广州地区汉族人乙型肝炎病毒感染与HLA-DPB1基因的相关性研究 被引量：6

1

作者 刘泽寰 范新兰 +5 位作者 林蒋海 符志彦 潘德京 付永贵 贾宗剑 徐安龙 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2002年第8期907-909,共3页

目的 :探讨人类白细胞抗原 (HLA)的DPB1基因与广州地区汉族人乙型肝炎病毒 (HBV)感染的相关性。方法 :采用测序分型技术 (SBT)对广州地区汉族人中 58例乙型肝炎患者和 75例正常个体的HLA -DPB1基因位点进行了基因分型。结果 :两者的HLA ... 目的 :探讨人类白细胞抗原 (HLA)的DPB1基因与广州地区汉族人乙型肝炎病毒 (HBV)感染的相关性。方法 :采用测序分型技术 (SBT)对广州地区汉族人中 58例乙型肝炎患者和 75例正常个体的HLA -DPB1基因位点进行了基因分型。结果 :两者的HLA -DPB1等位基因表现型频率差异均无显著性。结论 :本研究检验的广州地区部分汉族人的HBV感染与HLA 展开更多

关键词 广州市 汉族 乙型肝炎病毒感染 乙型肝炎病毒 HLA抗原 人类白细胞抗原 dpb1基因

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猕猴MHC-DPB1基因外显子2多态性研究 被引量：6

2

作者 徐怀亮 汪宴廷 +6 位作者 程安春 姚永芳 倪庆永 曾文 毕风均 杨泽霞 陈孝跃 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2010年第6期588-598,共11页

猕猴(Macaca mulatta)是最理想的医学实验灵长类动物,且为国家二级保护动物。为了解中国猕猴主要组织相容复合体(Major histocompatibility complex,MHC)基因的遗传多态性背景,为它们在生物医学研究中的应用及其遗传资源的保护提供一定... 猕猴(Macaca mulatta)是最理想的医学实验灵长类动物,且为国家二级保护动物。为了解中国猕猴主要组织相容复合体(Major histocompatibility complex,MHC)基因的遗传多态性背景,为它们在生物医学研究中的应用及其遗传资源的保护提供一定的科学依据,文章采用变性梯度凝胶电泳(Denaturing gradient gel electrophore-sis,DGGE)和克隆测序技术分析了106个四川野生猕猴MHC-DPB1基因的exon2,共检测到21个Mamu-DPB1等位基因,其中有15个为本研究中首次发现的新等位基因;从整个大的猕猴群体(106个个体)来看,等位基因频率最高的是Mamu-DPB1*30(0.1120);单独从不同地理群体来看,最高等位基因频率分别为:小金-DPB1*30(0.1120),黑水-DPB1*04(0.1702),巴中-DPB1*32(0.1613),汉源-DPB1*30(0.1120),九龙-DPB1*04(0.1139);氨基酸序列比对发现,猕猴Mamu-DPB1等位基因编码的氨基酸序列中,有12个氨基酸残基变异位点表现出物种特异性,其中有9个位于新发现的15个Mamu-DPB1等位基因氨基酸序列中;不同物种来源的DPB1等位基因系统发生树表明,猕猴与其近缘物种食蟹猴(Macaca fascicularis)的DPB1等位基因间存在着跨种多态(Trans-species polymorphism)现象。研究还表明,MHC-DPB1等位基因在中国猕猴群体和先前为主要研究对象的印度猕猴群体间具有较大的差异。 展开更多

关键词 猕猴 主要组织相容复合体Ⅱ类 Mamu-dpb1基因 多态性

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新疆石河子地区汉族人群HLA-DPB1基因多态性与肺结核易感的相关性研究 被引量：1

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作者 卢丽君 吴江东 +3 位作者 左维泽 张万江 章乐 吴芳 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第9期1225-1228,1249,共5页

目的:探讨研究新疆石河子地区的汉族肺结核患者与汉族健康对照者的人类白细胞抗原(HLA)-DPB1等位基因的多态性及其与肺结核易感的相关性。方法:采用DNA水平基于测序的分型方法(Sequence-based typing,SBT),通过病例-对照研究93例新疆石... 目的:探讨研究新疆石河子地区的汉族肺结核患者与汉族健康对照者的人类白细胞抗原(HLA)-DPB1等位基因的多态性及其与肺结核易感的相关性。方法:采用DNA水平基于测序的分型方法(Sequence-based typing,SBT),通过病例-对照研究93例新疆石河子地区汉族肺结核患者与96例同一地区的汉族随机健康对照者的HLA-DPB1位点的多态性,通过统计分析研究结果,筛选出易感和保护性基因。结果:在健康对照组中,共筛选出16个等位基因,其中HLA-DPB1*0501(28.1%)和HLA-DPB1*0201(27.6%)的基因频率显著高于其他位点,分别位居第一第二;病例组与对照组研究发现,HLADPB1*0201在对照组中的频率显著高于病例组(P<0.05)。而HLA-DPB1*0501在病例组的频率显著高于对照组(P<0.05)。结论:新疆石河子地区汉族人群HLA-DPB1基因频率与中国其他地区北方汉族人群大体一致;同时本研究提示HLADPB1*0501可能为新疆石河子地区汉族肺结核的易感性基因,而HLA-DPB1*0201则可能为其保护性基因。 展开更多

关键词 肺结核 HLA-dpb1等位基因 多态性 易感性

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HLA-B和-DRB1、HLA-DQB1和-DPB1座位基因重组的分析 被引量：1

4

作者 陈晨 王炜 +3 位作者 陈男英 董丽娜 章伟 朱发明 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期855-859,共5页

目的:探讨2个家系人类白细胞抗原(HLA)座位的重组情况。方法:采集家系成员的外周血,提取基因组DNA,采用聚合酶链反应-序列特异性寡核苷酸探针技术(PCR-SSO)和二代测序技术检测HLA-A、-B、-C、-DRB1、-DQB1和-DPB1座位,通过家系遗传分析... 目的:探讨2个家系人类白细胞抗原(HLA)座位的重组情况。方法:采集家系成员的外周血,提取基因组DNA,采用聚合酶链反应-序列特异性寡核苷酸探针技术(PCR-SSO)和二代测序技术检测HLA-A、-B、-C、-DRB1、-DQB1和-DPB1座位,通过家系遗传分析确定个体HLA单体型。结果:家系1中单体型HLA-A*11:01~C*03:04~B*13:01~DRB1*12:02~DQB1*03:01~DPB1*05:01:01G与HLA-A*03:01~C*04:01~B*35:03~DRB1*12:01~DQB1*03:01~DPB1*04:01:01G在HLA-B和HLA-DRB1座位间进行了交换,形成HLA-A*11:01~C*03:04~B*13:01~DRB1*12:01~DQB1*03:01~DPB1*04:01:01G。家系2中单体型HLA-A*02:06~C*03:03~B*35:01~DRB1*08:02~DQB1*04:02~DPB1*13:01:01G与HLA-A*11:01~C*07:02~B*38:02~DRB1*15:02~DQB1*05:01~DPB1*05:01:01G在HLA-DQB1和HLA-DPB1座位间进行了交换,形成HLA-A*02:06~C*03:03~B*35:01~DRB1*08:02~DQB1*04:02~DPB1*05:01:01G。结论:2个中国汉族人群家系分别发生了HLA-B和-DRB1、HLA-DQB1和-DPB1座位间的基因重组。 展开更多

关键词 人类白细胞抗原(HLA) 基因重组 二代测序 HLA-B和HLA-DRB1座位 HLA-DQB1和HLA-dpb1座位

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南方汉族慢性髓细胞性白血病与HLA-DPB1等位基因的相关性研究

5

作者 田红 周淑芸 +4 位作者 刘泽寰 付永贵 吕凤娟 林蒋海 徐安龙 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 2003年第3期266-268,共3页

为了探讨慢性髓细胞性白血病 (CML)与人类白细胞抗原 (HLA)DPB1基因的相关性和分析其遗传易感性 ,采用测序分型技术 (SBT)对 86例主要为广东藉的南方汉族CML患者和 82例健康对照者进行HLA DPB1基因分型。结果表明HLA DPB1 130 1和DPB1 2... 为了探讨慢性髓细胞性白血病 (CML)与人类白细胞抗原 (HLA)DPB1基因的相关性和分析其遗传易感性 ,采用测序分型技术 (SBT)对 86例主要为广东藉的南方汉族CML患者和 82例健康对照者进行HLA DPB1基因分型。结果表明HLA DPB1 130 1和DPB1 2 0 0 11的基因频率在病例组高于对照组。结论 展开更多

关键词 慢性髓细胞性白血病 HLA—dpb1等位基因 基因频率

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异基因骨髓移植中PCR-SSP和RFLP对HLA-DRB、DPB1分型的应用

6

作者 林祥华 陈志哲 +1 位作者 林敏辉 吕联煌 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2002年第8期558-561,共4页

目的:探讨序列特异性引物聚合酶链反应（PCR-SSP）和聚合酶链反应限制性片段长度多态性分析（PCR-RFLP）对HLA-DRB、DPB1分型在异基因骨髓移植中应用的可行性。方法:应用19对不同的DRB抗原所对应等位基因序列特异性的引物,PCR扩增供受者... 目的:探讨序列特异性引物聚合酶链反应（PCR-SSP）和聚合酶链反应限制性片段长度多态性分析（PCR-RFLP）对HLA-DRB、DPB1分型在异基因骨髓移植中应用的可行性。方法:应用19对不同的DRB抗原所对应等位基因序列特异性的引物,PCR扩增供受者各20个样本DRB,产物直接琼脂糖凝胶电泳分析;同时用另一对引物PCR扩增DPB1第二外显子,产物10种限制性内切酶酶切分析。结果:各DRB带清晰可辨,直接确定为该型;DPB1的多态性片段编码转换后确定其基因型;4例找到供者。结论:它们是异基因骨髓植前快速、精确和可靠的基因分型手段。 展开更多

关键词 异基因骨髓移植 PCR-SSP RFLP HLA-DRB dpb1 分型

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PCR-SBT法分析内蒙古地区鄂温克族人群HLA-DPB1等位基因型别

7

作者 海荣 毕力夫 +1 位作者 徐安龙 苏秀兰 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第8期602-604,共3页

目的:调查内蒙古鄂温克族人群人类白细胞抗原(Humanleukocyteantigen,HLA)DPB1基因多态性。方法:采用SBT(sequecing-based-typing)法。结果:在所检测的DPB1等位基因中,共检出20个等位基因,其中频率最高的是DPB1*02012(24.4%),其次是DPB1... 目的:调查内蒙古鄂温克族人群人类白细胞抗原(Humanleukocyteantigen,HLA)DPB1基因多态性。方法:采用SBT(sequecing-based-typing)法。结果:在所检测的DPB1等位基因中,共检出20个等位基因,其中频率最高的是DPB1*02012(24.4%),其次是DPB1*0402(22.6%),DPB1*0401(20.2%),DPB1*0501(10.7%),其余等位基因频率均低于5%。结论:内蒙古地区鄂温克族人群中HLA-DPB1分布特征有独特性,为本民族的人类学及疾病相关性研究提供依据。 展开更多

关键词 PCR-SBT法 内蒙古 鄂温克族 HLA-dpb1 等位基因 基因型别 人类白细胞抗原

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基于数据库探索HLA-DPB1基因在泛癌中的潜在价值

8

作者 王司颖 闫瑞玲 +1 位作者 管保章 张伟 《暨南大学学报（自然科学与医学版）》 CAS 北大核心 2023年第5期478-493,共16页

目的:探索HLA-DPB1在泛癌中的表达及其对患者预后、肿瘤免疫细胞浸润的影响及作用机制。方法:从UCSC XENA、TCGA数据库获取基因转录组和临床数据,从UALCAN、HPA数据库获取HLA-DPB1蛋白质在泛癌中的表达情况;使用Cox回归和Kaplan-Meier... 目的:探索HLA-DPB1在泛癌中的表达及其对患者预后、肿瘤免疫细胞浸润的影响及作用机制。方法:从UCSC XENA、TCGA数据库获取基因转录组和临床数据,从UALCAN、HPA数据库获取HLA-DPB1蛋白质在泛癌中的表达情况;使用Cox回归和Kaplan-Meier分析评估HLA-DPB1在泛癌中的预后价值;使用ESTIMATE算法和Timer数据库分析HLA-DPB1表达与免疫细胞浸润的相关性;使用cBioPortal数据库分析泛癌中HLA-DPB1的基因突变及其对预后的影响;使用STRING,GEPIA2及R包对HLA-DPB1相关基因进行GO功能注释及KEGG通路富集分析,进一步通过GSEA软件分析HLA-DPB1的生物学功能;采用Cancer SEA数据库分析HLA-DPB1对单个细胞功能状态的影响。结果:HLA-DPB1在大多数肿瘤组织中表达升高,HLA-DPB1高表达与宫颈鳞癌和腺癌(P=0.03)、肾透明细胞癌(P=1.8×10^(-3))、肺腺癌(P=1.0×10^(-4))、子宫内膜癌(P=0.02)、肉瘤(P=4.5×10^(-3))、皮肤黑色素瘤(P=5.6×10^(-7))的良好预后显著相关。HLA-DPB1基因突变存在于多种恶性肿瘤中,是皮肤恶性肿瘤的不良预后因素。HLA-DPB1表达促进肿瘤微环境中的免疫细胞浸润和免疫检查点相关基因的表达。HLA-DPB1可能通过FcεRI介导Ca^(2+)动员、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)激活及NF-κB激活等信号通路参与肿瘤免疫、炎症反应过程。结论:HLA-DPB1的表达水平与不同肿瘤患者的临床预后及免疫细胞浸润高度相关,HLA-DPB1有望成为新的肿瘤预后标志物和免疫治疗的潜在靶点。 展开更多

关键词 HLA-dpb1 泛癌分析 免疫浸润 生存预后

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HLA-DPB1位点相合情况对非血缘供者造血干细胞移植结局的影响 被引量：1

9

作者 徐世侠 张在文 +1 位作者 冯博 邢娜 《器官移植》 CAS CSCD 2017年第4期282-288,共7页

目的系统评价HLA-DPB1位点不相合对非血缘供者造血干细胞移植结局的影响。方法检索1995年1月至2016年12月Pub Med数据库、Embase数据库、国际骨髓移植中心登记处数据库(CIBMTR)、考克兰临床对照中心登记处数据库、考克兰相关文献资料数... 目的系统评价HLA-DPB1位点不相合对非血缘供者造血干细胞移植结局的影响。方法检索1995年1月至2016年12月Pub Med数据库、Embase数据库、国际骨髓移植中心登记处数据库(CIBMTR)、考克兰临床对照中心登记处数据库、考克兰相关文献资料数据库、中国生物医学文献数据库(CBM)、中国知网(CNKI)数据库等国内外数据库,收集关于HLA-DPB1位点不相合对非血缘供者造血干细胞移植临床结局影响的国内外文献。采用Review Manager 5.3软件分析存活率,植入失败发生率、移植物抗宿主病(GVHD)发生率、复发率及移植相关病死率等不良事件发生率,并做漏斗图评估发表偏倚。结果纳入19篇文献,共26 634例患者。Meta分析结果表明,与HLA-DPB1相合组比较,HLA-DPB1不相合组受者的无病存活率较低、在非T细胞去除的移植中受者的总存活率降低,HLA-DPB1不相合组受者重症GVHD的发生率及移植相关病死率较高,且2个位点不相合较1个位点不相合受者移植相关病死率更高。结论 HLA-DPB1位点对非血缘供者造血干细胞移植的存活率及不良事件发生率具有明显的影响,在选择非血缘供者时应考虑到HLA-DPB1位点的相合情况。 展开更多

关键词 造血干细胞移植 人类白细胞抗原 dpb1位点 Meta分析 存活率 并发症

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藏酋猴Mhc-DPB1基因exon2的多态性

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作者 李佳薏 姚永芳 +1 位作者 周亮 徐怀亮 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2012年第11期1417-1426,共10页

主要组织相容性复合体(Major histocompatibility complex,MHC)对许多疾病的易感性和抵抗力起着重要的作用。为了解藏酋猴(Macaca thibetana)的MHC基因遗传背景,以促进藏酋猴遗传资源的保护及其在生物医学研究中的应用,文章采用PCR扩增... 主要组织相容性复合体(Major histocompatibility complex,MHC)对许多疾病的易感性和抵抗力起着重要的作用。为了解藏酋猴(Macaca thibetana)的MHC基因遗传背景,以促进藏酋猴遗传资源的保护及其在生物医学研究中的应用,文章采用PCR扩增和克隆测序等方法对来自四川地区的70个藏酋猴样品的Mhc-DPB1基因exon 2进行了检测和分析。首次在藏酋猴中获得了18个DPB1等位基因(Math-DPB1),其中1个为假基因(Math-DPB1*01:06N)。18个等位基因中,Math-DPB1*06:01:01(67.14%)的阳性检出率最高,其次为Math-DPB1*01:03:01(37.14%)、Math-DPB1*09:02(25.71%)和Math-DPB1*22:01(15.71%)。氨基酸序列比对发现,藏酋猴Math-DPB1等位基因编码的氨基酸序列中,有5个氨基酸残基变异位点表现出物种特异性。不同物种来源的DPB1等位基因系统发生树表明,藏酋猴、猕猴(Macaca mulatta)和食蟹猴(Macaca fascicularis)的DPB1等位基因不是以物种特异性方式聚类,而是种间混聚在一起,并显示出明显的跨物种多态性(Trans-species polymorphism)。选择性检验表明,平衡选择(Balancing selection)在维持Math-DPB1基因的多态性中起着重要的作用。 展开更多

关键词 藏酋猴 主要组织相容性复合体Ⅱ类 dpb1基因 遗传多态性 跨物种多态

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一种以测序为基础的基因分型方法的建立 被引量：5

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作者 刘泽寰 林蒋海 +2 位作者 符志彦 潘德京 徐安龙 《中山大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2001年第5期83-87,共5页

设计了一种自动化的基因分型方法，能够直接利用ＰＣＲ产物的ＤＮＡ测序结果作为数据，通过自动化基因分型程序（ａｕｔｏｍａｔｉｃ ｇｅｎｏｔｙｐｉｎｇ ｐｒｏｇｒａｍ）与一个含有其等位基因序列的数据库进行比较，来完成高精度的... 设计了一种自动化的基因分型方法，能够直接利用ＰＣＲ产物的ＤＮＡ测序结果作为数据，通过自动化基因分型程序（ａｕｔｏｍａｔｉｃ ｇｅｎｏｔｙｐｉｎｇ ｐｒｏｇｒａｍ）与一个含有其等位基因序列的数据库进行比较，来完成高精度的基因分型工作．用这种方法对５０个随机挑选的中冈南方人的ＨＬＡ－ＤＰＢ１基因进行广基因分型，证明该方法是可行的，并从中发现了２个不明确杂合子以及一个新的等位基因序列．随后对这些样品克隆测序，发现除了２个不明确杂合子得到了进一步的区分外，其它样品都与前面的分型结果一致，显示了９６％的精确性．通过以上的研究表明，成功建立了一种高精度的、基于序列的分型（ｓｅｑｕｅｎｃｅ－ｂａｓｅｄ　ｔｙｐｉｎｇ）方法．既然该方法能成功分型ＨＬＡ－ＤＰＢ１基因，预示了该方法同样能应用于其它基因的分型．该ＡＧＰ程序可以在ｈｔｔｐ：／ｇｅｎｏｍｅ．ｚｓｕ．ｅｄｕ．ｃｎ免费下载． 展开更多

关键词 基因分型 序列 测序 HLA-dpb1 免疫系统

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