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49份柠檬种质遗传多样性的ISSR分析
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作者 余智城 陈振东 林秀香 《中国南方果树》 北大核心 2026年第1期31-34,共4页
探明柠檬种质资源遗传多样性,能为其保护与利用提供依据。采用ISSR分子标记技术对柠檬及近缘种49份材料进行遗传多样性分析。筛选出的12条ISSR引物共检测到87条DNA条带,其中77条为多态性条带,多态性条带比率为88.51%。聚类结果显示在遗... 探明柠檬种质资源遗传多样性,能为其保护与利用提供依据。采用ISSR分子标记技术对柠檬及近缘种49份材料进行遗传多样性分析。筛选出的12条ISSR引物共检测到87条DNA条带,其中77条为多态性条带,多态性条带比率为88.51%。聚类结果显示在遗传距离0.130时,可将49份样品划分为4个大类群。研究结果对柠檬种质资源的保护利用和遗传改良有重要意义。 展开更多
关键词 柠檬 issr 遗传多样性
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应用ISSR分子标记鉴定天麻杂交后代研究
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作者 崔丽丽 冯志伟 +5 位作者 郭鸿莹 陈曦 金美伶 王继阳 常彤 宋超 《特产研究》 2026年第1期91-96,共6页
杂交后代纯度是天麻种质创新的关键,纯度鉴定技术作为1杂交种鉴定评价的工具至关重要。为鉴定天麻杂交种的遗传纯度,本文利用ISSR分子标记技术对天麻杂交种及其亲本进行分析,从20条有效引物中筛选出5条特异性引物(编号为807,834,835,841... 杂交后代纯度是天麻种质创新的关键,纯度鉴定技术作为1杂交种鉴定评价的工具至关重要。为鉴定天麻杂交种的遗传纯度,本文利用ISSR分子标记技术对天麻杂交种及其亲本进行分析,从20条有效引物中筛选出5条特异性引物(编号为807,834,835,841,873)。结果表明,5条引物可快速有效地辨别杂交种,对供试杂交天麻后代的鉴定率为100%。聚类分析显示,WH01和WH02杂交F1代均与亲本红天麻的遗传关系最近,而WH03杂交后代与亲本遗传关系都较远。ISSR分子标记技术可准确、快速鉴定天麻杂交后代真实性,F1代和亲本之间、F1代之间都存在丰富的遗传变异。 展开更多
关键词 天麻 杂交 issr分子标记技术 种子纯度 鉴定
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采用ISSR评价东北地区不同滑菇栽培品种性状
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作者 韩闯 王凤利 +3 位作者 岳欣 赵彦姝 张景文 戴肖东 《中国瓜菜》 北大核心 2026年第1期134-140,共7页
为明确东北地区滑菇主栽品种的生物学特性与遗传背景,选取当地11个滑菇主栽品种,通过菌丝形态观察、ISSR分子标记分析以及农法栽培试验,系统评价其栽培性状和遗传性状。结果表明,11个滑菇品种ISSR比对整体具有良好的遗传多样性,遗传相... 为明确东北地区滑菇主栽品种的生物学特性与遗传背景,选取当地11个滑菇主栽品种,通过菌丝形态观察、ISSR分子标记分析以及农法栽培试验,系统评价其栽培性状和遗传性状。结果表明,11个滑菇品种ISSR比对整体具有良好的遗传多样性,遗传相似系数为0.74时聚为3簇,其中罗2023单独分支。早壮、罗2023、吉滑1号和日滑199这4个品种在各项测试中表现突出,菌丝长速快(≥0.42 cm·d^(-1)),遗传差异较大,长满袋时间短(≤25 d),出现首个菇蕾时间早(≤80 d),前2潮次产量高(≥290 g·袋^(-1)),且子实体色泽鲜亮、抗性强。综上,早壮、罗2023、吉滑1号和日滑199这4个品种兼具早生性、高产性与环境适应性,可作为东北低温寒区农法栽培的早生型重点栽培品种。 展开更多
关键词 滑菇 品种比较 issr标记 产量
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^(60)Co-γ射线对浙麦冬的生物学效应和ISSR分子标记研究
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作者 史晟旖 吴怡 +2 位作者 张亦琨 杨秀戍 倪穗 《核农学报》 北大核心 2026年第4期653-662,共10页
浙麦冬(Ophiopogon japonicus)存在品种老化、产量低、生长周期长,以及长期的无性繁殖导致遗传多样性降低等问题。为了加强浙麦冬资源的种质创新,本研究采用不同辐射剂量(0、30、60、90、120、150 Gy)的^(60)Co-γ射线对浙麦冬开展辐射... 浙麦冬(Ophiopogon japonicus)存在品种老化、产量低、生长周期长,以及长期的无性繁殖导致遗传多样性降低等问题。为了加强浙麦冬资源的种质创新,本研究采用不同辐射剂量(0、30、60、90、120、150 Gy)的^(60)Co-γ射线对浙麦冬开展辐射育种试验,以形态学和生理生化指标为依据,并结合简单重复序列区间(ISSR)分子标记技术,筛选出浙麦冬辐射诱变的最佳辐射剂量。结果表明,随着^(60)Co-γ射线剂量的升高,浙麦冬存活率不断下降,60 d后达到稳定水平,植株叶片颜色变深,株型变小,生长抑制作用明显。过氧化氢酶(CAT)活性和丙二醛(MDA)含量呈现逐渐上升趋势,脯氨酸(Pro)、可溶性糖含量和过氧化物酶(POD)、超氧化物歧化酶(SOD)活性均呈现先升后降的趋势,多在90 Gy达到最大值。叶片蜡质层出现斑片状脱落,气孔密度变大,面积减小,多呈闭合状态。相关性分析和主成分分析结果揭示了浙麦冬的生长抑制与抗氧化防御作用增强并存。ISSR分子标记鉴定结果显示,10条ISSR引物共扩增出84条谱带,其中54条(64.3%)具有多态性,多态性比例在37.5%~88.9%,且辐射剂量越高,与对照组的遗传距离越远,兼顾形态适应性、生理耐受性及遗传变异率,获得浙麦冬辐射诱变最适的^(60)Co-γ辐射剂量为90 Gy。本研究结果为浙麦冬的新品种培育提供了理论参考。 展开更多
关键词 浙麦冬 ^(60)Co-γ射线 辐射诱变 生物学效应 issr
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秀珍菇菌株拮抗鉴定及ISSR遗传多样性分析
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作者 孙楚涵 王娇 +5 位作者 贺琪 刘支宽 龚文兵 周雪 夏志兰 吴秋云 《中国食用菌》 2026年第1期19-23,共5页
通过拮抗试验及ISSR分子标记手段对11个秀珍菇菌株进行鉴定和遗传多样性分析,以明确其亲缘关系。拮抗试验结果表明,11个菌株的55种组合中,有29个组合有拮抗线且呈隆起型,25个组合有拮抗线且呈沟壑型。ISSR结果显示,11个菌株的遗传相似... 通过拮抗试验及ISSR分子标记手段对11个秀珍菇菌株进行鉴定和遗传多样性分析,以明确其亲缘关系。拮抗试验结果表明,11个菌株的55种组合中,有29个组合有拮抗线且呈隆起型,25个组合有拮抗线且呈沟壑型。ISSR结果显示,11个菌株的遗传相似系数为0.57时遗传差异与多样性明显,可划分为5个遗传聚类组:Ⅰ组包括秀珍菇18、台秀1号;Ⅱ组包括秀珍菇93、台秀2号;Ⅲ组包括台秀3号、新秀169、基因2005;Ⅳ组包括秀珍菇71、秀珍菇705、金秀1号;Ⅴ组包括秀珍菇1672。Ⅰ组和Ⅴ组与其他组之间遗传距离较远。试验结果可为秀珍菇育种的亲本选择及资源利用提供参考。 展开更多
关键词 秀珍菇 菌株 拮抗鉴定 issr分子标记
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基于ISSR分子标记的山药种质资源遗传多样性分析
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作者 王晓民 胡晓丽 +5 位作者 许爱玲 韩丽丽 关望辉 张鹏飞 上官晓霞 杨琴丽 《山西农业科学》 2026年第2期27-34,共8页
为明确山药种质资源的遗传多样性并指导品种选育,利用简单重复序列间扩增(ISSR)分子标记技术对34份山药种质的Nei's基因多样性指数(H)、Shannon信息指数(I)、有效等位基因数(Ne)等遗传多样性指标进行了分析,并进一步开展了群体结构... 为明确山药种质资源的遗传多样性并指导品种选育,利用简单重复序列间扩增(ISSR)分子标记技术对34份山药种质的Nei's基因多样性指数(H)、Shannon信息指数(I)、有效等位基因数(Ne)等遗传多样性指标进行了分析,并进一步开展了群体结构分析、聚类分析和主成分分析。结果显示,34份山药材料共检测出109条多态性条带,多态率为95.94%,有效等位基因数为1.430 5,Nei's基因多样性指数为0.267 0,Shannon指数为0.417 3,表明这些山药种质具有较高的分子多态性。群体结构分析结果显示,34份种质材料中存在4个基因库,其中,基因库1和基因库2为优势来源,基因组成占比分别为47.06%和29.41%。聚类分析结果显示,34份山药材料遗传相似系数(GS)为0.54~0.91,其中,GS为0.64时,34份山药种质聚为4大类。主成分分析结果显示,34份山药材料被分为4个相互独立的类群,群体分布较分散,不同群体间无明显重叠现象,表明山药种质资源遗传结构清晰,群体间存在显著的遗传差异。 展开更多
关键词 山药 种质资源 issr 群体结构分析 主成分分析 聚类分析 遗传多样性分析
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基于ISSR分子标记的蓝果忍冬表型及遗传多样性分析
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作者 刘健 齐雨 +6 位作者 王艳敏 白卉 韩文哲 杨攀科 黄佳奇 曹光浩 李海霞 《福建农林大学学报(自然科学版)》 北大核心 2026年第1期12-21,共10页
【目的】解析60份蓝果忍冬种质的遗传背景与表型特征,阐明种质资源的遗传多样性特征与亲缘关系,为该树种的品种鉴定、遗传改良及高效育种提供理论依据。【方法】对黑河中俄合作科技园区内的60份蓝果忍冬种质进行系统表型观测与水培取样... 【目的】解析60份蓝果忍冬种质的遗传背景与表型特征,阐明种质资源的遗传多样性特征与亲缘关系,为该树种的品种鉴定、遗传改良及高效育种提供理论依据。【方法】对黑河中俄合作科技园区内的60份蓝果忍冬种质进行系统表型观测与水培取样,利用简单重复间序列(ISSR)分子标记技术对其进行分析,基于NTSYS软件计算其遗传多样性指标,采用UPGMA法进行聚类分析,并构建遗传关系聚类图。【结果】基于表型性状的聚类分析将供试材料划分为4个显著差异类群:Ⅰ类(22个)表现为直立株型特征,其各性状指标均值处于中等水平;Ⅱ类(22个)展现出综合优异性状,其中以枝条顶端花青素着色强度表现突出;Ⅲ类(13个)以显著的不定芽发育能力为典型特征;Ⅳ类(3个)则在11项质量性状上呈现系统性生长缺陷,植株长势及分枝能力均显著低于其他类群。在遗传多样性分析方面,采用ISSR分子标记技术筛选出10条多态性引物,共扩增出68条条带(200~4000 bp),多态性比率达89.7%,表明所选引物具有理想的遗传鉴别能力。60个品种间的遗传相似性系数介于0.53~0.93,说明蓝果忍冬品种具有较广的遗传基础;基于遗传距离的聚类进一步将60个品种划分为A、B、C、D 4个类群,其中,B类群和C类群分别对应高花青素含量和强不定芽发育能力的表型类群,并表现出相对较近的遗传关系。L0-044与L0-005、L0-007与L0-044、L0-038与L0-0353组品种遗传相似度最高,而L0-168与L0-078遗传分化程度最大。【结论】蓝果忍冬种质的遗传多样性丰富,可将表型与分子聚类一致地划分为4个类群。其中,遗传类群B、C具备作为互补亲本实现性状聚合的潜力。 展开更多
关键词 蓝果忍冬 issr 表型性状 遗传多样性 聚类分析
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基于农艺性状及ISSR分子标记的哈密大枣遗传多样性分析
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作者 寇邦科 秦伟 +5 位作者 陈鹏飞 胡颖慧 英洁 张迎春 翟晨 杜红艳 《植物遗传资源学报》 北大核心 2026年第3期528-542,共15页
哈密大枣(Ziziphus jujuba‘Hamidazao’)是新疆特有的地方优良品种,对其开展遗传多样性研究对哈密大枣优质种源的保护和良种选育具有重要意义。以74份哈密大枣优株为材料,对30个农艺性状进行测量,采用变异分析、聚类分析等方法进行综... 哈密大枣(Ziziphus jujuba‘Hamidazao’)是新疆特有的地方优良品种,对其开展遗传多样性研究对哈密大枣优质种源的保护和良种选育具有重要意义。以74份哈密大枣优株为材料,对30个农艺性状进行测量,采用变异分析、聚类分析等方法进行综合评价,并用11条多态性高的ISSR引物进行PCR扩增分析。结果显示,哈密大枣优株之间的农艺性状变异系数在5.99%~30.09%之间,遗传多样性指数在1.36~1.95之间;基于表型性状聚类,在欧氏距离27处可将74份材料分为五大类群,第Ⅰ类表现出较强的营养生长势能,第Ⅱ类针刺长度显著高于其他类别,第Ⅲ类存在明显的生长弱势,第Ⅳ类呈现出均衡且偏优的生长势,第Ⅴ类为具有高产潜力的优良种质资源。11条ISSR引物在74份哈密大枣优株中共检测到94条条带,其中多态性条带75条,平均每个引物多态性条带比例为80.30%,平均观测等位基因数为1.80,平均有效等位基因数为1.35,平均Nei′s基因多样性指数为0.21,平均Shannon′s多样性信息指数为0.33。基于遗传相似系数可将哈密大枣优株分为五大类群,第Ⅰ类仅包括HM56单株,第Ⅱ类仅包括HM57,第Ⅲ类包含HM21、HM27、HM49和HM64,第Ⅳ类包括HM22和HM32,其余66份材料均归属于第Ⅴ类。优株之间遗传距离在0.04~0.52之间,遗传相似性在0.60~0.96之间,遗传相似性最高且遗传距离最小的组合为HM7与HM8、HM7与HM11;而遗传相似性最低且遗传距离最大的组合为HM3与HM56。研究表明哈密大枣优株之间具有一定的遗传变异,遗传信息相对丰富,可为未来哈密大枣资源利用和良种选育提供理论依据。 展开更多
关键词 哈密大枣 种质资源 农艺性状 issr标记 遗传多样性
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基于SSR和ISSR分子标记的华南地区香稻种质资源遗传多样性分析
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作者 陈兆贵 林倩宜 +3 位作者 林燕文 谭茜如 李梅清 刘冠明 《湖南农业科学》 2026年第2期1-7,共7页
采用SSR和ISSR分子标记技术,对20份华南地区香稻材料的遗传多样性进行了分析,揭示不同材料间的遗传特征。结果表明:SSR标记体系筛选的8对引物共扩增出63条条带,其中41条条带表现多态性,多态条带比率平均为63.07%,材料的遗传相似系数为0.... 采用SSR和ISSR分子标记技术,对20份华南地区香稻材料的遗传多样性进行了分析,揭示不同材料间的遗传特征。结果表明:SSR标记体系筛选的8对引物共扩增出63条条带,其中41条条带表现多态性,多态条带比率平均为63.07%,材料的遗传相似系数为0.3829~0.9696,平均值为0.6763,呈中等多态性。ISSR标记体系筛选5条引物扩增出38条带,其中15条带具有多态性,多态条带比率平均为41.80%,材料间遗传相似系数为0.7142~0.9859,平均值达0.8501,多态性较低。SSR标记检测到的多态性显著高于ISSR,更适合香稻遗传多样性分析。将2种分子标记得出的数据进行聚类分析,均将供试材料分为3大类群:类群Ⅰ包含17份材料,类群Ⅱ和Ⅲ分别包含1份和2份材料,2种标记在主要类群划分上具有一致性,但在部分材料(象香丝苗、美香占)的归类上存在差异,表明栽培稻遗传基础狭窄,且材料之间遗传存在一定差异。 展开更多
关键词 香稻 SSR issr 种质资源 遗传多样性 华南地区
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药用菊花花型性状与ISSR和SCoT标记关联分析
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作者 许兰杰 余永亮 +6 位作者 安素妨 董薇 吴晓慧 杨青 冯俊平 杨红旗 梁慧珍 《福建农业学报》 北大核心 2025年第10期987-996,共10页
【目的】筛选与药用菊花花型性状紧密关联的分子标记,为分子标记辅助育种提供技术依据。【方法】选用11条简单序列重复区间扩增(inter-simple sequence repeat,ISSR)及20条起始密码子靶向多态性(start codon targeted,SCoT)标记,对64份... 【目的】筛选与药用菊花花型性状紧密关联的分子标记,为分子标记辅助育种提供技术依据。【方法】选用11条简单序列重复区间扩增(inter-simple sequence repeat,ISSR)及20条起始密码子靶向多态性(start codon targeted,SCoT)标记,对64份药用菊花种质开展全基因组多位点扫描;运用OriginPro 2024和Structure 2.3软件分析其表型遗传多样性和分子群体结构;借助Tassel 5.0软件对9个花型性状与分子标记开展关联分析。【结果】64份药用菊花种质的9个花型性状的变异系数为30.67%~82.72%;31条标记在64份种质中累计扩增出197个多态性位点,多态性比率平均为88.33%;多态性信息量值(polymorphism information content,PIC)为0.57~0.87,平均值为0.78;相关性分析表明,花型性状间存在显著或极显著正相关;花型性状聚类分析表明,64份药用菊花种质可聚为大花型、小花型和中间型3大类;当K=4时,ΔK值达最大值,64份种质被划分为4个类群,其中Q>0.6的种质占比81.25%;关联分析发现,12个标记位点与8个花型性状显著关联(P<0.01),各位点对花型变异的解释率为11.74%~29.27%,其中ISSR37对外舌状花长的解释率最高。【结论】药用菊花花型性状遗传多样性丰富,所获得的12个与花型显著关联的分子标记可为高产、优质菊花新品种选育提供分子辅助手段。 展开更多
关键词 药用菊花 种质资源 花型性状 issr分子标记 SCoT分子标记
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连翘居群遗传多样性的ISSR分析
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作者 汤正辉 代子闻 《中南林业科技大学学报》 北大核心 2025年第5期132-140,153,共10页
【目的】分析连翘Forsythia suspensa自然居群的遗传多样性,为野生连翘种质资源收集、保存和良种选育等研究提供理论依据。【方法】应用ISSR分子标记对分布广泛的9个连翘自然居群138个野生单株进行遗传多样性分析。【结果】12条引物共得... 【目的】分析连翘Forsythia suspensa自然居群的遗传多样性,为野生连翘种质资源收集、保存和良种选育等研究提供理论依据。【方法】应用ISSR分子标记对分布广泛的9个连翘自然居群138个野生单株进行遗传多样性分析。【结果】12条引物共得到4485个重复性好的位点,平均每条引物扩增条带的数目为373.8条,使用POPGENE 32软件进行分析,在物种水平上,多态位点百分率为100%;总遗传多样性指数(Nei’s基因多样性指数H)为0.1091,Shannon信息多样性指数(I)为0.2010;居群间遗传分化系数(Gst)为0.1255,居群间的遗传变异占了总遗传变异的12.55%,87.45%的遗传变异来自居群内部;9个自然居群间的遗传距离为0.0018~0.0214,连翘居群间的遗传距离非常小,遗传相似度很高。使用NTSYS-pc 2.10e软件,根据遗传一致度进行样本间亲缘关系的UPGMA聚类分析,138个样本可划分为5个组,各山系的样本基本能够聚为一组,各组样本又存在连翘居群彼此交叉的情形,但地理位置近的样本因遗传距离较近会分入同一个组。【结论】连翘种质资源具有很高的遗传多样性,群体间存在高度的遗传分化,遗传变异主要来源于居群内的个体。人为因素干扰会造成居群规模变小、遗传多样性降低的情况。居群间遗传距离与地理距离在大区域尺度上具有相关性,而较小区域的居群间二者无相关性。 展开更多
关键词 连翘 遗传多样性 issr 聚类分析
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基于SRAP和ISSR标记的花椒种质资源遗传多样性及群体结构分析 被引量:2
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作者 李晋华 汪志燚 +4 位作者 王少铭 冷家归 侯颖辉 罗莉斯 李德文 《种子》 北大核心 2025年第1期10-18,30,共10页
为探究国内花椒种质资源遗传多样性及群体结构,本研究采用ISSR和SRAP分子标记技术对48份花椒资源进行遗传多样性、亲缘关系及群体结构分析。结果表明,利用筛选的6对SRAP、7条ISSR引物分别扩增出43条、56条多态性条带,多态性比率分别为87... 为探究国内花椒种质资源遗传多样性及群体结构,本研究采用ISSR和SRAP分子标记技术对48份花椒资源进行遗传多样性、亲缘关系及群体结构分析。结果表明,利用筛选的6对SRAP、7条ISSR引物分别扩增出43条、56条多态性条带,多态性比率分别为87.73%、88.89%;48份花椒种质材料的平均Nei's遗传多样性指数为0.4372,平均Shannon's信息指数为0.6217。根据不同来源地,对8个花椒群体进行遗传多样性分析,遗传多样性排序表现为贵州省遵义市群体>陕西省群体>四川省群体>贵州省黔西南州群体>江西省群体>贵州省铜仁市群体>贵州省黔东南州群体>贵州省贵阳市群体;分子遗传变异分析表明,在花椒种质资源总遗传变异中,92%的变异发生在种源内,只有8%的变异发生在种源间;Structure群体遗传结构和UPGMA聚类结果表明,种源间存在中等程度的基因交流现象。利用SRAP和ISSR标记可以对花椒种质资源进行较高效的多态性检出,花椒种质资源的种间遗传分化明显,而同一种类不同来源地资源的遗传分化较小。 展开更多
关键词 花椒 SRAP分子标记 issr分子标记 遗传多样性 群体结构分析
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基于果实性状和ISSR分子标记的荔枝种质遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建 被引量:1
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作者 刘小英 吴碧君 +3 位作者 曾丽兰 张游南 林革 刘国强 《南方农业学报》 北大核心 2025年第7期2216-2229,共14页
【目的】基于果实性状和ISSR分子标记对34份荔枝种质开展遗传多样性及聚类分析,并构建DNA指纹图谱,以期为荔枝种质资源分类鉴定、评价和创新利用提供理论参考。【方法】以我国34份荔枝种质资源为研究对象,对其平均单果重、可溶性固形物... 【目的】基于果实性状和ISSR分子标记对34份荔枝种质开展遗传多样性及聚类分析,并构建DNA指纹图谱,以期为荔枝种质资源分类鉴定、评价和创新利用提供理论参考。【方法】以我国34份荔枝种质资源为研究对象,对其平均单果重、可溶性固形物含量、果形、龟裂片形状、缝合线是否明显等果实性状进行观测,并进行变异分析、多样性分析及相关分析,分别基于果实形状和ISSR分子标记进行聚类分析。最后基于ISSR分子标记检测结果构建DNA指纹图谱。【结果】34份荔枝种质的单果重17.0~57.5 g,可溶性固形物含量13.0%~20.7%,果形有心形、近圆球形、卵圆形、椭圆形、歪心形,龟裂片形状有隆起、锥尖状突起、平滑,缝合线明显或不明显。果实性状的Shannon-Weaver多样性指数为0.67~1.97,其中缝合线是否明显最低,可溶性固形物含量最高。单果重与可溶性固形物含量呈极显著负相关(P<0.01),果形与龟裂片形状呈显著正相关(P<0.05)。基于果实性状的聚类结果显示,在欧氏距离为8时,供试材料被分为四大类,果实性状聚类结果与荔枝种质的果实缝合线是否明显相关性较强,其次是按果形和龟裂片形状进行聚类,且各类群包含不同地区的种质,说明聚类结果与地理分布无明显相关性。17条ISSR引物共扩增出191条条带,其中多态性条带165条,平均多态性比率86.39%,引物UBC835、UBC846和UBC879多态性比率高达100.00%;等位基因数(Na)为1.6875~2.0000,平均为1.8422,有效等位基因数(Ne)为1.2498~1.7177,平均为1.4470,Nei’s基因多样性指数(H')为0.16~0.40,平均为0.26,Shannon’s信息指数(I)为0.2616~0.5746,平均为0.4015。基于ISSR分子标记的聚类结果显示,34份荔枝种质的遗传相似系数为0.5916~0.8691,平均为0.7359,在遗传相似系数0.7100时,供试材料被分成四大类,各类群均包含多个地区的荔枝种质,聚类结果与地理分布无明显相关性,而与果实成熟期存在一定的相关性。ISSR引物UBC857可用于构建34份荔枝种质资源的DNA指纹图谱。【结论】34份荔枝种质果实性状遗传多样性较丰富,但遗传相似系数较高,遗传基础较狭窄。基于果实性状的聚类结果与ISSR分子标记的聚类结果仅部分相同,均与地理分布无明显相关性,分别与荔枝种质的果实缝合线是否明显和果实成熟期存在相关性。引物UBC857可鉴别34份荔枝种质资源。 展开更多
关键词 荔枝 果实性状 issr分子标记 遗传多样性 DNA指纹图谱
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基于ISSR和ITS分子标记的海南砂仁种质资源遗传多样性评价 被引量:2
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作者 罗凡 瞿云苹 +3 位作者 陈振夏 杨涛 范宇光 潘坤 《核农学报》 北大核心 2025年第5期886-896,I0001,共12页
为了对海南砂仁资源进行保护和管理,利用简单序列重复区间(ISSR)和核糖体RNA基因转录间隔区(ITS)技术,使用NTSYS、POPGENE、BioEdit和Clustalx等软件,分析了12个海南砂仁地理居群,共118份种质材料的遗传多样性和遗传分化程度。结果发现,... 为了对海南砂仁资源进行保护和管理,利用简单序列重复区间(ISSR)和核糖体RNA基因转录间隔区(ITS)技术,使用NTSYS、POPGENE、BioEdit和Clustalx等软件,分析了12个海南砂仁地理居群,共118份种质材料的遗传多样性和遗传分化程度。结果发现,ISSR引物筛选共获得25条多态性较高的引物,扩增获得132个位点,其中多态性位点93个,多态性比率达70.45%。通过对观测到的等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、居群内Nei’s基因多样性(H)、Shannon多样性信息指数(I)和基因流(Nm)统计,其平均值分别为1.164、1.103、0.059、0.087和0.271。基于海南砂ITS序列比对信息,检测出了11个单倍型,但在不同的居群中这些单倍型的分布不均匀,多个居群中仅检测出一种单倍型。上述结果表明,居群内的遗传多样性较低,不同地理居群的海南砂基因交流较少、遗传分化明显,居群间的遗传变异是其总遗传多样性的来源,由于居群间基因交流匮乏,已经导致海南砂居群内出现近交衰退。本研究可为海南砂种质资源的保护、利用和可持续开发提供科学依据。 展开更多
关键词 海南砂仁 遗传多样性 遗传分化 issr ITS 单倍型
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基于ISSR分子标记的新疆西天山栒子属种质资源遗传多样性分析 被引量:2
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作者 阿克居力得孜·努尔改里得 李茹雪 +2 位作者 杨禧雨 陆彪 周龙 《植物遗传资源学报》 北大核心 2025年第5期905-915,共11页
为探究新疆西天山栒子属各居群之间的遗传多样性水平及亲缘关系,利用ISSR分子标记对新疆西天山15个野生居群112份栒子属植物进行遗传多样性分析。研究发现,15条ISSR引物共扩增出166个条带,其中多态性条带143个,平均多态性条带比例为86.2... 为探究新疆西天山栒子属各居群之间的遗传多样性水平及亲缘关系,利用ISSR分子标记对新疆西天山15个野生居群112份栒子属植物进行遗传多样性分析。研究发现,15条ISSR引物共扩增出166个条带,其中多态性条带143个,平均多态性条带比例为86.29%,新疆西天山15个野生居群112份栒子属植物的Nei′s基因多样性指数和香农信息指数分别为0.2124和0.3254,各居群间遗传分化系数为0.4259,基因流为0.6740,表明栒子属野生居群水平的遗传分化程度极大且各居群间存在一定的基因交流。新疆西天山栒子属植物在整体水平上的遗传差异明显,遗传多样性较高。在居群水平上,特克斯县北山毛溜沟居群的遗传多样性最为丰富。聚类结果显示,绝大部分地理位置相近的居群聚为一类,但也有部分地理位置相近的居群并没有聚在一起。本研究结果可为新疆西天山栒子属种质资源的有效保护及开发利用提供重要参考依据。 展开更多
关键词 新疆西天山 栒子属 遗传多样性 issr分子标记
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珍稀树种望天树ISSR-PCR反应体系的建立和优化 被引量:1
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作者 黎婷演 李婷 +3 位作者 谢乐 梁小春 徐圆圆 杨梅 《西北林学院学报》 北大核心 2025年第4期127-135,146,共10页
为建立适合望天树的ISSR-PCR反应体系,以望天树嫩叶为试验材料,采用L_(16)(4^(5))正交试验设计对ISSR-PCR反应的5个因素即模板DNA浓度、Mg^(2+)浓度、dNTPs浓度、Taq DNA聚合酶含量及引物浓度进行优化,建立适用于望天树的最佳ISSR-PCR... 为建立适合望天树的ISSR-PCR反应体系,以望天树嫩叶为试验材料,采用L_(16)(4^(5))正交试验设计对ISSR-PCR反应的5个因素即模板DNA浓度、Mg^(2+)浓度、dNTPs浓度、Taq DNA聚合酶含量及引物浓度进行优化,建立适用于望天树的最佳ISSR-PCR反应体系,且在此基础上筛选出适合该反应体系的引物和最佳退火温度,最终以望天树5个家系为材料验证反应体系的稳定性。结果表明,望天树ISSR-PCR最佳反应体系(20μL)各组分终浓度为:模板DNA 90 ng,引物浓度0.3μmol/L,dNTPs浓度0.2 mmol/L,Mg^(2+)浓度2.5 mmol/L,Taq DNA聚合酶1.0 U;筛选出3条重复性好、条带清晰、多态性高的ISSR引物,且最佳引物(UBC864)的最适退火温度为56.9℃。采用优化后的反应体系及引物对5个望天树种源样品进行ISSR-PCR条带检测,结果表明上述反应体系稳定可靠。该ISSR-PCR优化体系和候选引物适用于望天树遗传多样性分析,可为望天树种质资源保护与利用研究工作奠定基础。 展开更多
关键词 望天树 issr-PCR 正交试验设计 体系优化 引物筛选
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基于表型性状和ISSR分析的5个核桃品种亲缘关系鉴定 被引量:1
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作者 吴雨桦 李丕军 +6 位作者 熊福博 李润 刘华 白斌 郑崇文 王静 冯春 《安徽农业科学》 2025年第2期117-123,共7页
[目的]选择四川省栽培面积最大、产量最多的核桃品种“盐源早”(Juglansregia“Yanyuanzao”),探索“盐源早”的亲缘关系。[方法]选择“盐源早”、“三台泡核桃”(Juglanssigillata‘Santai’)、“漾濞泡核桃”(Juglanssigillata“Yangb... [目的]选择四川省栽培面积最大、产量最多的核桃品种“盐源早”(Juglansregia“Yanyuanzao”),探索“盐源早”的亲缘关系。[方法]选择“盐源早”、“三台泡核桃”(Juglanssigillata‘Santai’)、“漾濞泡核桃”(Juglanssigillata“Yangbi”)、“温185”(Juglansregia“Wen185”)、“新新2”(Juglansregia“Xinxin2”)5个核桃品种为试验材料,测定单果重、果仁重、出仁率、坚果三径、果形指数、种壳厚以及果仁成分(粗蛋白、粗脂肪)等指标,通过方差、相关性、聚类与主成分分析等探索5个核桃品种的表型性状和果仁成分多样性;利用ISSR分子标记技术探究“盐源早”等5个核桃品种的遗传多样性和遗传关系。[结果]果实的表型性状与果仁成分多样性分析结果表明,5个核桃品种的单果重、果仁重、出仁率、侧径、横径、纵径、果形指数、种壳厚及果仁成分(粗脂肪、粗蛋白含量)之间差异极显著或显著(P<0.01或P<0.05)。聚类分析和主成分分析结果表明,可将5个核桃品种聚为三大类群,第Ⅰ类为“温185”,第Ⅱ类为“新新2”“盐源早”“漾濞泡核桃”,第Ⅲ类为“三台泡核桃”。利用ISSR分子标记筛选出10条图谱条带清晰,背景明亮,重复性强,多态性较好,稳定性强的引物。通过对扩增图谱进行多态性分析结果表明,5个核桃品种的有效等位基因数均值为1.3370,Nei’s基因多样性指数均值为0.1935,Shannon信息指数均值为0.2858。聚类分析和主成分分析表明,“盐源早”和“漾濞泡核桃”聚为一类,表明亲缘关系表现较近,且相同地区的“温185”和“新新2”聚为一类,“三台泡核桃”聚为一类。[结论]通过对5个核桃品种的果实表型性状、果仁成分及ISSR分子标记的聚类分析得出,“盐源早”与“漾濞泡核桃”亲缘关系较近。 展开更多
关键词 核桃品种 表型性状 果仁成分 issr分子标记
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基于ISSR-SCoT标记结合欧式距离聚类分析24份黄精种质遗传多样性 被引量:1
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作者 叶夏雯 曹书禹 +2 位作者 吴延青 陈铌铍 金波 《广东农业科学》 2025年第3期25-34,共10页
【目的】联合使用ISSR和SCoT分子标记技术,基于UPGMA和欧式距离法聚类分析,从分子水平综合分析不同产地的24份黄精种质的遗传多样性,为促进黄精属种质资源的保护、开发与利用提供参考。【方法】采用ISSR和SCoT两种分子标记技术,对来自我... 【目的】联合使用ISSR和SCoT分子标记技术,基于UPGMA和欧式距离法聚类分析,从分子水平综合分析不同产地的24份黄精种质的遗传多样性,为促进黄精属种质资源的保护、开发与利用提供参考。【方法】采用ISSR和SCoT两种分子标记技术,对来自我国11个省份的24份黄精属植物种质进行遗传多样性分析。【结果】分别从ISSR通用引物和SCoT通用引物中筛选出效果较好的15条引物,扩增后分别获得229条和210条清晰条带的标记,平均多态性百分比分别为98.40%和98.10%。与SCoT标记结果相比,ISSR分子标记技术可获得更多的黄精遗传多态性位点。24份黄精Nei's基因分化系数(G_(st))为0.0474,表明95.26%的遗传变异是在种内进行,基因流N_(m)>1表明种内存在明显的基因流动。其中15份P.sibiricum Red.黄精种质的G_(st)为0.0471,表明95.29%的遗传变异在种内进行,N_(m)>1表明种内基因交流较多。对于ISSR、SCoT和ISSR-SCoT组合数据经UPGMA分析表明,三类数据的聚类结果各有异同。进一步将ISSR-SCoT组合数据运用欧式距离算法进行聚类分析,与UPGMA聚类算法结果一致的是,ZJ6和HN4具有最近的遗传距离,并且将24份黄精遗传系数进行聚类热图可视化后的结果与欧式距离算法聚类结果基本一致。【结论】联合使用ISSR和SCoT分子标记,并综合运用UPGMA和欧式距离算法,可以获得更全面的黄精遗传多样性信息。不同产地的24份黄精种质资源具有丰富的遗传多样性,且与地理位置基本相关。 展开更多
关键词 黄精 issr SCoT 遗传多样性 聚类分析 遗传距离
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基于农艺性状及ISSR标记的铁皮石斛种质资源遗传多样性分析
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作者 董蓉娇 李桂琳 +4 位作者 周侯光 贾敏 姚志军 茶文彪 李泽生 《种子》 北大核心 2025年第6期130-138,共9页
为探索铁皮石斛种质遗传多样性,以云南地区70份铁皮石斛种质资源为试验材料,对15个农艺性状进行测量统计,并用6条ISSR引物进行PCR扩增。结果表明,铁皮石斛种质资源农艺性状变异丰富,变异系数为14.18%~53.16%,遗传多样性指数为1.83~2.29... 为探索铁皮石斛种质遗传多样性,以云南地区70份铁皮石斛种质资源为试验材料,对15个农艺性状进行测量统计,并用6条ISSR引物进行PCR扩增。结果表明,铁皮石斛种质资源农艺性状变异丰富,变异系数为14.18%~53.16%,遗传多样性指数为1.83~2.29;主成分分析结果表明,6个主成分因子累积贡献率为72.44%,能反映铁皮石斛资源的大部分遗传信息;70份材料在遗传距离60.0处时被分为5个亚类群;6个ISSR引物在70份铁皮石斛材料中共检测到50个多态性位点,ISSR引物扩增DNA条带数为2~12,多态性比率100%,平均有效等位基因数目为1.45个,群体多态性信息指数范围为0.08~0.54,群体多样性指数范围为0.03~0.37;在遗传距离为0.30处时,将铁皮石斛资源划分为2个类群,第一类群66份材料,第二类群4份材料。研究表明,铁皮石斛种质资源具有丰富的遗传多样性。 展开更多
关键词 铁皮石斛 种质资源 农艺性状 issr标记 遗传多样性
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月季黑斑病菌ISSR遗传多样性分析
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作者 郭加启 陈锋 +6 位作者 吕博 杨园园 过聪 宋居荣 杨捷 向发云 林建国 《南方农业学报》 北大核心 2025年第2期496-507,共12页
【目的】探讨我国月季黑斑病病原菌的种类、遗传多样性及其亲缘关系,为月季种质黑斑病抗性鉴定及病害防控提供理论依据。【方法】分离来自全国7个大区15个省(区)27个市(县)的月季黑斑病病原菌,扩增菌株ITS序列确定病原菌种类,并经柯赫... 【目的】探讨我国月季黑斑病病原菌的种类、遗传多样性及其亲缘关系,为月季种质黑斑病抗性鉴定及病害防控提供理论依据。【方法】分离来自全国7个大区15个省(区)27个市(县)的月季黑斑病病原菌,扩增菌株ITS序列确定病原菌种类,并经柯赫氏法则验证其致病性。采用ISSR分子标记技术研究病原菌的遗传多样性;将扩增的条带数据记为0-1矩阵,并使用PopGene 32.0计算遗传多样性指数和遗传距离等指标;利用NTsys-pc 2.1进行非加权平均法(UPGMA)聚类分析。【结果】分离得到107株病原菌,按不同市(县)可划分为27个居群;经鉴定107株菌株均为蔷薇盘二孢(Marssonina rosae)。经筛选确定了ISSR-PCR扩增的3条引物,分别为UBC884、UBC885和UBC886,3条引物共扩增出84条条带,多态性条带数为84条,多态性比率为100%,显示出高多态性,可用于蔷薇盘二孢菌株的扩增。107株菌株群体的遗传多样性分析结果显示,菌株居群间的平均观测等位基因数(Na)为1.3369、平均有效等位基因数(Ne)为1.2431,平均Nei’s多样性指数(H)为0.1367,平均Shannon’s信息指数(I)为0.1993,平均总基因多样性(Ht)为0.2827,平均居群内基因多样性(Hs)为0.1368,平均遗传分化系数(Gst)为0.5163,平均基因流(Nm)为0.4684。基于UPGMA聚类分析,107株蔷薇盘二孢菌株在遗传相似性系数为0.57时划分为8个类群,类群Ⅰ~Ⅶ中来自各个地区的菌株相互混杂,Ⅷ中的部分菌株大致根据市(县)的地理位置聚在一起。【结论】107株来自不同地理区域的蔷薇盘二孢菌株表现出丰富的遗传多样性,居群间基因流动水平较低,遗传分化程度较高,且菌株遗传多样性与地理来源之间关联性不强。 展开更多
关键词 月季黑斑病 蔷薇盘二孢 issr分子标记 遗传多样性
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