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基于GFM和GAMM模型分析对虾白斑综合征(WSSV)对黄海和东海北部水域虾类生物量的影响
被引量：
1
1
作者
徐婷婷
滕广亮
+4 位作者
李英瑕
吴强
单秀娟
张庆利
金显仕
《渔业科学进展》
CSCD
北大核心
2022年第1期46-55,共10页
虾类是海洋生态系统功能群的重要组成部分,其生物量变化受到多重因素的影响。本研究在开展黄海和东海北部水域虾类白斑综合征病毒(white spot syndrome virus,WSSV)流行病学调查的基础上,利用梯度随机森林模型(gradient random forest m...
虾类是海洋生态系统功能群的重要组成部分,其生物量变化受到多重因素的影响。本研究在开展黄海和东海北部水域虾类白斑综合征病毒(white spot syndrome virus,WSSV)流行病学调查的基础上,利用梯度随机森林模型(gradient random forest model,GFM)和广义加性混合模型(generalized additive mixed models,GAMM),分析了2016—2018年间黄海和东海北部水域WSSV流行对虾类生物量的影响。分子检测结果显示,调查所获取的26种虾类中,11种被检测为WSSV阳性;2016、2017和2018年WSSV阳性采样站点的比率分别为48.40%、38.75%和21.74%,虾类样品中WSSV阳性检出比率分别为16.86%、9.60%和4.80%。GFM模型分析显示,解释变量“阳性样品数的对数(ln_posi)”对响应变量“虾类生物量的对数(ln_Abu)”的重要性最高。GAMM分析中,根据赤池信息准则(Akaike information criterion,AIC)最小原则筛选出的最优模型为:ln_Abu~WSSV阳性率(P_rate)+ln_posi+经度(Long),该模型中ln_posi和P_rate是影响虾类生物量的极显著相关因子,ln_Abu随着P_rate的升高而降低。研究表明,WSSV在黄海和东海北部水域虾类中流行,推测对该海域的虾类生物量存在影响。
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关键词
对虾白斑综合征病毒
黄海和东海北部
虾类
GFM
模型
gamm模型
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职称材料
东南太平洋赤道海域茎柔鱼(Dosidicus gigas)雌雄性比变化及与海域环境的关系
2
作者
梅勇杰
林东明
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第6期1488-1498,共11页
雌雄性比作为有性生殖生物种类繁衍的基础,是物种种群维持的关键。选取2017~2019年1~9月我国远洋鱿钓作业渔船在东南太平洋赤道海域捕获的茎柔鱼渔获样本,分析雌雄性比的时空变化,并利用混合模型分析雌雄性比与栖息海域环境因子的关系...
雌雄性比作为有性生殖生物种类繁衍的基础,是物种种群维持的关键。选取2017~2019年1~9月我国远洋鱿钓作业渔船在东南太平洋赤道海域捕获的茎柔鱼渔获样本,分析雌雄性比的时空变化,并利用混合模型分析雌雄性比与栖息海域环境因子的关系。结果显示,茎柔鱼的总体雌雄性比在1∶1至4.67∶1之间,随着月份推移呈下降趋势;成熟群体的雌雄性比在0∶1至0.34∶1之间,随着月份推移呈增大趋势;总体雌雄性比与性成熟个体占比呈负相关关系,而在性成熟个体占比>10%时成熟群体的雌雄性比呈增大趋势。同时,总体雌雄性比与采样经度×纬度存在显著相关性(P<0.05),且与海表温、海表盐度、海平面高度及叶绿素a浓度等环境因子显著相关(P<0.05);但是,成熟群体雌雄性比与采样经度×纬度、海域环境因子等的关系不明显。结果表明,茎柔鱼的雌雄性比变化主要与性腺发育有关,且总体雌雄性比与栖息海域环境密切相关,而成熟群体具有较强的环境适应性以保持相对稳定的雌雄性比。
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关键词
茎柔鱼
性比
gamm模型
海洋环境
东南太平洋
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职称材料
题名
基于GFM和GAMM模型分析对虾白斑综合征(WSSV)对黄海和东海北部水域虾类生物量的影响
被引量：
1
1
作者
徐婷婷
滕广亮
李英瑕
吴强
单秀娟
张庆利
金显仕
机构
中国水产科学研究院黄海水产研究所
青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室
出处
《渔业科学进展》
CSCD
北大核心
2022年第1期46-55,共10页
基金
国家重点研发计划项目(2017YFC1404503)
农业农村部财政项目“黄渤海渔业资源调查”
+1 种基金
中国水产科学研究院基本科研业务费(2020TD39)
中国水产科学研究院黄海水产研究所基本科研业务费项目(20603022020005)共同资助。
文摘
虾类是海洋生态系统功能群的重要组成部分,其生物量变化受到多重因素的影响。本研究在开展黄海和东海北部水域虾类白斑综合征病毒(white spot syndrome virus,WSSV)流行病学调查的基础上,利用梯度随机森林模型(gradient random forest model,GFM)和广义加性混合模型(generalized additive mixed models,GAMM),分析了2016—2018年间黄海和东海北部水域WSSV流行对虾类生物量的影响。分子检测结果显示,调查所获取的26种虾类中,11种被检测为WSSV阳性;2016、2017和2018年WSSV阳性采样站点的比率分别为48.40%、38.75%和21.74%,虾类样品中WSSV阳性检出比率分别为16.86%、9.60%和4.80%。GFM模型分析显示,解释变量“阳性样品数的对数(ln_posi)”对响应变量“虾类生物量的对数(ln_Abu)”的重要性最高。GAMM分析中,根据赤池信息准则(Akaike information criterion,AIC)最小原则筛选出的最优模型为:ln_Abu~WSSV阳性率(P_rate)+ln_posi+经度(Long),该模型中ln_posi和P_rate是影响虾类生物量的极显著相关因子,ln_Abu随着P_rate的升高而降低。研究表明,WSSV在黄海和东海北部水域虾类中流行,推测对该海域的虾类生物量存在影响。
关键词
对虾白斑综合征病毒
黄海和东海北部
虾类
GFM
模型
gamm模型
Keywords
White spot syndrome virus(WSSV)
Yellow Sea and the northern East China Sea
Shrimp
Gradient random forest model(GFM)
Generalized additive mixed models(
gamm
)
分类号
S932.5 [农业科学—渔业资源]
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职称材料
题名
东南太平洋赤道海域茎柔鱼(Dosidicus gigas)雌雄性比变化及与海域环境的关系
2
作者
梅勇杰
林东明
机构
上海海洋大学海洋生物资源与管理学院
上海海洋大学大洋渔业资源可持续开发省部共建教育部重点实验室
上海海洋大学国家远洋渔业工程技术研究中心
上海海洋大学农业农村部大洋渔业开发重点实验室
出处
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第6期1488-1498,共11页
基金
国家自然科学基金项目,41876144号
上海市人才发展资金项目,2020107号
上海市自然科学基金项目,16ZR1415400号。
文摘
雌雄性比作为有性生殖生物种类繁衍的基础,是物种种群维持的关键。选取2017~2019年1~9月我国远洋鱿钓作业渔船在东南太平洋赤道海域捕获的茎柔鱼渔获样本,分析雌雄性比的时空变化,并利用混合模型分析雌雄性比与栖息海域环境因子的关系。结果显示,茎柔鱼的总体雌雄性比在1∶1至4.67∶1之间,随着月份推移呈下降趋势;成熟群体的雌雄性比在0∶1至0.34∶1之间,随着月份推移呈增大趋势;总体雌雄性比与性成熟个体占比呈负相关关系,而在性成熟个体占比>10%时成熟群体的雌雄性比呈增大趋势。同时,总体雌雄性比与采样经度×纬度存在显著相关性(P<0.05),且与海表温、海表盐度、海平面高度及叶绿素a浓度等环境因子显著相关(P<0.05);但是,成熟群体雌雄性比与采样经度×纬度、海域环境因子等的关系不明显。结果表明,茎柔鱼的雌雄性比变化主要与性腺发育有关,且总体雌雄性比与栖息海域环境密切相关,而成熟群体具有较强的环境适应性以保持相对稳定的雌雄性比。
关键词
茎柔鱼
性比
gamm模型
海洋环境
东南太平洋
Keywords
Dosidicus gigas
sex ratio
gamm
marine environment
southeast Pacific
分类号
S931 [农业科学—渔业资源]
S932 [农业科学—渔业资源]
Q958 [生物学—动物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于GFM和GAMM模型分析对虾白斑综合征(WSSV)对黄海和东海北部水域虾类生物量的影响
徐婷婷
滕广亮
李英瑕
吴强
单秀娟
张庆利
金显仕
《渔业科学进展》
CSCD
北大核心
2022
1
在线阅读
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职称材料
2
东南太平洋赤道海域茎柔鱼(Dosidicus gigas)雌雄性比变化及与海域环境的关系
梅勇杰
林东明
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
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