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金银花EIN3/EIL基因家族的全基因组鉴定及LjEIL3在干旱胁迫下的功能分析
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作者 徐容 李金龙 +1 位作者 陈双成 赵丹雳 《河南农业科学》 北大核心 2025年第10期81-90,共10页
基于金银花基因组数据,利用生物信息学对金银花EIN3/EIL基因家族成员进行了鉴定,并对其理化性质、基因结构、基因表达模式、逆境胁迫响应等进行了系统分析。结果表明,在金银花全基因组水平鉴定到5个LjEIL家族成员,编码592~682个氨基酸,... 基于金银花基因组数据,利用生物信息学对金银花EIN3/EIL基因家族成员进行了鉴定,并对其理化性质、基因结构、基因表达模式、逆境胁迫响应等进行了系统分析。结果表明,在金银花全基因组水平鉴定到5个LjEIL家族成员,编码592~682个氨基酸,均为酸性亲水核蛋白。染色体定位结果显示,LjEIL基因分布于4条染色体,通过系统发育分析将其划分为ClassⅠ和ClassⅢ2个亚族。基因结构分析结果表明,LjEIL基因均含有典型的EIN3结构域,且外显子-内含子组成较为简单。LjEIL基因启动子区域预测出61个顺式作用元件,以光响应元件为主,并富含茉莉酸甲酯、赤霉素、厌氧诱导、低温响应等元件。转录组数据分析结果显示,LjEIL基因具有典型的组织与发育阶段特异性表达模式,其中LjEIL3在成熟叶、茎尖及幼芽期表达量最高。qRT-PCR结果表明,干旱胁迫均能诱导LjEIL基因表达,其中LjEIL3上调幅度最大,且随干旱胁迫时间的延长表达量持续升高。此外,转LjEIL3基因拟南芥在20%聚乙二醇6000模拟干旱处理10 d后存活率显著高于野生型,进一步证实了LjEIL3基因在干旱胁迫中发挥正向调控的作用。综上,LjEIL3基因具有调控植物响应干旱胁迫的功能,可为金银花抗逆分子育种提供重要的基因资源。 展开更多
关键词 金银花 ein3/eil基因家族 表达模式 干旱胁迫
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棉花EIN3/EIL家族基因序列分析及GhEIL3基因克隆 被引量:6
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作者 张析 李潇玲 +2 位作者 郭文婷 张鹏飞 张薇 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第3期445-452,共8页
该研究以拟南芥AtEIN3基因为探针,从陆地棉TM-1全基因组测序数据库中筛选其同源序列,序列分析得到16条具有EIN3结构域的基因序列。对陆地棉EIN3/EIL家族基因的基因结构、系统进化、序列相似性及结构域分布情况进行分析,发现它们与拟南芥... 该研究以拟南芥AtEIN3基因为探针,从陆地棉TM-1全基因组测序数据库中筛选其同源序列,序列分析得到16条具有EIN3结构域的基因序列。对陆地棉EIN3/EIL家族基因的基因结构、系统进化、序列相似性及结构域分布情况进行分析,发现它们与拟南芥EIN3/EIL家族基因在N端具有较高相似度,其中15条基因序列包含5个保守结构,1条包含4个保守结构。在此基础上,采用RT-PCR方法从抗枯萎病的陆地棉品种‘中棉所12’中克隆得到一个新的EIN3/EIL家族基因,命名为GhEIL3(GenBank登录号为KY072936)。序列分析表明:GhEIL3基因开放阅读框长1 092bp,编码363个氨基酸,含有一个EIN3结构域。实时荧光定量PCR(qRT-PCR)结果显示,GhEIL3基因在枯萎病菌诱导后呈上调表达,诱导后1h其相对表达量达到最大值,推测GhEIL3基因可能参与棉花对枯萎病菌的防御反应。 展开更多
关键词 棉花 ein3/eil 枯萎病 基因克隆 Gheil3
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凤丹白牡丹EIN3/EIL家族基因的克隆与表达分析
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作者 韩波 徐玲霞 +1 位作者 曹小迎 张光琴 《河南农业科学》 北大核心 2022年第3期112-117,共6页
乙烯调节植物非生物应激反应和耐受性,而EIN3/EIL家族基因是乙烯通路中的关键基因。参考牡丹3个EIL基因设计引物,获得3个凤丹白牡丹的EIN3/EIL基因,分别命名为PoEIL1、PoEIL2、PoEIL3(GenBank登录号为MZ648327—MZ648329)。序列分析表明... 乙烯调节植物非生物应激反应和耐受性,而EIN3/EIL家族基因是乙烯通路中的关键基因。参考牡丹3个EIL基因设计引物,获得3个凤丹白牡丹的EIN3/EIL基因,分别命名为PoEIL1、PoEIL2、PoEIL3(GenBank登录号为MZ648327—MZ648329)。序列分析表明,它们与拟南芥EIN3/EIL家族基因具有较高相似度,其中PoEIL1与拟南芥的AtEIL3聚为一支,PoEIL2和PoEIL3与AtEIN3和AtEIL1聚在一起。保守基序(Motif)分析结果显示,每条序列至少存在5个相同位置的保守基序。实时荧光定量PCR(qRTPCR)结果表明,3个基因在各组织中均有表达,但表达量各异。3个基因在不同花期花瓣中的表达特性也不一致,PoEIL1随着花的盛开表达量增加,推测PoEIL1与花的发育有关,可以通过调控PoEIL1的表达来调控花期。 展开更多
关键词 牡丹 凤丹白 ein3/eil 基因克隆 表达分析
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葡萄EIN3/EIL转录因子家族成员鉴定及表达特征分析 被引量:4
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作者 乃国洁 卢世雄 +3 位作者 马维峰 李艳梅 陈佰鸿 毛娟 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第6期856-870,共15页
【目的】探究葡萄EIN3/EIL家族的进化特性及其在逆境胁迫及不同激素处理下的表达模式。【方法】通过Blast比对鉴定EIN3/EIL转录因子家族成员,对该家族进行生物信息学分析,利用qRT-PCR分析该转录因子家族成员在不同激素及逆境胁迫下的表... 【目的】探究葡萄EIN3/EIL家族的进化特性及其在逆境胁迫及不同激素处理下的表达模式。【方法】通过Blast比对鉴定EIN3/EIL转录因子家族成员,对该家族进行生物信息学分析,利用qRT-PCR分析该转录因子家族成员在不同激素及逆境胁迫下的表达情况。【结果】EIN3/EIL家族主要分布在6号染色体上,定位在细胞核中,蛋白质二级结构以α-螺旋和不规则卷曲为主。对顺式作用元件分析发现,EIL基因的启动子序列中包含许多激素应答、胁迫响应、植物防御及与植物生长相关的元件。组织芯片数据显示,不同组织中EILs基因的表达量由低到高依次为根、叶、茎且VvEIL2基因在所有组织中高表达。qRT-PCR分析表明,逆境胁迫下,VvEILs基因在NaCl诱导下的表达量较高且根系中VvEIL1基因的表达量最高,是对照的18倍;激素处理下,EILs基因均被不同程度地诱导表达,且在250 mg·L^(-1)乙烯利处理下,VvEIL6基因的表达量极显著高于对照,是对照的93倍;随着处理浓度的增加,乙烯利诱导下VvEIL2和VvEIL5基因下调表达,乙烯抑制剂处理下上调表达。【结论】葡萄EIN3/EIL基因家族在非生物逆境胁迫应答过程中具有重要作用,VvEIL2和VvEIL5在乙烯信号通路中可能是负调控因子。 展开更多
关键词 葡萄 ein3/eil转录因子家族 胁迫诱导 QRT-PCR
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