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全基因组关联分析在水稻遗传育种中的应用
被引量：
14
1
作者
唐富福
徐非非
包劲松
《核农学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第5期598-606,共9页
关联分析是解析作物表型多样性遗传基础的有效工具,也是挖掘有利等位基因的重要手段,在作物遗传育种中发挥着越来越重要的作用。随着挖掘覆盖全基因组的单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphisms,SNP)标记技术的不断改进,基于连...
关联分析是解析作物表型多样性遗传基础的有效工具,也是挖掘有利等位基因的重要手段,在作物遗传育种中发挥着越来越重要的作用。随着挖掘覆盖全基因组的单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphisms,SNP)标记技术的不断改进,基于连锁不平衡(Linkage disequilibrium,LD)的全基因组关联分析为研究作物的农艺、品质、产量和抗性等复杂性状提供了新途径。本文在系统介绍全基因组关联分析方法的基础上,详尽总结了其在水稻遗传育种中的研究进展,并探讨了其存在的潜在问题及解决途径。
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关键词
全基因组关联分析
单核苷酸多态性
群体结构
基因型鉴定
水稻
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职称材料
抗穗发芽合成小麦改良品系的筛选及遗传分析
被引量：
2
2
作者
藏天青
刘玉娥
+8 位作者
马春芳
李潇
王希友
郝明
张连全
袁中伟
姜博
刘登才
甯顺腙
《四川农业大学学报》
CSCD
北大核心
2023年第6期998-1007,共10页
【目的】筛选抗穗发芽的合成小麦改良品系,分析潜在的相关基因。【方法】6个环境(2年3点)下,对129份改良品系进行了穗发芽抗性的鉴定及评价,同时利用Wheat 55K芯片数据进行全基因组关联分析。【结果】获得3份抗穗发芽品系(发芽指数GI≤0...
【目的】筛选抗穗发芽的合成小麦改良品系,分析潜在的相关基因。【方法】6个环境(2年3点)下,对129份改良品系进行了穗发芽抗性的鉴定及评价,同时利用Wheat 55K芯片数据进行全基因组关联分析。【结果】获得3份抗穗发芽品系(发芽指数GI≤0.2;发芽率GR≤40%),分别为红皮品系L2741、L3006、白皮品系L586,得到3个显著关联的位点。【结论】获得的3份抗穗发芽品系可在培育抗穗发芽品种中利用,获得46个可能的候选基因,其中4个基因主要与植物抗逆性有关,推测其在小麦抗穗发芽中起重要作用。
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关键词
人工合成小麦改良品系
穗发芽
全基因型组关联分析
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职称材料
题名
全基因组关联分析在水稻遗传育种中的应用
被引量：
14
1
作者
唐富福
徐非非
包劲松
机构
浙江大学原子核农业科学研究所
四川省原子能研究院
出处
《核农学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第5期598-606,共9页
基金
公益性行业(农业)科研专项(201103007)
中央高校基本科研业务费专项(2011FZA6011)
文摘
关联分析是解析作物表型多样性遗传基础的有效工具,也是挖掘有利等位基因的重要手段,在作物遗传育种中发挥着越来越重要的作用。随着挖掘覆盖全基因组的单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphisms,SNP)标记技术的不断改进,基于连锁不平衡(Linkage disequilibrium,LD)的全基因组关联分析为研究作物的农艺、品质、产量和抗性等复杂性状提供了新途径。本文在系统介绍全基因组关联分析方法的基础上,详尽总结了其在水稻遗传育种中的研究进展,并探讨了其存在的潜在问题及解决途径。
关键词
全基因组关联分析
单核苷酸多态性
群体结构
基因型鉴定
水稻
Keywords
genome-wide association studies （gwas）genotyping
Rice
Single nucleotide polymorphism （SNP）
Population structure
分类号
S511 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
抗穗发芽合成小麦改良品系的筛选及遗传分析
被引量：
2
2
作者
藏天青
刘玉娥
马春芳
李潇
王希友
郝明
张连全
袁中伟
姜博
刘登才
甯顺腙
机构
四川农业大学西南作物基因资源发掘与利用国家重点实验室/小麦研究所
出处
《四川农业大学学报》
CSCD
北大核心
2023年第6期998-1007,共10页
基金
四川省科技厅项目(2023NSFSC0218)。
文摘
【目的】筛选抗穗发芽的合成小麦改良品系,分析潜在的相关基因。【方法】6个环境(2年3点)下,对129份改良品系进行了穗发芽抗性的鉴定及评价,同时利用Wheat 55K芯片数据进行全基因组关联分析。【结果】获得3份抗穗发芽品系(发芽指数GI≤0.2;发芽率GR≤40%),分别为红皮品系L2741、L3006、白皮品系L586,得到3个显著关联的位点。【结论】获得的3份抗穗发芽品系可在培育抗穗发芽品种中利用,获得46个可能的候选基因,其中4个基因主要与植物抗逆性有关,推测其在小麦抗穗发芽中起重要作用。
关键词
人工合成小麦改良品系
穗发芽
全基因型组关联分析
Keywords
synthetic wheat improved lines
pre-harvest sprouting(PHS)
genotyp
e-wide
association
study(
gwas
)
分类号
S512.1 [农业科学—作物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
全基因组关联分析在水稻遗传育种中的应用
唐富福
徐非非
包劲松
《核农学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013
14
在线阅读
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职称材料
2
抗穗发芽合成小麦改良品系的筛选及遗传分析
藏天青
刘玉娥
马春芳
李潇
王希友
郝明
张连全
袁中伟
姜博
刘登才
甯顺腙
《四川农业大学学报》
CSCD
北大核心
2023
2
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