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题名柑橘GGP基因家族生物信息学分析
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作者
王平
柯甫志
徐建国
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机构
浙江省柑橘研究所
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出处
《浙江农业科学》
2022年第12期2921-2923,2938,共4页
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基金
台州市科技项目(21nya03)
浙江省农业(果品)新品种选育重大科技项目(2021C02066-1)
国家现代农业(柑橘)产业体系岗位科学家项目(MATS)。
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文摘
GDP-L-半乳糖磷酸化酶(GDP-L-galactose phosphorylase, GGP)是植物抗坏血酸(ascorbic acid, AsA)生物合成的一个关键酶。本研究利用生物信息学分析技术从克里曼丁橘基因组数据库中鉴定到4个GGP基因序列,分别位于4条不同染色体上,均含有内含子,氨基酸个数为307~455个,蛋白质二级结构以无规则卷曲和α-螺旋为主。顺式作用元件预测柑橘GGP基因家族参与光、逆境胁迫和植物生长等响应。转录组数据显示,CsGGP2和CsGGP4是柑橘AsA生物合成起作用的家族成员,CsGGP2是主导成员,参与果皮早期发育;CsGGP4协同参与须根黄龙病胁迫。上述结果为进一步确定柑橘GGP家族基因的功能奠定基础。
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关键词
柑橘
ggp基因家族
生物信息学分析
功能预测
基因表达
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分类号
S666.2
[农业科学—果树学]
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