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低氧胁迫与常氧条件下斑马鱼鳃中热休克蛋白基因家族的表达差异比较
被引量：
9
1
作者
狄治朝
周涛
许强华
《大连海洋大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第6期690-695,共6页
为研究斑马鱼热休克蛋白(HSP)应对低氧胁迫的生物学功能,对低氧胁迫与常氧条件下斑马鱼Danio rerio鳃组织进行转录组测序,利用实时荧光定量RT-PCR技术检测了低氧胁迫与常氧条件下斑马鱼鳃中热休克蛋白家族基因的表达差异。结果表明:在...
为研究斑马鱼热休克蛋白(HSP)应对低氧胁迫的生物学功能,对低氧胁迫与常氧条件下斑马鱼Danio rerio鳃组织进行转录组测序,利用实时荧光定量RT-PCR技术检测了低氧胁迫与常氧条件下斑马鱼鳃中热休克蛋白家族基因的表达差异。结果表明:在参与比较的斑马鱼鳃转录组测序中,共找到80个热休克蛋白家族基因成员;在低氧与常氧条件下鳃中热休克蛋白家族中有28个基因表达呈明显变化,其中16个基因表达量显著上调(P<0. 05),12个基因表达量显著下调(P<0. 05); Hsp47基因是低氧胁迫下表达量增加最明显的热休克蛋白基因,Hsp90ab1基因是低氧胁迫下唯一表达量升高的大分子热休克蛋白基因;低氧胁迫下Hsp47在鳃、肌肉中的表达极显著升高(P<0. 01),Hsp90ab1在鳃、皮肤和肌肉中的表达显著或极显著升高(P<0. 05或P<0. 01);不同低氧浓度胁迫下斑马鱼鳃中HSP47和HSP90ab1蛋白表达均呈现显著增加(P<0. 05)。研究表明,HSP47和HSP90ab1可能是斑马鱼低氧应激中最重要的热休克蛋白成员,具有重要的适应功能。
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关键词
斑马鱼
低氧
转录组分析
热休克蛋白
hsp47基因
hsp
90ab1
基因
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职称材料
题名
低氧胁迫与常氧条件下斑马鱼鳃中热休克蛋白基因家族的表达差异比较
被引量：
9
1
作者
狄治朝
周涛
许强华
机构
上海海洋大学海洋科学学院
上海海洋大学大洋渔业资源可持续开发教育部重点实验室
国家远洋渔业工程技术研究中心
远洋渔业协同创新中心
出处
《大连海洋大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第6期690-695,共6页
基金
国家自然科学基金资助项目(31572598
31772826)
+1 种基金
上海市浦江人才计划项目(16PJ1404000)
上海市教育委员会曙光计划项目(13SG51)
文摘
为研究斑马鱼热休克蛋白(HSP)应对低氧胁迫的生物学功能,对低氧胁迫与常氧条件下斑马鱼Danio rerio鳃组织进行转录组测序,利用实时荧光定量RT-PCR技术检测了低氧胁迫与常氧条件下斑马鱼鳃中热休克蛋白家族基因的表达差异。结果表明:在参与比较的斑马鱼鳃转录组测序中,共找到80个热休克蛋白家族基因成员;在低氧与常氧条件下鳃中热休克蛋白家族中有28个基因表达呈明显变化,其中16个基因表达量显著上调(P<0. 05),12个基因表达量显著下调(P<0. 05); Hsp47基因是低氧胁迫下表达量增加最明显的热休克蛋白基因,Hsp90ab1基因是低氧胁迫下唯一表达量升高的大分子热休克蛋白基因;低氧胁迫下Hsp47在鳃、肌肉中的表达极显著升高(P<0. 01),Hsp90ab1在鳃、皮肤和肌肉中的表达显著或极显著升高(P<0. 05或P<0. 01);不同低氧浓度胁迫下斑马鱼鳃中HSP47和HSP90ab1蛋白表达均呈现显著增加(P<0. 05)。研究表明,HSP47和HSP90ab1可能是斑马鱼低氧应激中最重要的热休克蛋白成员,具有重要的适应功能。
关键词
斑马鱼
低氧
转录组分析
热休克蛋白
hsp47基因
hsp
90ab1
基因
Keywords
Danio rerio
hypoxia
RNA sequencing
heat shock protein
hsp
47
hsp
90ab1
分类号
Q786 [生物学—分子生物学]
R285 [医药卫生—中药学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
低氧胁迫与常氧条件下斑马鱼鳃中热休克蛋白基因家族的表达差异比较
狄治朝
周涛
许强华
《大连海洋大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018
9
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职称材料
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