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柑橘GGP基因家族生物信息学分析: 1; 作者王平柯甫志徐建国《浙江农业科学》 2022年第12期2921-2923,2938,共4页; GDP-L-半乳糖磷酸化酶(GDP-L-galactose phosphorylase, GGP)是植物抗坏血酸(ascorbic acid, AsA)生物合成的一个关键酶。本研究利用生物信息学分析技术从克里曼丁橘基因组数据库中鉴定到4个GGP基因序列,分别位于4条不同染色体上,均含... 展开更多; 关键词柑橘 ggp基因家族生物信息学分析功能预测基因表达; 在线阅读下载PDF 职称材料

刺梨GGP和DHAR基因序列多态性及其与果实维生素C含量的关联分析被引量：1: 2; 作者李广贵林国都 +4 位作者胡玉乾张怀山白静安华明鲁敏《江苏农业科学》 2020年第8期63-69,共7页; 高含量的维生素C是刺梨果实的重要性状,挖掘与维生素C含量相关联的基因序列变异及单倍型对刺梨的品种改良具有指导意义。在21份野生刺梨资源中对GGP和DHAR基因进行PCR扩增和测序,分析基因序列多态性及其与果实维生素C含量的相关性。GGP... 展开更多; 关键词刺梨维生素C ggp基因 DHAR基因基因序列多态性单倍型关联分析; 在线阅读下载PDF 职称材料

猕猴桃维生素C的合成规律及关键基因鉴定研究被引量：4: 3; 作者刘晓莹解潇冬 +4 位作者成畅汪文杰吕海燕李大卫钟彩虹《植物科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第5期657-668,共12页; 本研究以3个不同杂交猕猴桃(Actinidia)群体的果实为材料,测定果实不同发育时期的维生素C(Vc)含量;采用实时荧光定量法PCR法分析猕猴桃Vc合成关键基因的表达情况;对发掘的关键基因GGP开展蛋白结构、理化性质和亲水性和疏水性分析,并在... 展开更多; 关键词猕猴桃维生素C 合成规律基因鉴定 ggp基因; 在线阅读下载PDF 职称材料

绿色杜氏藻DvGGPS生物信息学及转录差异研究被引量：3: 4; 作者周静龚一富 +4 位作者马颖瑞刘浩朱帅旗王何瑜严小军《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第4期635-642,共8页; 香叶酰香叶酰焦磷酸合成酶(GGPS)能够催化焦磷酸异戊烯酯(IPP)与二甲基丙烯焦磷酸(DMAPP)反应形成二萜化合物通用前体香叶酰基香叶酰焦磷酸(GGPP)。为深入了解GGPS蛋白在类胡萝卜素合成途径中的作用,通过Illumina Hi Seq TM 2000高通量... 展开更多; 关键词绿色杜氏藻 ggpS基因生物信息学分析类胡萝卜素; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名柑橘GGP基因家族生物信息学分析: 1; 作者王平柯甫志徐建国; 机构浙江省柑橘研究所; 出处《浙江农业科学》 2022年第12期2921-2923,2938,共4页; 基金台州市科技项目(21nya03) 浙江省农业(果品)新品种选育重大科技项目(2021C02066-1) 国家现代农业(柑橘)产业体系岗位科学家项目(MATS)。; 文摘 GDP-L-半乳糖磷酸化酶(GDP-L-galactose phosphorylase, GGP)是植物抗坏血酸(ascorbic acid, AsA)生物合成的一个关键酶。本研究利用生物信息学分析技术从克里曼丁橘基因组数据库中鉴定到4个GGP基因序列,分别位于4条不同染色体上,均含有内含子,氨基酸个数为307~455个,蛋白质二级结构以无规则卷曲和α-螺旋为主。顺式作用元件预测柑橘GGP基因家族参与光、逆境胁迫和植物生长等响应。转录组数据显示,CsGGP2和CsGGP4是柑橘AsA生物合成起作用的家族成员,CsGGP2是主导成员,参与果皮早期发育;CsGGP4协同参与须根黄龙病胁迫。上述结果为进一步确定柑橘GGP家族基因的功能奠定基础。; 关键词柑橘 ggp基因家族生物信息学分析功能预测基因表达; 分类号 S666.2 [农业科学—果树学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名刺梨GGP和DHAR基因序列多态性及其与果实维生素C含量的关联分析被引量：1: 2; 作者李广贵林国都胡玉乾张怀山白静安华明鲁敏; 机构贵州大学农学院/贵州省果树工程技术研究中心; 出处《江苏农业科学》 2020年第8期63-69,共7页; 基金国家自然科学基金(编号:31660558) 贵州省大学生创新创业训练计划(编号:2018053) 贵州大学SRT计划(编号:2018244)。; 文摘高含量的维生素C是刺梨果实的重要性状,挖掘与维生素C含量相关联的基因序列变异及单倍型对刺梨的品种改良具有指导意义。在21份野生刺梨资源中对GGP和DHAR基因进行PCR扩增和测序,分析基因序列多态性及其与果实维生素C含量的相关性。GGP基因在21份野生刺梨中共扩增出长度为2035 bp的同源序列,其中包含22处变异位点,产生15种单倍型,在0.01显著性水平上,3个单核苷酸多态性(SNP)及Hap15与刺梨果实高含量维生素C相关;在0.05显著性水平上,3个SNP及Hap7与刺梨果实低含量维生素C相关;GGP基因单倍型存在网状进化。DHAR基因在21份野生刺梨中共扩增出长度为1609 bp的同源序列,其中包含69处变异位点,产生9种单倍型,在0.05显著性水平上,8个SNP、9个InDel及Hap9与刺梨果实中低含量维生素C相关,1个SNP及单倍型Hap4~Hap6与刺梨果实中高含量维生素C相关;DHAR基因单倍型呈现扇形进化。GGP基因具有更高的单倍型多样性,DHAR基因具有更高的DNA多态性;GGP基因特异单倍型Hap15和DHAR基因特异单倍型Hap4共同存在于刺梨中时,可以使果实维生素C含量表现为高的状态;而GGP基因特异单倍型Hap7和DHAR基因单倍型Hap9同时存在于刺梨中时,可以使果实维生素C含量表现为低的状态。; 关键词刺梨维生素C ggp基因 DHAR基因基因序列多态性单倍型关联分析; 分类号 S661.203.2 [农业科学—果树学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名猕猴桃维生素C的合成规律及关键基因鉴定研究被引量：4: 3; 作者刘晓莹解潇冬成畅汪文杰吕海燕李大卫钟彩虹; 机构中国科学院武汉植物园安徽农业大学园艺学院; 出处《植物科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第5期657-668,共12页; 基金国家自然科学基金(C150102) 湖北省猕猴桃自然科技资源库项目(ZKJXPJ202100000)。; 文摘本研究以3个不同杂交猕猴桃(Actinidia)群体的果实为材料,测定果实不同发育时期的维生素C(Vc)含量;采用实时荧光定量法PCR法分析猕猴桃Vc合成关键基因的表达情况;对发掘的关键基因GGP开展蛋白结构、理化性质和亲水性和疏水性分析,并在杂交群体中验证GGP基因对于后代果实Vc合成的调控作用。结果显示,当高Vc的猕猴桃物种作为亲本时,杂交子代Vc含量在早期(花后60 d)达到最大值,再随着果实发育而逐渐降低;当中低Vc含量的猕猴桃物种作为亲本,其后代果实Vc含量一直较低且发育规律与母本相似。Vc合成相关基因中,仅有GGP基因在高Vc杂交群体中的表达量均显著高于低Vc杂交群体。在GGP的3个同源基因中,GGP1和GGP3的蛋白质二级、三级结构、理化性质以及亲、疏水性高度相似;但GGP2与前者存在较大的差异。在3个杂交群体后代果实中采用关联分析验证GGP1和GGP3的功能发现,GGP3基因对杂交后代果实的Vc合成可能具有最为重要的作用。研究结果表明,不同猕猴桃杂交群体Vc含量的合成规律存在差异,GGP3基因可能对不同杂交群体后代果实的Vc合成具有重要影响。; 关键词猕猴桃维生素C 合成规律基因鉴定 ggp基因; Keywords Actinidia Vitamin C Synthesis rule Gene identification ggp; 分类号 Q943.2 [生物学—植物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名绿色杜氏藻DvGGPS生物信息学及转录差异研究被引量：3: 4; 作者周静龚一富马颖瑞刘浩朱帅旗王何瑜严小军; 机构宁波大学海洋学院; 出处《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第4期635-642,共8页; 基金浙江省重点科技创新团队项目(2012R10029-07 2010R50029) +1 种基金宁波科技攻关项目(2013C10018) 浙江省大学生科技创新活动计划暨新苗人才计划项目(2014R405050); 文摘香叶酰香叶酰焦磷酸合成酶(GGPS)能够催化焦磷酸异戊烯酯(IPP)与二甲基丙烯焦磷酸(DMAPP)反应形成二萜化合物通用前体香叶酰基香叶酰焦磷酸(GGPP)。为深入了解GGPS蛋白在类胡萝卜素合成途径中的作用,通过Illumina Hi Seq TM 2000高通量测序获得Dv GGPS基因c DNA全长序列,对GGPS基因序列进行生物信息学分析,并研究花生四烯酸(AA)、乙酰水杨酸(ASA)和硫酸铈铵(ACS)对Dv GGPS基因转录水平的影响及绿色杜氏藻类胡萝卜素含量变化。生物信息学分析结果表明,Dv GGPS基因c DNA全长2 229 bp,含1 041 bp开放阅读框,编码346个氨基酸。GGPS蛋白质序列理论等电点(p I)为5.82,相对分子质量为37.66 k Da,该蛋白为疏水性蛋白,无信号肽和跨膜区域。二级结构预测显示该蛋白分子中α-螺旋结构最多,占57.23%。同源比对结果表明,绿色杜氏藻GGPS蛋白与雨生红球藻亲缘关系最近。qRT-PCR结果表明,62.5 mg·L^(-1)AA、50 mg·L^(-1)ASA和0.8 mg·L^(-1)ACS处理的Dv GGPS基因转录水平达到最高,此时类胡萝卜素含量也均有提高,说明绿色杜氏藻类胡萝卜素的生物学合成可能是通过诱导Dv GGPS基因表达实现的,Dv GGPS基因在类胡萝卜素生物合成中起关键作用。Dv GGPS基因的克隆及表达调控研究为今后探明类胡萝卜素积累的分子机理提供了重要参考,也为进一步通过代谢工程手段提高绿色杜氏藻类胡萝卜素含量奠定了理论基础。; 关键词绿色杜氏藻 ggpS基因生物信息学分析类胡萝卜素; Keywords Dunaliella viridis geranylgeranyl pyrophosphate synthase gene bioinformatics carotenoid; 分类号 Q943.2 [生物学—植物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	柑橘GGP基因家族生物信息学分析	王平柯甫志徐建国	《浙江农业科学》	2022	0	在线阅读下载PDF 职称材料
2	刺梨GGP和DHAR基因序列多态性及其与果实维生素C含量的关联分析	李广贵林国都胡玉乾张怀山白静安华明鲁敏	《江苏农业科学》	2020	1	在线阅读下载PDF 职称材料
3	猕猴桃维生素C的合成规律及关键基因鉴定研究	刘晓莹解潇冬成畅汪文杰吕海燕李大卫钟彩虹	《植物科学学报》 CAS CSCD 北大核心	2022	4	在线阅读下载PDF 职称材料
4	绿色杜氏藻DvGGPS生物信息学及转录差异研究	周静龚一富马颖瑞刘浩朱帅旗王何瑜严小军	《核农学报》 CAS CSCD 北大核心	2017	3	在线阅读下载PDF 职称材料