴别34份荔枝种质资源。 展开更多
关键词 荔枝 果实性状 issr分子标记 遗传多样性 DNA指纹图谱
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48份绿豆种质资源表型性状及ISSR遗传多样性分析
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作者 白重阳 朱凯波 +5 位作者 鲍红春 宗海龙 柳凇尹 薛瑞雯 赵子荣 李小雷 《种子》 北大核心 2025年第5期174-180,共7页
为分析绿豆种质资源的遗传多样性,利用株高、主茎粗、主茎节数等10个表型性状及ISSR分子标记技术对48份绿豆种质资源进行变异系数、聚类分析和遗传多样性分析。结果表明,所有表型性状变异系数均大于8%,变异系数最大的表型性状为单株荚数... 为分析绿豆种质资源的遗传多样性,利用株高、主茎粗、主茎节数等10个表型性状及ISSR分子标记技术对48份绿豆种质资源进行变异系数、聚类分析和遗传多样性分析。结果表明,所有表型性状变异系数均大于8%,变异系数最大的表型性状为单株荚数(71.23%),其次为主茎茸毛密度(35.88%)和主茎茸毛颜色(35.20%)。表型性状聚类分析将供试材料分为五大类群。ISSR-PCR最终筛选出17条多态性有效引物,共检测274个位点,多态性位点百分率为83.57%,有效等位基因数为1.799,Nei's基因多样性指数(期望杂合度)为0.434,Shannon's信息指数为0.622,聚类分析将供试材料分为五大类群。供试材料表型性状分化程度高,具有丰富的遗传多样性。 展开更多
关键词 issr 绿豆 遗传多样性 聚类分析
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基于表型性状和ISSR分析的5个核桃品种亲缘关系鉴定
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作者 吴雨桦 李丕军 +6 位作者 熊福博 李润 刘华 白斌 郑崇文 王静 冯春 《安徽农业科学》 2025年第2期117-123,共7页
[目的]选择四川省栽培面积最大、产量最多的核桃品种“盐源早”(Juglansregia“Yanyuanzao”),探索“盐源早”的亲缘关系。[方法]选择“盐源早”、“三台泡核桃”(Juglanssigillata‘Santai’)、“漾濞泡核桃”(Juglanssigillata“Yangb... [目的]选择四川省栽培面积最大、产量最多的核桃品种“盐源早”(Juglansregia“Yanyuanzao”),探索“盐源早”的亲缘关系。[方法]选择“盐源早”、“三台泡核桃”(Juglanssigillata‘Santai’)、“漾濞泡核桃”(Juglanssigillata“Yangbi”)、“温185”(Juglansregia“Wen185”)、“新新2”(Juglansregia“Xinxin2”)5个核桃品种为试验材料,测定单果重、果仁重、出仁率、坚果三径、果形指数、种壳厚以及果仁成分(粗蛋白、粗脂肪)等指标,通过方差、相关性、聚类与主成分分析等探索5个核桃品种的表型性状和果仁成分多样性;利用ISSR分子标记技术探究“盐源早”等5个核桃品种的遗传多样性和遗传关系。[结果]果实的表型性状与果仁成分多样性分析结果表明,5个核桃品种的单果重、果仁重、出仁率、侧径、横径、纵径、果形指数、种壳厚及果仁成分(粗脂肪、粗蛋白含量)之间差异极显著或显著(P<0.01或P<0.05)。聚类分析和主成分分析结果表明,可将5个核桃品种聚为三大类群,第Ⅰ类为“温185”,第Ⅱ类为“新新2”“盐源早”“漾濞泡核桃”,第Ⅲ类为“三台泡核桃”。利用ISSR分子标记筛选出10条图谱条带清晰,背景明亮,重复性强,多态性较好,稳定性强的引物。通过对扩增图谱进行多态性分析结果表明,5个核桃品种的有效等位基因数均值为1.3370,Nei’s基因多样性指数均值为0.1935,Shannon信息指数均值为0.2858。聚类分析和主成分分析表明,“盐源早”和“漾濞泡核桃”聚为一类,表明亲缘关系表现较近,且相同地区的“温185”和“新新2”聚为一类,“三台泡核桃”聚为一类。[结论]通过对5个核桃品种的果实表型性状、果仁成分及ISSR分子标记的聚类分析得出,“盐源早”与“漾濞泡核桃”亲缘关系较近。 展开更多
关键词 核桃品种 表型性状 果仁成分 issr分子标记
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青海地区藏茴香种质资源遗传多样性的ISSR分析
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作者 郑铭贤 杨莉娜 +1 位作者 沈宁东 朱惠琴 《安徽农业科学》 2025年第7期150-155,164,共7页
[目的]研究青海地区15个藏茴香种质的遗传多样性和亲缘关系,为藏茴香人工培育良种提供理论支撑。[方法]以改良的CTAB法提取149个藏茴香个体鲜叶中的DNA,并用筛选的10个高效ISSR引物进行分子标记。[结果]得到多态性条带8412个,总多态性比... [目的]研究青海地区15个藏茴香种质的遗传多样性和亲缘关系,为藏茴香人工培育良种提供理论支撑。[方法]以改良的CTAB法提取149个藏茴香个体鲜叶中的DNA,并用筛选的10个高效ISSR引物进行分子标记。[结果]得到多态性条带8412个,总多态性比率90.21%,Nei’s基因多样性指数(H′)平均值为0.50,Shannon’s信息指数(I)平均值为0.75,藏茴香种质间的遗传相似度为0.84~0.97;遗传多样性指数(H_(t))、居群内遗传多样性指数(H_(s))、基因分化系数(G_(st))、基因流(N_(m))分别为0.23、0.17、0.26、1.42。种质间聚类分析将15个种质划分为3大类;个体间聚类将149个藏茴香个体划为6大类。[结论]青海地区野生藏茴香种质具有丰富的遗传多样性,而种质间存在广泛的基因交流,这种基因交流在地域上呈现出一定的同向逐步扩散规律,青海地区野生藏茴香丰富的遗传多样性来自个体间的差异。 展开更多
关键词 藏茴香 种质资源 issr分子标记 遗传多样性
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基于ISSR-SCoT标记结合欧式距离聚类分析24份黄精种质遗传多样性
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作者 叶夏雯 曹书禹 +2 位作者 吴延青 陈铌铍 金波 《广东农业科学》 2025年第3期25-34,共10页
【目的】联合使用ISSR和SCoT分子标记技术,基于UPGMA和欧式距离法聚类分析,从分子水平综合分析不同产地的24份黄精种质的遗传多样性,为促进黄精属种质资源的保护、开发与利用提供参考。【方法】采用ISSR和SCoT两种分子标记技术,对来自我... 【目的】联合使用ISSR和SCoT分子标记技术,基于UPGMA和欧式距离法聚类分析,从分子水平综合分析不同产地的24份黄精种质的遗传多样性,为促进黄精属种质资源的保护、开发与利用提供参考。【方法】采用ISSR和SCoT两种分子标记技术,对来自我国11个省份的24份黄精属植物种质进行遗传多样性分析。【结果】分别从ISSR通用引物和SCoT通用引物中筛选出效果较好的15条引物,扩增后分别获得229条和210条清晰条带的标记,平均多态性百分比分别为98.40%和98.10%。与SCoT标记结果相比,ISSR分子标记技术可获得更多的黄精遗传多态性位点。24份黄精Nei's基因分化系数(G_(st))为0.0474,表明95.26%的遗传变异是在种内进行,基因流N_(m)>1表明种内存在明显的基因流动。其中15份P.sibiricum Red.黄精种质的G_(st)为0.0471,表明95.29%的遗传变异在种内进行,N_(m)>1表明种内基因交流较多。对于ISSR、SCoT和ISSR-SCoT组合数据经UPGMA分析表明,三类数据的聚类结果各有异同。进一步将ISSR-SCoT组合数据运用欧式距离算法进行聚类分析,与UPGMA聚类算法结果一致的是,ZJ6和HN4具有最近的遗传距离,并且将24份黄精遗传系数进行聚类热图可视化后的结果与欧式距离算法聚类结果基本一致。【结论】联合使用ISSR和SCoT分子标记,并综合运用UPGMA和欧式距离算法,可以获得更全面的黄精遗传多样性信息。不同产地的24份黄精种质资源具有丰富的遗传多样性,且与地理位置基本相关。 展开更多
关键词 黄精 issr SCoT 遗传多样性 聚类分析 遗传距离
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基于ISSR分子标记的钻天柳遗传多样性分析
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作者 张煜 高金辉 +4 位作者 薛永辉 江振 张国财 张和阳 张厚良 《林业科技》 2025年第4期33-39,共7页
2021-2022年在大、小兴安岭设置18个天然分布点及样地,采集50株钻天柳样本。利用改进的CTAB方法提取叶片的基因组DNA,通过ISSR-PCR扩增筛选引物并确定最佳退火温度。结果表明,提取的基因组DNA符合要求,确定了10条引物及相应退火温度。... 2021-2022年在大、小兴安岭设置18个天然分布点及样地,采集50株钻天柳样本。利用改进的CTAB方法提取叶片的基因组DNA,通过ISSR-PCR扩增筛选引物并确定最佳退火温度。结果表明,提取的基因组DNA符合要求,确定了10条引物及相应退火温度。钻天柳居群种群遗传多样性相对丰富,多态条带百分率平均值为91.91%,物种水平为92.22%,有一定遗传变异,且海拔548 m时Shannon信息指数、Nei's基因多样性指数达到最高值。种群间遗传分化系数GST=0.2303,遗传分化明显有基因流,5个天然居群亲缘关系较近,遗传相似度0.8867~0.9651,遗传距离0.0355~0.1203,29株个体分为4大组群。研究认为钻天柳遗传多样性源于遗传变异,其繁育系统和种子传播方式影响遗传结构,地理隔离影响不显著。 展开更多
关键词 钻天柳 issr分子标记 遗传多样性 遗传结构
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珍稀树种望天树ISSR-PCR反应体系的建立和优化
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作者 黎婷演 李婷 +3 位作者 谢乐 梁小春 徐圆圆 杨梅 《西北林学院学报》 北大核心 2025年第4期127-135,146,共10页
为建立适合望天树的ISSR-PCR反应体系,以望天树嫩叶为试验材料,采用L_(16)(4^(5))正交试验设计对ISSR-PCR反应的5个因素即模板DNA浓度、Mg^(2+)浓度、dNTPs浓度、Taq DNA聚合酶含量及引物浓度进行优化,建立适用于望天树的最佳ISSR-PCR... 为建立适合望天树的ISSR-PCR反应体系,以望天树嫩叶为试验材料,采用L_(16)(4^(5))正交试验设计对ISSR-PCR反应的5个因素即模板DNA浓度、Mg^(2+)浓度、dNTPs浓度、Taq DNA聚合酶含量及引物浓度进行优化,建立适用于望天树的最佳ISSR-PCR反应体系,且在此基础上筛选出适合该反应体系的引物和最佳退火温度,最终以望天树5个家系为材料验证反应体系的稳定性。结果表明,望天树ISSR-PCR最佳反应体系(20μL)各组分终浓度为:模板DNA 90 ng,引物浓度0.3μmol/L,dNTPs浓度0.2 mmol/L,Mg^(2+)浓度2.5 mmol/L,Taq DNA聚合酶1.0 U;筛选出3条重复性好、条带清晰、多态性高的ISSR引物,且最佳引物(UBC864)的最适退火温度为56.9℃。采用优化后的反应体系及引物对5个望天树种源样品进行ISSR-PCR条带检测,结果表明上述反应体系稳定可靠。该ISSR-PCR优化体系和候选引物适用于望天树遗传多样性分析,可为望天树种质资源保护与利用研究工作奠定基础。 展开更多
关键词 望天树 issr-PCR 正交试验设计 体系优化 引物筛选
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基于ISSR分子标记的金花菌遗传多样性分析
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作者 吴凤 黄显雅 +3 位作者 秦玉燕 周海兰 蒋越华 李菊馨 《南方农业学报》 北大核心 2025年第7期2230-2238,共9页
【目的】基于ISSR分子标记对不同地理来源的金花菌进行遗传多样性分析,为金花菌菌种资源的分类鉴定、评价及挖掘利用提供科学依据。【方法】利用ISSR分子标记对湖南益阳、陕西咸阳、广西横州和广西梧州4个不同地理来源的61株金花菌菌株... 【目的】基于ISSR分子标记对不同地理来源的金花菌进行遗传多样性分析,为金花菌菌种资源的分类鉴定、评价及挖掘利用提供科学依据。【方法】利用ISSR分子标记对湖南益阳、陕西咸阳、广西横州和广西梧州4个不同地理来源的61株金花菌菌株进行遗传多样性分析;使用NSYSpc 2.10e计算不同菌株之间的遗传相似系数并进行非加权组平均法(UPGMA)聚类分析,使用PopGene 1.32计算遗传多样性相关参数。【结果】使用11条ISSR引物共扩增获得168个位点,其中多态性位点158个,多态性比例为94.0%。UPGMA聚类分析结果显示,61株金花菌菌株之间的遗传相似系数在0.48~1.00;当遗传相似系数为0.60时,61株金花菌菌株被分为5个类群,类群Ⅰ为冠突曲霉(Aspergillus cristatus),类群Ⅱ为谢瓦氏曲霉(Aspergillus chevalieri),类群Ⅲ为假灰绿曲霉(Aspergillus pseudoglaucus),类群Ⅳ为Aspergillus cibarius,类群Ⅴ为赤曲霉(Aspergillus ruber)。4个地理群体的Nei’s遗传一致度在0.7409~0.9967,平均值为0.8607;遗传距离在0.0033~0.3000,平均值为0.1560;其中,陕西咸阳群体与湖南益阳群体之间的遗传距离最小,Nei’s遗传一致度最高,而广西梧州群体与湖南益阳群体之间的遗传距离最大,Nei’s遗传一致度最低。61株金花菌菌株的平均Nei’s基因多样性指数(H')为0.2622,平均Shannon’s信息指数(I)为0.4082,群体间遗传分化系数为0.4228,群体基因流值为0.6825。【结论】金花菌菌株具有丰富的遗传多样性,ISSR类群划分与金花菌菌种分类具有一定关联,同一菌种的遗传多样性与地理来源之间不存在明显的相关性。 展开更多
关键词 金花菌 曲霉属 冠突曲霉 issr分子标记 遗传多样性
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基于ISSR标记的大别山区野生蕲艾种质资源评价
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作者 董翔 杨敏 +5 位作者 廖新安 夏恒建 张文才 王圣军 彭仕梅 曾长立 《农业与技术》 2025年第22期107-111,共5页
种质资源又称遗传资源,已成为国家战略资源,事关国家主权和安全。蕲艾是我国常见传统中药材和国家地理标志产品,已成为大别山区乡村振兴的重要产业。基于ISSR分子标记分析了分布于大别山区4个蕲艾野生种群的遗传资源。研究结果揭示,89.... 种质资源又称遗传资源,已成为国家战略资源,事关国家主权和安全。蕲艾是我国常见传统中药材和国家地理标志产品,已成为大别山区乡村振兴的重要产业。基于ISSR分子标记分析了分布于大别山区4个蕲艾野生种群的遗传资源。研究结果揭示,89.74%的PPB(多态性位点百分率)存在于蕲艾的物种水平,体现出在物种水平上蕲艾的遗传多样性水平较高。4个野生种群间的PPB变化比较大,范围在38.46%~79.49%。蕲春县翁堑村(AWQ)和蕲春县九棵松村(AJK)2个种群的遗传多样性较高,遗传资源丰富(PPB分别为79.49%、74.36%),而赤龙湖国家湿地公园华中影视城蕲艾种群(ACL)遗传多样性最低(PPB为38.46%)。分子变异分析展示种群内的遗传变异高于种群间,达到79.55%。种群聚类分析揭示AWQ和AJK 2个种群聚在一起,蕲春县塘埦(ATW)种群单独分开自成一支,48个蕲艾个体聚类分析表明同一种群的个体有些同其他种群的个体聚在一块。建议优选保护AWQ和AJK等野生种质资源,建立保护点。本研究为野生蕲艾资源的保护与利用、新品种培育提供重要的数据,助力乡村振兴产业健康发展。 展开更多
关键词 大别山 蕲艾 野生种群 issr 遗传资源
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江西铅山红芽芋脱毒苗遗传稳定性的ISSR检测
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作者 张艺欣 阿迪莱·吾马尔 +4 位作者 哈丽米兰·艾合买提 杜静怡 何凌婷 张芝瑶 闵凌瑞 《种子》 北大核心 2025年第10期244-252,共9页
江西铅山红芽芋一般是以球茎进行无性繁殖,在其无性繁殖过程中容易感染病毒,病毒在植株体内积累易造成种性退化、产量下降、品质变劣,因此,培育其脱毒苗具有重要的现实意义。为了检测江西铅山红芽芋脱毒苗的遗传稳定性,采用ISSR分子标... 江西铅山红芽芋一般是以球茎进行无性繁殖,在其无性繁殖过程中容易感染病毒,病毒在植株体内积累易造成种性退化、产量下降、品质变劣,因此,培育其脱毒苗具有重要的现实意义。为了检测江西铅山红芽芋脱毒苗的遗传稳定性,采用ISSR分子标记技术对茎尖常规培养脱毒苗、茎尖玻璃化法、茎尖包埋玻璃化法、茎尖包埋脱水法和茎尖小滴玻璃化法超低温疗法脱毒苗的遗传稳定性进行检测。结果表明,江西铅山红芽芋较佳的ISSR引物有6条(807、825、827、836、857和868),6条引物对江西铅山红芽芋9个样本进行PCR扩增,共得到总位点59个,其中多态位点有21个,多态百分数为35.59%。不同引物扩增得到的总位点数量存在差异,多态位点的范围为1~6个,平均每对引物检测到的多态位点为3.5个。6条引物检测到的观察等位基因数的范围为1.1429~1.6000,有效等位基因数的范围为1.1143~1.4763,Nei's基因多样性指数的范围为0.1222~0.2572,Shannon's信息指数的范围为0.2048~0.3690。江西铅山红芽芋9个样本的遗传相似系数为0.7596~0.9135,均超过0.7,说明江西铅山红芽芋9个样本的遗传变异程度较低。UPGMA聚类分析结果表明,江西铅山红芽芋的茎尖玻璃化法、茎尖包埋脱水法、茎尖包埋玻璃化法和茎尖小滴玻璃化法超低温脱毒可能会造成江西铅山红芽芋的遗传变异,但茎尖常规培养脱毒不会造成江西铅山红芽芋的遗传变异。 展开更多
关键词 江西铅山红芽芋 脱毒苗 遗传稳定性 issr检测
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罗汉果ISSR-PCR反应体系优化及引物筛选
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作者 关妙娟 李金梅 +3 位作者 谭勇 罗湘 吴梦伟 杜沛霖 《安徽农业科学》 2025年第21期100-104,共5页
[目的]建立高效、稳定的罗汉果ISSR-PCR反应体系。[方法]采用正交试验设计L_(16)(4^(5))对影响ISSR-PCR反应体系的模板DNA、引物、Mg^(2+)、dNTPs、Taq酶进行优化,确定罗汉果ISSR-PCR最优体系。[结果]在20μL中,罗汉果最优ISSR-PCR反应... [目的]建立高效、稳定的罗汉果ISSR-PCR反应体系。[方法]采用正交试验设计L_(16)(4^(5))对影响ISSR-PCR反应体系的模板DNA、引物、Mg^(2+)、dNTPs、Taq酶进行优化,确定罗汉果ISSR-PCR最优体系。[结果]在20μL中,罗汉果最优ISSR-PCR反应体系条件为10×Buffer 2.0μL,Mg^(2+)1.5 mmol/L(1.2μL)、dNTPs 0.3 mmol/L(2.4μL)、Taq酶1.0 U、引物0.4μmol/L(0.8μL)、模板DNA 75 ng(1.5μL)。以最佳反应条件为前提,使用100条ISSR通用引物进行试验,挑选清楚明晰、规整条带的通用引物10条,最后选定引物最高效退火温度。[结论]该试验为罗汉果的品种间近缘关系、遗传资源和生物的多样性研究提供了参考。 展开更多
关键词 罗汉果 issr 体系优化 引物筛选
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牡丹‘粉丽’翠叶后代的ISSR标记鉴定及遗传多样性分析
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作者 冀含乐 马会萍 +3 位作者 韩鲲 闫进晓 郭亚珍 王二强 《特产研究》 2025年第5期11-15,共5页
本研究旨在通过ISSR分子标记技术,探究牡丹‘粉丽’及其翠叶杂交后代的分子多态性、遗传规律及真杂种鉴定。以牡丹品种‘粉丽’为母本,分别与‘粉中冠’和‘赵粉’杂交,获得翠叶杂交后代,提取父母本及后代的基因组DNA,筛选ISSR引物并进... 本研究旨在通过ISSR分子标记技术,探究牡丹‘粉丽’及其翠叶杂交后代的分子多态性、遗传规律及真杂种鉴定。以牡丹品种‘粉丽’为母本,分别与‘粉中冠’和‘赵粉’杂交,获得翠叶杂交后代,提取父母本及后代的基因组DNA,筛选ISSR引物并进行PCR扩增,通过电泳分析多态性条带,采用UPGMA法进行聚类分析。从96个引物中筛选出12个多态性引物,共获得1 573个电泳条带,其中1 527个为多态性条带,多态比率达97.08%。聚类分析显示,3个翠叶杂交后代与亲本的遗传相似系数在0.877 4~0.890 7之间,表明其为真杂种且遗传多样性较高。ISSR分子标记技术可用于牡丹杂交后代的真伪鉴定及亲缘关系分析,为牡丹资源挖掘及杂交育种提供理论依据。 展开更多
关键词 牡丹‘粉丽’ 翠叶后代 issr分析 真杂种鉴定 遗传多样性
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