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禽腺病毒8a型贵州株的Fiber蛋白遗传进化分析及其结构预测
1
作者
韦国雪
赵超
+6 位作者
韩帅博
王乃秀
杨婷
王立坤
余锐
彭进
程振涛
《贵州畜牧兽医》
2025年第3期14-17,共4页
为了解禽腺病毒8a型(FAdV-8a)贵州株的纤突蛋白(Fiber)遗传进化情况及其结构特点,对前期构建的FAdV-8a贵州株Fiber蛋白pMD19-T-FAdV-8a-Fiber阳性重组质粒进行测序,应用DNAstar软件对Fiber蛋白进行氨基酸顺序分析并构建遗传进化树;分别...
为了解禽腺病毒8a型(FAdV-8a)贵州株的纤突蛋白(Fiber)遗传进化情况及其结构特点,对前期构建的FAdV-8a贵州株Fiber蛋白pMD19-T-FAdV-8a-Fiber阳性重组质粒进行测序,应用DNAstar软件对Fiber蛋白进行氨基酸顺序分析并构建遗传进化树;分别利用在线软件ExPasy-ProtParam分析Fiber蛋白的理化性质,ExPasy-Protscale分析亲疏水性,TMHMM分析蛋白跨膜结构域,SOPMA2.0预测蛋白的二级结构,SWISS MODEL预测蛋白的三级结构,通过PyMOL Viewer 3.1输出预测的三级结构图。结果:FAdV-8a贵州株与FAdV-8b广东株的Fiber蛋白同源性最高且亲缘关系最近;FAdV-8a贵州株Fiber蛋白为疏水性蛋白,属于不稳定蛋白,不存在跨膜区;含有2种二级结构,其中延伸链共174个(占比33.33%),无规则卷曲348个(占比57.41%);三级结构模式图与其二级结构预测结果大致相同。
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关键词
禽腺病毒
fadv-8a
Fiber蛋白
遗传进化
蛋白质结构
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职称材料
题名
禽腺病毒8a型贵州株的Fiber蛋白遗传进化分析及其结构预测
1
作者
韦国雪
赵超
韩帅博
王乃秀
杨婷
王立坤
余锐
彭进
程振涛
机构
贵州大学动物科学学院
贵州省动物疫病与兽医公共卫生重点实验室
出处
《贵州畜牧兽医》
2025年第3期14-17,共4页
基金
“禽腺病毒8a型贵州株的分离与鉴定”大学生创新创业训练项目(gzusc2023025号)
“动物病原分子特征与致病机制研究”贵州省科技支撑计划项目(黔科合平台人才[2021]5646号)
“安卡拉病毒贵州株生物学特性与致病机理研究”贵州省科技支撑计划项目(黔科合基础[2020]1Y409)。
文摘
为了解禽腺病毒8a型(FAdV-8a)贵州株的纤突蛋白(Fiber)遗传进化情况及其结构特点,对前期构建的FAdV-8a贵州株Fiber蛋白pMD19-T-FAdV-8a-Fiber阳性重组质粒进行测序,应用DNAstar软件对Fiber蛋白进行氨基酸顺序分析并构建遗传进化树;分别利用在线软件ExPasy-ProtParam分析Fiber蛋白的理化性质,ExPasy-Protscale分析亲疏水性,TMHMM分析蛋白跨膜结构域,SOPMA2.0预测蛋白的二级结构,SWISS MODEL预测蛋白的三级结构,通过PyMOL Viewer 3.1输出预测的三级结构图。结果:FAdV-8a贵州株与FAdV-8b广东株的Fiber蛋白同源性最高且亲缘关系最近;FAdV-8a贵州株Fiber蛋白为疏水性蛋白,属于不稳定蛋白,不存在跨膜区;含有2种二级结构,其中延伸链共174个(占比33.33%),无规则卷曲348个(占比57.41%);三级结构模式图与其二级结构预测结果大致相同。
关键词
禽腺病毒
fadv-8a
Fiber蛋白
遗传进化
蛋白质结构
分类号
S852.659.1 [农业科学—基础兽医学]
Q75 [生物学—分子生物学]
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作者
出处
发文年
被引量
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1
禽腺病毒8a型贵州株的Fiber蛋白遗传进化分析及其结构预测
韦国雪
赵超
韩帅博
王乃秀
杨婷
王立坤
余锐
彭进
程振涛
《贵州畜牧兽医》
2025
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