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甜荞柠檬酸转运蛋白基因FeFRD3的克隆及表达分析
被引量：
4
1
作者
李洪有
钟长春
+3 位作者
蔡芳
霍冬敖
张晓娜
陈庆富
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第3期409-415,共7页
该研究采用同源克隆策略,从甜荞中克隆到1个柠檬酸转运蛋白基因FeFRD3(GenBank登录号为MG462907)。FeFRD3基因含一个1 554bp开放阅读框,编码517个氨基酸,预测蛋白分子量为55.83kD,等电点为8.48。生物信息学分析显示,FeFRD3蛋白含有8个...
该研究采用同源克隆策略,从甜荞中克隆到1个柠檬酸转运蛋白基因FeFRD3(GenBank登录号为MG462907)。FeFRD3基因含一个1 554bp开放阅读框,编码517个氨基酸,预测蛋白分子量为55.83kD,等电点为8.48。生物信息学分析显示,FeFRD3蛋白含有8个跨膜区,定位于质膜和液泡膜上。蛋白序列分析结果表明,FeFRD3与拟南芥、大豆和水稻的FRD3同源蛋白有较高的序列一致性。系统进化树分析表明,FeFRD3属于具有将铁由根向地上部位长距离转运功能的柠檬酸转运蛋白,且与拟南芥AtFRD3亲缘关系最近。qRT-PCR分析结果表明,FeFRD3基因在甜荞根、茎、叶和种子中均有表达,但在根中的表达量最高,在种子中的表达量最低;缺铁胁迫没有影响FeFRD3基因在根中的表达,但高铁胁迫明显诱导了该基因在根中的表达。研究结果为进一步深入研究FeFRD3基因在甜荞铁长距离转运中的功能奠定了基础。
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关键词
甜荞
柠檬酸转运蛋白
fefrd3基因
缺铁胁迫
表达分析
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职称材料
题名
甜荞柠檬酸转运蛋白基因FeFRD3的克隆及表达分析
被引量：
4
1
作者
李洪有
钟长春
蔡芳
霍冬敖
张晓娜
陈庆富
机构
贵州师范大学荞麦产业技术研究中心
四川农业大学农学院
出处
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第3期409-415,共7页
基金
国家自然科学基金(31471562
31701494)
+2 种基金
国家现代农业产业技术体系荞麦育种岗位科学家专项资金(CARS-08-A4)
贵州省高层次创新型人才培养计划(20154020)
贵州师范大学博士科研项目(11904/0517051)
文摘
该研究采用同源克隆策略,从甜荞中克隆到1个柠檬酸转运蛋白基因FeFRD3(GenBank登录号为MG462907)。FeFRD3基因含一个1 554bp开放阅读框,编码517个氨基酸,预测蛋白分子量为55.83kD,等电点为8.48。生物信息学分析显示,FeFRD3蛋白含有8个跨膜区,定位于质膜和液泡膜上。蛋白序列分析结果表明,FeFRD3与拟南芥、大豆和水稻的FRD3同源蛋白有较高的序列一致性。系统进化树分析表明,FeFRD3属于具有将铁由根向地上部位长距离转运功能的柠檬酸转运蛋白,且与拟南芥AtFRD3亲缘关系最近。qRT-PCR分析结果表明,FeFRD3基因在甜荞根、茎、叶和种子中均有表达,但在根中的表达量最高,在种子中的表达量最低;缺铁胁迫没有影响FeFRD3基因在根中的表达,但高铁胁迫明显诱导了该基因在根中的表达。研究结果为进一步深入研究FeFRD3基因在甜荞铁长距离转运中的功能奠定了基础。
关键词
甜荞
柠檬酸转运蛋白
fefrd3基因
缺铁胁迫
表达分析
Keywords
Fagopyrum esculentum
citrate efflux transporters
fefrd
3
gene
deficiency iron stress
expression analysis
分类号
Q785 [生物学—分子生物学]
Q786 [生物学—分子生物学]
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作者
出处
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被引量
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1
甜荞柠檬酸转运蛋白基因FeFRD3的克隆及表达分析
李洪有
钟长春
蔡芳
霍冬敖
张晓娜
陈庆富
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018
4
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