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白及PMM基因cDNA序列克隆及甘露糖合成相关基因的表达特性分析
被引量：
4
1
作者
许娟
石云平
+5 位作者
苏祖祥
林茜
李小泉
韦绍龙
桂杰
胡一凤
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第9期1913-1921,共9页
【目的】克隆白及磷酸甘露糖变位酶(PMM)基因(BsPMM)cDNA序列,并检测甘露糖合成相关基因的表达特性,为研究甘露糖合成相关基因的调控功能及白及多糖合成机制提供理论依据。【方法】采用RT-PCR克隆BsPMM基因cDNA序列,对其进行生物信息学...
【目的】克隆白及磷酸甘露糖变位酶(PMM)基因(BsPMM)cDNA序列,并检测甘露糖合成相关基因的表达特性,为研究甘露糖合成相关基因的调控功能及白及多糖合成机制提供理论依据。【方法】采用RT-PCR克隆BsPMM基因cDNA序列,对其进行生物信息学分析,并采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测BsPMM和GDP-甘露糖焦磷酸化酶基因(BsGMP)在不同品种(桂及1号和桂及2号)、生育期(苗期、生长旺期和成熟期)和组织(叶片、茎、假鳞茎和根)中的表达特性,同时测定不同生育期假鳞茎的多糖和甘露糖含量。【结果】克隆获得的BsPMM基因cDNA全长1062bp,包含一个759bp的开放阅读框(ORF),编码252个氨基酸,该基因编码的蛋白BsPMM定位于细胞质,含一个从细胞内部到外部的跨膜螺旋区;不稳定系数为41.67,为不稳定蛋白;总平均疏水指数为-0.304,为亲水性蛋白,含植物PMM蛋白特有的4个保守结构域,属于HAD超家族成员。BsPMM蛋白与单子叶植物尤其是兰科植物铁皮石斛和蝴蝶兰PMM蛋白的亲缘关系较近,与罂粟、葡萄和芦笋等双子叶植物PMM的亲缘关系较远。BsPMM和BsGMP基因在不同品种、组织和生育期均有表达,且二者在假鳞茎中表达量显著高于其他组织(P<0.05),区别在于桂及1号在生长旺期的表达量最高,而桂及2号在苗期的表达量最高。桂及1号和桂及2号假鳞茎中甘露糖含量和多糖含量均随生育期推移呈逐渐升高的变化趋势。【结论】BsPMM和BsGMP基因表达具有时空、组织和品种特异性,可能是调控多糖合成代谢途径中的关键基因,参与白及甘露糖和多糖的合成。
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关键词
白及
甘露糖
多糖
磷酸甘露糖变位酶(PMM)
GDP-甘露糖焦磷酸化酶基因(GMP)
表达特性
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职称材料
题名
白及PMM基因cDNA序列克隆及甘露糖合成相关基因的表达特性分析
被引量：
4
1
作者
许娟
石云平
苏祖祥
林茜
李小泉
韦绍龙
桂杰
胡一凤
机构
广西农业科学院生物技术研究所
出处
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第9期1913-1921,共9页
基金
广西自然科学基金项目（2016GXNSFBA380124）
南宁市科学研究与技术开发计划项目（20162332）
广西农业科学院基本科研业务专项（2018YT20）
文摘
【目的】克隆白及磷酸甘露糖变位酶(PMM)基因(BsPMM)cDNA序列,并检测甘露糖合成相关基因的表达特性,为研究甘露糖合成相关基因的调控功能及白及多糖合成机制提供理论依据。【方法】采用RT-PCR克隆BsPMM基因cDNA序列,对其进行生物信息学分析,并采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测BsPMM和GDP-甘露糖焦磷酸化酶基因(BsGMP)在不同品种(桂及1号和桂及2号)、生育期(苗期、生长旺期和成熟期)和组织(叶片、茎、假鳞茎和根)中的表达特性,同时测定不同生育期假鳞茎的多糖和甘露糖含量。【结果】克隆获得的BsPMM基因cDNA全长1062bp,包含一个759bp的开放阅读框(ORF),编码252个氨基酸,该基因编码的蛋白BsPMM定位于细胞质,含一个从细胞内部到外部的跨膜螺旋区;不稳定系数为41.67,为不稳定蛋白;总平均疏水指数为-0.304,为亲水性蛋白,含植物PMM蛋白特有的4个保守结构域,属于HAD超家族成员。BsPMM蛋白与单子叶植物尤其是兰科植物铁皮石斛和蝴蝶兰PMM蛋白的亲缘关系较近,与罂粟、葡萄和芦笋等双子叶植物PMM的亲缘关系较远。BsPMM和BsGMP基因在不同品种、组织和生育期均有表达,且二者在假鳞茎中表达量显著高于其他组织(P<0.05),区别在于桂及1号在生长旺期的表达量最高,而桂及2号在苗期的表达量最高。桂及1号和桂及2号假鳞茎中甘露糖含量和多糖含量均随生育期推移呈逐渐升高的变化趋势。【结论】BsPMM和BsGMP基因表达具有时空、组织和品种特异性,可能是调控多糖合成代谢途径中的关键基因,参与白及甘露糖和多糖的合成。
关键词
白及
甘露糖
多糖
磷酸甘露糖变位酶(PMM)
GDP-甘露糖焦磷酸化酶基因(GMP)
表达特性
Keywords
Bletilla striata
mannose
polysaccharide
phosphomannomutase(PMM)
gdp-mannose
pyrophosphorylase
gene
(
bsgmp
)
expression characteristics
分类号
S567.239 [农业科学—中草药栽培]
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作者
出处
发文年
被引量
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1
白及PMM基因cDNA序列克隆及甘露糖合成相关基因的表达特性分析
许娟
石云平
苏祖祥
林茜
李小泉
韦绍龙
桂杰
胡一凤
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
4
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