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伯氏螺旋体在小鼠宿主中的关节特异性转录谱(英文)
被引量:
6
1
作者
宝福凯
Erol Fikerig
《科技通报》
2008年第6期832-838,846,共8页
目的建立伯氏疏螺旋体感染的小鼠模型,研究伯氏疏螺旋体在小鼠关节组织中的关节特异性基因表达谱。方法首先,建立伯氏疏螺旋体感染小鼠模型,在不同时间点处死小鼠,收集小鼠关节、心脏、皮肤和膀胱组织,从四种组织中分别提取总RNA;随后,...
目的建立伯氏疏螺旋体感染的小鼠模型,研究伯氏疏螺旋体在小鼠关节组织中的关节特异性基因表达谱。方法首先,建立伯氏疏螺旋体感染小鼠模型,在不同时间点处死小鼠,收集小鼠关节、心脏、皮肤和膀胱组织,从四种组织中分别提取总RNA;随后,用DECAL技术和微阵列技术分析不同时间点伯氏疏螺旋体在四种组织中的转录组;最后,将伯氏疏螺旋体在关节中的转录组依次与其他三种组织中的转录组进行比较,找出仅在关节中表达的伯氏疏螺旋体基因,从而获得伯氏疏螺旋体不同时间点的关节特异性基因表达谱。结果与其他组织相比,在感染后第15天,伯氏疏螺旋体在小鼠关节组织特异地表达21个基因,其中13个基因位于伯氏疏螺旋体染色体上,8个基因位于质粒上;在感染后的第105天,伯氏疏螺旋体在小鼠关节组织特异地表达24个基因,其中13个基因位于伯氏疏螺旋体染色体上,11个基因位于质粒上。结论伯氏疏螺旋体在小鼠关节组织中存在独特的基因表达谱,这些在关节中特异表达的基因可能与莱姆关节炎的发生、发展有关。
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关键词
伯氏疏螺旋体
莱姆病
DECAL技术
微阵列
基因
转录组
表达谱
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职称材料
ERH基因对人膀胱癌细胞周期的影响
被引量:
1
2
作者
周荣升
韩从辉
+5 位作者
陈波
郝林
史振铎
姜波
张治国
庞昆
《中国医药导报》
CAS
2020年第33期4-8,45,F0004,共7页
目的探讨未成熟同源蛋白增强子(ERH)基因影响人膀胱尿路上皮癌(BUC)细胞株T24增殖及凋亡的分子生物学机制。方法将BUC T24细胞分为ERH敲除组和ERH正常组,通过人转录组表达谱芯片技术检测全基因谱中受ERH敲除影响的基因表达情况。通过生...
目的探讨未成熟同源蛋白增强子(ERH)基因影响人膀胱尿路上皮癌(BUC)细胞株T24增殖及凋亡的分子生物学机制。方法将BUC T24细胞分为ERH敲除组和ERH正常组,通过人转录组表达谱芯片技术检测全基因谱中受ERH敲除影响的基因表达情况。通过生物信息分析技术、生物功能富集和蛋白互作分析技术确定ERH基因影响人BUC T24细胞增殖及凋亡的可能分子生物学机制,并通过功能实验加以验证。结果人转录组表达谱芯片结果显示,ERH基因在ERH敲除组表达明显降低,FC值为-4.50,P<0.0001。ERH敲除组比ERH正常组有344个基因表达上调,254个基因表达下调(截断值|FC|>2)。生物功能富集分析结果提示,ERH基因与细胞因子、肿瘤坏死因子、P53下调、细胞凋亡等密切有关;蛋白互作分析技术结果发现ERH基因可能通过细胞周期蛋白影响BUC T24细胞的增殖与凋亡。功能实验提示ERH基因通过细胞周期(主要影响细胞周期的S期)产生上述作用。结论ERH基因通过调控细胞周期影响人膀胱癌T24细胞增殖和凋亡。
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关键词
未成熟同源蛋白增强子基因
膀胱癌
增殖与凋亡
细胞周期
人转录组表达谱芯片技术
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职称材料
题名
伯氏螺旋体在小鼠宿主中的关节特异性转录谱(英文)
被引量:
6
1
作者
宝福凯
Erol Fikerig
机构
昆明医学院微生物学与免疫学教研室
Department of Internal Medicine
出处
《科技通报》
2008年第6期832-838,846,共8页
基金
Supported by the USA NIH(No.:5R21AI054630-02)
文摘
目的建立伯氏疏螺旋体感染的小鼠模型,研究伯氏疏螺旋体在小鼠关节组织中的关节特异性基因表达谱。方法首先,建立伯氏疏螺旋体感染小鼠模型,在不同时间点处死小鼠,收集小鼠关节、心脏、皮肤和膀胱组织,从四种组织中分别提取总RNA;随后,用DECAL技术和微阵列技术分析不同时间点伯氏疏螺旋体在四种组织中的转录组;最后,将伯氏疏螺旋体在关节中的转录组依次与其他三种组织中的转录组进行比较,找出仅在关节中表达的伯氏疏螺旋体基因,从而获得伯氏疏螺旋体不同时间点的关节特异性基因表达谱。结果与其他组织相比,在感染后第15天,伯氏疏螺旋体在小鼠关节组织特异地表达21个基因,其中13个基因位于伯氏疏螺旋体染色体上,8个基因位于质粒上;在感染后的第105天,伯氏疏螺旋体在小鼠关节组织特异地表达24个基因,其中13个基因位于伯氏疏螺旋体染色体上,11个基因位于质粒上。结论伯氏疏螺旋体在小鼠关节组织中存在独特的基因表达谱,这些在关节中特异表达的基因可能与莱姆关节炎的发生、发展有关。
关键词
伯氏疏螺旋体
莱姆病
DECAL技术
微阵列
基因
转录组
表达谱
Keywords
Borrelia burgdorferi
Lyme disease
DECAL
microarray
transcriptome
expression
profile
分类号
R514 [医药卫生—内科学]
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职称材料
题名
ERH基因对人膀胱癌细胞周期的影响
被引量:
1
2
作者
周荣升
韩从辉
陈波
郝林
史振铎
姜波
张治国
庞昆
机构
江苏省徐州市中心医院南京中医药大学附属徐州中心医院东南大学医学院附属徐州医院徐州医科大学徐州临床学院泌尿外科
江苏师范大学生命科学学院
苏州大学附属第三临床学院泌尿外科
出处
《中国医药导报》
CAS
2020年第33期4-8,45,F0004,共7页
基金
国家自然科学基金资助项目(82004110、81774089)
江苏省妇幼保健协会科研项目(FYX202026)
+2 种基金
江苏省徐州市临床技术骨干研修计划项目(2019GG005)
江苏省中医药局科技项目(YB2017055)
江苏省高等学校自然科学研究面上项目(17KJB360001)。
文摘
目的探讨未成熟同源蛋白增强子(ERH)基因影响人膀胱尿路上皮癌(BUC)细胞株T24增殖及凋亡的分子生物学机制。方法将BUC T24细胞分为ERH敲除组和ERH正常组,通过人转录组表达谱芯片技术检测全基因谱中受ERH敲除影响的基因表达情况。通过生物信息分析技术、生物功能富集和蛋白互作分析技术确定ERH基因影响人BUC T24细胞增殖及凋亡的可能分子生物学机制,并通过功能实验加以验证。结果人转录组表达谱芯片结果显示,ERH基因在ERH敲除组表达明显降低,FC值为-4.50,P<0.0001。ERH敲除组比ERH正常组有344个基因表达上调,254个基因表达下调(截断值|FC|>2)。生物功能富集分析结果提示,ERH基因与细胞因子、肿瘤坏死因子、P53下调、细胞凋亡等密切有关;蛋白互作分析技术结果发现ERH基因可能通过细胞周期蛋白影响BUC T24细胞的增殖与凋亡。功能实验提示ERH基因通过细胞周期(主要影响细胞周期的S期)产生上述作用。结论ERH基因通过调控细胞周期影响人膀胱癌T24细胞增殖和凋亡。
关键词
未成熟同源蛋白增强子基因
膀胱癌
增殖与凋亡
细胞周期
人转录组表达谱芯片技术
Keywords
Enhancer of rudimentary homolog gene
Bladder cancer
Proliferation and apoptosis
Cell cycle
human transcriptome expression profile microarray technology
分类号
R737.14 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
伯氏螺旋体在小鼠宿主中的关节特异性转录谱(英文)
宝福凯
Erol Fikerig
《科技通报》
2008
6
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职称材料
2
ERH基因对人膀胱癌细胞周期的影响
周荣升
韩从辉
陈波
郝林
史振铎
姜波
张治国
庞昆
《中国医药导报》
CAS
2020
1
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职称材料
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