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Evaluating Feed Intake of Fishes in Aquaculture Nutrition Experiments with Due Consideration of Mortality and Fish Survival
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作者 Lateef Akinwumi Folorunso Benjamin Obukowho Emikpe +2 位作者 Augustine Eyiwunmi Falaye Akeem Babatunde Dauda Emmanuel Kolawole Ajani 《Journal of Northeast Agricultural University(English Edition)》 CAS 2017年第2期45-50,共6页
Mortality is normal and natural in aquaculture experiments. However, it becomes a problem when measuring feed intake as a component of nutrient utilization parameters such as: feed conversion ratio, feed conversion e... Mortality is normal and natural in aquaculture experiments. However, it becomes a problem when measuring feed intake as a component of nutrient utilization parameters such as: feed conversion ratio, feed conversion efficiency, apparent net protein utilization, protein efficiency ratio and protein productive value. In order to accurately evaluate feed intake with due consideration of mortality encountered, a formulae was developed using empirical data obtained from an experiement that had mortality. The formulae Fwas: total feed consumed by numbers of survived fishes=DL∑i=1n(Fi/Ni)N. Where, D=Numbers of days fishes were fed within each period ibefore it was adjusted(e.g fortnight), it was constant throught period of experiment; F=Uantity of feed fed per day for a fortnight before the quantity was adjusted, it changed every fortnight; L=Numbers of living fishes at the end of experimental period; N=Numbers of fishes at each weighing period, it might change every fortnight or might be constant if no mortality occurred; while n=Numbers of times fishes were weighed and quantity of feed was adjusted but this did not include the final weighing at the termination of experiment. However, if the fishes were weighed weekly, then D=6. 展开更多
关键词 feed intake MORTALITY FORMULAE FISH nutrient utilization
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Prosperity and Disappearance of Introduced Fishes in Xiangmoshan Reservoir
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作者 FAN Zhaoting CHEN Weixing LIU Yi FANG Jingjie LIU Qingzhen 《Journal of Northeast Agricultural University(English Edition)》 CAS 2010年第3期29-37,共9页
In order to enhance the resources, some fishes were introduced into Xiangmoshan reservoir. The introduced fishes consisted of different ecotypes such as silver carp (Hypophthahnichthys rnolitrix (Cuvier et Valencien... In order to enhance the resources, some fishes were introduced into Xiangmoshan reservoir. The introduced fishes consisted of different ecotypes such as silver carp (Hypophthahnichthys rnolitrix (Cuvier et Valenciennes)), big head (Aristichthys nobilis (Richardso)) and lake herring (Coregonus clupeaformis (Mitchill)) that were plankton feeders, common carp (Cyprinus carpio Linnaeus) and crucian carp (Carassius auratus gibelio) belonging to the polyphagia, and also the non-native predator Walleye (Stizostedion vitreum (Mitchill)) and big mouth (Silurus soldatovi rneridonalis Chen), et al. Among there were not only the cool water fish Peled (Coregonus peled (Gmelin)), but also the warm water fish big mouth. The introduction of non-native fishes resulted in ecosystem changes of the reservoir and some native fishes had gone to decrease their population sizes or been in the condition of depopulation such as Opsariichthys uncirostris arnurensis (Berg), Rhodeus sericeus (Pallas) and Silurus asotus (Linnaeus). The native common carp had disappeared after the introduction of non-native species. Roach (Rutilus rutilus lacustris (Pallas) had been thriven for one or two generations after its introduction and immeidiatly disappeared. Silver fish (Protosalanx hyalocranius (Abbott)), Lake herring (Coregonus clupeaformis (Mitchill)) and Walleye (Stizostedion vitreum (Mitchill)) died several years after the introduction, so most of the introduced species has passed out of existence. Via many years introduction of different fishes, composition of species and the structure of the population in the reservoir had been changed obviously. It was necessary to further estimate whether the ecosystem of the reservoir had been damaged. 展开更多
关键词 Xiangmoshan reservoir introdued fish prosperity and disappearance ecological damage
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SRF融合富于细胞肌纤维瘤2例临床病理特征
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作者 徐园园 毛荣军 +3 位作者 谢乐 莫超华 李红玲 黄颖欣 《临床与实验病理学杂志》 北大核心 2025年第7期948-952,共5页
目的 探讨SRF融合富于细胞肌纤维瘤(cellular myofibroma with SRF fusions, CMSRF)的临床病理学特征、诊断及鉴别诊断。方法 收集2例CMSRF的临床资料,采用免疫组化SP两步法检测相关蛋白表达,行荧光原位杂交(fluorescence in situ hybri... 目的 探讨SRF融合富于细胞肌纤维瘤(cellular myofibroma with SRF fusions, CMSRF)的临床病理学特征、诊断及鉴别诊断。方法 收集2例CMSRF的临床资料,采用免疫组化SP两步法检测相关蛋白表达,行荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization, FISH)检测基因重排,并复习相关文献。结果 肿瘤组织均呈结节状生长,结节内瘤细胞弥漫分布,呈束状、席纹状和漩涡状排列,瘤细胞核呈梭形、卵圆形,胞质红染,异型不明显或轻度异型性,偶见核分裂象,瘤组织中可见数量不等的薄壁血管,局灶可见血管外皮瘤样特征。免疫表型:desmin、SMA、Calponin和CD99均(+),Caldesmon(部分+);Ki67热点区增殖指数1%~10%。FISH检测示SRF断裂(+)。结论 结合肿瘤形态学、免疫组化特征和SRF基因改变可明确CMSRF的诊断,局部切除可获得良好预后。 展开更多
关键词 肌纤维瘤 肌周细胞瘤 SRF 免疫组织化学 FISH
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基于荧光原位杂交(FISH)技术的假俭草染色体鉴定和核型分析
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作者 李建建 王浩然 +4 位作者 张源 徐夕雯 李晓慧 张苓 郭海林 《植物资源与环境学报》 北大核心 2025年第1期33-41,共9页
以假俭草(Eremochloa ophiuroides(Munro)Hack.)品种‘赣北’(‘Ganbei’)基因组序列数据为基础,通过生物信息学手段挖掘和设计了假俭草染色体特异的单拷贝寡核苷酸(oligo)探针库,同时结合端粒重复序列和rDNA重复序列探针,在假俭草根尖... 以假俭草(Eremochloa ophiuroides(Munro)Hack.)品种‘赣北’(‘Ganbei’)基因组序列数据为基础,通过生物信息学手段挖掘和设计了假俭草染色体特异的单拷贝寡核苷酸(oligo)探针库,同时结合端粒重复序列和rDNA重复序列探针,在假俭草根尖细胞有丝分裂中期染色体上进行了系列荧光原位杂交(FISH)试验。结果显示:假俭草染色体核型公式为2n=2x=18(2SAT),利用5S rDNA和18S rDNA重复序列探针可识别出第5和第4号染色体,且第4号染色体18S rDNA富集区段易出现或存在断裂现象;设计的假俭草染色体特异单拷贝oligo探针可识别出第2、第6和第9号染色体,进一步结合rDNA重复序列探针结果还发现第4号染色体与第8号染色体间发生了染色体易位。综合分析认为,假俭草染色体核型存在不稳定性,且其基因组在进化过程中发生了染色体结构重排。本研究建立的基于重复序列和单拷贝oligo探针的FISH技术体系,可为假俭草染色体的准确识别和变异鉴定提供新方法,观察到的假俭草染色体核型特征可为假俭草高质量基因组图谱的构建提供细胞学证据。 展开更多
关键词 假俭草 染色体 重复序列 寡核苷酸(oligo) 荧光原位杂交(FISH) 核型分析
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Environmental DNA assessment of fish diversity, distribution and niche characteristics in Zhutuo spawning ground in the upper reaches of the Yangtze River
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作者 LU Jia WANG Li +3 位作者 LI Ruijiao YANG Jin ZHANG Peng YANG Shengfa 《水利水电技术(中英文)》 北大核心 2025年第S1期454-467,共14页
[Objective]Implementation of the Ten-Year Fishing Ban policy may alter fish diversity and niche characteristics of dominant species in spawning grounds within the National Nature Reserve for Rare and Endemic Fish in t... [Objective]Implementation of the Ten-Year Fishing Ban policy may alter fish diversity and niche characteristics of dominant species in spawning grounds within the National Nature Reserve for Rare and Endemic Fish in the Upper Yangtze River.This study initiated continuous monitoring of natural spawning habitats from February 2022 to assess these ecological changes.[Methods]Environmental DNA(eDNA)metabarcoding was employed to analyze fish species composition,biodiversity patterns,and niche parameters of dominant species.Water sampling followed the CEN/TS 19461 standard across five monitoring transects(ZT1-ZT5).[Results]The eDNA analysis detected 45 species of fish belonging to 38 genera,13 families,and 3 orders were detected through environmental DNA(eDNA)in this survey,including 10 species endemic to the upper reaches of the Yangtze River,such as Procypris rabaudi and Myxocyprinus asiaticus.The fish community was mainly composed of bottom-dwelling,settling ovum-producing,omnivorous fish.The variation ranges of the Chao1 index,ACE index,Shannon index,and Simpson index are 736~996,719~965,1.58~3.23,and 0.83~0.99,respectively,indicating that fish species in spawning sites are abundant and community distribution uniformity is high.All indexes are highest at ZT1 monitoring points.Cluster analysis showed that,at a certain similarity level,fish community types in spawning sites could be basically divided into two groups:ZT1,ZT3,and ZT5 clustered together,and ZT2 and ZT4 clustered together,indicating similar fish community habitats.There are 9 dominant fish species in typical deep pool habitats in the reserve,with niche widths(Bi)ranging from 1.13 to 3.87.The dominant fish species are broad and medium niche fish,such as Cyprinus carpio and Hemiculter tchangi,with the niche overlap index(Oik)of some dominant fish species reaching more than 0.95.This indicates fierce competition for resources among the fish in this spawning ground.[Conclusion]The Zhutuo spawning ground demonstrates high species richness with homogeneous community structure and intense resource competition.This study establishes an eDNA-based monitoring framework that enhances conventional survey method,providing critical baseline data for adaptive management under the fishing moratorium regime. 展开更多
关键词 eDNA metabarcoding fishes endemic to the upper reaches of the Yangtze River spawning ground fish diversity niche characteristics
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免疫组化及分子标志物在弥漫性胸膜间皮瘤中的诊断价值
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作者 李少玲 武春燕 +6 位作者 张莉萍 侯立坤 董正伟 谢惠康 吴伟 张伟 黄焰 《临床与实验病理学杂志》 北大核心 2025年第6期706-712,共7页
目的探讨免疫组化及分子标志物在弥漫性胸膜间皮瘤(diffuse pleural mesothelioma,DPM)中的诊断价值。方法统计分析114例DPM的临床影像表现、组织学分型和分级,以及Calretinin、WT-1、CK5/6、MC、D2-40、UPK3B和GATA3在DPM中的阳性率和B... 目的探讨免疫组化及分子标志物在弥漫性胸膜间皮瘤(diffuse pleural mesothelioma,DPM)中的诊断价值。方法统计分析114例DPM的临床影像表现、组织学分型和分级,以及Calretinin、WT-1、CK5/6、MC、D2-40、UPK3B和GATA3在DPM中的阳性率和BAP-1、MTAP的缺失率,计算MTAP免疫组化与p16基因FISH检测状态的一致性及MTAP免疫组化检测的敏感度和特异度。结果114例DPM中,男性66例(57.9%),女性48例(42.1%),平均年龄58.1岁(范围16~85岁)。影像学主要表现为胸腔积液、胸膜多发占位(55.3%,63/114)。上皮样型、肉瘤样型和双相型DPM分别为88例(77.2%)、17例(14.9%)和9例(7.9%)。上皮样型DPM中,低级别和高级别者分别为69例(78.4%)和19例(21.6%)。上皮样型DPM中阳性率较高的间皮标志物分别为Calretinin(92.4%,81/88)、D2-40(90.0%,79/88)和WT-1(90.0%,79/88);肉瘤样型DPM中阳性率较高的标志物分别为D2-40(76.5%,13/17)、WT-1(64.7%,11/17)和Calretinin(29.4%,5/17);UPK3B在上皮样型和双相型DPM中的阳性率分别为59.1%(39/66)和66.7%(4/6),在肉瘤样型DPM中不表达(0/12)。在114例DPM中,BAP1和MTAP免疫组化缺失率分别为47.3%(53/112)和19.2%(20/104),p16基因FISH检测缺失率为31.5%(34/108),MTAP免疫组化与p16基因FISH检测状态一致性为81.0%(81/100),对p16基因FISH检测状态,MTAP免疫组化的特异度为95.5%(64/67),敏感度为51.5%(17/33)。此外,GATA3在肉瘤样型DPM中高表达(76.5%,13/17)。UPK3B在上皮样型DPM胸腔镜获得样本和经皮肺穿刺活检样本中的阳性率分别为59.2%(32/54)和36.7%(11/30),差异有统计学意义(P<0.05),WT-1在肉瘤样型DPM胸腔镜获得样本中的阳性率高于经皮肺穿刺活检样本(90.0%vs 28.6%,P=0.009)。结论Calretinin、D2-40和WT-1是DPM中阳性率较高的间皮标志物,可作为DPM诊断的一线标志物;UPK3B在上皮样型DPM中具有诊断意义;GATA3可作为肉瘤样型DPM诊断的补充标志物,MTAP免疫组化可作为p16基因FISH检测的补充替代标志物。 展开更多
关键词 弥漫性胸膜间皮瘤 CALRETININ D2-40 WT-1 UPK3B FISH
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成人伴IRF4重排的大B细胞淋巴瘤63例临床病理学特征及预后分析
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作者 张瑜琇 易红梅 +6 位作者 李安琪 李医民 欧阳斌燊 董磊 张蕾 许海敏 王朝夫 《临床与实验病理学杂志》 北大核心 2025年第2期171-178,共8页
目的探讨成人伴IRF4重排的大B细胞淋巴瘤(large B-cell lymphoma with IRF4 rearrangement,LBCL-IRF4r)的临床病理学特征及预后。方法收集63例成人LBCL-IRF4r的临床资料,采用免疫组化EnVision两步法检测相关蛋白表达,FISH技术检测IRF4、... 目的探讨成人伴IRF4重排的大B细胞淋巴瘤(large B-cell lymphoma with IRF4 rearrangement,LBCL-IRF4r)的临床病理学特征及预后。方法收集63例成人LBCL-IRF4r的临床资料,采用免疫组化EnVision两步法检测相关蛋白表达,FISH技术检测IRF4、BCL2、MYC、BCL6和TP53基因重排或缺失,分析临床病理特征与预后的关系。另收集132例成人非特指型弥漫大B细胞淋巴瘤(diffuse large B-cell lymphoma,DLBCL)预后数据进行对比分析。结果63例成人LBCL-IRF4r男女比为1.1∶1,中位年龄54.0岁(范围20~84岁),其中<40岁14例(22.2%)、40~60岁24例(38.1%)、>60岁25例(39.7%);Waldeyer环18例(28.6%)、颈部淋巴结8例(12.7%)、其他淋巴结和淋巴器官合计7例(11.1%)、胃13例(20.6%)、肠4例(6.4%)和其他结外部位合计13例(20.6%);63例均存在IRF4基因重排,无BCL2和MYC基因易位(0/58),30.9%(17/55)存在BCL6基因易位,16.3%(8/49)有TP53基因缺失。59例获得随访,中位随访28个月(范围1~65个月),完全缓解48例(81.4%),疾病进展或复发10例(16.9%),死亡3例(5.1%)。单因素分析显示,乳酸脱氢酶水平、Ann Arbor分期、国际预后指数(international prognostic index,IPI)评分、生长模式、Hans分型和双表达BCL2和C-MYC与患者无进展生存显著相关;年龄、Ann Arbor分期和IPI评分与总生存显著相关。多因素Cox回归分析显示,双表达BCL2和C-MYC是无进展生存的独立预后因素。成人LBCL-IRF4r的完全缓解率和无进展生存显著高于成人非特指型DLBCL。结论LBCL-IRF4r可发生于成人各年龄段,好发于Waldeyer环、颈部淋巴结和胃肠道,临床预后较好。 展开更多
关键词 淋巴瘤 伴IRF4重排的大B细胞淋巴瘤 弥漫大B细胞淋巴瘤 FISH
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伴BAP1突变的富于细胞性Neurothekeoma 1例
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作者 黄瑶 周露婷 王朝夫 《临床与实验病理学杂志》 北大核心 2025年第9期1259-1260,共2页
在临床诊断中,富于细胞性Neurothekeoma常因与丛状纤维组织细胞瘤等肿瘤存在相似性引发混淆,增加了准确诊断的难度。本例患者左肩部肿块形态欠规则,且CDFI未见明显血流信号,最终综合评估确诊为富于细胞性Neurothekeoma。本文根据患者临... 在临床诊断中,富于细胞性Neurothekeoma常因与丛状纤维组织细胞瘤等肿瘤存在相似性引发混淆,增加了准确诊断的难度。本例患者左肩部肿块形态欠规则,且CDFI未见明显血流信号,最终综合评估确诊为富于细胞性Neurothekeoma。本文根据患者临床表征、病理学检查以及免疫表型,并复习相关文献,旨在进一步深化对富于细胞性Neurothekeoma病变特性的理解,进而推动诊断水平的提升。 展开更多
关键词 NEUROTHEKEOMA BAP1 FISH 病例报道
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Fishing Effort Estimation of Trawlers Based on Vessel Monitoring System Data
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作者 LI Dan LU Feng +8 位作者 XU Shuo WANG Yu XUE Muhan NI Hanchen FANG Hui ZHANG Man MA Zhenhua CHEN Zuozhi XU Jian 《农业机械学报》 北大核心 2025年第2期523-532,共10页
Estimating trawler fishing effort plays a critical role in characterizing marine fisheries activities,quantifying the ecological impact of trawling,and refining regulatory frameworks and policies.Understanding trawler... Estimating trawler fishing effort plays a critical role in characterizing marine fisheries activities,quantifying the ecological impact of trawling,and refining regulatory frameworks and policies.Understanding trawler fishing inputs offers crucial scientific data to support the sustainable management of offshore fishery resources in China.An XGBoost algorithm was introduced and optimized through Harris Hawks Optimization(HHO),to develop a model for identifying trawler fishing behaviour.The model demonstrated exceptional performance,achieving accuracy,sensitivity,specificity,and the Matthews correlation coefficient of 0.9713,0.9806,0.9632,and 0.9425,respectively.Using this model to detect fishing activities,the fishing effort of trawlers from Shandong Province in the sea area between 119°E to 124°E and 32°N to 40°N in 2021 was quantified.A heatmap depicting fishing effort,generated with a spatial resolution of 1/8°,revealed that fishing activities were predominantly concentrated in two regions:121.1°E to 124°E,35.7°N to 38.7°N,and 119.8°E to 122.8°E,33.6°N to 35.4°N.This research can provide a foundation for quantitative evaluations of fishery resources,which can offer vital data to promote the sustainable development of marine capture fisheries. 展开更多
关键词 TRAWLER vessel position data machine learning fishing effort
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Current status and diversity of fish resources in the Pinglu Canal Century Project
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作者 LU Jia TANG Wei +3 位作者 WANG Li XU Shengxian ZHANG Peng YANG Shengfa 《水利水电技术(中英文)》 北大核心 2025年第4期131-144,共14页
[Objective]The channel straightening project of the Pinglu Canal has fragmented the river course,compromising the integrity of original river course and causing ecosystem patchiness.Understanding the current status of... [Objective]The channel straightening project of the Pinglu Canal has fragmented the river course,compromising the integrity of original river course and causing ecosystem patchiness.Understanding the current status of fish resources and the characteristics of their diversity is crucial for the ecological management of the Pinglu Canal.[Methods]During the spring and autumn in 2021 and 2022,a survey of fish resources and species diversity in the Pinglu Canal was conducted using multi-mesh gill nets.A total of 125 fish species were collected,belonging to 10 orders,34 families,and 89 genera.[Results]The result showed that the Pinglu Canal contained three nationally protected Class II species,two endemic species of the Qinjiang River,three anadromous/migratory species,and eight invasive species,accounting for 2.4%,1.6%,2.4%,and 6.4%of the total species,respectively.The fish community primarily consisted of mid-and bottom-dwelling,adhesive-egg-laying,and omnivorous species.The Shannon-Wiener,Simpson,Margalef,and Pielou indices of the fish community in the Pinglu Canal ranged from 2.347 to 2.757,0.081 to 0.151,3.493 to 4.382,and 0.812 to 0.892,respectively.These indices showed relatively uniform distribution across different river reaches.[Conclusion]The result indicate that the fish community structure in the Pinglu Canal is relatively uniform.The reach from the Yujiang River to the Shaping River shows higher stability,while other river reaches experience moderate or severe disturbances.This study provides supplementary baseline data on the fish community structure in the Pinglu Canal and explores the potential impact of inter-basin connectivity on fish resources,aiming to provide a scientific basis for habitat restoration assessments after the channel straightening project. 展开更多
关键词 Pinglu Canal Project inter-basin connectivity fish resources community structure BIODIVERSITY influencing factors
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GLI1基因改变的间叶性肿瘤1例
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作者 刘四春 朱娜娜 胡怀远 《临床与实验病理学杂志》 北大核心 2025年第9期1252-1253,共2页
GLI1基因改变的间叶性肿瘤是一种罕见的具有独特基因改变的软组织肿瘤,其明确诊断需分子检测支持。本例右下肢皮下软组织肿块1年渐增大就诊,最初其形态学及多项免疫组化标记均无法明确肿瘤起源及类型,最终依靠分子检测明确诊断,本文总... GLI1基因改变的间叶性肿瘤是一种罕见的具有独特基因改变的软组织肿瘤,其明确诊断需分子检测支持。本例右下肢皮下软组织肿块1年渐增大就诊,最初其形态学及多项免疫组化标记均无法明确肿瘤起源及类型,最终依靠分子检测明确诊断,本文总结其临床病理特点,结合国内外文献报道,加深对该肿瘤的认识,提高诊断水平。 展开更多
关键词 间叶性肿瘤 GLI1基因 免疫组织化学 FISH 病例报道
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miRNA表达水平检测技术研究进展
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作者 周兆瑞 徐梦思 甘尚权 《现代畜牧科技》 2025年第2期127-131,共5页
miRNA(microRNA)是一类由为21~23个核苷酸组成的小型非编码RNA分子,它们主要通过靶mRNA序列中3′非编码区(3′UTR)相互结合,进而调控靶基因的表达,一般通过抑制的方式影响靶基因的翻译。目前,miRNA已被证实在机体的各种生命活动过程中... miRNA(microRNA)是一类由为21~23个核苷酸组成的小型非编码RNA分子,它们主要通过靶mRNA序列中3′非编码区(3′UTR)相互结合,进而调控靶基因的表达,一般通过抑制的方式影响靶基因的翻译。目前,miRNA已被证实在机体的各种生命活动过程中发挥了关键的调控作用。因此,研发具有高特异性和高灵敏度的miRNA检测技术尤为重要。该文将围绕Northern blot(Northern印记)、实时荧光定量PCR(qRT-PCR)、荧光原位杂交(FISH)、miRNA测序法进行综述。 展开更多
关键词 miRNA检测 Northern blot QRT-PCR FISH miRNA测序法
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High-Precision Fish Pose Estimation Method Based on Improved HRNet
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作者 PENG Qiujun LI Weiran +1 位作者 LIU Yeqiang LI Zhenbo 《智慧农业(中英文)》 2025年第3期160-172,共13页
[Objective]Fish pose estimation(FPE)provides fish physiological information,facilitating health monitoring in aquaculture.It aids decision-making in areas such as fish behavior recognition.When fish are injured or def... [Objective]Fish pose estimation(FPE)provides fish physiological information,facilitating health monitoring in aquaculture.It aids decision-making in areas such as fish behavior recognition.When fish are injured or deficient,they often display abnormal behaviors and noticeable changes in the positioning of their body parts.Moreover,the unpredictable posture and orientation of fish during swimming,combined with the rapid swimming speed of fish,restrict the current scope of research in FPE.In this research,a FPE model named HPFPE is presented to capture the swimming posture of fish and accurately detect their key points.[Methods]On the one hand,this model incorporated the CBAM module into the HRNet framework.The attention module enhanced accuracy without adding computational complexity,while effectively capturing a broader range of contextual information.On the other hand,the model incorporated dilated convolution to increase the receptive field,allowing it to capture more spatial context.[Results and Discussions]Experiments showed that compared with the baseline method,the average precision(AP)of HPFPE based on different backbones and input sizes on the oplegnathus punctatus datasets had increased by 0.62,1.35,1.76,and 1.28 percent point,respectively,while the average recall(AR)had also increased by 0.85,1.50,1.40,and 1.00,respectively.Additionally,HPFPE outperformed other mainstream methods,including DeepPose,CPM,SCNet,and Lite-HRNet.Furthermore,when compared to other methods using the ornamental fish data,HPFPE achieved the highest AP and AR values of 52.96%,and 59.50%,respectively.[Conclusions]The proposed HPFPE can accurately estimate fish posture and assess their swimming patterns,serving as a valuable reference for applications such as fish behavior recognition. 展开更多
关键词 AQUACULTURE computer vision fish pose estimation key point attention mechanism
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基于FISH和GISH技术的芝麻栽培种和野生种染色体组特征比较分析 被引量:1
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作者 马琴 赵瑞红 +5 位作者 琚铭 陈成彬 段迎辉 杨伟飞 苗红梅 张海洋 《河南农业科学》 北大核心 2024年第10期48-53,共6页
为揭示胡麻属物种进化特征,探究胡麻属基因组结构演变及物种进化,促进野生资源的开发利用,以芝麻栽培种豫芝11号和2n=26类型野生种S.alatum 3651为试验材料,采用荧光原位杂交(FISH)和基因组荧光原位杂交(GISH)技术对芝麻栽培种和野生种... 为揭示胡麻属物种进化特征,探究胡麻属基因组结构演变及物种进化,促进野生资源的开发利用,以芝麻栽培种豫芝11号和2n=26类型野生种S.alatum 3651为试验材料,采用荧光原位杂交(FISH)和基因组荧光原位杂交(GISH)技术对芝麻栽培种和野生种染色体组特征进行分析。结果表明,芝麻栽培种和野生种均为2n=2x=26类型;rDNA-FISH杂交结果显示,栽培种的13对染色体中,3对染色体(第7、8、9对染色体)的短臂端部携带45S rDNA特异信号,显示为随体特异染色体;2对染色体(第5、11对染色体)的短臂携带5S rDNA特异信号,5S rDNA与45S rDNA信号位于不同染色体上。野生种的13对染色体中,有2对染色体(第4、7对染色体)携带45S rDNA杂交信号,1对染色体(第4对染色体)携带5S rDNA特异信号,5S rDNA与45S rDNA信号位于同一染色体不同位置,表明栽培种与野生种的染色体组特征差异较大。GISH杂交结果显示,分别以栽培种和野生种的基因组DNA作探针与自身染色体杂交,每条染色体上携带不同强弱的杂交信号,而与对方染色体杂交,均表现出极少的杂交信号。芝麻栽培种和野生种具有相同的染色体数目,但染色体rDNA数量、分布及其GISH信号均存在明显差异,说明栽培种和野生种亲缘关系较远。 展开更多
关键词 芝麻 栽培种 野生种S.alatum 染色体组 rDNA 荧光原位杂交(FISH) 基因组荧光原位杂交(GISH)
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尿脱落细胞FISH单染色体拷贝大量异常分析
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作者 汤永飞 何惠华 +3 位作者 阎红琳 刘琳 袁静萍 钱红 《临床与实验病理学杂志》 CAS 北大核心 2024年第4期436-438,441,共4页
目的探讨尿脱落细胞FISH单染色体拷贝大量异常病例的FISH检测结果特点与最终活检病理结果的相关性,进一步完善FISH阳性诊断标准。方法收集847例行尿脱落细胞FISH检测,选择其中不符合阳性标准、但存在大量单染色体拷贝的5例作为研究对象... 目的探讨尿脱落细胞FISH单染色体拷贝大量异常病例的FISH检测结果特点与最终活检病理结果的相关性,进一步完善FISH阳性诊断标准。方法收集847例行尿脱落细胞FISH检测,选择其中不符合阳性标准、但存在大量单染色体拷贝的5例作为研究对象,分析它们的临床特征、FISH检测结果特点、脱落细胞学特征和活检组织病理学检测结果。结果观察相应区域100个核异质上皮细胞,例1显示3号染色体3倍体扩增,异常细胞数32个;例2显示17号染色体3倍体扩增,异常细胞数48个;例3显示17号染色体5倍体扩增,异常细胞数56个;例4显示17号染色体单倍体,异常细胞数67个;例5显示p16基因杂合子缺失,异常细胞数61个,其它染色体均无异常。5例活检病理结果均为低级别或高级别乳头状尿路上皮癌。结论在临床实践中,尿脱落细胞FISH单染色体拷贝大量异常的病例应引起重视,将其归入可疑阳性比较合适,从而能提高尿FISH检测的敏感性,使患者获益。 展开更多
关键词 尿路上皮癌 尿脱落细胞 FISH
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多基因组合FISH检测技术在黑色素瘤诊断中的应用价值及质控要点分析
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作者 范晓杰 贾迎 刘月平 《临床与实验病理学杂志》 CAS 北大核心 2024年第10期1088-1091,共4页
目的探讨FISH技术在黑色素瘤诊断中的应用价值及质控要点。方法应用黑色素瘤多基因组合FISH检测试剂盒,对109例色素样本中的6个基因位点(MYB、RREB1、PTEN、MYC、CDKN2A和CCND1)进行检测,分析FISH检测阳性病例的临床病理特征。结果黑色... 目的探讨FISH技术在黑色素瘤诊断中的应用价值及质控要点。方法应用黑色素瘤多基因组合FISH检测试剂盒,对109例色素样本中的6个基因位点(MYB、RREB1、PTEN、MYC、CDKN2A和CCND1)进行检测,分析FISH检测阳性病例的临床病理特征。结果黑色素瘤中的6个基因位点FISH阳性率均显著高于良性黑色素细胞痣(P<0.05)。88例黑色素瘤多基因组合FISH检测结果与各项临床病理特征相关性分析结果显示,不同黑色素瘤组织类型病例中同时3个及以上探针(≥3个探针)FISH阳性比例差异有统计学意义,其中结节型最高(100%),肢端雀斑样次之(96.43%),表浅播散型较低(82.35%)。Breslow厚度>2.0 mm病例中≥3个探针FISH阳性比率显著高于Breslow厚度≤2.0 mm病例。黑色素瘤样本的FISH质控关键点是组织固定:黑色素瘤组织FISH备片2.5~3μm厚为宜;若色素影响严重,可做单种绿色信号判读加其他检测方式辅助诊断。结论FISH检测6个基因位点对黑色素瘤辅助诊断具有重要价值;应严格进行黑色素瘤样本FISH技术的质量控制。 展开更多
关键词 黑色素瘤 FISH 多基因组合 质量控制 辅助诊断
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胡桃楸高质量中期染色体制片及rDNA的物理定位 被引量:1
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作者 倪润欣 宁仪杭 +3 位作者 王子玥 刘光欣 甄艳 席梦利 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2024年第10期50-55,共6页
【目的】以胡桃楸雄花序为材料,建立染色体形态良好、染色体分散且无细胞质背景的胡桃楸高质量染色体制片技术,为深入开展胡桃楸分子细胞遗传学研究提供参考。【方法】通过卡宝品红压片观察花药发育进程,采集花药细胞处于分裂旺盛阶段... 【目的】以胡桃楸雄花序为材料,建立染色体形态良好、染色体分散且无细胞质背景的胡桃楸高质量染色体制片技术,为深入开展胡桃楸分子细胞遗传学研究提供参考。【方法】通过卡宝品红压片观察花药发育进程,采集花药细胞处于分裂旺盛阶段的雄花序,分别采用1 MPa一氧化二氮(N2O,笑气)、0.7 mmol·L^(-1)环己酰胺、2 mmol·L^(-1)8-羟基喹啉对花序进行不同时间预处理。剥开花序取出花药,酶解后制成悬液,在55℃的烤片机上涂片。以45S rDNA和5S rDNA为探针,对中期染色体进行原位杂交。【结果】1)当雄花序颜色鲜绿、长度达到约1.5 cm、花药顶端变为红色时,花药细胞分裂旺盛,可以观察到大量小孢子母细胞和中期分裂相。因此,为了获得丰富的有丝分裂中期分裂相,取材最佳时机是雄花序中上部的花药顶端变红时,可以保证雄花序中大部分花药处于旺盛分裂期。2)2 mmol·L^(-1)8-羟基喹啉预处理4、6、8 h的染色体都均凝缩不充分,边缘不清晰,拖尾明显,且大部分着丝粒无法辨认;0.7 mmol·L^(-1)环己酰胺预处理4 h的染色体较长,凝缩不充分,拖尾严重,预处理6 h的染色体凝缩适当,形态清晰,大部分着丝粒可以辨认,预处理8 h的染色体边缘清晰,但凝缩过度,着丝粒不明显;1 MPa N2O预处理2 h的染色体长度适中,但凝缩不充分,边缘模糊,处理3、4 h的染色体凝缩程度都较高,染色体较为粗短,染色体间形态差异不明显;此外,N2O预处理4 h的染色体中,有部分会出现粘连拉丝的情况。因此,胡桃楸雄花序最合适的预处理条件为0.7 mmol·L^(-1)环己酰胺处理6 h。3)胡桃楸染色体数为32,染色体基数为16(2n=2x=32)。45S rDNA和5S rDNA探针在胡桃楸染色体上均产生明亮的FISH信号。45S rDNA的杂交信号位于1对中着丝粒染色体的着丝粒附近,2条染色体上的信号强度相近;5S rDNA的杂交信号位于另外1对中着丝粒染色体的着丝粒附近,2条染色体上的信号强度一强一弱。【结论】以胡桃楸花药顶端变红的雄花序为材料,成功建立胡桃楸高质量中期染色体制备及FISH技术体系,为核桃属植物的分子细胞遗传学研究奠定基础,也为花药量大的植物获取高质量染色体制片提供了参考。 展开更多
关键词 胡桃楸 雄花序 染色体制片 荧光原位杂交(FISH)
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伴ETV6-NTRK基因融合的肺非典型类癌1例并文献复习
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作者 郭亚骢 王龙飞 +3 位作者 魏晓莹 王铭 樊翔 张丽华 《临床与实验病理学杂志》 CAS 北大核心 2024年第6期656-658,662,共4页
目的探讨伴ETV6-NTRK基因融合的肺非典型类癌的临床病理学特征。方法回顾性分析1例肺非典型类癌的临床病理学特征,行支气管镜活检,采用免疫组化EnVision法检测蛋白表达,FISH、DNA和RNA二代测序法检测分子学改变,并复习相关文献。结果患... 目的探讨伴ETV6-NTRK基因融合的肺非典型类癌的临床病理学特征。方法回顾性分析1例肺非典型类癌的临床病理学特征,行支气管镜活检,采用免疫组化EnVision法检测蛋白表达,FISH、DNA和RNA二代测序法检测分子学改变,并复习相关文献。结果患者男性,49岁,影像学检查发现左下肺门占位伴肺门和纵隔淋巴结肿大,左侧肋骨病理性骨折。免疫表型:肿瘤细胞pan-TRK、CKpan、Syn、CgA、TTF-1和CK7均(+),SSTR2(个别+),CD56(+/-),Napsin A和p40均(-),Ki67增殖指数约15%;FISH检测ETV6基因和NTRK基因断裂重组;DNA二代测序检测发现IGR(UPSTREAM MCTP2)-ETV6融合,RNA二代测序检测到ETV6-NTRK3融合。NTRK靶向药物治疗后肿瘤明显缩小。结论NTRK基因融合可见于肺神经内分泌肿瘤;晚期肿瘤常规行NTRK免疫组化标记,可筛选NTRK基因改变靶向药物治疗获益的患者。 展开更多
关键词 肺肿瘤 非典型类癌 pan-TRK ETV6-NTRK3 二代测序 FISH 免疫组织化学
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滑膜肉瘤中TRPS1的表达及意义
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作者 杨倩倩 郭凌川 +3 位作者 庞培 杨红丽 孙晓静 刘文婷 《临床与实验病理学杂志》 CAS 北大核心 2024年第8期839-844,共6页
目的 探讨TRPS1在滑膜肉瘤中的表达及意义。方法 收集21例经SS18(18q11)(SYT) FISH检测或SS18-SSX免疫组化检测诊断的滑膜肉瘤。采用免疫组化EnVision两步法检测TRPS1的表达,并复习相关文献。结果 21例滑膜肉瘤中,男性12例,女性9例,年龄... 目的 探讨TRPS1在滑膜肉瘤中的表达及意义。方法 收集21例经SS18(18q11)(SYT) FISH检测或SS18-SSX免疫组化检测诊断的滑膜肉瘤。采用免疫组化EnVision两步法检测TRPS1的表达,并复习相关文献。结果 21例滑膜肉瘤中,男性12例,女性9例,年龄17~79岁,中位年龄50岁,平均47.1岁。发病部位:肺、腿、肾各3例,足、腰大肌各2例,直肠、胸腔、踝管、腹股沟区、膝、手掌、鼻腔、前臂各1例。肿瘤最大径1.2~13 cm。眼观:肿瘤切面灰白、灰黄色,实性,伴出血、局灶暗红。镜检:单相纤维型滑膜肉瘤(16/21,76.2%),差分化型滑膜肉瘤(小细胞型)(3/21,14.3%),双相型滑膜肉瘤(2/21,9.5%)。免疫表型:瘤细胞均表达SS18-SSX(18/18,100%)、TLE1(12/12,100%)、BCL2(18/18,100%),部分表达EMA(10/16,62.5%)、CK(12/18,66.7%)、CD99(4/10,40.0%)、SMA(3/16,18.6%)、S-100(3/19,15.8%),desmin均阴性,Ki67增殖指数3%~80%,平均39.9%。FISH检测:11例均为SS18(18q11)分裂阳性。21例滑膜肉瘤均不同程度及强度地表达TRPS1(21/21,100%),其中阳性范围>50%的19例(19/21,90.5%),阳性强度2+及以上19例(19/21,90.5%)。21例患者均经手术切除肿物,20例获得随访,3例术后联合放疗和化疗,18例术后行化疗,7例出现不同程度的复发或转移,9例死亡,病死率45%(9/20)。结论 TRPS1虽然被视为高度敏感和特异的乳腺起源标志物,但在滑膜肉瘤中呈高表达,需警惕其在病理诊断中的陷阱。 展开更多
关键词 滑膜肉瘤 TRPS1 SYT FISH 免疫组织化学
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小麦大、小粒材料的细胞学鉴定及其粒重相关基因表达研究
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作者 徐晓艺 汪晓璐 +3 位作者 韩冉 马朋涛 徐文竞 刘成 《山东农业科学》 北大核心 2024年第8期10-15,36,共7页
籽粒大小是影响小麦产量的重要农艺性状,开展控制籽粒大小相关基因的筛选鉴定和表达研究对小麦高产育种具有借鉴意义。本研究利用染色体计数和荧光原位杂交(FISH)的方法对15份大粒材料(千粒重高于50 g)和15份小粒材料(千粒重低于21 g)... 籽粒大小是影响小麦产量的重要农艺性状,开展控制籽粒大小相关基因的筛选鉴定和表达研究对小麦高产育种具有借鉴意义。本研究利用染色体计数和荧光原位杂交(FISH)的方法对15份大粒材料(千粒重高于50 g)和15份小粒材料(千粒重低于21 g)进行鉴定,结果显示,京5044、京5085、藏1783、黑72-0484、LJ15鉴010共5份大粒材料的染色体条数为28,为四倍体小麦;其余材料染色体条数均为42,为六倍体小麦。选取六倍体的大粒和小粒材料各3份作为试验材料,用水稻和拟南芥的64个粒重相关基因在小麦基因组中筛选同源基因,对其进行qRT-PCR分析,选出6个在大、小粒材料中表达量存在显著差异的基因进行对比分析。结果表明,基因RiGSK2、RiGW8和RiGGC2在大粒材料HR2015-1-1-2-9中表达量较高,RiGS3和RiD11在小粒材料红秃头3中表达量较高,ArTTG2在3份小粒材料中表达量均较高,推测这6个基因可能是控制小麦粒重的关键基因,在后续研究中将进一步验证它们对小麦产量的贡献。 展开更多
关键词 小麦 籽粒大小 荧光原位杂交(FISH) 粒重相关基因 表达分析
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