期刊文献+
共找到9篇文章
< 1 >
每页显示 20 50 100
江西省汉坦病毒分离及其S和M基因特征分析 被引量:3
1
作者 刘师文 徐刚 +4 位作者 施勇 龚甜 李健雄 刘晓庆 熊英 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第12期1157-1161,1199,共6页
目的对2011年江西省采集的鼠肺标本进行汉坦病毒的分离鉴定,了解分离病毒株的基因特征。方法采用Vero-E6细胞对阳性鼠肺标本进行病毒分离,采用直接免疫荧光法和RT-PCR方法对毒株进行鉴定。扩增分离株的S、M片段基因进行克隆测序。运用DN... 目的对2011年江西省采集的鼠肺标本进行汉坦病毒的分离鉴定,了解分离病毒株的基因特征。方法采用Vero-E6细胞对阳性鼠肺标本进行病毒分离,采用直接免疫荧光法和RT-PCR方法对毒株进行鉴定。扩增分离株的S、M片段基因进行克隆测序。运用DNAstar软件包和MEGA3.1软件对序列进行分析。结果从15份标本分离到2株来自褐家鼠的汉城型汉坦病毒。对其中1株病毒的S、M片段进行了克隆和序列测定,其中S片段含1 772个核苷酸,编码429个氨基酸;M片段含3 651个核苷酸,编码1 133个氨基酸。经核苷酸和氨基酸同源性分析,新分离株与国内外汉城型病毒核苷酸同源性94.8%~98.0%,氨基酸同源性98.2%~99.6%。与汉城型标准株80-39株相比,S片段仅1个氨基酸位点发生变异;M片段有9个氨基酸位点发生变异,糖基化位点的数目和位置没有发生变化。结论从江西省褐家鼠分离到两株汉城型病毒,病毒基因变异较小,型别相对稳定。 展开更多
关键词 汉坦病毒 病毒分离 m基因 s基因 序列分析
在线阅读 下载PDF
汉坦病毒Z5株M和S片段全基因序列测定及分析 被引量:2
2
作者 李婵 谢荣辉 +4 位作者 朱函坪 徐芳 姚苹苹 程胤凯 朱智勇 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期215-217,225,共4页
目的测定汉坦病毒Z5株M、S片段的全长序列,了解其分子结构特征,并分析Z5与其他汉坦病毒株的遗传学差异。方法设计引物,用RT-PCR技术扩增Z5株全长M与S片段。PCR产物纯化后克隆入T载体并测定序列及分析。结果Z5株M片段的全基因序列含有3 ... 目的测定汉坦病毒Z5株M、S片段的全长序列,了解其分子结构特征,并分析Z5与其他汉坦病毒株的遗传学差异。方法设计引物,用RT-PCR技术扩增Z5株全长M与S片段。PCR产物纯化后克隆入T载体并测定序列及分析。结果Z5株M片段的全基因序列含有3 616个核苷酸,编码1 135个氨基酸。S全基因序列含有1 700个核苷酸,编码429个氨基酸。经核苷酸与氨基酸同源性分析,Z5株应属于汉坦病毒的汉滩型(HTN型)毒株,与Z10株同属一个亚型。结论Z5株病毒和其他汉滩病毒病毒在核苷酸序列上有差异,但在氨基酸水平上的同源性仍较高。 展开更多
关键词 汉坦病毒 ms基因片段 序列分析
在线阅读 下载PDF
陕西省部分地区猪流行性腹泻病毒S、M和N基因的遗传变异分析 被引量:2
3
作者 庞文静 何亚鹏 +3 位作者 付明哲 许信刚 郭抗抗 张琪 《动物医学进展》 北大核心 2016年第11期25-30,共6页
为了解陕西省部分地区猪流行性腹泻病毒(PEDV)的遗传和变异情况,采集陕西省部分地区规模化猪场的5份疑似PEDV感染的猪小肠内容物,进行PEDV S、M和N基因的RT-PCR扩增,并对扩增产物进行序列测定和遗传变异分析。结果表明,5份病料均能扩... 为了解陕西省部分地区猪流行性腹泻病毒(PEDV)的遗传和变异情况,采集陕西省部分地区规模化猪场的5份疑似PEDV感染的猪小肠内容物,进行PEDV S、M和N基因的RT-PCR扩增,并对扩增产物进行序列测定和遗传变异分析。结果表明,5份病料均能扩增出PEDV S、M和N基因,5株病毒分别命名为SXSL、SX-BJ、SX-YL、SX-WN和SX-HZ株。序列分析表明,5株毒株之间的S、M和N基因核苷酸序列的同源性分别为96.7%~99.8%、98.4%~100%和97.2%~99.9%;氨基酸序列的同源性分别为97.4%~99.9%、98.2%~100%和98.2%~100%。该5株病毒与中国疫苗株CV777的S、M和N基因核苷酸序列的同源性分别为93.9%~99.8%、98.1%~100%和95.3%~99.9%,氨基酸序列的同源性为93.6%~99.9%、96.2%~100%和98.2%~100%。遗传进化分析结果显示,5个陕西分离株的S基因与中国疫苗株CV777亲缘关系较远,与近年来中国株、日本株以及韩国株亲缘关系较近。SX-SL株、SX-BJ株和SX-YL株的M和N基因与中国疫苗株CV777亲缘关系较近,且与中国株CHGD-01亲缘关系密切。SX-WN株和SX-HZ株的M和N基因与中国疫苗株CV777亲缘关系较远。该5株病毒的S基因以及SX-WN株和SX-HZ株的M基因和N基因变异程度较大,而SX-SL株、SX-BJ株和SX-YL株三个流行株均与中国株CHGD-01亲缘关系密切,并且与近年在陕西省流行的PEDV也不完全相同。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 s基因 m基因 N基因 序列分析
在线阅读 下载PDF
2株鸡传染性支气管炎病毒的分离鉴定与S1、M和N基因序列分析 被引量:4
4
作者 何家辉 封柯宇 +3 位作者 李鸿鑫 宋才良 张钰坤 谢青梅 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2021年第1期10-14,共5页
为跟踪了解广东地区鸡传染性支气管炎病流行情况,2019年从广东省清远、惠州两地疑似鸡传染性支气管炎发病鸡群中采集分离到2株传染性支气管炎病毒,并对其进行了鉴定和分析。结果显示,在鸡胚上盲传3代后均出现鸡胚的典型病变,死亡鸡胚全... 为跟踪了解广东地区鸡传染性支气管炎病流行情况,2019年从广东省清远、惠州两地疑似鸡传染性支气管炎发病鸡群中采集分离到2株传染性支气管炎病毒,并对其进行了鉴定和分析。结果显示,在鸡胚上盲传3代后均出现鸡胚的典型病变,死亡鸡胚全身出血明显,未死亡鸡胚发育受阻,呈明显的侏儒胚、蜷缩。将2个分离株分别命名为CK/CH/GD/QY1119和CK/CH/GD/HZ1225,分别测定其半数感染量(EID 50),扩增其S 1、M和N基因核苷酸序列,获得相应的推导氨基酸序列并对其分析。分离株CK/CH/GD/QY1119和CK/CH/GD/HZ1225的EID 50分别为10-7.5/0.1 mL和10-6.75/0.1 mL,2个分离株S 1基因与Mass型等疫苗株同源性为76.2%~82.1%,同源性均较低。与H120疫苗株相比,2个分离株的S 1、M和N基因存在若干氨基酸的差异,2个分离株S 1基因均存在氨基酸的插入,分离株CK/CH/GD/QY1119的M基因存在氨基酸的缺失,分离株CK/CH/GD/HZ1225的M基因存在氨基酸的插入。进化树分析显示,2个分离株分别属于LDT3型分支和QX型分支,均在S 1、M和N基因进化树上的分属上存在差异。结果表明本次分离得到的2个分离株的S 1、M和N基因均存在不同程度变异,在临床防控中应引起重视。本试验为鸡传染性支气管炎的有效防控提供了参考依据。 展开更多
关键词 鸡传染性支气管炎病毒 LDT3型 QX型 s 1基因 m基因 N基因 序列分析
在线阅读 下载PDF
天津地区汉坦病毒分离株TJJ16 M基因片段克隆和序列分析 被引量:1
5
作者 杨东靖 陈锦英 +2 位作者 李力 苏旭 丁建清 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第8期696-699,共4页
目的分析天津地区汉坦病毒分离株TJJ16 M基因的分子特征。方法采用细胞培养法从鼠肺标本中分离汉坦病毒TJJ16,提取TJJ16感染Vero-E6细胞的总RN A,经逆转录扩增病毒cDNA,继而进行PCR分别扩增M1和M2基因片段,克隆于T载体并测序拼接,对其... 目的分析天津地区汉坦病毒分离株TJJ16 M基因的分子特征。方法采用细胞培养法从鼠肺标本中分离汉坦病毒TJJ16,提取TJJ16感染Vero-E6细胞的总RN A,经逆转录扩增病毒cDNA,继而进行PCR分别扩增M1和M2基因片段,克隆于T载体并测序拼接,对其进行序列分析和生物信息学分析。结果汉坦病毒TJJ16株的M基因片段全序列长为3616nt,仅有1个开放读码框架(ORF),编码1 136个氨基酸,序列分析表明其为汉滩型(HTN型)汉坦病毒,与HTN型Q32株同属1个亚型。结论TJJ16病毒株M基因片段的克隆和序列分析证实其为HTN型,系天津地区的首次报道。 展开更多
关键词 汉坦病毒 m基因片段 序列分析
在线阅读 下载PDF
1株汉坦病毒的分离及其S基因片段的克隆和序列分析 被引量:1
6
作者 徐芳 姚苹苹 +1 位作者 朱函坪 谢荣辉 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第7期665-668,共4页
目的对浙江省肾综合征出血热(Hemorrhagic Fever with Renal Syndrome,HFRS)疫区-龙泉,新分离到的毒株的S基因片段进行克隆并进行序列测定及分析,以确定毒株的型别和基因变异程度,为进一步研究病毒进化和变异提供了有利条件。方... 目的对浙江省肾综合征出血热(Hemorrhagic Fever with Renal Syndrome,HFRS)疫区-龙泉,新分离到的毒株的S基因片段进行克隆并进行序列测定及分析,以确定毒株的型别和基因变异程度,为进一步研究病毒进化和变异提供了有利条件。方法采用直接免疫荧光检测疫区鼠肺HV抗原。将HV抗原阳性的鼠肺标本接种Vero-E6细胞,分离病毒。参考GenBank发表的汉坦病毒核蛋白基因序列,设计合成一对引物,提取分离株细胞培养物的总RNA,应用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)方法扩增新毒株S片段基因,并克隆入载体,纯化后进行核苷酸序列测定及分析。结果成功分离到的新毒株S片段的全基因序列共1 700个核苷酸,只有一个开放读码框架,共编码429个氨基酸。新毒株与HTN型毒株比较,核苷酸同源率为85.7%-91.9%。与SEO型毒株比较,核苷酸同源率为71.2%-75%,表明该毒株为HTN型毒株。结论浙江HFRS疫区新分离汉坦病毒株可以定型为HTN型毒株,可能为新的亚型。 展开更多
关键词 汉坦病毒 病毒分离 s片段 序列分析
在线阅读 下载PDF
肾综合征出血热病毒SEO亚型Gou3株S全基因分析的确证 被引量:2
7
作者 姚智慧 董关木 +1 位作者 俞永新 刘文雪 《中国人兽共患病杂志》 CSCD 北大核心 2001年第6期23-25,共3页
目的 为进一步了解Gou3株的分子基础 ,分析S片段全基因序列 ,以确证该株为SEO亚型毒株。方法 从感染的Vero细胞提取总RNA ,RT -PCR产物纯化后克隆于T载体测序。结果 Gou3株S片段的全基因序列共 173 2个核苷酸 ,最大读码框架从其 4 3... 目的 为进一步了解Gou3株的分子基础 ,分析S片段全基因序列 ,以确证该株为SEO亚型毒株。方法 从感染的Vero细胞提取总RNA ,RT -PCR产物纯化后克隆于T载体测序。结果 Gou3株S片段的全基因序列共 173 2个核苷酸 ,最大读码框架从其 4 3到 13 3 2 ,共编码 4 2 9个氨基酸。序列同源比较分析表明 ,Gou3株与HTN型 76- 118株同源性为67 7% ,与SEO型为 88.1%~ 88.3 % ,与 3株SEO型毒株S片段相差高达 11.7%~ 11.9%。其氨基酸序列与 76- 118同源性为 82 .6% ,与SEO型为 97.4 %~ 98.4 %。并绘出了种系发生树。结论 Gou3株S片段全基因的序列分析 ,确证了Gou3株为新发现的SEO型病毒的亚型毒株。GenBank注册号为AF2 8865 展开更多
关键词 肾综合征出血热病毒 Gou3株 s片段 序列测定 种系发生树 sEO亚型 流行性出血热
在线阅读 下载PDF
浙江新分离汉坦病毒ZT71株S基因片段的克隆及序列分析 被引量:2
8
作者 谢荣辉 翁景清 +6 位作者 姚苹苹 李婵 徐芳 朱函坪 赵芝雅 茅海燕 朱智勇 《中国人兽共患病杂志》 CSCD 北大核心 2005年第7期570-573,共4页
目的为了获得浙江省汉坦病毒基因组更为详尽的资料,研究汉坦病毒的进化状况及变异程度,为疫苗病毒株的选择使用提供科学依据。方法本实验室利用RT-PCR方法扩增ZT71株S基因片段并克隆入质粒载体,进行核苷酸序列测定及分析。结果ZT71株S... 目的为了获得浙江省汉坦病毒基因组更为详尽的资料,研究汉坦病毒的进化状况及变异程度,为疫苗病毒株的选择使用提供科学依据。方法本实验室利用RT-PCR方法扩增ZT71株S基因片段并克隆入质粒载体,进行核苷酸序列测定及分析。结果ZT71株S基因由1754个核苷酸组成,只有一个开放读码框架,共编码429个氨基酸。与HTN型病毒(76-118)的核苷酸和氨基酸同源性分别为72.0%和82.6%,与SEO型病毒(SR-11、R22、Guo3、8610)核苷酸和氨基酸同源性分别为88.4%—96.5%和98.1%—99.0%,与其它型汉坦病毒的同源都很低。结论表明此分离的病毒为SEO型汉坦病毒,为进一步研究其进化和变异提供了有利条件。 展开更多
关键词 汉坦病毒 ZTT1株 s片段 序列分析
在线阅读 下载PDF
闽西地区猪流行性腹泻病毒FJLY1703株基因特征及遗传进化分析 被引量:3
9
作者 董波 傅云扉 +2 位作者 戴爱玲 李晓华 杨小燕 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第4期336-340,共5页
为阐明闽西地区猪流行性腹泻病毒(PEDV)的遗传进化和重组事件。本研究从福建龙岩感染PEDV仔猪送检样品中鉴定出1株PEDV(闽西FILY1703株),采用PCR方法扩增其N、E、M以及S基因序列并测序。N、E、M以及S基因同源性及进化分析显示,FJLY1703... 为阐明闽西地区猪流行性腹泻病毒(PEDV)的遗传进化和重组事件。本研究从福建龙岩感染PEDV仔猪送检样品中鉴定出1株PEDV(闽西FILY1703株),采用PCR方法扩增其N、E、M以及S基因序列并测序。N、E、M以及S基因同源性及进化分析显示,FJLY1703株与CV777等早期经典株同源性较低且亲缘关系较远,而与2010年后国内分离株的同源性较高且进化关系较近。S基因编码的氨基酸序列与疫苗株CV777 S蛋白的氨基酸序列相比,FJLY1703株S蛋白抗原表位COE中存在8个突变,这些变化与2010年后中国PEDV分离株相似;且FJLY1703株E、M以及N基因编码的氨基酸序列中分别存在1个、3个和12个突变位点,均与我国当前流行株突变位点相似。S基因的重组分析表明,FJLY1703株是一株以CV777株为代表的早期经典株与2010年后PEDV变异株的重组流行株,上述研究结果提示在闽西地区需要研制针对PEDV流行株的疫苗来控制PEDV的感染。本研究为闽西地区PEDV流行病学研究提供参考依据。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 s基因 E基因 m基因 N基因 遗传进化分析 序列分析 重组分析
在线阅读 下载PDF
上一页 1 下一页 到第
使用帮助 返回顶部