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基于GMapping算法与指纹地图构建的井下定位方法 被引量：4
1
作者 蒋磊 杨柳铭 +2 位作者 武方达 韩会杰 周雪 《工矿自动化》 北大核心 2017年第9期96-101,共6页
针对现有井下定位算法定位精度差和依赖信号源坐标的问题,提出一种基于GMapping算法与指纹地图构建的井下定位方法。将待定位的位置信号特征与信号分布图进行匹配,选择最优定位坐标,从而提高井下定位精度;通过与GMapping算法相结合,避... 针对现有井下定位算法定位精度差和依赖信号源坐标的问题,提出一种基于GMapping算法与指纹地图构建的井下定位方法。将待定位的位置信号特征与信号分布图进行匹配,选择最优定位坐标,从而提高井下定位精度;通过与GMapping算法相结合,避免了指纹地图构建过程维护成本高的问题,优化了算法的搜索与匹配效率。实际测试结果表明,该方法平均定位误差为57.7cm,可以满足井下定位要求。 展开更多
关键词 井下定位 即时定位与地图构建 Gmapping算法 指纹地图 信号分布图
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基于高通量测序的青花菜KASP标记开发与应用 被引量：1
2
作者 张振超 陶美奇 +4 位作者 潘永飞 孙国胜 王传友 安林海 戴忠良 《核农学报》 北大核心 2025年第3期513-521,I0003-I0005,共12页
为提高青花菜分子标记辅助育种水平,本研究基于高通量测序数据开发了70组KASP标记,并采用KASP检测平台对43份青花菜试验材料进行分型,根据分型结果筛选出分型效果好、多态性高的标记,用于指纹图谱构建、遗传关系确定和纯度鉴定。结果表... 为提高青花菜分子标记辅助育种水平,本研究基于高通量测序数据开发了70组KASP标记,并采用KASP检测平台对43份青花菜试验材料进行分型,根据分型结果筛选出分型效果好、多态性高的标记,用于指纹图谱构建、遗传关系确定和纯度鉴定。结果表明,70组KASP标记中,未分型成功有3个,未分型材料>5份有13个,多态性差的有6个,分型成功48个(成功率68.6%)。48个标记中,多态性信息含量(PIC)值≥0.30的标记有37个(占比77.08%),其中PIC值为0.37的标记数量最多,为11个,0.38的标记有3个。将48个标记的分型结果转化为二元编码数据,获得了43份青花菜育种材料的SNP-DNA指纹图谱。聚类分析结果发现,Br05与其他材料的遗传关系较远;Br12和Br19、Br33和Br34之间遗传系数均为100,Br14和Br32的遗传系数为99,表明两两间为同一株系的可能性大,这与在田间的表型观察结果基本一致。10组标记对30株Br19的一致性进行鉴定,发现纯度值区间为83.3%~96.7%,说明Br19株系间存在差异;采用10组标记对亲本Br19、Br35和杂交种F1(Br19×Br35)进行基因分型,结果有5个标记(SNP07、SNP09、SNP10、SNP11和SNP19)在三者间的分型结果不同,可用于杂交制种田F1(Br19×Br35)种子纯度鉴定。本研究结果对青花菜种质资源鉴定、分子标记辅助育种与新品种保护具有重要的应用价值。 展开更多
关键词 高通量测序 竞争性等位基因特异性PCR 指纹图谱 纯度鉴定 分子标记
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基于SSR标记“藏乌梨”品种真实性鉴定
3
作者 张靖国 陈启亮 +3 位作者 杨晓平 范净 杜威 胡红菊 《中国南方果树》 北大核心 2025年第4期198-200,共3页
近期梨果市场有种黑色果皮、号称产自西藏的“藏乌梨”受到热捧,但其品种真实性不详。本研究以市售“藏乌梨”为试材,通过基于SSR标记的分子指纹图谱构建及与国家砂梨种质资源圃(武汉)数据库进行比对,并结合果实形态学特征分析表明,所... 近期梨果市场有种黑色果皮、号称产自西藏的“藏乌梨”受到热捧,但其品种真实性不详。本研究以市售“藏乌梨”为试材,通过基于SSR标记的分子指纹图谱构建及与国家砂梨种质资源圃(武汉)数据库进行比对,并结合果实形态学特征分析表明,所谓“藏乌梨”是“玉露香”,而非西藏的“乌梨”;其黑皮疑似由于在果实成熟采收后经某种热处理而成。 展开更多
关键词 藏乌梨 SSR 指纹图谱 玉露香梨
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不同花色芍药种质资源遗传多样性分析与指纹图谱构建
4
作者 许兰杰 安素妨 +6 位作者 董薇 梁慧珍 谭政委 李春明 杨红旗 杨青 余永亮 《种子》 北大核心 2025年第4期78-84,共7页
为了揭示不同花色芍药材料的遗传背景,明确材料间的亲缘关系,利用筛选出的20个起始密码子多态性标记(SCoT)引物对不同花色的56份芍药材料进行遗传多样性分析并构建DNA指纹图谱。结果表明,SCoT引物共扩增出106个条带,其中多态性条带87条... 为了揭示不同花色芍药材料的遗传背景,明确材料间的亲缘关系,利用筛选出的20个起始密码子多态性标记(SCoT)引物对不同花色的56份芍药材料进行遗传多样性分析并构建DNA指纹图谱。结果表明,SCoT引物共扩增出106个条带,其中多态性条带87条,多态性比率为82.08%;平均每个引物扩增出4.35个条带;多态信息含量介于0.5790~0.8910之间,平均为0.7591。不同花色群体等位基因数、有效等位基因数、Nei's基因多样性指数、Shannon's信息指数平均值分别为1.5448、1.3780、0.2200和0.2447,以浅紫色群体最高;供试5个花色芍药群体间的遗传相似系数为0.8926~0.9745,浅紫色群体和深紫色群体的遗传相似系数最高,二者的亲缘关系相对较近。不同花色群体内遗传多样性系数为0.2690,基因分化系数为0.1490,基因流为2.8551;方差分析显示,96.68%的遗传变异在群体内。聚类分析结果显示,在遗传相似系数为0.68处,将56份芍药材料分为两大类;基于10个SCoT标记的42个位点构建56个芍药种质的指纹图谱。SCoT分子标记可有效鉴别不同花色芍药种质,不同花色芍药群体间遗传分化较小。 展开更多
关键词 芍药 遗传多样性 DNA指纹图谱
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赶黄草茎UPLC指纹图谱建立及其成分分析
5
作者 刘佳 夏陈 +3 位作者 邓俊琳 余鳗游 朱永清 向卓亚 《粮食与油脂》 北大核心 2025年第3期155-162,共8页
基于超高效液相色谱法(UPLC)指纹图谱,结合成分含量并采用化学模式识别法、聚类热图分析及正交偏最小二乘法-判别分析(OPLS-DA)综合评价不同产地赶黄草茎的质量。结果表明:建立的赶黄草茎UPLC指纹图谱共标定6个共有峰,分别是紫云英苷、... 基于超高效液相色谱法(UPLC)指纹图谱,结合成分含量并采用化学模式识别法、聚类热图分析及正交偏最小二乘法-判别分析(OPLS-DA)综合评价不同产地赶黄草茎的质量。结果表明:建立的赶黄草茎UPLC指纹图谱共标定6个共有峰,分别是紫云英苷、乔松素-7-O-葡萄糖苷、槲皮素、山奈酚、乔松素-7-O-(3″-O-没食子酰基-4″,6″-六羟基联苯二甲酰基)-β-葡萄糖苷(PGHG)和赶黄草茎苷A;16批赶黄草茎相似度为0.777~0.998;16批赶黄草茎样品中14种化合物含量之间有显著差异。通过聚类热图分析将16批赶黄草茎样品分为3类,四川省泸州市古蔺县样品与其他产地样品能被完全区分;OPLS-DA共筛选出9个质量差异标志性成分。建立的赶黄草茎UPLC指纹图谱及14个成分含量测定方法可靠、重复性好,其化学模式识别方法稳定可行,可为赶黄草茎质量研究提供参考。 展开更多
关键词 赶黄草茎 指纹图谱 聚类热图 成分分析
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基于SSR分子标记的紫椴遗传多样性分析和指纹图谱构建
6
作者 高磊 刘丹 《北京林业大学学报》 北大核心 2025年第3期28-37,共10页
【目的】紫椴是重要的经济树种和国家重点保护的濒危树种,基于SSR分子标记,分析不同种源紫椴遗传多样性,构建指纹图谱,旨在为紫椴居群的保护、全国紫椴种质资源的收集保存以及资源库建设提供参照。【方法】从国内5个省11个市采集16个种... 【目的】紫椴是重要的经济树种和国家重点保护的濒危树种,基于SSR分子标记,分析不同种源紫椴遗传多样性,构建指纹图谱,旨在为紫椴居群的保护、全国紫椴种质资源的收集保存以及资源库建设提供参照。【方法】从国内5个省11个市采集16个种源的173份紫椴样品,采用SSR分子标记进行PCR扩增,分析紫椴的遗传多样性;利用分子方差分析和种群聚类分析探究居群间的遗传分化;根据筛选的引物构建紫椴的指纹图谱。【结果】(1)从12组引物中筛选出了8组表现出高度多态性和良好重复性的引物,这些引物总共识别出101个等位基因,平均每个多态性位点上分布有12.6个等位基因。多态信息含量在不同位点间的变动区间为0.506~0.897,平均值达到0.739。(2)仅需4对引物(C110、C840、D150、TC5)即可有效区分所有紫椴个体,并构建紫椴指纹图谱。(3)紫椴种源的遗传多样性较为丰富,有效等位基因数为4.937,Shannon’s信息指数达到1.777,Nei’s基因多样性则为0.771。(4)分子方差分析结果表明,91%的遗传变异来源于紫椴群体内。(5)根据遗传距离构建进化树,将16个种源划分为5个亚类,多数地理距离较近的种源聚到一起,表现出较相近的遗传关系。【结论】紫椴群体总体遗传多样性水平较高,遗传分化处于中等水平,群体内遗传变异占主导地位。16个居群中,吉林省汪清种源(JWQ3)、黑龙江种源(HDN7、HDN8、HDN9)和河北承德市种源(HCD15)遗传多样性水平低,应进行原地保护,重点持续关注;种群JWQ2、JWQ4、JHL5、HNA10、LDD12和LFX13等的遗传多样性水平较高,可重点收集资源和保存培育。研究结果为深入研究中国紫椴的居群分布、进化和保护提供科学依据。 展开更多
关键词 紫椴 SSR标记 遗传多样性 遗传分化 DNA指纹图谱 聚类分析
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基于KASP标记的芥菜种质资源分子身份证构建 被引量：1
7
作者 朱海峰 王天鹏 +6 位作者 全瀚仪 陈海旭 蔡旭 梁建丽 武剑 李梅兰 王晓武 《中国蔬菜》 北大核心 2025年第3期34-45,共12页
利用由588份芥菜材料重测序分析获得9000个SNP的数据集,开发了覆盖芥菜全基因组的111个KASP标记。在对187份不同类型芥菜种质资源分子标记和表型分析的基础上,剔除了21份基因型重复,表型高度相似的材料。基于“用最少标记区分最多品种... 利用由588份芥菜材料重测序分析获得9000个SNP的数据集,开发了覆盖芥菜全基因组的111个KASP标记。在对187份不同类型芥菜种质资源分子标记和表型分析的基础上,剔除了21份基因型重复,表型高度相似的材料。基于“用最少标记区分最多品种”的原则,筛选出61个能够用于芥菜材料鉴定的KASP标记,利用这些标记的分型数据,构建了芥菜的基因型数字编码——指纹码;同时,对芥菜生产上重要的形态学性状(叶色、叶形、叶缘缺刻、包心情况、株高和膨大部位)进行调查,结合芥菜类型信息,构建了芥菜的表型数字编码——性状码。综合指纹码和性状码,构建166份芥菜材料的分子身份证二维码,为芥菜种质资源和品种的数字化管理奠定了重要基础。 展开更多
关键词 芥菜 种质资源 KASP标记 指纹图谱 分子身份证
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辣椒果实颜色性状与SSR分子标记的关联分析及指纹图谱构建
8
作者 段敏杰 李怡斐 +3 位作者 王春萍 黄任中 黄启中 张世才 《生物技术通报》 北大核心 2025年第7期81-94,共14页
【目的】对辣椒种质材料进行遗传多样性分析,挖掘与果实颜色性状关联的分子标记。【方法】以57份辣椒种质为供试材料,利用7个果实颜色性状与20个SSR标记进行遗传多样性分析,使用Tassel 5.0软件的一般线性模型(GLM)和混合线性模型(MLM)进... 【目的】对辣椒种质材料进行遗传多样性分析,挖掘与果实颜色性状关联的分子标记。【方法】以57份辣椒种质为供试材料,利用7个果实颜色性状与20个SSR标记进行遗传多样性分析,使用Tassel 5.0软件的一般线性模型(GLM)和混合线性模型(MLM)进行SSR标记和性状的关联分析,并构建种质指纹图谱。【结果】7个果实颜色性状遗传多样性指数变幅为1.58(果皮L值)-2.08(果肉a值),变异系数变幅为9.07%-51.84%,果实色价与果皮和果肉的Lab值之间存在一定的相关性。20个SSR标记检测出107个多态性位点,平均每个标记5.1个;引物多态性信息含量(PIC)变幅为0.221-0.864,平均0.624;香农信息指数(I)和Nei’s遗传多样性指数(H)平均值分别为1.3和0.646;57份辣椒种质遗传相似性系数变幅为0.069-0.9151,平均0.294。系统聚类将57份种质划分为2个亚族,亚族Ⅰ和亚族Ⅱ分别包含28和29份种质,群体结构分析将种质划分为2个亚群,亚群Ⅰ和亚群Ⅱ分别有33和24份种质,与聚类分析结果交叉重叠度较高。利用GLM和MLM两种模型共检测到与辣椒果实颜色性状相关的16个标记,表型解释率为6.6%-13.8%;标记SSR4与果实色价极显著关联(P<0.01),标记SSR6、SSR9和SSR17在2种模型中均被检测到与同一性状显著关联。利用9对核心引物构建了57份辣椒种质的指纹图谱。【结论】对57份辣椒果实色价和Lab值的遗传多样性和基于SSR标记的遗传多样性进行综合分析,并构建种质指纹图谱,为辣椒种质资源鉴定、优异种质筛选及分子辅助育种提供了一定的理论依据。 展开更多
关键词 辣椒 果实颜色性状 SSR标记 遗传多样性 关联分析 指纹图谱
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抗青枯病雪茄烟ZX145的SNP指纹图谱构建
9
作者 李光灿 张玉芹 +11 位作者 曹长代 张兴伟 肖志亮 杨晴 周东新 章慧芬 周永 耿锐梅 修启贵 宋志美 胡海洲 杨爱国 《中国烟草科学》 北大核心 2025年第5期1-9,共9页
为筛选具有青枯病抗性的优质雪茄烟材料,并为其后续育种应用提供分子标记,本研究基于包含雪茄烟种质ZX145在内的19份烟草种质GBS(基因分型测序,genotyping-by-sequencing)重测序数据,鉴定到221个ZX145特异SNP位点;筛选特异SNP位点开发K... 为筛选具有青枯病抗性的优质雪茄烟材料,并为其后续育种应用提供分子标记,本研究基于包含雪茄烟种质ZX145在内的19份烟草种质GBS(基因分型测序,genotyping-by-sequencing)重测序数据,鉴定到221个ZX145特异SNP位点;筛选特异SNP位点开发KASP分子标记,并利用71份不同类型烟草种质进行检测,获得28对能区分ZX145与其他种质的KASP分子标记;挑选覆盖所有染色体的24个位点构成ZX145的特异性SNP指纹图谱;并在福建、贵州、安徽三地病圃开展青枯病抗性及农艺性状、产量性状综合评价。结果表明,ZX145在病圃中抗性表现为中抗至抗病水平,优于常规对照,且产值效益较好。ZX145可作为雪茄烟抗青枯病育种的优质抗源,所得KASP标记可为其育种应用提供支撑。 展开更多
关键词 青枯病 雪茄烟 指纹图谱 抗病性
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基于果实性状和ISSR分子标记的荔枝种质遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建
10
作者 刘小英 吴碧君 +3 位作者 曾丽兰 张游南 林革 刘国强 《南方农业学报》 北大核心 2025年第7期2216-2229,共14页
【目的】基于果实性状和ISSR分子标记对34份荔枝种质开展遗传多样性及聚类分析,并构建DNA指纹图谱,以期为荔枝种质资源分类鉴定、评价和创新利用提供理论参考。【方法】以我国34份荔枝种质资源为研究对象,对其平均单果重、可溶性固形物... 【目的】基于果实性状和ISSR分子标记对34份荔枝种质开展遗传多样性及聚类分析,并构建DNA指纹图谱,以期为荔枝种质资源分类鉴定、评价和创新利用提供理论参考。【方法】以我国34份荔枝种质资源为研究对象,对其平均单果重、可溶性固形物含量、果形、龟裂片形状、缝合线是否明显等果实性状进行观测,并进行变异分析、多样性分析及相关分析,分别基于果实形状和ISSR分子标记进行聚类分析。最后基于ISSR分子标记检测结果构建DNA指纹图谱。【结果】34份荔枝种质的单果重17.0~57.5 g,可溶性固形物含量13.0%~20.7%,果形有心形、近圆球形、卵圆形、椭圆形、歪心形,龟裂片形状有隆起、锥尖状突起、平滑,缝合线明显或不明显。果实性状的Shannon-Weaver多样性指数为0.67~1.97,其中缝合线是否明显最低,可溶性固形物含量最高。单果重与可溶性固形物含量呈极显著负相关(P<0.01),果形与龟裂片形状呈显著正相关(P<0.05)。基于果实性状的聚类结果显示,在欧氏距离为8时,供试材料被分为四大类,果实性状聚类结果与荔枝种质的果实缝合线是否明显相关性较强,其次是按果形和龟裂片形状进行聚类,且各类群包含不同地区的种质,说明聚类结果与地理分布无明显相关性。17条ISSR引物共扩增出191条条带,其中多态性条带165条,平均多态性比率86.39%,引物UBC835、UBC846和UBC879多态性比率高达100.00%;等位基因数(Na)为1.6875~2.0000,平均为1.8422,有效等位基因数(Ne)为1.2498~1.7177,平均为1.4470,Nei’s基因多样性指数(H')为0.16~0.40,平均为0.26,Shannon’s信息指数(I)为0.2616~0.5746,平均为0.4015。基于ISSR分子标记的聚类结果显示,34份荔枝种质的遗传相似系数为0.5916~0.8691,平均为0.7359,在遗传相似系数0.7100时,供试材料被分成四大类,各类群均包含多个地区的荔枝种质,聚类结果与地理分布无明显相关性,而与果实成熟期存在一定的相关性。ISSR引物UBC857可用于构建34份荔枝种质资源的DNA指纹图谱。【结论】34份荔枝种质果实性状遗传多样性较丰富,但遗传相似系数较高,遗传基础较狭窄。基于果实性状的聚类结果与ISSR分子标记的聚类结果仅部分相同,均与地理分布无明显相关性,分别与荔枝种质的果实缝合线是否明显和果实成熟期存在相关性。引物UBC857可鉴别34份荔枝种质资源。 展开更多
关键词 荔枝 果实性状 ISSR分子标记 遗传多样性 DNA指纹图谱
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茄科作物DNA指纹图谱研究进展及其在遗传育种的应用
11
作者 胡娜 魏庆镇 +3 位作者 庞鸿涛 王五宏 包崇来 祝彪 《中国蔬菜》 北大核心 2025年第10期34-44,共11页
茄科作物是我国重要的蔬菜作物之一。DNA指纹图谱技术直接反映生物个体DNA水平的差异,是近年来主要的品种鉴定工具。本文综述了茄科代表作物(番茄、马铃薯、辣椒、茄子、烟草、枸杞)DNA指纹图谱的研究进展,同时阐述了指纹图谱在品种鉴... 茄科作物是我国重要的蔬菜作物之一。DNA指纹图谱技术直接反映生物个体DNA水平的差异,是近年来主要的品种鉴定工具。本文综述了茄科代表作物(番茄、马铃薯、辣椒、茄子、烟草、枸杞)DNA指纹图谱的研究进展,同时阐述了指纹图谱在品种鉴定、遗传多样性分析、标记辅助育种等遗传育种领域的应用,并对该技术在茄科作物育种方面存在的问题进行讨论,为今后茄科作物的品种保护、亲本选配遗传育种等多方面提供理论支撑。 展开更多
关键词 茄科作物 指纹图谱 遗传育种
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基于谱效关联技术的中药质量控制研究进展 被引量：5
12
作者 张建锋 侯长周 +2 位作者 侯晓杰 安海 张石宇 《中华中医药学刊》 北大核心 2025年第3期205-209,I0043,共6页
对国内外有关谱效关联研究论文进行分析研究,在谱效关联技术中主要运用色谱法、电感耦合、等离子体质谱法、紫外分光光度法等,对单味中药、中药复方制剂、中药饮片的抗菌、抗炎、抗氧化等方面进行谱效关联研究,通过离体细胞、细菌及在... 对国内外有关谱效关联研究论文进行分析研究,在谱效关联技术中主要运用色谱法、电感耦合、等离子体质谱法、紫外分光光度法等,对单味中药、中药复方制剂、中药饮片的抗菌、抗炎、抗氧化等方面进行谱效关联研究,通过离体细胞、细菌及在体动物等生物活性评价模型,采用偏最小二乘法、灰色关联度法、相似性分析法、层次聚类分析法、主成分分析法及双变量分析法等方法,探究了中药的药效物质基础,为中药的质量控制提供了新的方法。谱效关联技术在中药质量控制过程中,还存在以下不足:一是研究指纹图谱色谱峰中各化学成分的相互作用对中药药效的影响报道较少;二是针对同种疾病,各单个或综合的数据处理方法之间缺乏差异性比较,不同的分析方法可能存在差异,导致谱效关联结果出现偏颇。如果能在解决以上两个问题的基础上,进一步对相应活性成分作靶点和通路研究,将能更加全面、系统地对中药药效机理进行剖析,助力中药高质量发展。 展开更多
关键词 中药质量控制 谱效关联 指纹图谱 生物活性模型 谱效分析方法
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基于ISTOA-SVM的发动机故障诊断方法研究 被引量：2
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作者 李耀华 缑应祺 +1 位作者 潘成 宋凯歌 《机械设计》 北大核心 2025年第6期154-164,共11页
针对传统分类器难以处理发动机大量监控数据的缺陷,提出了一种基于领域搜索策略的改进乌燕鸥算法(improved sooty tern optimization algorithm,ISTOA)与支持向量机(support vector machine,SVM)相结合的发动机故障诊断方法。通过引入... 针对传统分类器难以处理发动机大量监控数据的缺陷,提出了一种基于领域搜索策略的改进乌燕鸥算法(improved sooty tern optimization algorithm,ISTOA)与支持向量机(support vector machine,SVM)相结合的发动机故障诊断方法。通过引入自适应变螺旋搜索策略与混沌映射以改进乌燕鸥算法,提高全局搜索能力及收敛速度,将其应用于支持向量机参数寻优,从而构建诊断模型进行故障诊断。利用实际故障数据和指印图的增补数据对所提出模型进行试验,结果表明:ISTOA-SVM模型能有效提升分类精度与速度且不易受正常数据影响,而指印图数据的嵌入可进一步提高模型诊断精度。使用实际故障案例,验证了所提出的模型可以有效应用于实际发动机故障诊断中。 展开更多
关键词 航空工程 航空发动机 乌燕鸥算法 支持向量机 指印图 故障诊断
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四川省主要杂交稻亲本的SSR多态性分析和指纹图谱的构建与应用 被引量：111
14
作者 肖小余 王玉平 +2 位作者 张建勇 李仕贵 荣廷昭 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2006年第1期1-7,共7页
利用微卫星标记对四川省主推杂交水稻品种进行了DNA指纹图谱构建和品种鉴定研究。208对引物中具有多态性的引物共123对,占所用引物的59.13%。不同染色体的微卫星分析的多态性不同,第9、10染色体微卫星的多态性高于其他染色体,第12染色... 利用微卫星标记对四川省主推杂交水稻品种进行了DNA指纹图谱构建和品种鉴定研究。208对引物中具有多态性的引物共123对,占所用引物的59.13%。不同染色体的微卫星分析的多态性不同,第9、10染色体微卫星的多态性高于其他染色体,第12染色体上的微卫星标记的多态性最差,仅为46.15%。42份常用杂交水稻亲本材料聚类分析表明,恢复系和不育系的遗传基础均较狭窄,但恢复系和不育系之间的遗传距离相对较远,从一定程度上反映了遗传距离与杂种优势的正相关。筛选出的各个亲本材料的特异引物或引物组合,能够将某个亲本材料与其他材料相区分。利用这些SSR引物建立了四川省主要杂交水稻亲本的DNA指纹数据库,可以有效地解决杂交水稻及其杂交种的鉴定问题,以及有效地分析各材料间的亲缘关系。从DNA指纹数据库中筛选出D优527的特异引物RM337、RM244和RM346,可以鉴定出D优527中的纯度,与田间鉴定结果一致;在真伪性鉴定中将同一不育系配组的D优527和D优68区分开,说明微卫星鉴定结果是准确可靠的,可用于品种权保护和品种真伪性及纯度鉴定。 展开更多
关键词 杂交水稻 微卫星标记 指纹图谱 遗传多样性 品种鉴定
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56个杂交水稻骨干亲本SSR指纹图谱的构建及遗传相似性分析 被引量：28
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作者 从夕汉 李莉 +5 位作者 滕斌 刘海珍 倪大虎 陆徐忠 宋丰顺 杨剑波 《生物学杂志》 CAS CSCD 2010年第1期87-91,共5页
以中国56个杂交水稻骨干亲本为研究材料,包括水稻雄性不育系和恢复系。从国标中公布的48对水稻SSR引物中筛选出14对稳定性好、多态性高、杂带少且在染色体上分布均匀的引物作为核心引物,建立56个杂交水稻骨干亲本的SSR指纹图谱,结果表明... 以中国56个杂交水稻骨干亲本为研究材料,包括水稻雄性不育系和恢复系。从国标中公布的48对水稻SSR引物中筛选出14对稳定性好、多态性高、杂带少且在染色体上分布均匀的引物作为核心引物,建立56个杂交水稻骨干亲本的SSR指纹图谱,结果表明:14对SSR引物在56份材料中共扩增出48个多态性片段,平均每对引物可以检测3.43个等位基因。聚类分析得出56个品种间的遗传相似性系数在0.63～0.98之间,基本上反映了不同品种间的亲缘关系。 展开更多
关键词 水稻 微卫星 指纹图谱 遗传相似性
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用微卫星DNA标记建立宁2A的指纹图谱 被引量：43
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作者 于永红 李云海 +5 位作者 马荣荣 王晓燕 胡国成 斯华敏 傅亚萍 孙宗修 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2001年第3期215-217,共3页
应用筛选出的 4对 SSR引物 ,建立了杂交水稻不育系宁 2 A以及宁 2 B的 DNA指纹图谱 ,结果表明 ,宁 2 A/ B特异性的 SSR指纹是引物 RM2 0 6的谱带 1和引物 RM2 2 4的谱带 1。通过与其他广泛应用的杂交水稻亲本材料的遗传关系分析 ,发现宁... 应用筛选出的 4对 SSR引物 ,建立了杂交水稻不育系宁 2 A以及宁 2 B的 DNA指纹图谱 ,结果表明 ,宁 2 A/ B特异性的 SSR指纹是引物 RM2 0 6的谱带 1和引物 RM2 2 4的谱带 1。通过与其他广泛应用的杂交水稻亲本材料的遗传关系分析 ,发现宁 2 A/ B具有籼稻的遗传成分 ,从而在分子水平上解释了该材料与籼稻亲和性较高的原因。 展开更多
关键词 杂交水稻 简单序列重复 指纹图谱
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基于SSR标记的福建省若干水稻品种DNA指纹图谱构建及遗传多样性分析 被引量：32
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作者 马红勃 许旭明 +2 位作者 韦新宇 杨旺兴 邹文广 《福建农业学报》 CAS 2010年第1期33-38,共6页
以24份杂交稻品种和18份杂交稻亲本为材料，利用SSR分子标记进行DNA指纹图谱构建和遗传多样性分析。24对引物在研究材料中共检测到74个多态性片段，平均每对引物的多态性片段为3．1个。基于24个SSR标记的扩增结果，利用NTSYS2．10e软件... 以24份杂交稻品种和18份杂交稻亲本为材料，利用SSR分子标记进行DNA指纹图谱构建和遗传多样性分析。24对引物在研究材料中共检测到74个多态性片段，平均每对引物的多态性片段为3．1个。基于24个SSR标记的扩增结果，利用NTSYS2．10e软件计算Dice遗传相似系数，并建立UPGMA聚类图，结果表明：42份材料之间的相似系数变化范围为0．60～1．00，在遗传相似系数0．68处可以将42份材料分为6个类群，较好地反映了供试材料的亲缘关系，可为水稻育种中亲本选择提供参考。同时建立了42份材料×12个SSR标记的指纹图谱，为杂交水稻品种纯度和真伪鉴定提供科学数据。 展开更多
关键词 水稻 SSR 指纹图谱 遗传多样性
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大麦DUS测试标准品种的遗传多样性分析及指纹图谱的构建 被引量：16
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作者 王艳平 沈奇 +2 位作者 张继红 李华勇 吴燕 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第2期273-278,共6页
为对大麦种子的真伪进行有效监控,防止假冒伪劣品种进入市场,也为新品种登记测试以及种质资源遗传多样性分析提供参考,采用SSR标记技术对29个大麦DUS测试标准品种进行了遗传多样性分析和指纹图谱的构建。利用筛选出的28对有多态性的SSR... 为对大麦种子的真伪进行有效监控,防止假冒伪劣品种进入市场,也为新品种登记测试以及种质资源遗传多样性分析提供参考,采用SSR标记技术对29个大麦DUS测试标准品种进行了遗传多样性分析和指纹图谱的构建。利用筛选出的28对有多态性的SSR引物共扩增出125个等位基因,每对引物可扩增出3～7个等位基因,平均4.46个等位基因,每对引物在29个品种中的PIC值为0.25～0.81,平均为0.62。聚类分析表明,29个大麦DUS测试标准品种可聚成4类,具有较远的亲缘关系,这些材料首先按照穗棱型进行聚类,表明不同穗棱型品种间存在较大遗传差异。构建了29个大麦DUS测试标准品种在28个SSR位点上的指纹图谱。 展开更多
关键词 大麦DUS测试 标准品种 SSR标记 遗传多样性 指纹图谱
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太湖稻区及国内部分香稻SSR指纹图谱构建及遗传多样性初析 被引量：18
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作者 朱勇良 谢裕林 +5 位作者 黄凌哲 吴建祥 乔中英 王建平 黄萌 陈培峰 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期666-671,共6页
以太湖稻区和国内其他地区的39个香稻品种,以及籼型恢复系2个对照品种为研究材料,利用SSR分子标记进行DNA指纹图谱构建和遗传多样性分析。从40对国标中公布的水稻SSR引物中筛选出13对核心引物,在41个水稻品种中共检测到36个多态性片段... 以太湖稻区和国内其他地区的39个香稻品种,以及籼型恢复系2个对照品种为研究材料,利用SSR分子标记进行DNA指纹图谱构建和遗传多样性分析。从40对国标中公布的水稻SSR引物中筛选出13对核心引物,在41个水稻品种中共检测到36个多态性片段。据此建立41个水稻品种的DNA指纹图谱,进行聚类分析,发现供试41个品种的遗传相似系数在0.58以上,而供试香稻品种的遗传相似系数在0.64以上,基本反映了不同品种间的亲缘关系。 展开更多
关键词 香稻 微卫星 DNA指纹图谱 遗传多样性
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我国茶树主要骨干亲本及其衍生品种(系)的SSR分析 被引量：20
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作者 段云裳 姜燕华 +3 位作者 王丽鸳 成浩 房婉萍 黎星辉 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期533-538,共6页
铁观音、黄棪和福鼎大白茶分别是我国乌龙茶和红绿茶育种中的骨干亲本,由它们衍生出了一系列的优良品种,研究其遗传多样性及构建指纹图谱将有助于今后茶树育种工作中骨干亲本的合理利用和品种权的保护。本研究利用40对SSR引物对我国乌... 铁观音、黄棪和福鼎大白茶分别是我国乌龙茶和红绿茶育种中的骨干亲本,由它们衍生出了一系列的优良品种,研究其遗传多样性及构建指纹图谱将有助于今后茶树育种工作中骨干亲本的合理利用和品种权的保护。本研究利用40对SSR引物对我国乌龙茶骨干亲本铁观音、黄棪及其衍生品种(系)和红绿茶骨干亲本福鼎大白茶及衍生品种进行了研究。结果表明,34份供试品种(系)的基因多样性指数(H)为0.54,平均遗传距离0.58,表明我国茶树主要骨干亲本及其衍生品种(系)具有较高的遗传多样性水平和较大的遗传变异,且90%的遗传多样性来自品种之间的遗传差异。聚类结果表明两套品种(系)各自聚为一类,遗传结构分析也显示两套品种(系)之间存在明显的差异。利用其中稳定性和多态性俱佳的5对引物组合构建了供试材料的数码指纹图谱。 展开更多
关键词 骨干亲本及衍生品种(系) 遗传多样性 亲缘关系 指纹图谱 SSR标记
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