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草莓NBS-LRR家族基因FaNBS1的克隆与表达分析
被引量:
12
1
作者
刘建成
段可
+3 位作者
李静
叶正文
苏建宇
高清华
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第6期1025-1031,共7页
利用同源克隆结合RACE技术从久香草莓茎尖cDNA中分离到一个抗病相关TIR-NBS-LRR类基因FaNBS1(GenBank登录号:HQ845018),解析了该基因及其编码蛋白的组织结构和同源特征;并采用半定量RT-PCR技术分析了该基因在不同组织中的表达差异...
利用同源克隆结合RACE技术从久香草莓茎尖cDNA中分离到一个抗病相关TIR-NBS-LRR类基因FaNBS1(GenBank登录号:HQ845018),解析了该基因及其编码蛋白的组织结构和同源特征;并采用半定量RT-PCR技术分析了该基因在不同组织中的表达差异和外源植物生长物质处理下的表达变化。该基因在基因组上长为2434bp,由3个外显子组成的转录本包含长1893bp的读码框。所编码蛋白含630个氨基酸残基,在15~146是保守的TIR结构域,191~492是NB-ARC结构域。FaNBS1与大豆TIR-NBS-LRR抗性蛋白ADF78118的全序列一致性为50.20%,在NB-ARC保守结构域的一致性为52.06%。半定量RT-PCR分析显示,FaNBS1在检测的所有组织中都表汰佃存摹套分年组织中表达水平最高,日存叶中的表达水平明显受到外源水杨酸和脱落酸处理的影响.
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关键词
草莓
NBS—LRR基因
同源克隆
基因结构
进化树
RT—PCR
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职称材料
题名
草莓NBS-LRR家族基因FaNBS1的克隆与表达分析
被引量:
12
1
作者
刘建成
段可
李静
叶正文
苏建宇
高清华
机构
宁夏大学生命科学学院
上海市农业科学院生物技术研究所
上海市农业科学院林木果树研究所
出处
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第6期1025-1031,共7页
基金
上海农科院科技发展基金项目(农科发2008(02))
上海市科技兴农重点攻关项目(沪农科攻字(2008)第1-4号)
上海市科委自然科学基金项目(10ZR1426700),上海市科委青年科技启明星计划(09QA1405300)
文摘
利用同源克隆结合RACE技术从久香草莓茎尖cDNA中分离到一个抗病相关TIR-NBS-LRR类基因FaNBS1(GenBank登录号:HQ845018),解析了该基因及其编码蛋白的组织结构和同源特征;并采用半定量RT-PCR技术分析了该基因在不同组织中的表达差异和外源植物生长物质处理下的表达变化。该基因在基因组上长为2434bp,由3个外显子组成的转录本包含长1893bp的读码框。所编码蛋白含630个氨基酸残基,在15~146是保守的TIR结构域,191~492是NB-ARC结构域。FaNBS1与大豆TIR-NBS-LRR抗性蛋白ADF78118的全序列一致性为50.20%,在NB-ARC保守结构域的一致性为52.06%。半定量RT-PCR分析显示,FaNBS1在检测的所有组织中都表汰佃存摹套分年组织中表达水平最高,日存叶中的表达水平明显受到外源水杨酸和脱落酸处理的影响.
关键词
草莓
NBS—LRR基因
同源克隆
基因结构
进化树
RT—PCR
Keywords
fragaria× ananassa duch. cv. jiuxiang
NBS-LRR disease resistance gene
Homologouscloning
Gene organization
Phylogenetic tree
RT-PCR
分类号
S668.4 [农业科学—果树学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
草莓NBS-LRR家族基因FaNBS1的克隆与表达分析
刘建成
段可
李静
叶正文
苏建宇
高清华
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011
12
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