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14份杏种质的ISSR分析 被引量：26
1
作者 冯晨静 张元慧 +4 位作者 徐秀英 师国洪 刘威生 孟庆瑞 杨建民 《河北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第5期52-55,62,共5页
以冀光为试材,研究了PCR反应体系的主要成分及退火温度对杏ISSR扩增结果的影响.同时,从42对ISSR引物中筛选出12对扩增条带清晰、多态性好的引物进行扩增,并运用UPGMA聚类分析法,分析了12份杏种质的亲缘关系及多样性.结果表明:在20 μL... 以冀光为试材,研究了PCR反应体系的主要成分及退火温度对杏ISSR扩增结果的影响.同时,从42对ISSR引物中筛选出12对扩增条带清晰、多态性好的引物进行扩增,并运用UPGMA聚类分析法,分析了12份杏种质的亲缘关系及多样性.结果表明:在20 μL的反应体系中,模板DNA含量在10～80 ng均能得到较好的扩增;dNTP用量对扩增无明显影响;而引物、Mg2+的最适浓度分别为0.25 μmol/L、0.25 mmol/L;Taq酶在0.5～4 U均能得到好的扩增条带;退火温度在50～52.1℃范围内均能得到清晰的条带;并在此基础上建立了杏ISSR反应体系.当相似系数在0.444～0.452之间时,将12份杏材料划分为3类:①普通杏(Amentaca vulgaris),西伯利亚杏(A.sibirica),辽杏(A.mandshurica),藏杏(A.holosericea)类型;②仁用杏品种一窝蜂;③紫杏(A. dasycarpa). 展开更多
关键词 杏 issr(inter-simple sequence repeat) 品种鉴定 亲缘关系 反应体系
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苹果品种ISSR指纹图谱构建 被引量：76
2
作者 宣继萍 章镇 +2 位作者 房经贵 高志红 车胜利 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第6期421-423,共3页
以富士、长富2、长富6、红星、新世纪、美国8号及凉香等7个品种为试材,进行了ISSR(inter-simplesequencerepeats)分析,构建了这几个苹果品种的ISSR指纹图谱。发现引物IS061可将富士、长富2与长富6三个品种一一区分开;而IS026则能将富士... 以富士、长富2、长富6、红星、新世纪、美国8号及凉香等7个品种为试材,进行了ISSR(inter-simplesequencerepeats)分析,构建了这几个苹果品种的ISSR指纹图谱。发现引物IS061可将富士、长富2与长富6三个品种一一区分开;而IS026则能将富士、红星、新世纪及美国8号4个品种相互区别开。初步证明利用ISSR标记技术能很好地将不同苹果品种鉴别出来。 展开更多
关键词 苹果 品种 issr 指纹图谱构建
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云南省苹果棉蚜种群遗传多样性的ISSR分析 被引量：3
3
作者 刘佳妮 李正跃 +3 位作者 桂富荣 陈斌 于亮 李世吉 《西南大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期136-140,共5页
苹果棉蚜是世界性检疫害虫,在云南省苹果主要产区造成严重的危害.从100条ISSR(Inter-si mple Sequence Repeat)引物中共筛选出4条多态性和重复性好的引物,研究了云南省昆明市、丽江市、昭通市3个苹果主产区共57个采样点的苹果棉蚜种群... 苹果棉蚜是世界性检疫害虫,在云南省苹果主要产区造成严重的危害.从100条ISSR(Inter-si mple Sequence Repeat)引物中共筛选出4条多态性和重复性好的引物,研究了云南省昆明市、丽江市、昭通市3个苹果主产区共57个采样点的苹果棉蚜种群间及种群内的遗传多样性.4条引物在苹果棉蚜DNA中共扩增出49个位点,多态位点百分率为75.51%.由Shannon信息指数和Nei s指数估算的种群间遗传分化系数为42.48%和17.53%,种群内遗传分化系数分别为57.52%和83.17%,表明苹果棉蚜大部分遗传变异主要存在于种群内部.各种群的遗传距离聚类分析表明,昆明种群与昭通种群的亲缘关系较丽江种群为近.研究结果为我国苹果棉蚜的遗传防治研究提供了分子依据,为进一步研究苹果棉蚜的分子进化提供了背景资料. 展开更多
关键词 苹果棉蚜 issr(inter-simple sequence repeat)标记 遗传多样性
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广西桑树品种遗传多样性ISSR分析 被引量：1
4
作者 刘玲 沈曦彤 +5 位作者 朱方容 邱长玉 范小敏 陈祥平 柯皓天 陈仁芳 《西南大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2016年第7期30-35,共6页
利用ISSR(inter-simple sequence repeat)分析了广西桑树品种的亲缘关系.刘圩7号、灵太3号、恭同5号、大寺12号、池塘1号、刘圩2号、那学8号、那陈2号、那学14号、小董1号、板朝1号、冯屋1号、邕新3号、邕新11号、恭同9号、太平2号、沙... 利用ISSR(inter-simple sequence repeat)分析了广西桑树品种的亲缘关系.刘圩7号、灵太3号、恭同5号、大寺12号、池塘1号、刘圩2号、那学8号、那陈2号、那学14号、小董1号、板朝1号、冯屋1号、邕新3号、邕新11号、恭同9号、太平2号、沙油4号、板屯车2号有较近的亲缘关系;大寺特号、冯屋5号、池塘4号、太平新1号、恭城4号有较近的亲缘关系;大寺5号、灵太1号、恭江1号、涠盛4号、灵太2号、板罗1号、那楼14号、恭同4号有较近的亲缘关系;钦州桑、大新白桑、广西鸡桑、全州长穗桑、环江1号、钦州长果桑、桂772、涠州岛白桑、邕新荆桑12号、隆林鬼桑、隆林蒙桑有较近的亲缘关系.白桑种遗传变异大;广东桑种亲缘关系靠近白桑,支持中国植物志、GenBank将广东桑置于白桑的变种.野生桑种与栽培桑种遗传背景明显不同.钦州桑、桂772、邕新荆桑12号遗传背景倾向野生桑,在抗性、速生方面有独特优点,在今后杂交育种中应注意利用. 展开更多
关键词 广西 桑树品种 issr(inter-simple sequence repeat) 亲缘关系
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23株酿酒酵母ISSR指纹图谱分析及SCAR标记的建立
5
作者 栾春艳 李晓玲 +2 位作者 郑国斌 姚娟 王健 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2014年第3期163-167,共5页
目的:构建酿酒酵母菌株的简单重复序列间多态性指纹图谱数据库并建立序列特异性扩增区(sequence characterized amplifi ed region,SCAR)标记技术,为酿酒酵母菌株的分类、遗传亲缘关系鉴定及菌种专利保护提供可靠的DNA分子标记技术依据... 目的:构建酿酒酵母菌株的简单重复序列间多态性指纹图谱数据库并建立序列特异性扩增区(sequence characterized amplifi ed region,SCAR)标记技术,为酿酒酵母菌株的分类、遗传亲缘关系鉴定及菌种专利保护提供可靠的DNA分子标记技术依据。方法:在简单重复序列间多态性(inter-simple sequence repeat,ISSR)指纹数据分析基础上进行聚类分析并对菌种进行分类鉴定,同时将酿酒酵母菌株9号和15号中扩增获得的ISSR特异性DNA带转化为可以直接用于菌株快速鉴定的SCAR分子标记。结果:构建23株酿酒酵母的ISSR指纹图谱,并在相似系数为0.85水平上将23个供试菌株分为3大类,其中,1、2、4、7、15、16、17、19、20、21、23聚为第一类;10、11、12、13、14、18号菌株聚为第二类且10号和11号菌为同一菌株;3、5、6、8、9、22号菌聚为第三类且属于同一菌株。此外,利用所获得的2个特异性条带成功转化为序列特异性扩增区分子标记。结论:在生产上酿酒酵母菌株遗传背景差异不大,常存在同物异名现象,而采用ISSR指纹及其SCAR分子标记技术快速鉴定酿酒酵母菌株在工业生产上具有重要意义。 展开更多
关键词 酿酒酵母菌 简单重复序列间多态性 DNA指纹图谱 序列特异性扩增区
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18份樱属材料亲缘关系的ISSR分析 被引量：16
6
作者 周成城 杨德明 +3 位作者 李士坤 万佳艺 荣俊冬 郑郁善 《森林与环境学报》 CSCD 北大核心 2020年第1期46-53,共8页
对福建山樱花、11份日本樱花品种和6份选优材料进行了标记,通过筛选出来的12条引物进行聚合酶链式反应(PCR)扩增。结果显示,共获得144个位点,多态性位点135个,多态性占93.75%。选取引物UBC808和UBC835构建指纹图谱,简单重复序列间扩增(I... 对福建山樱花、11份日本樱花品种和6份选优材料进行了标记,通过筛选出来的12条引物进行聚合酶链式反应(PCR)扩增。结果显示,共获得144个位点,多态性位点135个,多态性占93.75%。选取引物UBC808和UBC835构建指纹图谱,简单重复序列间扩增(ISSR)分子标记能有效地对18份樱属材料进行区分和鉴定。供试材料间的遗传相似系数在0.4532~0.8333之间,平均0.6337;遗传距离在0.1823~0.7651之间。通过非加权组平均法(UPGMA)进行聚类分析,在遗传相似性系数为0.5899时,可将18份樱属材料划分为4大类,其中选优材料与福建山樱花或日本樱花亲缘关系较近,但在花色、花期等方面有一定差异,且能区分和鉴定供试材料的亲缘关系。研究结果能为国内樱花新品种鉴定、优选和商品化等提供参考依据。 展开更多
关键词 樱花 简单重复序列间扩增 遗传多样性 指纹图谱
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基于SCAR标记和DNA条形码技术的苍术基原鉴别研究
7
作者 陈研 冯露露 +1 位作者 黄荣 齐伟辰 《世界科学技术-中医药现代化》 CSCD 北大核心 2024年第2期490-501,共12页
目的开发出能同时鉴别北苍术和关苍术的分子标记方法,并探究不同种质资源苍术的遗传进化关系。方法对不同地区北苍术Atractylodes chinensis(Bunge)Koidz及关苍术A.japonica Koidz.ex Kitam基因组DNA的差异片段进行测序,结合SRAP、ISSR... 目的开发出能同时鉴别北苍术和关苍术的分子标记方法,并探究不同种质资源苍术的遗传进化关系。方法对不同地区北苍术Atractylodes chinensis(Bunge)Koidz及关苍术A.japonica Koidz.ex Kitam基因组DNA的差异片段进行测序,结合SRAP、ISSR、DAMD分子标记方法,优化PCR反应体系,筛选并转换成特异性标记,同时,采用条形码方法分析种间序列差异。结果通过SRAP、ISSR、DAMD三种分子标记方法的PCR扩增,共筛选出198对能稳定扩增且重现性好的引物,转换出7对能稳定、快速鉴别北苍术和关苍术的SCAR引物。条形码方法检测出北苍术ITS2序列长度为454 bp,关苍术ITS2序列长度为453 bp,与其他苍术属植物之间遗传距离较远。NJ树结果显示,北苍术、关苍术及其他苍术属植物均各自聚为一支,表现出良好的单系性。依据ITS2二级结构,4种苍术属植物在螺旋区的茎环数目、大小、位置均有明显差异,可以直观地进行区分。结论所开发的特异性SCAR标记为苍术属植物优良品种的筛选提供了新方法,DNA条形码能稳定、准确鉴别北苍术。 展开更多
关键词 北苍术 关苍术 Internal transcribed spacer 2(ITS2) sequence-related amplified polymorphism(SRAP) inter-simple sequence repeat(issr) Direct amplification of minisatellite region DNA(DAMD) sequence characterized amplified regions(SCAR)
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不同特异种质罗汉果的遗传差异及杂交优势预测 被引量：2
8
作者 覃信梅 蒋水元 +5 位作者 韩愈 向巧彦 李虹 甘金佳 梁勇诗 黄夕洋 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2018年第2期425-431,共7页
利用简单序列重复区间扩增多态性(ISSR)技术分析了罗汉果航天、无籽、野生、栽培4类种质的遗传差异,构建DNA指纹图谱和UPGMA聚类图,并进行杂交优势预测的应用研究。结果表明,筛选出的19个ISSR引物中的5个可直接鉴别罗汉果21份特异种质,... 利用简单序列重复区间扩增多态性(ISSR)技术分析了罗汉果航天、无籽、野生、栽培4类种质的遗传差异,构建DNA指纹图谱和UPGMA聚类图,并进行杂交优势预测的应用研究。结果表明,筛选出的19个ISSR引物中的5个可直接鉴别罗汉果21份特异种质,种质间的遗传相似性系数为0.656~0.896,在相似性系数为0.795处的聚类结果分为5类。不同种质间存在一定的遗传变异,尤其是广西金秀(S17)、湖南永州(S18)和广西百色(S19)的野生种质与桂林主产区种质间,航天种质内以及雌雄株间都产生了较大的遗传差异。根据遗传差异的大小,对9个雌株预测了20个可能获得理想杂交优势的组合,推测雄株S13、S7和S9是较好的父本材料。该研究补充完善了罗汉果种质资源的遗传背景信息,从而为罗汉果种质的保护、创新和利用提供了理论基础及依据。 展开更多
关键词 罗汉果 特异种质 遗传差异 简单序列重复区间扩增多态性(issr)指纹图谱 杂交预测
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云产品牌卷烟主体烟叶原料的复烤烟指纹图谱的构建 被引量：1
9
作者 樊杰 张奇 +1 位作者 吴田 夏莺莺 《湖南农业大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2015年第6期627-630,共4页
以红花大金元、云87、NC297、NC102、K326复烤烟品种为研究对象,进行ISSR分析,发现利用826、836、841、847、856 ISSR引物能够区分这5个复烤烟品种。在此基础上,分别利用826和856引物构建了5个复烤烟的DNA指纹图谱,引物826在250~1 000 b... 以红花大金元、云87、NC297、NC102、K326复烤烟品种为研究对象,进行ISSR分析,发现利用826、836、841、847、856 ISSR引物能够区分这5个复烤烟品种。在此基础上,分别利用826和856引物构建了5个复烤烟的DNA指纹图谱,引物826在250~1 000 bp共读得6个水平的PCR条带,引物856在750~2 000 bp共读得5个水平的PCR条带。 展开更多
关键词 复烤烟 简单重复序列间多态性 指纹图谱
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