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小豆抗锈病基因VaRust1的初步定位
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作者 徐晓丹 冷淼 +4 位作者 张明媛 孙伟娜 柯希望 殷丽华 左豫虎 《黑龙江八一农垦大学学报》 2025年第4期8-16,共9页
为挖掘小豆抗锈病基因,用小豆抗病品种LJ01与感病品种宝清红进行杂交,获得LJO1/宝清红F_(1),F_(1)自交构建F_(2)群体。通过对亲本及F_(1)、F_(2)接种小豆锈菌菌株ZXLO1进行抗性鉴定,明确小豆抗锈病品种LJO1对小豆锈菌菌株ZXL01的抗性由... 为挖掘小豆抗锈病基因,用小豆抗病品种LJ01与感病品种宝清红进行杂交,获得LJO1/宝清红F_(1),F_(1)自交构建F_(2)群体。通过对亲本及F_(1)、F_(2)接种小豆锈菌菌株ZXLO1进行抗性鉴定,明确小豆抗锈病品种LJO1对小豆锈菌菌株ZXL01的抗性由一个隐性基因控制。利用分离分组分析法(Bulked segrgant analysis,BSA),对抗病亲本LJO1、感病亲本宝清红及LJO1/宝清红F_(2)群体构建的抗感池进行差异标记分析,初步将LJ01的抗锈基因定位于3号染色体20467677~26201507bp区域内,命名为VaRust1。开发该区间内的SNP分子标记,经遗传连锁分析发现,11个SNP分子标记和抗锈病基因VaRust1有连锁关系,其中分子标记Vaby0001、Vaby0003、Vaby0011和小豆抗锈病基因VaRust1连锁最为紧密,遗传距离均为5.69cM。小豆抗锈病基因VaRust1定位区间内基因预测显示,该区间存在52个基因,其中37个基因具有功能注释,基因HKW66_Vig0249750、HKW66_Vig0249920和HKW66_Vig0249830分别编码WRKY转录因子、丝氨酸/苏氨酸激酶及F-box/LRR结构蛋白,可作为小豆抗锈病候选基因。 展开更多
关键词 小豆 锈病 基因定位 SNP
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Mapmaker3.0和作图软件使用 被引量:9
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作者 王竹林 杨睿 +2 位作者 杨兴圣 刘曙东 胡甘 《实验室研究与探索》 CAS 北大核心 2012年第11期62-65,共4页
构建各种生物体的遗传连锁图谱成为分子遗传学和作物育种领域QTL定位的热点。Mapmaker3.0是当前普遍用于遗传连锁距离计算的软件。Mapmaker3.0的使用首先要准备标记数据文件,然后用Sequence命令输入欲分析的标记座位,接着键入Group命令... 构建各种生物体的遗传连锁图谱成为分子遗传学和作物育种领域QTL定位的热点。Mapmaker3.0是当前普遍用于遗传连锁距离计算的软件。Mapmaker3.0的使用首先要准备标记数据文件,然后用Sequence命令输入欲分析的标记座位,接着键入Group命令指导程序将Sequence中的标记分为不同的连锁群,接下来,程序在一个连锁群内部决定最有可能的标记排列次序,计算一个连锁群中所有的标记每一个可能的次序最大似然图谱,比较这些图谱的可能性并找出最合适图谱,这部分工作用Compare命令完成,再用sequence和map命令得到标记之间的连锁数据。之后,将这些数据按Genemap或MapDraw分析软件所要求的数据格式输入,通过对这2个软件的正确使用,就可得到需要的遗传连锁图谱图形文件。 展开更多
关键词 Mapmaker3 0 genemap MapDraw 遗传连锁图谱 连锁距离
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水稻卷叶性状QTL的初步定位 被引量:12
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作者 高艳红 吕川根 +4 位作者 王茂青 王澎 闫晓燕 谢坤 万建民 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2007年第1期5-10,共6页
以水稻平展叶品种Ketan Nangka和剑叶中度卷曲的广超丝苗杂交F1衍生的185个F2单株为定位群体,利用110个微卫星标记(SSR)对卷叶基因进行初步定位。在全基因组内构建分子遗传连锁图谱并进行QTL检测,在第4染色体长臂上定位到1个卷叶QTL(qRL... 以水稻平展叶品种Ketan Nangka和剑叶中度卷曲的广超丝苗杂交F1衍生的185个F2单株为定位群体,利用110个微卫星标记(SSR)对卷叶基因进行初步定位。在全基因组内构建分子遗传连锁图谱并进行QTL检测,在第4染色体长臂上定位到1个卷叶QTL(qRL-4-1)。它来自广超丝苗,与标记RM5473紧密连锁,加性效应为1.005,显性效应为-0.220,对表型的贡献率为7.27%,可能是一个新发现的QTL。同时在第5染色体长臂上定位到2个卷叶QTLs(qRL-5-9和qRL-5-10),两侧的标记分别为RM291-RM161和RM161-RM294,加性效应分别为1.812和1.347,显性效应分别为0.1196和0.1417,对表型的贡献率分别是16.08%和27.98%,其卷叶效应也来自广超丝苗,这2个位点验证了前人的研究结果。广超丝苗生育前期叶片并不表现卷曲,至生育后期才表现卷曲,其叶片卷曲基因在水稻株型育种上可能有较好的实用价值。 展开更多
关键词 水稻 卷叶 QTL 基因定位 育种
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一个水稻长护颖基因的遗传分析 被引量:1
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作者 秦海龙 张启军 +3 位作者 廖慧敏 宗寿余 夏士健 吕川根 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2014年第2期231-236,共6页
为进一步弄清水稻花器官发育的分子机理,本试验对从美国引进的水稻资源中发现的1份长护颖材料(暂时命名为Y93)的表型、遗传和基因定位进行研究。表型鉴定结果显示,在正常生长条件下,Y93表现为护颖发育异常,护颖长度明显大于颖壳长度,而... 为进一步弄清水稻花器官发育的分子机理,本试验对从美国引进的水稻资源中发现的1份长护颖材料(暂时命名为Y93)的表型、遗传和基因定位进行研究。表型鉴定结果显示,在正常生长条件下,Y93表现为护颖发育异常,护颖长度明显大于颖壳长度,而千粒质量和糙米率极显著低于正常护颖品种9311。Y93与9311杂交,正反交F1均表现为正常护颖长度,F2出现护颖长度分离,长护颖植株与正常长度护颖植株比例为262∶803=1∶3.06(χ2=0.09<P0.05=3.84),符合1∶3的孟德尔分离比,表明Y93的长护颖性状呈隐性单基因遗传。以Y93×9311 F2的262株隐性单株为定位群体,采用BSA(Bulked segregation analysis,BSA)法,将Y93长护颖基因(暂时命名为lsl)初步定位于水稻第7染色体上分子标记RM5344与RM3325之间,该基因与2个标记间的遗传距离分别为0.38 cM和2.10 cM。基因组测序分析结果表明,lsl可能为已发现的长护颖G1基因的1个新等位基因。 展开更多
关键词 水稻 长护颖 简单重复序列标记 基因定位
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乙酰基亚硝基脲诱变的一种角膜混浊小鼠及其突变基因的染色体定位 被引量:1
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作者 陈兵 糜婷 +2 位作者 倪俊达 耿滕 薛整风 《中华实验眼科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第8期701-704,共4页
背景乙酰基亚硝基脲(ENU)诱导小鼠基因突变是研究基因功能及建立人类疾病动物模型的一种有效手段。目的研究ENU诱变获得的1只角膜混浊小鼠角膜组织形态变化,并对其突变基因进行染色体定位。方法选用8-10周龄的C57BL/6J(B6)雄鼠40... 背景乙酰基亚硝基脲(ENU)诱导小鼠基因突变是研究基因功能及建立人类疾病动物模型的一种有效手段。目的研究ENU诱变获得的1只角膜混浊小鼠角膜组织形态变化,并对其突变基因进行染色体定位。方法选用8-10周龄的C57BL/6J(B6)雄鼠40只,腹腔内注射ENU。将注射后的雄鼠与同品系母鼠交配,在其后代小鼠中筛选眼部突变个体,并将突变个体与同品系小鼠配种以确定是否遗传。对ENU诱变获得1只角膜混浊小鼠的角膜行组织病理学观察。繁殖[(B6xD2)F1xB6]N2角膜混浊小鼠,用平均分布于小鼠染色体上的微卫星标记对N2小鼠染色体进行扫描。采用优势对数计分法(LOD)判定突变基因与微卫星是否连锁。结果将角膜呈现混浊小鼠与B6背景小鼠配种,在其59只后代中出现19只类似表型的突变小鼠。角膜组织病理学检查发现,该例角膜混浊小鼠角膜基质增厚,出现新生血管和炎性细胞浸润,成纤维细胞明显增多。突变基因与微卫星间的连锁分析发现,26个N2样品中突变基因与位于小鼠2号染色体63.42eM处的D2Mi307位点发生3例交换,LOD值为3.79,该突变基因位于小鼠第2号染色体。结论成功获得角膜混浊小鼠并将其突变基因初步定位于2号染色体,有望为人类角膜混浊疾病研究提供一种新的小鼠模型。 展开更多
关键词 乙酰基亚硝基脲 角膜混浊 突变诱导 新生血管 基因定位 表型 小鼠
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