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青稞耐低氮相关类甜蛋白基因HvTOND1克隆和亚细胞定位研究
被引量:
4
1
作者
安立昆
姚有华
+1 位作者
姚晓华
吴昆仑
《西北农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第8期1157-1166,共10页
为了探索青稞耐低氮相关类甜蛋白基因HvTOND1的基因和蛋白结构特点,为青稞耐低氮分子机制研究提供基础。以青稞‘昆仑14’叶片为材料,根据植物基因组数据库Gramene(http://www.gramene.org/)中的大麦HvTOND1(HORVU5Hr1G005300)基因和启...
为了探索青稞耐低氮相关类甜蛋白基因HvTOND1的基因和蛋白结构特点,为青稞耐低氮分子机制研究提供基础。以青稞‘昆仑14’叶片为材料,根据植物基因组数据库Gramene(http://www.gramene.org/)中的大麦HvTOND1(HORVU5Hr1G005300)基因和启动子区域序列设计引物,通过PCR获得青稞‘昆仑14’HvTOND1基因和启动子区域序列。采用生物信息学软件对HvTOND1基因启动子区域元件以及蛋白理化性质、跨膜结构、磷酸化位点、信号肽、二级结构、三级结构进行分析。结果表明HvTOND1没有内含子,HvTOND1蛋白由171个氨基酸组成,具有4个磷酸化位点,具有信号肽,不具有跨膜结构。将HvTOND1与其他植物的氨基酸序列进行对比并构建进化树发现青稞HvTOND1与节节麦AtsTOND1亲缘关系最近。亚细胞定位结果显示HvTOND1定位在内质网中。
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关键词
青稞
类甜蛋白
hvtond1基因
生物信息学分析
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职称材料
题名
青稞耐低氮相关类甜蛋白基因HvTOND1克隆和亚细胞定位研究
被引量:
4
1
作者
安立昆
姚有华
姚晓华
吴昆仑
机构
青海大学农林科学院
青海省青稞遗传育种重点实验室
国家麦类改良中心青海青稞分中心
出处
《西北农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第8期1157-1166,共10页
基金
青海省农林科学院创新基金(2019-NKY-O5)
国家自然科学基金(32060423,31960427)
+2 种基金
国家大麦(青稞)产业技术体系(CARS-05)
青海省科技厅重点研发与转化计划项目(2020-NK-119)
国家重点研发计划项目子课题(2019YFD1001701-4)。
文摘
为了探索青稞耐低氮相关类甜蛋白基因HvTOND1的基因和蛋白结构特点,为青稞耐低氮分子机制研究提供基础。以青稞‘昆仑14’叶片为材料,根据植物基因组数据库Gramene(http://www.gramene.org/)中的大麦HvTOND1(HORVU5Hr1G005300)基因和启动子区域序列设计引物,通过PCR获得青稞‘昆仑14’HvTOND1基因和启动子区域序列。采用生物信息学软件对HvTOND1基因启动子区域元件以及蛋白理化性质、跨膜结构、磷酸化位点、信号肽、二级结构、三级结构进行分析。结果表明HvTOND1没有内含子,HvTOND1蛋白由171个氨基酸组成,具有4个磷酸化位点,具有信号肽,不具有跨膜结构。将HvTOND1与其他植物的氨基酸序列进行对比并构建进化树发现青稞HvTOND1与节节麦AtsTOND1亲缘关系最近。亚细胞定位结果显示HvTOND1定位在内质网中。
关键词
青稞
类甜蛋白
hvtond1基因
生物信息学分析
Keywords
Hulless barely(Hordeum vulgare L.var.nudum Hook.f.)
Thaumatin-like protein,
hvtond
1
gene
Bioinformatics analysis
分类号
S513 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
青稞耐低氮相关类甜蛋白基因HvTOND1克隆和亚细胞定位研究
安立昆
姚有华
姚晓华
吴昆仑
《西北农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
4
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