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山羊IL15RA基因突变位点鉴定及其与生长性状的关联性
1
作者
王本治
王翱
+5 位作者
吴贤锋
徐倩
李文杨
甘乾福
肖天放
刘远
《福建农业学报》
CSCD
北大核心
2024年第11期1218-1227,共10页
【目的】检测福清山羊和努比亚山羊群体细胞介素15受体亚基α(IL15RA–interleukin 15 receptor subunit alpha,IL15RA)基因的表达谱以及突变位点多态性,分析不同位点与山羊生长性状的相关性,进一步分析IL15RA基因对山羊生长性状的影响...
【目的】检测福清山羊和努比亚山羊群体细胞介素15受体亚基α(IL15RA–interleukin 15 receptor subunit alpha,IL15RA)基因的表达谱以及突变位点多态性,分析不同位点与山羊生长性状的相关性,进一步分析IL15RA基因对山羊生长性状的影响。【方法】随机挑选福清山羊和努比亚山羊12月龄羯羊各3只,分别采集心、肝、脾、肺、肾、头颈半棘肌、背最长肌、股四头肌和臀股二头肌共9种组织,采用qRT-PCR方法构建该基因在两个品种不同组织中的表达谱,Sanger测序检测福清山羊(n=108)和努比亚山羊(n=286)群体中IL15RA基因的SNP位点,并分析其与生长性状的相关性。【结果】(1)IL15RA基因在肌肉组织中的表达水平显著低于内脏组织(P<0.05),福清山羊背最长肌表达水平显著低于努比亚山羊(P<0.05),肺部组织表达量显著高于努比亚山羊(P<0.05)。(2)福清山羊和努比亚山羊IL15RA基因内含子3存在1个InDel位点,为g.22224_22225 Del A,Del22224。内含子6存在1个SNP位点,为g.33428A>G。(3)SNP-g.33428位点显著影响(P<0.05)福清山羊的体重、胸围、胸宽、胸深、尻宽等指标。(4)在福清山羊中,单倍型组合DD/AA、ID/GG为优势单倍型组合;在努比亚山羊中,单倍型组合ID/AA、II/GG为优势单倍型组合。【结论】IL15RA基因多态性与福清山羊和努比亚山羊生长性状显著相关,IL15RA基因可作为福清山羊和努比亚山羊生长性状选育的候选基因。
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关键词
山羊
il15ra
基因
单核苷酸多态性
生长发育
关联分析
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职称材料
题名
山羊IL15RA基因突变位点鉴定及其与生长性状的关联性
1
作者
王本治
王翱
吴贤锋
徐倩
李文杨
甘乾福
肖天放
刘远
机构
福建农林大学动物科学学院
福建省农业科学院畜牧兽医研究所
福建省畜禽遗传育种重点实验室
出处
《福建农业学报》
CSCD
北大核心
2024年第11期1218-1227,共10页
基金
福建省科技计划公益类专项(2022R11010025-15)
福建省农业高质量发展超越“5511”协同创新工程项目(XTCXGC2021008)
福建省农业科学院科技创新团队建设项目(CXTD2021006-2)。
文摘
【目的】检测福清山羊和努比亚山羊群体细胞介素15受体亚基α(IL15RA–interleukin 15 receptor subunit alpha,IL15RA)基因的表达谱以及突变位点多态性,分析不同位点与山羊生长性状的相关性,进一步分析IL15RA基因对山羊生长性状的影响。【方法】随机挑选福清山羊和努比亚山羊12月龄羯羊各3只,分别采集心、肝、脾、肺、肾、头颈半棘肌、背最长肌、股四头肌和臀股二头肌共9种组织,采用qRT-PCR方法构建该基因在两个品种不同组织中的表达谱,Sanger测序检测福清山羊(n=108)和努比亚山羊(n=286)群体中IL15RA基因的SNP位点,并分析其与生长性状的相关性。【结果】(1)IL15RA基因在肌肉组织中的表达水平显著低于内脏组织(P<0.05),福清山羊背最长肌表达水平显著低于努比亚山羊(P<0.05),肺部组织表达量显著高于努比亚山羊(P<0.05)。(2)福清山羊和努比亚山羊IL15RA基因内含子3存在1个InDel位点,为g.22224_22225 Del A,Del22224。内含子6存在1个SNP位点,为g.33428A>G。(3)SNP-g.33428位点显著影响(P<0.05)福清山羊的体重、胸围、胸宽、胸深、尻宽等指标。(4)在福清山羊中,单倍型组合DD/AA、ID/GG为优势单倍型组合;在努比亚山羊中,单倍型组合ID/AA、II/GG为优势单倍型组合。【结论】IL15RA基因多态性与福清山羊和努比亚山羊生长性状显著相关,IL15RA基因可作为福清山羊和努比亚山羊生长性状选育的候选基因。
关键词
山羊
il15ra
基因
单核苷酸多态性
生长发育
关联分析
Keywords
goat
il15ra
single nucleotide polymorphisms
growth and development
correlation analysis
分类号
S813 [农业科学—畜牧学]
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题名
作者
出处
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1
山羊IL15RA基因突变位点鉴定及其与生长性状的关联性
王本治
王翱
吴贤锋
徐倩
李文杨
甘乾福
肖天放
刘远
《福建农业学报》
CSCD
北大核心
2024
0
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