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RNA二级结构预测的支持向量机模型研究 被引量:2
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作者 何静媛 何中市 邹东升 《计算机科学》 CSCD 北大核心 2008年第4期181-183,共3页
RNA二级结构预测问题是生物信息学的一个研究重点,本文主要利用支持向量机(SVM)模型来研究RNA二级结构预测问题。通过改进NSSEL标签[4],形成了能表示平面伪结结构的E-NSSEL标签,该标签作为SVM模型输出端的类别标识,因此,测试序列经过SV... RNA二级结构预测问题是生物信息学的一个研究重点,本文主要利用支持向量机(SVM)模型来研究RNA二级结构预测问题。通过改进NSSEL标签[4],形成了能表示平面伪结结构的E-NSSEL标签,该标签作为SVM模型输出端的类别标识,因此,测试序列经过SVM模型预测后得到相应的E-NSSEL序列,该序列可以恢复为二级结构。此算法能有效地解决传统算法中存在的时间复杂性的问题和长链分子的预测问题。 展开更多
关键词 SVM e-nssel标签 RNA二级结构 平面伪结
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含伪结的RNA分子二级结构预测
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作者 张洪礼 张娜 +1 位作者 刘文远 王常武 《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2011年第8期219-222,共4页
预测含伪结的RNA分子二级结构是生物信息学的一个研究难点。利用多分类支持向量机结合贝叶斯神经网络针对含伪结的RNA分子二级结构进行预测。利用多分类支持向量机进行预测,输出端得到相应碱基的平面伪结结构的E-NSSEL(Ex-tend New Seco... 预测含伪结的RNA分子二级结构是生物信息学的一个研究难点。利用多分类支持向量机结合贝叶斯神经网络针对含伪结的RNA分子二级结构进行预测。利用多分类支持向量机进行预测,输出端得到相应碱基的平面伪结结构的E-NSSEL(Ex-tend New Secondary Structure Element Label)类别标签。使用碱基已预测的结果通过贝叶斯神经网络进行修正,并恢复RNA分子二级结构。使用该方法能有效地改善含伪结的RNA分子二级结构的预测效果。 展开更多
关键词 多分类支持向量机 贝叶斯神经网络 RNA二级结构 e-nssel标签 平面伪结
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