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中国荷斯坦牛白细胞黏附缺陷症PCR-RFLP检测方法的研究
被引量:
7
1
作者
王洪梅
李建斌
+4 位作者
许尚忠
高运东
张秀红
刘文浩
仲跻峰
《生物技术通报》
CAS
CSCD
2007年第3期155-158,170,共5页
本试验根据已知牛染色体上CD18编码基因序列设计引物,提取牛血液和精液DNA,可扩增出338bp的DNA片段,将PCR产物克隆到pMD18-T载体中,对阳性重组质粒进行测序,确定为牛的CD18基因。由于CD18基因的383位碱基由A变为G,而引起牛白细胞黏附缺...
本试验根据已知牛染色体上CD18编码基因序列设计引物,提取牛血液和精液DNA,可扩增出338bp的DNA片段,将PCR产物克隆到pMD18-T载体中,对阳性重组质粒进行测序,确定为牛的CD18基因。由于CD18基因的383位碱基由A变为G,而引起牛白细胞黏附缺陷症(BLAD),通过对济南市11个奶牛场356头奶牛及53头荷斯坦种公牛进行了BLAD的PCR-RFLP检测,共检出3头杂合母牛(携带者),占检测母牛群的0.84%,在荷斯坦公牛中只检测到一种基因型,没有发现隐性突变基因的携带者。
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关键词
荷斯坦牛
牛白细胞黏附缺陷症
pcr-rflp
测序
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职称材料
牛朊蛋白(bPrP^C)基因的克隆和序列分析
被引量:
7
2
作者
吴润
谢庆阁
+1 位作者
刘湘涛
陈豪泰
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2004年第3期318-323,共6页
分别从9头牛(3头牦牛、3头荷斯坦牛和3头秦川黄牛)全血中提取基因组总DNA,用所设计引物以聚合酶链式反应扩增出细胞型朊蛋白(PrPC)基因,并克隆到pMD18-T载体。序列分析表明所克隆的牛PrPC的片段大小为795bp,包含了牛朊蛋白基因的完整编...
分别从9头牛(3头牦牛、3头荷斯坦牛和3头秦川黄牛)全血中提取基因组总DNA,用所设计引物以聚合酶链式反应扩增出细胞型朊蛋白(PrPC)基因,并克隆到pMD18-T载体。序列分析表明所克隆的牛PrPC的片段大小为795bp,包含了牛朊蛋白基因的完整编码区序列,为含单一外显子的完整开放阅读框,与国内外报道的已知序列基本相同。本次所报道的牛PrP(bPrPC)基因含6个短而富含G-C的元件,可编码八肽Pro-His-Gly-Gly-Gly-Trp-Gly-Gln/Arg或九肽Pro-Gln/His-Gly-Gly-Gly-Gly-Trp/Arg-Gly-Gln。这些bPrPC基因序列相比较,其核苷酸和氨基酸同源性分别在99.0%~100.0%和99.2%~100.0%之间。在整个18个碱基替换中,多数替换是保守的,为同义突变,仅有5个替换引起氨基酸突变,分别为HN200302的W60R、HN200303的S154N、MN200301的A129V、NN200302的Q234R和NN200303的Q94R突变。发现牦牛朊粒基因在126(A→G)、234(G→A)和678(T→C)位的特征性核苷酸替换,但均为同义码替换。
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关键词
牛
朊蛋白
基因克隆
序列分析
神经变性疾病
疯牛病
朊病毒
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职称材料
中国荷斯坦奶牛铁蛋白基因3′端克隆及序列分析
3
作者
罗佳捷
彭瑛
+5 位作者
罗锐
张彬
李丽立
吴力专
占今舜
邢月腾
《草业学报》
CSCD
北大核心
2013年第5期96-103,共8页
本研究旨在克隆和分析中国荷斯坦奶牛的铁蛋白(FTH)基因,为该基因的功能研究和有效利用提供理论依据。运用cDNA末端快速扩增(RACE)技术从公犊肝脏组织中扩增出FTH基因的3′端cDNA序列,并利用生物信息学方法对该基因的氨基酸序列进行分...
本研究旨在克隆和分析中国荷斯坦奶牛的铁蛋白(FTH)基因,为该基因的功能研究和有效利用提供理论依据。运用cDNA末端快速扩增(RACE)技术从公犊肝脏组织中扩增出FTH基因的3′端cDNA序列,并利用生物信息学方法对该基因的氨基酸序列进行分析。结果表明,FTH基因3′端cDNA全长为489bp,编码81个氨基酸;经生物信息学分析表明,该基因编码的蛋白无N端信号肽及跨膜区,相对分子质量为9.125 3kD,理论等电点为5.19,脂肪系数为85.56,总亲水性为-0.342,其一级结构中存在4个功能结构域;二级结构元件以α-螺旋和β-旋转为主;同源序列分析表明,中国荷斯坦奶牛与原牛FTH氨基酸的相似性最高(99%);系统进化树显示,在该基因座位上中国荷斯坦奶牛与所测物种的亲缘关系均较远。本研究有助于揭示FTH家族基因的进化历史,为对其进行深入的功能分析和利用研究提供参考。
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关键词
中国荷斯坦奶牛
铁蛋白
CDNA末端快速扩增
克隆
序列分析
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职称材料
奶牛DQA2基因序列特征分析
被引量:
2
4
作者
陈朗
彭乔烽
+3 位作者
刘云红
郑天宇
朱乔峰
刘丽霞
《中国奶牛》
2019年第6期1-5,共5页
为了获得荷斯坦牛DQA2基因序列并研究其序列特征及编码蛋白的结构和功能,本研究采用DNA混合池扩增后直接测序的方法,通过DNAstar软件和在线服务器预测中国荷斯坦牛DQA2基因CDS区编码蛋白的理化性质、疏水性/亲水性、糖基化位点、信号肽...
为了获得荷斯坦牛DQA2基因序列并研究其序列特征及编码蛋白的结构和功能,本研究采用DNA混合池扩增后直接测序的方法,通过DNAstar软件和在线服务器预测中国荷斯坦牛DQA2基因CDS区编码蛋白的理化性质、疏水性/亲水性、糖基化位点、信号肽、跨膜结构、二级结构以及三级结构。结果表明,中国荷斯坦牛DQA2基因CDS区长度为765bp,编码254个氨基酸,蛋白结构预测是一种混合型的可溶性蛋白质,具有4个潜在的N-糖基化位点,分别为Asn31、Asn96、Asn260、Asn369;在第1~23位氨基酸之间存在信号肽;存在1个典型的跨膜螺旋区,氨基酸序号为217-239。本研究结果为进一步研究荷斯坦牛的抗病育种提供了理论基础。
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关键词
荷斯坦牛
DQA2
序列特征分析
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职称材料
题名
中国荷斯坦牛白细胞黏附缺陷症PCR-RFLP检测方法的研究
被引量:
7
1
作者
王洪梅
李建斌
许尚忠
高运东
张秀红
刘文浩
仲跻峰
机构
山东省农业科学院奶牛研究中心
中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
山东奥克斯生物技术有限公司
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
2007年第3期155-158,170,共5页
基金
山东省良种产业化项目(2003~2009)
山东省农科院青年科研基金项目(2005YQ048)
文摘
本试验根据已知牛染色体上CD18编码基因序列设计引物,提取牛血液和精液DNA,可扩增出338bp的DNA片段,将PCR产物克隆到pMD18-T载体中,对阳性重组质粒进行测序,确定为牛的CD18基因。由于CD18基因的383位碱基由A变为G,而引起牛白细胞黏附缺陷症(BLAD),通过对济南市11个奶牛场356头奶牛及53头荷斯坦种公牛进行了BLAD的PCR-RFLP检测,共检出3头杂合母牛(携带者),占检测母牛群的0.84%,在荷斯坦公牛中只检测到一种基因型,没有发现隐性突变基因的携带者。
关键词
荷斯坦牛
牛白细胞黏附缺陷症
pcr-rflp
测序
Keywords
holstein cattle blad pcr-rflp sequence analysis
分类号
S858.23 [农业科学—临床兽医学]
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职称材料
题名
牛朊蛋白(bPrP^C)基因的克隆和序列分析
被引量:
7
2
作者
吴润
谢庆阁
刘湘涛
陈豪泰
机构
中国农业科学院兰州兽医研究所农业部畜禽病毒学重点实验室
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2004年第3期318-323,共6页
基金
农业部畜禽病毒学重点实验室资助项目(2002-01)
文摘
分别从9头牛(3头牦牛、3头荷斯坦牛和3头秦川黄牛)全血中提取基因组总DNA,用所设计引物以聚合酶链式反应扩增出细胞型朊蛋白(PrPC)基因,并克隆到pMD18-T载体。序列分析表明所克隆的牛PrPC的片段大小为795bp,包含了牛朊蛋白基因的完整编码区序列,为含单一外显子的完整开放阅读框,与国内外报道的已知序列基本相同。本次所报道的牛PrP(bPrPC)基因含6个短而富含G-C的元件,可编码八肽Pro-His-Gly-Gly-Gly-Trp-Gly-Gln/Arg或九肽Pro-Gln/His-Gly-Gly-Gly-Gly-Trp/Arg-Gly-Gln。这些bPrPC基因序列相比较,其核苷酸和氨基酸同源性分别在99.0%~100.0%和99.2%~100.0%之间。在整个18个碱基替换中,多数替换是保守的,为同义突变,仅有5个替换引起氨基酸突变,分别为HN200302的W60R、HN200303的S154N、MN200301的A129V、NN200302的Q234R和NN200303的Q94R突变。发现牦牛朊粒基因在126(A→G)、234(G→A)和678(T→C)位的特征性核苷酸替换,但均为同义码替换。
关键词
牛
朊蛋白
基因克隆
序列分析
神经变性疾病
疯牛病
朊病毒
Keywords
Bos grunniens(yak)
Bos taurus(
holstein
/Friesian
cattle
)
Bos taurus(Qinchuan
cattle
)
Prion protein gene
DNA cloning
sequence
analysis
分类号
S852.659.7 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
中国荷斯坦奶牛铁蛋白基因3′端克隆及序列分析
3
作者
罗佳捷
彭瑛
罗锐
张彬
李丽立
吴力专
占今舜
邢月腾
机构
湖南农业大学动物科学技术学院
湖南广播电视大学农医部
中国科学院亚热带农业生态研究所 动物生态营养与健康养殖联合实验室 农业生态工程重点实验室
出处
《草业学报》
CSCD
北大核心
2013年第5期96-103,共8页
基金
国家自然科学基金项目(31072053
30671516)
+2 种基金
教育部高等学校博士学科点专项科研基金(博导类)项目(20104320110001)
湖南省自然科学基金重点项目(11JJ2014)
湖南省博士生科技创新项目(CX2010B284)资助
文摘
本研究旨在克隆和分析中国荷斯坦奶牛的铁蛋白(FTH)基因,为该基因的功能研究和有效利用提供理论依据。运用cDNA末端快速扩增(RACE)技术从公犊肝脏组织中扩增出FTH基因的3′端cDNA序列,并利用生物信息学方法对该基因的氨基酸序列进行分析。结果表明,FTH基因3′端cDNA全长为489bp,编码81个氨基酸;经生物信息学分析表明,该基因编码的蛋白无N端信号肽及跨膜区,相对分子质量为9.125 3kD,理论等电点为5.19,脂肪系数为85.56,总亲水性为-0.342,其一级结构中存在4个功能结构域;二级结构元件以α-螺旋和β-旋转为主;同源序列分析表明,中国荷斯坦奶牛与原牛FTH氨基酸的相似性最高(99%);系统进化树显示,在该基因座位上中国荷斯坦奶牛与所测物种的亲缘关系均较远。本研究有助于揭示FTH家族基因的进化历史,为对其进行深入的功能分析和利用研究提供参考。
关键词
中国荷斯坦奶牛
铁蛋白
CDNA末端快速扩增
克隆
序列分析
Keywords
Chinese
holstein
cattle
FTH
RACE
clone
sequence
analysis
分类号
S823.91 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
奶牛DQA2基因序列特征分析
被引量:
2
4
作者
陈朗
彭乔烽
刘云红
郑天宇
朱乔峰
刘丽霞
机构
西北民族大学生命科学与工程学院
出处
《中国奶牛》
2019年第6期1-5,共5页
基金
西北民族大学国家级大学生创新创业训练计划资助项目(201810742132)
西北民族大学中央高校基本科研业务费专项资金资助项目(31920170029)
文摘
为了获得荷斯坦牛DQA2基因序列并研究其序列特征及编码蛋白的结构和功能,本研究采用DNA混合池扩增后直接测序的方法,通过DNAstar软件和在线服务器预测中国荷斯坦牛DQA2基因CDS区编码蛋白的理化性质、疏水性/亲水性、糖基化位点、信号肽、跨膜结构、二级结构以及三级结构。结果表明,中国荷斯坦牛DQA2基因CDS区长度为765bp,编码254个氨基酸,蛋白结构预测是一种混合型的可溶性蛋白质,具有4个潜在的N-糖基化位点,分别为Asn31、Asn96、Asn260、Asn369;在第1~23位氨基酸之间存在信号肽;存在1个典型的跨膜螺旋区,氨基酸序号为217-239。本研究结果为进一步研究荷斯坦牛的抗病育种提供了理论基础。
关键词
荷斯坦牛
DQA2
序列特征分析
Keywords
holstein
cattle
DQA2
sequence
feature
analysis
分类号
S823.3 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
中国荷斯坦牛白细胞黏附缺陷症PCR-RFLP检测方法的研究
王洪梅
李建斌
许尚忠
高运东
张秀红
刘文浩
仲跻峰
《生物技术通报》
CAS
CSCD
2007
7
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职称材料
2
牛朊蛋白(bPrP^C)基因的克隆和序列分析
吴润
谢庆阁
刘湘涛
陈豪泰
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2004
7
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职称材料
3
中国荷斯坦奶牛铁蛋白基因3′端克隆及序列分析
罗佳捷
彭瑛
罗锐
张彬
李丽立
吴力专
占今舜
邢月腾
《草业学报》
CSCD
北大核心
2013
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
4
奶牛DQA2基因序列特征分析
陈朗
彭乔烽
刘云红
郑天宇
朱乔峰
刘丽霞
《中国奶牛》
2019
2
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职称材料
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