微孢子虫(microsporidia)是一类细胞内专性寄生的单细胞真核生物,虽然分子生物学的研究证据表明其与真菌(fun-gi)存在亲缘关系,但这些证据均是基于单个或少数几个基因构建系统进化树而得出的。利用家蚕微孢子虫全基因组数据,采用基于基...微孢子虫(microsporidia)是一类细胞内专性寄生的单细胞真核生物,虽然分子生物学的研究证据表明其与真菌(fun-gi)存在亲缘关系,但这些证据均是基于单个或少数几个基因构建系统进化树而得出的。利用家蚕微孢子虫全基因组数据,采用基于基因同源性的Darkhorse基因组统计方法,鉴定家蚕微孢子虫基因组中每个基因的来源谱系,并通过全基因组谱系可能性指数(lineage probability index,LPI)分析微孢子虫与其他物种的亲缘关系。结果表明家蚕微孢子虫与其他微孢子虫的LPI加权平均值为0.93,具有最近的亲缘关系,与真菌界的LPI加权平均值为0.65,与原生生物界的LPI加权平均值为0.38。由此证明微孢子虫与真菌存在着更近的亲缘关系,微孢子虫门属于真菌界而非原生生物界。展开更多
通过在基因组水平上对成千上万的单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism,SNP）进行系统性检测和分析,全基因组关联性研究（genome-wide association study,GWAS）发现了一系列与人类复杂性状和疾病（比如,身高、恶性肿瘤、糖...通过在基因组水平上对成千上万的单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism,SNP）进行系统性检测和分析,全基因组关联性研究（genome-wide association study,GWAS）发现了一系列与人类复杂性状和疾病（比如,身高、恶性肿瘤、糖尿病和高血压）相关的常见遗传变异位点[1-3]。展开更多
文摘微孢子虫(microsporidia)是一类细胞内专性寄生的单细胞真核生物,虽然分子生物学的研究证据表明其与真菌(fun-gi)存在亲缘关系,但这些证据均是基于单个或少数几个基因构建系统进化树而得出的。利用家蚕微孢子虫全基因组数据,采用基于基因同源性的Darkhorse基因组统计方法,鉴定家蚕微孢子虫基因组中每个基因的来源谱系,并通过全基因组谱系可能性指数(lineage probability index,LPI)分析微孢子虫与其他物种的亲缘关系。结果表明家蚕微孢子虫与其他微孢子虫的LPI加权平均值为0.93,具有最近的亲缘关系,与真菌界的LPI加权平均值为0.65,与原生生物界的LPI加权平均值为0.38。由此证明微孢子虫与真菌存在着更近的亲缘关系,微孢子虫门属于真菌界而非原生生物界。
文摘通过在基因组水平上对成千上万的单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism,SNP）进行系统性检测和分析,全基因组关联性研究（genome-wide association study,GWAS）发现了一系列与人类复杂性状和疾病（比如,身高、恶性肿瘤、糖尿病和高血压）相关的常见遗传变异位点[1-3]。
