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A novel frameshift mutation in the beta-subunit of the epithelial sodium channel gene caused Liddle syndrome
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作者 Peng Fan Chaoxia Lu +7 位作者 Di Zhang Kunqi Yang Peipei Lu Ying Zhang Xu Meng Yaxin Liu Xue Zhang Xianliang Zhou 《中国循环杂志》 CSCD 北大核心 2018年第S01期162-162,共1页
Objective To characterize a novel frameshift mutation of the epithelial sodium channel(ENaC)βsubunit in a Chinese family with clinical suspicion of Liddle syndrome.And to emphasize that genetic testing is a confirmat... Objective To characterize a novel frameshift mutation of the epithelial sodium channel(ENaC)βsubunit in a Chinese family with clinical suspicion of Liddle syndrome.And to emphasize that genetic testing is a confirmatory evidence of the diagnosis of Liddle syndrome.Methods DNA samples from the proband with early-onset,treatment-resistant hypertension and hypokalemia and 31 additional relatives were all sequenced for mutations in exon 13 of theβ-ENaC andγ-ENaC genes,using amplification by polymerase chain reaction and direct DNA sequencing. 展开更多
关键词 frameshift MUTATION the EPITHELIAL sodium channel GENE Liddle SYNDROME
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RELT基因移码突变导致遗传性釉质发育不全
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作者 张真伟 徐欣然 +2 位作者 高学军 董艳梅 田华 《北京大学学报(医学版)》 北大核心 2025年第1期13-18,共6页
目的:纳入1例临床特征和遗传方式符合遗传性釉质发育不全的患者家系,在中国人群中发现RELT基因突变与遗传性釉质发育不全相关,分析其突变效应,探究基因型与表型的关系。方法:收集患者及家系成员的临床资料,分析其临床表型;采集家系成员... 目的:纳入1例临床特征和遗传方式符合遗传性釉质发育不全的患者家系,在中国人群中发现RELT基因突变与遗传性釉质发育不全相关,分析其突变效应,探究基因型与表型的关系。方法:收集患者及家系成员的临床资料,分析其临床表型;采集家系成员的外周静脉血等生物样本,提取基因组DNA,进行全外显子组测序(whole-exome sequencing,WES),分析其致病基因,采用Sanger测序验证。利用SIFT、PolyPhen-2等网站预测突变的致病性;利用Uniprot网站对比不同物种的蛋白序列,分析蛋白保守性;利用Alphafold 2等生物信息学软件分析突变蛋白在三维结构等方面的改变。结果:先证者表现为典型的钙化不全型遗传性釉质发育不全,磨耗重,釉质较软,表面粗糙着色,部分釉质丧失,其他家系成员不具有类似的口腔表现。WES和Sanger测序结果表明该先证者携带RELT基因的纯合移码突变,即NM_032871.3:c.1169_1170del,其父母均为携带者,该突变被预测为能致病。生物信息学分析结果显示,该突变位点在不同物种间高度保守。蛋白三维结构预测显示,与野生型RELT蛋白相比,突变蛋白p.Pro390fs35构象提前终止,影响该蛋白正常功能。结论:通过对一个遗传性釉质发育不全家系进行表型分析、基因测序及功能预测等,发现RELT基因的纯合移码突变可造成蛋白结构异常,导致钙化不全型遗传性釉质发育不全。 展开更多
关键词 遗传性釉质发育不全 RELT基因 移码突变 釉质矿化
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IARS1单杂合突变相关生长迟缓和肝病1例报告
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作者 李阳 毛迪 +1 位作者 魏丽亚 巩纯秀 《临床肝胆病杂志》 北大核心 2025年第4期731-735,共5页
IARS1基因变异罕见,经检索,仅有10例详尽临床及遗传数据的病例被文献报道。本文报道了1例IARS1单杂合变异相关的生长迟缓和肝病,并总结IARS1变异导致生长迟缓、智力障碍、肌张力低下和肝病的临床及遗传学特点,扩展了生长迟缓、智力障碍... IARS1基因变异罕见,经检索,仅有10例详尽临床及遗传数据的病例被文献报道。本文报道了1例IARS1单杂合变异相关的生长迟缓和肝病,并总结IARS1变异导致生长迟缓、智力障碍、肌张力低下和肝病的临床及遗传学特点,扩展了生长迟缓、智力障碍、肌张力低下和肝病的遗传谱。 展开更多
关键词 移码突变 肝疾病 儿童
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碱基插入产生HLA无效等位基因的序列分析及确认
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作者 全湛柔 钟艳平 +2 位作者 何柳媚 杨冰娜 邹红岩 《中国实验血液学杂志》 北大核心 2025年第1期276-279,共4页
目的:确认1例碱基插入产生无效等位基因HLA-C*08:127N的序列。方法:应用PCR-SSOP及PCR-SBT进行HLA常规检测,发现1例急性髓系白血病患者HLA-C的序列图谱均存在异常。应用二代测序技术对该位点序列进行确认。结果:HLA-C位点SSOP分型结果为... 目的:确认1例碱基插入产生无效等位基因HLA-C*08:127N的序列。方法:应用PCR-SSOP及PCR-SBT进行HLA常规检测,发现1例急性髓系白血病患者HLA-C的序列图谱均存在异常。应用二代测序技术对该位点序列进行确认。结果:HLA-C位点SSOP分型结果为C*03:04,C*08:01;SBT结果分析时发现序列在第3外显子疑似插入或缺失,二代测序确认结果为C*03:04,C*08:127N。结论:碱基插入产生HLA无效等位基因,SBT分析软件无法给出正确的结果,而二代测序技术可以更直观得到准确的HLA分型结果。 展开更多
关键词 人类白细胞抗原 无效等位基因 碱基插入 移码突变 二代测序
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1例Dent病患者CLCN5基因新发移码突变的生物信息学分析
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作者 张营营 李楠楠 +1 位作者 范亮亮 刘纪实 《中南大学学报(医学版)》 北大核心 2025年第5期913-918,共6页
Dent病是一种罕见的X连锁隐性遗传肾小管疾病,临床特征为低分子量蛋白尿(low molecular weight proteinuria,LMWP)、高钙尿症、肾钙质沉着等,可诱发进行性肾功能衰竭。该病主要由CLCN5基因突变引起。本文报告1例10岁男性患者,在常规体... Dent病是一种罕见的X连锁隐性遗传肾小管疾病,临床特征为低分子量蛋白尿(low molecular weight proteinuria,LMWP)、高钙尿症、肾钙质沉着等,可诱发进行性肾功能衰竭。该病主要由CLCN5基因突变引起。本文报告1例10岁男性患者,在常规体检中发现蛋白尿表型,综合生化检测结果及临床评估显示显著的LMWP和高钙尿症,病理组织染色显示肾小球系膜细胞及基质均增多。进一步的全外显子测序发现患者CLCN5基因中有1个突变(NM_001127899.4,c.1158delC,p.F387Lfs*42),导致移码和提前终止,可能破坏其在氯/氢离子交换和内涵体酸化中的功能。生物信息学分析显示该突变致病。基因检测在诊断罕见肾病中具有重要意义,对致病突变的早期识别有助于及时干预、疾病管理以及改善患者的预后。本文扩展了CLCN5的突变谱,有助于理解Dent病的遗传和分子机制。 展开更多
关键词 Dent病 CLCN5基因 全外显子测序 移码突变 生物信息学分析
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假尿苷修饰体外转录mRNA在翻译过程中发生的+1核糖体框架移码
6
作者 于永利 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期269-273,共5页
为应对世界范围内的COVID-19疫情,假尿苷(Ψ)修饰的体外转录mRNA(Ψ-IVT-mRNA)被授权应用于SARS-Cov-2 mRNA疫苗。最近,Ψ-IVT-mRNA被发现在翻译蛋白质时发生核糖体“滞顿”,导致+1核糖体移码,在体外和体内翻译出异常的蛋白质。在接种SA... 为应对世界范围内的COVID-19疫情,假尿苷(Ψ)修饰的体外转录mRNA(Ψ-IVT-mRNA)被授权应用于SARS-Cov-2 mRNA疫苗。最近,Ψ-IVT-mRNA被发现在翻译蛋白质时发生核糖体“滞顿”,导致+1核糖体移码,在体外和体内翻译出异常的蛋白质。在接种SARS-Cov-2 mRNA疫苗的人群,这种异常蛋白可能激发脱靶T细胞反应或抗体反应或产生其它意想不到的副作用。这一发现对研制有效“安全”的mRNA疫苗/药物有“警示”和指导意义。 展开更多
关键词 SARS-CoV-2疫苗 体外转录mRNA 假尿苷修饰 核糖体框架移码
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PAX6新发移码和无义变异导致中国先天性无虹膜病一家系临床表型和基因型分析
7
作者 王冬冬 杜娇 +3 位作者 黄子旭 但汉东 林作鹏 宋宗明 《中华实验眼科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第10期927-931,共5页
目的分析先天性无虹膜病一家系的临床表现及其致病原因,并分析候选变异对蛋白结构的影响。方法采用家系调查研究方法,收集2023年6月于河南省立眼科医院就诊的中国河南地区汉族先天性无虹膜病一家系2代3人的临床资料,其中患者1例。详细... 目的分析先天性无虹膜病一家系的临床表现及其致病原因,并分析候选变异对蛋白结构的影响。方法采用家系调查研究方法,收集2023年6月于河南省立眼科医院就诊的中国河南地区汉族先天性无虹膜病一家系2代3人的临床资料,其中患者1例。详细询问患者及其家系成员病史,并进行全面眼科检查,包括视力、眼压、眼前节照相、彩色眼底照相、超声生物显微镜、光学相干断层扫描等。采集该家系成员外周血,对患者进行全外显子组测序,其他成员采用Sanger测序验证。对新发现的变异位点进行致病性和蛋白结构分析。结果先证者男,23岁,双眼视力较差、无虹膜、角膜变性、晶状体轻度混浊、前房较浅且眼压高、周边视网膜变性、黄斑发育不良。先证者父母临床表型未见明显异常。全外显子组测序显示,PAX 6基因外显子10存在移码和无义变异c.734_735del(p.Arg245Asnfs*20),该变异为第734~735位碱基缺失,导致其245位精氨酸变异为天冬酰胺,并在其后19个氨基酸处提前出现终止密码子。该变异在HGMD、Clinvar、千人基因组和gnomAD数据库均未见收录。先证者父母未携带该变异,符合家系共分离。通过SMART工具进行亚结构鉴定发现该变异位于HOX结构域中。氨基酸保守性分析发现PAX 6基因翻译的氨基酸序列第245位精氨酸在人、小家鼠、家犬、非洲爪蟾、猕猴等物种中高度保守。经ACMG《序列变异解读标准和指南》评估,该变异被分类为致病性变异(PVS1+PS2+PM2+PP3)。蛋白结构分析显示,PAX6蛋白的同源结构域和富含脯氨酸-丝氨酸-苏氨酸的结构域缺失。结论PAX 6基因新发移码和无义致病性变异c.734_735del(p.Arg245Asnfs*20)是该先天性无虹膜病家系的致病变异位点,该变异使PAX6蛋白同源结构域和富含脯氨酸-丝氨酸-苏氨酸的结构域缺失。 展开更多
关键词 无虹膜 家系 移码变异 PAX6基因 基因分析
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IRF8新发移码突变的基因功能分析
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作者 李乐盈 陈尧 +3 位作者 周维涛 何晨 张端午 钱莉玲 《复旦学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期359-367,共9页
目的对反复肺炎患儿队列病因筛查中发现的干扰素调节因子8基因(interferon regulator factor 8,IRF8)新发突变(c.1266dupA)进行分子细胞水平的功能研究与验证。方法针对IRF8突变序列构建野生与突变蛋白过表达载体,通过质粒转染或构建慢... 目的对反复肺炎患儿队列病因筛查中发现的干扰素调节因子8基因(interferon regulator factor 8,IRF8)新发突变(c.1266dupA)进行分子细胞水平的功能研究与验证。方法针对IRF8突变序列构建野生与突变蛋白过表达载体,通过质粒转染或构建慢病毒感染不同工具细胞,通过qPCR、Western blot、免疫荧光等实验手段检测其表达差异及对下游炎症相关基因表达调控的改变。结果IRF8野生及突变过表达载体构建成功,且转染效率可观,包装成的慢病毒感染效率亦较高。突变基因IRF8(c.1266dupA)相较于野生型IRF8转录水平降低,表达蛋白的相对分子质量略增大,表达量降低,突变蛋白IRF8mut相对野生型IRF8蛋白核质比增加,IRF8(c.1266dupA)对下游ISRE元件的抑制功能增强。结论IRF8新发移码突变属于功能获得型(gain of function,GOF)突变。 展开更多
关键词 干扰素调节因子8(IRF8) 移码突变 反复感染 转录调控
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基于外显子组测序的Axenfeld-Rieger综合征致病突变筛查 被引量:3
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作者 王琦 刘鑫娜 +1 位作者 邵正波 原慧萍 《中华实验眼科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第10期929-934,共6页
目的对Axenfeld-Rieger综合征(ARS)一家系进行临床检查和基因检测,寻找致病突变。方法采用家系调查研究方法,纳入2018年于哈尔滨医科大学附属第二医院就诊的中国汉族ARS一家系,该家系3代共15人,其中患者3例。详细记录家族史,进行眼科及... 目的对Axenfeld-Rieger综合征(ARS)一家系进行临床检查和基因检测,寻找致病突变。方法采用家系调查研究方法,纳入2018年于哈尔滨医科大学附属第二医院就诊的中国汉族ARS一家系,该家系3代共15人,其中患者3例。详细记录家族史,进行眼科及全身一般检查。采集受检者外周静脉血2~5 ml并提取淋巴细胞基因组DNA和RNA。对先证者DNA进行外显子测序,利用人群数据库及生物信息学分析筛选可疑突变,Sanger测序和实时荧光定量PCR进行验证,对可疑突变进行保守性和有害性预测,参照美国医学遗传学与基因组学学会(ACMG)遗传变异分类标准与指南对候选罕见变异进行致病性评估。结果3例患者均存在ARS典型的眼部、牙齿和肚脐发育异常,且均携带PITX2基因c.525delC(p.Asp175Glufs^(*))杂合突变,家系中其他人员无相应临床表型且未检测到该变异位点,符合家系共分离。3例患者PITX2 mRNA相对表达量为0.672±0.063,明显低于健康对照的1.015±0.179,差异有统计学意义(t=8.847,P<0.001)。dbSNP、1000G、gnomeAD、ExAC、Korea1K、EVS数据库中均未收录该变异,MutationTaster评为有害,受影响的氨基酸序列在9种动物中保守存在。ACMG遗传变异分类标准和指南评价该变异位点为致病变异。结论PITX2基因c.525delC(p.Asp175Glufs*)变异为该家系患者的致病变异,首次在中国ARS家系中报道。 展开更多
关键词 AXENFELD-RIEGER综合征 家系 基因检测 全外显子组测序 PITX2基因 移码突变
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中国一先天性无虹膜家系PAX6基因新致病突变位点的筛查及验证 被引量:1
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作者 刘宇莹 刘琼 +3 位作者 万文苹 杨鸽 夏昆 金学民 《中华实验眼科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第7期602-606,共5页
背景先天性无虹膜是临床上罕见的先天性遗传性眼病。研究显示,配对盒转录因子6基因(PAX6)与先天性无虹膜症密切相关,但不同患者中PAX6基因的突变位点不同。目的对中国一常染色体显性遗传先天性无虹膜家系进行PAX6基因突变位点分析... 背景先天性无虹膜是临床上罕见的先天性遗传性眼病。研究显示,配对盒转录因子6基因(PAX6)与先天性无虹膜症密切相关,但不同患者中PAX6基因的突变位点不同。目的对中国一常染色体显性遗传先天性无虹膜家系进行PAX6基因突变位点分析。方法于2014年8月在郑州大学第一附属医院收集一汉族先天性无虹膜家系,采集该家系9名成员及同期100名健康体检者的外周静脉血10ml,采用标准酚一氯仿提取法提取基因组DNA,对PCR扩增产物进行测序、对比及突变分析。采用实时荧光定量PCR法验证和比较该家系中患病者与该家系表型正常者和健康对照者淋巴细胞中PAX6mRNA的相对含量。结果该家系共3代9名成员,遗传方式符合常染色体显性遗传。家系中共5例患病者,成年患病者均表现为虹膜缺失和白内障,儿童患病者表现为无虹膜;其他4名家系成员表型正常。测序结果显示,家系患病者均存在11号染色体PAX6基因10号外显子的移码突变,第796位核糖核苷酸G缺失(C.796delG),产生提前终止密码子,而家系正常成员及100名对照者均无此突变。实时荧光定量PCR结果显示,家系中患病者淋巴细胞中PAX6mRNA表达水平比家系中正常成员约低50%,差异有统计学意义(Z=-2.449,P=0.016)。结论PAX6基因C.796delG为此先天性无虹膜家系的致病突变位点,扩增了PAX6基因突变谱。 展开更多
关键词 先天性无虹膜/遗传性 人类第11号染色体/基因 配对盒转录因子/基因 碱基序列 码突变 家系 中国人/基因
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常州市运河水和饮用水的致突变研究及其评价 被引量:2
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作者 马文漪 章敏 徐东炯 《南京大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 1989年第3期105-114,共10页
1984年1月、3月和9月,取京杭大运河常州-武进段四个断面的水样,作Ames试验.结果是:上游的河水厂断面为阴性,其余三个断面都是阳性,其中石化厂断面尤为严重;检测丁堰断面运河水不同组分的致突变性,表明致突变物主要在碱性组分.结果还表明... 1984年1月、3月和9月,取京杭大运河常州-武进段四个断面的水样,作Ames试验.结果是:上游的河水厂断面为阴性,其余三个断面都是阳性,其中石化厂断面尤为严重;检测丁堰断面运河水不同组分的致突变性,表明致突变物主要在碱性组分.结果还表明,所检水样的致突变作用一般不受S9活化系统存在与否的影响,致突变物主要是移码型的.另外,常州市第二水厂源水和出厂自来水的Ames试验结果表明,在源水加氯处理过程中会产生致突变物,从而增加饮用水的潜在危害. 展开更多
关键词 河水 饮用水 致突变性 有机污染物
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以酵母病毒杀伤系统为基础的抗病毒药物筛选模型 被引量:1
12
作者 叶燕锐 潘力 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第8期449-452,500,共5页
许多病毒利用程序性-1核糖体移码作为翻译调节机制进行繁殖。程序性酵母的病毒杀伤系统由L-A病毒和M1卫星病毒组成。M1病毒编码一种分泌型毒素K1,能杀死不含病毒的酵母细胞,但有自身免疫功能。L-A通过一定频率-1移码事件进行繁殖,-1移... 许多病毒利用程序性-1核糖体移码作为翻译调节机制进行繁殖。程序性酵母的病毒杀伤系统由L-A病毒和M1卫星病毒组成。M1病毒编码一种分泌型毒素K1,能杀死不含病毒的酵母细胞,但有自身免疫功能。L-A通过一定频率-1移码事件进行繁殖,-1移码效率的改变影响L-A病毒的存活,使M1数量快速下降。因此以程序性-1核糖体移码为靶位,建立以酵母病毒杀伤系统为基础的筛选模型,在抗病毒药物的高通量筛选方面有良好的应用前景。 展开更多
关键词 酵母杀伤系统 程序性-1核糖体移码 抗病毒药物
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X-ray CCD165-SX探测器快速数据采集
13
作者 柳义 周平 《核电子学与探测技术》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期396-399,共4页
对X光探测器X-ray CCD165-SX在帧移模式下进行数据采集。选择合适开口高度的掩膜,使得CCD的曝光面仅是整个探测面的一小部份。利用TTL信号发生器产生的脉冲信号触发子潜像帧移,将各个不同时间内产生的子潜像储存在CCD的芯片上不同位置上... 对X光探测器X-ray CCD165-SX在帧移模式下进行数据采集。选择合适开口高度的掩膜,使得CCD的曝光面仅是整个探测面的一小部份。利用TTL信号发生器产生的脉冲信号触发子潜像帧移,将各个不同时间内产生的子潜像储存在CCD的芯片上不同位置上,当芯片填满子潜像时,一次性读出。这种方式大大加快了实验数据的采集速度。实验中对快速升温的情况下对PE样品进行测试,成功地采集到了随时间快速变化的散射信号。 展开更多
关键词 X射线电荷耦合探测器 快速数据采集 帧移模式 TTL信号发生器
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乙型脑炎病毒NS1'蛋白移码序列的鉴定
14
作者 郑浩 童光志 《中国动物传染病学报》 CAS 2012年第1期38-42,共5页
本文通过对猪乙型脑炎病毒(Japanese encephalitis virus,JEV)基因组中移码序列分析,设计合成三条引物,通过PCR扩增出假定的NS1'移码片段,并将移码片段三倍重复克隆入pET-28a表达载体中。重组质粒转化E.coli BL-21后,经IPTG诱导在3... 本文通过对猪乙型脑炎病毒(Japanese encephalitis virus,JEV)基因组中移码序列分析,设计合成三条引物,通过PCR扩增出假定的NS1'移码片段,并将移码片段三倍重复克隆入pET-28a表达载体中。重组质粒转化E.coli BL-21后,经IPTG诱导在37℃下实现目的片段的可溶性表达。纯化表达产物,并免疫小鼠制备了多抗血清,以多抗血清为一抗,对JEV感染的Vero细胞进行免疫荧光分析,结果发现抗移码片段表达蛋白的血清可识别JEV蛋白。以JEV感染Vero细胞,提取感染细胞总蛋白,分别以NS1单抗和以上制备的多抗血清为一抗,进行Western blot分析。结果显示,NS1单抗为一抗,可染出48 kDa的NS1条带和56 kDa的NS1'条带;而以多抗血清为一抗,仅染出56 kDa的条带。上述结果显示,多抗血清识别的NS1'蛋白为NS1'移码后片段表达的蛋白。 展开更多
关键词 乙型脑炎病毒 核糖体移码 NS1′蛋白
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游仆虫肽链释放因子eRF1对编程性翻译移码的影响 被引量:4
15
作者 李禄琴 胡苗清 +2 位作者 王软林 柴宝峰 梁爱华 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第5期468-474,共7页
编程性翻译移码是mRNA翻译为多肽链时核糖体沿mRNA正向或反向滑动1个碱基才能表达出1个完整多肽链的现象.人的肽链释放因子eRF1对HIV-1病毒的编程性-1移码有直接的影响.而且在频繁发生编程性+1移码的单细胞真核生物游仆虫中,肽链释放因... 编程性翻译移码是mRNA翻译为多肽链时核糖体沿mRNA正向或反向滑动1个碱基才能表达出1个完整多肽链的现象.人的肽链释放因子eRF1对HIV-1病毒的编程性-1移码有直接的影响.而且在频繁发生编程性+1移码的单细胞真核生物游仆虫中,肽链释放因子eRF1对编程性移码也有明显的影响.为进一步研究eRF1中影响编程性翻译移码的关键序列及调控机理,本研究将含有不同终止密码子的移码序列和已报道的游仆虫移码基因Ndr2分别插入双荧光素酶报告基因中,成功建立了可在酵母中进行研究的编程性移码报告检测体系.利用游仆虫肽链释放因子Eo-eRF1b的N结构域和酵母肽链释放因子Sc eRF1的MC结构域构建了杂合肽链释放因子(Eo/Sc eRF1),检测Eo-eRF1b N结构域中的不同突变位点对移码效率的影响.结果表明,游仆虫肽链释放因子eRF1b中YCF区的突变能明显促进含终止密码UAA的移码序列的移码,推测这可能是由于eRF1突变体降低了对UAA的识别所导致.此外,杂合肽链释放因子Eo/Sc eRF1能够有效地提高移码基因Ndr2的移码效率.eRF1b中YCF区的突变同样能明显促进Ndr2的移码.因此,游仆虫肽链释放因子YCF区的特殊序列可能是这种生物中发生编程性移码频率较高的原因之一.本研究为探讨纤毛虫编程性翻译移码调控机制提供了实验数据. 展开更多
关键词 八肋游仆虫 编程性翻译移码 肽链释放因子 双荧光素酶报告体系
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无义介导的mRNA降解 被引量:9
16
作者 贾晓波 胡剑 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第2期115-120,共6页
无义介导的mRNA降解(nonsense-mediated mRNA decay,NMD)作为真核细胞中重要RNA监控机制,识别并降解开放阅读框中含有提前终止密码子(premature termination codon,PTC)的mRNA,以避免因截短的蛋白产物积累对细胞造成毒害.NMD还调控正常... 无义介导的mRNA降解(nonsense-mediated mRNA decay,NMD)作为真核细胞中重要RNA监控机制,识别并降解开放阅读框中含有提前终止密码子(premature termination codon,PTC)的mRNA,以避免因截短的蛋白产物积累对细胞造成毒害.NMD还调控正常生理基因的表达,暗示其在真核细胞中扮演重要角色.NMD途径的关键是PTC的识别.本文通过3种模型来分别阐述发现于哺乳动物、酵母等不同有机体的识别机制.通常由NMD因子UPF1(up-frameshift)等被招募至含PTC的mRNA上,借助这些因子组装形成"功能复合体"并激活降解.但目前对于PTC识别后的过程仍认识有限,本文通过综述NMD途径的分子机制以更好地理解其生物学意义. 展开更多
关键词 提前终止密码子(PTC) 外显子连接复合体(EJC) 上游移码蛋白(UPF)
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先天性虹膜缺损合并先天性白内障一家系的PAX6基因新突变
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作者 顾静 易浩安 +5 位作者 查旭 孔艳波 江伟阳 杨芳 李凡 何永蜀 《中华实验眼科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第10期966-971,共6页
目的探讨先天性虹膜缺损合并先天性白内障一家系的致病基因及遗传方式。方法采用家系调查研究方法,2020年2月于云南省残疾人康复中心和昆明医科大学第二附属医院眼科收集云南汉族先天性虹膜缺损合并先天性白内障一家系,对先证者及其父... 目的探讨先天性虹膜缺损合并先天性白内障一家系的致病基因及遗传方式。方法采用家系调查研究方法,2020年2月于云南省残疾人康复中心和昆明医科大学第二附属医院眼科收集云南汉族先天性虹膜缺损合并先天性白内障一家系,对先证者及其父母、子女和丈夫进行眼科临床检查及诊断。收集该家系成员全血,提取基因组DNA。对先证者及其丈夫进行全外显子组测序,采用生物信息学分析方法定位可疑致病基因,采用UGENE进行氨基酸保守性分析;采用MutationTaster预测变异对蛋白翻译的影响;参照美国医学遗传学与基因组学学会(ACMG)遗传变异分类标准与指南对变异位点进行致病性评估。对所有收集样本进行Sanger测序验证,确定致病基因及变异位点。结果先证者临床表现为双眼虹膜大部缺损,仅周边部见少量虹膜组织,晶状体皮质及后囊混浊,伴有眼球震颤,眼部检查无其他异常。先证者全外显子组测序结果显示,PAX6基因第8外显子有1个新的杂合移码变异PAX6:c.415dupA(p.R139fs),发生移码突变的位点在各物种间保守。MutationTaster预测结果显示,该变异位点位于PAX6蛋白高度保守区,变异使蛋白质丧失功能。ACMG遗传变异分类标准与指南评分为PVS1+PM2+PP1,为致病性变异。结合该家系疾病临床表型及Sanger测序分析,显示变异与疾病共分离,表明该变异致病。先证者及子女均患该病,先证者父母表型正常,该变异为新发变异,符合常染色体显性遗传。结论PAX6基因杂合移码突变c.415dupA(p.R139fs)是导致该家系出现先天性虹膜缺损合并先天性白内障的原因,该变异位点为首次报道。 展开更多
关键词 虹膜疾病 眼组织缺损 白内障 家系 基因检测 PAX6基因 移码突变 新发突变
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绝经后确诊成骨不全症两例报告
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作者 王诗玮 王晓黎 +2 位作者 谷剑秋 李玉姝 单忠艳 《中华骨质疏松和骨矿盐疾病杂志》 CSCD 北大核心 2022年第4期391-396,共6页
成骨不全症(osteogenesis imperfecta,OI)是最常见的单基因骨病,常幼年起病。本文报道两例新发COL1A1基因移码突变(c.2850delG、c.358dupC)导致的Ⅰ型OI患者,确诊时均为绝经后女性,描述其临床表型,以及双膦酸盐治疗后骨密度和骨代谢标... 成骨不全症(osteogenesis imperfecta,OI)是最常见的单基因骨病,常幼年起病。本文报道两例新发COL1A1基因移码突变(c.2850delG、c.358dupC)导致的Ⅰ型OI患者,确诊时均为绝经后女性,描述其临床表型,以及双膦酸盐治疗后骨密度和骨代谢标志物的变化。提示临床医生注意对绝经后骨质疏松女性充分进行成骨不全的鉴别诊断,尤其是既往有脆性骨折史的女性。 展开更多
关键词 成骨不全 COL1A1基因 移码突变
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基于CRISPR-Cas9基因编辑技术创制大豆gmnark超结瘤突变体 被引量:5
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作者 柏梦焱 袁珏慧 +2 位作者 孙嘉丰 厉苏宁 关跃峰 《大豆科学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期525-532,共8页
为研究豆科作物结瘤自我调节机制(autoregulation of nodulation, AON)的作用机理,运用CRISPR-Cas9基因编辑技术创制大豆品种华春6号超结瘤gmnark突变体,设计3条靶向目的基因GmNARK的特异sgRNA,构建CRISPR-Cas9敲除载体。通过毛根转化... 为研究豆科作物结瘤自我调节机制(autoregulation of nodulation, AON)的作用机理,运用CRISPR-Cas9基因编辑技术创制大豆品种华春6号超结瘤gmnark突变体,设计3条靶向目的基因GmNARK的特异sgRNA,构建CRISPR-Cas9敲除载体。通过毛根转化试验选取sgRNA-B和sgRNA-C两条编辑效率较高的sgRNA用于大豆稳定转化,在T1代筛选出8种不同突变类型的突变体,在T2代通过营养液水培试验证明其中5种突变体有超结瘤的表型。选取gmnark-A突变体作进一步表型分析,发现其具有超结瘤、植株矮小和叶片深绿的表型。本研究所创制的gmnark突变体是研究AON途径作用机制与根瘤发育的重要遗传材料,同时此新种质资源具有作为"绿肥"与其它作物进行间作或轮作的巨大潜力。 展开更多
关键词 大豆 基因编辑 结瘤自我调节机制 移码突变
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利用CRISPR/Cas9系统构建Prdx6基因敲除的RAW264.7细胞系 被引量:4
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作者 翟菲菲 全芷仪 +12 位作者 王路鹿 张士军 鞠丹迪 水一鸣 常江 常恒祯 胡盼 李岩松 卢士英 周玉 柳增善 李兆辉 任洪林 《动物医学进展》 北大核心 2019年第4期36-40,共5页
利用CRISPR/Cas9系统构建敲除Prdx6基因的RAW264.7小鼠巨噬细胞系,为探讨Prdx6与布鲁菌感染及胞内寄生的关系构建细胞模型。针对Prdx6基因的第1外显子设计sgRNA,构建重组表达载体Prdx6-pX459-sgRNA,将重组质粒转染RAW264.7细胞,嘌呤霉... 利用CRISPR/Cas9系统构建敲除Prdx6基因的RAW264.7小鼠巨噬细胞系,为探讨Prdx6与布鲁菌感染及胞内寄生的关系构建细胞模型。针对Prdx6基因的第1外显子设计sgRNA,构建重组表达载体Prdx6-pX459-sgRNA,将重组质粒转染RAW264.7细胞,嘌呤霉素初步筛选。单细胞接种并扩繁,提取基因组DNA,PCR及测序鉴定。结果表明,在敲除细胞株基因组中存在碱基缺失,导致移码突变。说明成功获得敲除Prdx6基因的RAW264.7细胞系。 展开更多
关键词 CRISPR/Cas9 RAW264.7 Prdx6 移码突变 布鲁菌
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