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大豆FUL基因家族进化规律分析及基因编辑靶点鉴定
被引量：
2
1
作者
黎永力
杜浩
+5 位作者
李泰
甘卓然
侯智红
董利东
刘宝辉
程群
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第4期1120-1132,共13页
栽培大豆起源于我国黄淮海地区,我国具有悠久的大豆种植历史和丰富的大豆遗传资源。然而,近年来我国大豆进口依赖度极高,严重威胁到我国的粮食安全,因此培育高产优质的大豆品种至关重要。株高、籽粒大小等是影响大豆产量的重要农艺性状...
栽培大豆起源于我国黄淮海地区,我国具有悠久的大豆种植历史和丰富的大豆遗传资源。然而,近年来我国大豆进口依赖度极高,严重威胁到我国的粮食安全,因此培育高产优质的大豆品种至关重要。株高、籽粒大小等是影响大豆产量的重要农艺性状,因此,挖掘调控这些农艺性状的基因,并解析其分子机制具有重要意义。FRUITFULL(FUL)基因属于MADS-box类转录因子,在植物的开花、生长发育、果实成熟等方面起着重要的作用。本研究通过生物信息学分析发现,在大豆中含有6个FUL基因,它们均具有1个保守的MADS-box和1个较为保守的K-box结构域,并主要在豆荚中表达,说明该基因家族可能调控大豆种子相关性状。其中,只有GmFUL3b基因在叶片中高度表达,说明该基因在进化过程中功能可能产生了分化。此外,还发现6个FUL基因之间的进化规律不同。为进一步确定其生物学功能,利用CRISPR/Cas9技术,分别构建6个FUL基因的敲除突变体载体,转化大豆毛根进行靶点验证,并成功鉴定出其中5个基因的有效靶点,为进一步获得稳定的大豆突变体材料及解析GmFULs家族基因的功能提供了重要的理论基础。
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关键词
大豆
ful基因
生物信息学分析
CRISPR/Cas9技术
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职称材料
莲NnFUL基因克隆、亚细胞定位及表达分析
被引量：
3
2
作者
陈岳
张微微
+1 位作者
田代科
王金刚
《上海农业学报》
CSCD
2015年第4期11-18,共8页
为了研究MADS—box A类基因在莲花器官发育中的作用,以莲品种‘大洒锦'(Nelumbo nucifera‘Da sajin')的花蕾为试验材料,利用RT-PCR方法克隆了莲FUL-like基因cDNA序列,命名为NnFUL。NnFUL的cDNA长度为763 bp,其开放阅读框(Open ...
为了研究MADS—box A类基因在莲花器官发育中的作用,以莲品种‘大洒锦'(Nelumbo nucifera‘Da sajin')的花蕾为试验材料,利用RT-PCR方法克隆了莲FUL-like基因cDNA序列,命名为NnFUL。NnFUL的cDNA长度为763 bp,其开放阅读框(Open reading frame,ORF)共编码250个氨基酸。该蛋白属于亲水性蛋白,二级结构主要由α-螺旋、无规则卷曲和延伸链组成。系统进化分析表明:NnFUL编码的蛋白与AP1/SQUA亚家族中的FUL-like蛋白聚为一类,与二球悬铃木(Platanus×acerifolia)的FUL-like蛋白具有较高的亲缘关系。亚细胞定位显示该基因位于细胞核中。荧光定量Real-time PCR结果表明:NnFUL在花器官中表达量最高,主要集中在花萼和花瓣中,同时在营养器官中也有表达;因此,NnFUL在花器官发育尤其花萼和花瓣形成中有一定的调控作用。
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关键词
莲
花器官发育
ful
—like
基因
克隆
亚细胞定位
MADS—box
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职称材料
核桃FRUITFULL(JrFUL)基因的克隆及表达分析
被引量：
6
3
作者
王企
陈利娜
+4 位作者
夏小丛
敬丹
李好先
骆翔
曹尚银
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第8期992-1004,共13页
【目的】研究核桃JrFUL基因的序列特征及在核桃雌雄异熟开花机制中的作用。【方法】以核桃雌先型品种‘极早丰’及雄先型品种‘新早丰’的雌雄花芽为材料,外部形态测量确定不同品种核桃雌雄花芽形态分化差异。通过qRTPCR技术,分析核桃Jr...
【目的】研究核桃JrFUL基因的序列特征及在核桃雌雄异熟开花机制中的作用。【方法】以核桃雌先型品种‘极早丰’及雄先型品种‘新早丰’的雌雄花芽为材料,外部形态测量确定不同品种核桃雌雄花芽形态分化差异。通过qRTPCR技术,分析核桃JrFUL、JrAP1、JrLFY及JrSOC1基因在两个核桃品种不同发育时期的雌、雄花芽中的表达模式。克隆核桃JrFUL基因CDS序列,对其结构进行分析。【结果】春季萌芽期后,2月26日雌、雄花芽的横、纵径逐渐开始出现显著差异。不同核桃品种同一时期的雌、雄花芽的几个基因表达量有所差异。克隆得到的核桃JrFUL基因CDS编码区的全长序列长度为747 bp,命名为JrFUL,编码248个氨基酸。NCBI数据库Blast比对表明核桃JrFUL基因与其他植物物种FUL同源基因的相似性较高。系统进化分析发现核桃JrFUL与连香树及葡萄的FUL亲缘关系最近。【结论】JrFUL基因可能在核桃开花进程中起到关键作用,可能对雄花的开放有促进作用。JrLFY与JrSOC1基因可能一定程度上促进核桃开花,JrAP1基因可能一定程度上抑制核桃开花。
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关键词
核桃
ful基因
QRT-PCR
基因
克隆
表达分析
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职称材料
题名
大豆FUL基因家族进化规律分析及基因编辑靶点鉴定
被引量：
2
1
作者
黎永力
杜浩
李泰
甘卓然
侯智红
董利东
刘宝辉
程群
机构
广州大学生命科学学院
出处
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第4期1120-1132,共13页
基金
国家自然科学基金项目(31901568,32001508)。
文摘
栽培大豆起源于我国黄淮海地区,我国具有悠久的大豆种植历史和丰富的大豆遗传资源。然而,近年来我国大豆进口依赖度极高,严重威胁到我国的粮食安全,因此培育高产优质的大豆品种至关重要。株高、籽粒大小等是影响大豆产量的重要农艺性状,因此,挖掘调控这些农艺性状的基因,并解析其分子机制具有重要意义。FRUITFULL(FUL)基因属于MADS-box类转录因子,在植物的开花、生长发育、果实成熟等方面起着重要的作用。本研究通过生物信息学分析发现,在大豆中含有6个FUL基因,它们均具有1个保守的MADS-box和1个较为保守的K-box结构域,并主要在豆荚中表达,说明该基因家族可能调控大豆种子相关性状。其中,只有GmFUL3b基因在叶片中高度表达,说明该基因在进化过程中功能可能产生了分化。此外,还发现6个FUL基因之间的进化规律不同。为进一步确定其生物学功能,利用CRISPR/Cas9技术,分别构建6个FUL基因的敲除突变体载体,转化大豆毛根进行靶点验证,并成功鉴定出其中5个基因的有效靶点,为进一步获得稳定的大豆突变体材料及解析GmFULs家族基因的功能提供了重要的理论基础。
关键词
大豆
ful基因
生物信息学分析
CRISPR/Cas9技术
Keywords
soybean
ful
genes
bioinformatics analysis
CRISPR/Cas9 technology
分类号
S565.1 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
莲NnFUL基因克隆、亚细胞定位及表达分析
被引量：
3
2
作者
陈岳
张微微
田代科
王金刚
机构
东北农业大学园艺学院
中国科学院上海辰山植物科学研究中心
上海市资源植物功能基因组学重点实验室
上海农林职业技术学院园艺园林系
出处
《上海农业学报》
CSCD
2015年第4期11-18,共8页
基金
黑龙江省自然科学基金(C201112)
上海市绿化和市容管理局科学技术项目(G142427)
+1 种基金
上海市科学技术委员会课题(14DZ2260400)
上海市绿化与市容管理局攻关项目(F112421)
文摘
为了研究MADS—box A类基因在莲花器官发育中的作用,以莲品种‘大洒锦'(Nelumbo nucifera‘Da sajin')的花蕾为试验材料,利用RT-PCR方法克隆了莲FUL-like基因cDNA序列,命名为NnFUL。NnFUL的cDNA长度为763 bp,其开放阅读框(Open reading frame,ORF)共编码250个氨基酸。该蛋白属于亲水性蛋白,二级结构主要由α-螺旋、无规则卷曲和延伸链组成。系统进化分析表明:NnFUL编码的蛋白与AP1/SQUA亚家族中的FUL-like蛋白聚为一类,与二球悬铃木(Platanus×acerifolia)的FUL-like蛋白具有较高的亲缘关系。亚细胞定位显示该基因位于细胞核中。荧光定量Real-time PCR结果表明:NnFUL在花器官中表达量最高,主要集中在花萼和花瓣中,同时在营养器官中也有表达;因此,NnFUL在花器官发育尤其花萼和花瓣形成中有一定的调控作用。
关键词
莲
花器官发育
ful
—like
基因
克隆
亚细胞定位
MADS—box
Keywords
Nelumbo nucifera
Floral organ development
ful
-like gene
Cloning
Subcellular localization
MADS-box
分类号
Q75 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
核桃FRUITFULL(JrFUL)基因的克隆及表达分析
被引量：
6
3
作者
王企
陈利娜
夏小丛
敬丹
李好先
骆翔
曹尚银
机构
中国农业科学院郑州果树研究所
出处
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第8期992-1004,共13页
基金
国家科技基础性工作专项重点项目（2012FY110100）
中国农业科学院科技创新工程（CAAS-ASTIP-2019-ZFRI-03）
文摘
【目的】研究核桃JrFUL基因的序列特征及在核桃雌雄异熟开花机制中的作用。【方法】以核桃雌先型品种‘极早丰’及雄先型品种‘新早丰’的雌雄花芽为材料,外部形态测量确定不同品种核桃雌雄花芽形态分化差异。通过qRTPCR技术,分析核桃JrFUL、JrAP1、JrLFY及JrSOC1基因在两个核桃品种不同发育时期的雌、雄花芽中的表达模式。克隆核桃JrFUL基因CDS序列,对其结构进行分析。【结果】春季萌芽期后,2月26日雌、雄花芽的横、纵径逐渐开始出现显著差异。不同核桃品种同一时期的雌、雄花芽的几个基因表达量有所差异。克隆得到的核桃JrFUL基因CDS编码区的全长序列长度为747 bp,命名为JrFUL,编码248个氨基酸。NCBI数据库Blast比对表明核桃JrFUL基因与其他植物物种FUL同源基因的相似性较高。系统进化分析发现核桃JrFUL与连香树及葡萄的FUL亲缘关系最近。【结论】JrFUL基因可能在核桃开花进程中起到关键作用,可能对雄花的开放有促进作用。JrLFY与JrSOC1基因可能一定程度上促进核桃开花,JrAP1基因可能一定程度上抑制核桃开花。
关键词
核桃
ful基因
QRT-PCR
基因
克隆
表达分析
Keywords
Walnut
ful
gene
qRT-PCR
Cloning
Expression analysis
分类号
S664.1 [农业科学—果树学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
大豆FUL基因家族进化规律分析及基因编辑靶点鉴定
黎永力
杜浩
李泰
甘卓然
侯智红
董利东
刘宝辉
程群
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
2
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
莲NnFUL基因克隆、亚细胞定位及表达分析
陈岳
张微微
田代科
王金刚
《上海农业学报》
CSCD
2015
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
核桃FRUITFULL(JrFUL)基因的克隆及表达分析
王企
陈利娜
夏小丛
敬丹
李好先
骆翔
曹尚银
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
6
在线阅读
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职称材料
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