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从土壤样品中提取和纯化微生物DNA方法研究进展 被引量:6
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作者 张秀敏 徐金娥 王海祥 《保定师范专科学校学报》 2005年第2期34-39,共6页
自然界存在的微生物只有一少部分能够通过标准纯培养方法获得,而绝大多数是难培养和不能培养的微生物,近年出现了一些新的直接从环境基质中提取微生物DNA的方法,用来研究环境中微生物多样性。对目前用于提取和纯化环境样品中微生物DNA... 自然界存在的微生物只有一少部分能够通过标准纯培养方法获得,而绝大多数是难培养和不能培养的微生物,近年出现了一些新的直接从环境基质中提取微生物DNA的方法,用来研究环境中微生物多样性。对目前用于提取和纯化环境样品中微生物DNA的研究进展进行了综述. 展开更多
关键词 土壤 微生物 dna提取 dna纯化
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微量脱落细胞DNA提取纯化方法比较 被引量:2
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作者 江煜灵 巫家盛 +1 位作者 赵春鹤 袁家龙 《黑龙江科技信息》 2016年第9期34-35,共2页
本文比较了实验室常用的kingfisher flex工作站纯化方案及kingfisher FL纯化方案的检验效果。日常案件检材的检验结果表明运用kingfisher flex方案对微量脱落细胞DNA进行纯化的检测结果优于kingfisher FL方案。实验检材检验结果也提示... 本文比较了实验室常用的kingfisher flex工作站纯化方案及kingfisher FL纯化方案的检验效果。日常案件检材的检验结果表明运用kingfisher flex方案对微量脱落细胞DNA进行纯化的检测结果优于kingfisher FL方案。实验检材检验结果也提示在微量范围内,kingfisher flex方案优于kingfisher FL方案,在检材DNA含量较多时,两种纯化方案效果相当。 展开更多
关键词 kingfisher FLEX kingfisher FL 脱落细胞 微量 dna纯化
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一种土壤微生物总DNA的高效提取方法 被引量:29
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作者 黄婷婷 曹慧 +1 位作者 王兴祥 崔中利 《土壤》 CAS CSCD 北大核心 2004年第6期662-666,共5页
获得高浓度、大片段、多样性程度高的土壤微生物总DNA 是研究土壤微生物群落结构的分子生态学基础。本文采用间接法(菌体细胞回收法)提取红壤地区两种土壤类型的土壤微生物总DNA,定量计算其回收率,并与直接法(细胞原位裂解法)比较了提... 获得高浓度、大片段、多样性程度高的土壤微生物总DNA 是研究土壤微生物群落结构的分子生态学基础。本文采用间接法(菌体细胞回收法)提取红壤地区两种土壤类型的土壤微生物总DNA,定量计算其回收率,并与直接法(细胞原位裂解法)比较了提取效率和纯度。结果表明:红壤地区2种土壤每克干土的总DNA提取量,间接法约为0.34和0.53礸/g干土,直接法约为13.62和24.32礸/g干土;间接法的提取效率低于直接法,但所得DNA片段较大,且Sau 3AⅠ 酶切和16 S rDNA通用引物PCR扩增结果显示,间接法比直接法更能有效地去除土壤中的某些抑制剂,所得总DNA的纯度更高,有利于后续操作。 展开更多
关键词 土壤微生物 dna提取 细胞回收 dna纯化
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基于磁珠的细菌基因组DNA快速提取方法 被引量:8
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作者 高秋月 景奉香 +3 位作者 李海燕 陈季武 金庆辉 赵建龙 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2010年第21期11071-11074,共4页
[目的]为临床上大肠杆菌O157∶H7的快速检测提供参考。[方法]依据高盐离子浓度下多聚核苷酸与羧基修饰的磁珠表面可发生非特异性吸附,而蛋白、单糖、多糖和脂类等细胞成分不被吸附的原理,建立了一种以磁性微珠为载体的细菌基因组DNA纯... [目的]为临床上大肠杆菌O157∶H7的快速检测提供参考。[方法]依据高盐离子浓度下多聚核苷酸与羧基修饰的磁珠表面可发生非特异性吸附,而蛋白、单糖、多糖和脂类等细胞成分不被吸附的原理,建立了一种以磁性微珠为载体的细菌基因组DNA纯化方法—磁性DNA纯化法。[结果]该方法可在7min内完成对大肠杆菌O157∶H7基因组DNA的高效富集与纯化;与德国进口同类试剂盒gene-MAG-DNA/Bacteria及AxyPrep细菌基因组DNA纯化试剂盒相比,该方法操作简单、耗时短、不需要使用离心机和有机试剂,且无需常规快速提取法的沸水浴等步骤,安全、快速、成本低,在临床、食品、环境病原体快速检测领域具有巨大的推广价值。[结论]该研究成功建立了一种细菌基因组DNA的快速提取方法。 展开更多
关键词 磁珠 dna纯化 大肠杆菌O157∶H7
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微量接触DNA的浓缩与回收 被引量:8
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作者 徐程 丰蕾 +2 位作者 杨帆 涂政 胡兰 《山西医科大学学报》 CAS 2014年第6期532-535,551,552,共6页
目的对纯化后的微量DNA进行进一步浓缩,提高DNA检验成功率。方法将30 ml(约600 pg)纯化后的微量DNA,分别采用Amicon离心超滤管和DNA Clean&ConcentratorTM-5试剂盒进行浓缩回收,用Identifiler试剂盒进行PCR扩增及分型检测,比较STR... 目的对纯化后的微量DNA进行进一步浓缩,提高DNA检验成功率。方法将30 ml(约600 pg)纯化后的微量DNA,分别采用Amicon离心超滤管和DNA Clean&ConcentratorTM-5试剂盒进行浓缩回收,用Identifiler试剂盒进行PCR扩增及分型检测,比较STR分型图谱的平均峰高、峰面积和等位基因丢失率。检验24枚白纸上的汗潜指纹,比较浓缩前后的检验效果。结果经过Amicon离心超滤管回收后,STR分型平均峰高85.3RFU,平均峰面积为1 130.8,等位基因丢失率为66.13%。经过DNA Clean&ConcentratorTM-5试剂盒回收后,STR分型平均峰高147.5RFU,平均峰面积为1 960.2,等位基因丢失率为35.14%。汗潜指纹的DNA检验通过DNA Clean&ConcentratorTM-5试剂盒纯化浓缩,获得有效分型的数量由浓缩前的9枚提高为20枚。结论 DNA Clean&ConcentratorTM-5试剂盒可以明显提高微量DNA检材的检验成功率,效果优于Amicon离心超滤管。对白纸上的指纹,DNA Clean&ConcentratorTM-5试剂盒浓缩后检验成功率升高。 展开更多
关键词 法医物证学 微量dna STR分型 dna纯化
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一种直接用于PCR分析的风沙土微生物总DNA提取方法 被引量:2
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作者 张颖 曹成有 《东北大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2010年第11期1640-1643,共4页
以风沙土为材料,直接提取土壤微生物DNA.采用SDS—溶菌酶—CTAB—蛋白酶K和液氮反复冻融法裂解细胞得到DNA粗提液,以PEG对其纯化.结果表明,SDS—溶菌酶—CTAB—蛋白酶K和液氮反复冻融法裂解细胞可获得大片段的DNA,提高DNA产率.每克干土... 以风沙土为材料,直接提取土壤微生物DNA.采用SDS—溶菌酶—CTAB—蛋白酶K和液氮反复冻融法裂解细胞得到DNA粗提液,以PEG对其纯化.结果表明,SDS—溶菌酶—CTAB—蛋白酶K和液氮反复冻融法裂解细胞可获得大片段的DNA,提高DNA产率.每克干土的DNA提取量为0.586~1.311μg.所提DNA片段在23Kb以上.PEG可有助于去除DNA中腐植酸,DNA不作回收纯化即可作为模板进行16SrDNAPCR扩增.SDS—溶菌酶—CTAB—蛋白酶K和液氮反复冻融裂解细胞、PEG纯化DNA的方法组合是一种简便的适合风沙土微生物总DNA的提取方法. 展开更多
关键词 风沙土 土壤微生物 dna提取 dna纯化 PCR扩增
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An economic and efficient method for further purification of crude DNA extracted from forest soils
7
作者 韩国民 宋福强 +3 位作者 倪武 何沙娥 张智俊 田兴军 《Journal of Forestry Research》 SCIE CAS CSCD 2010年第2期246-250,I0008,共6页
To obtain pure DNA directly from some complex forest soils are still very difficulty at present,though many methods even commercial kits have been attempted.This paper reports an economic and efficient method for furt... To obtain pure DNA directly from some complex forest soils are still very difficulty at present,though many methods even commercial kits have been attempted.This paper reports an economic and efficient method for further purifying crude DNA extracted from forest soils with two steps.First,the crude DNA was dissolved using the extraction buffer,which removed the debris by chloroform-isoamyl alcohol,and then reprecipitated the DNA by isopropanol;second,the recovered DNA was further purified with silica spin column.Results show that 82-91% of the humic acids was removed by step one.The remaining humic acids could be completely effaced through the second step.The recovered DNA following this protocol was quite pure and ready for sensitive conventional PCR reactions.This is an economic,efficient,and timesaving method.Moreover,crude DNA extracted by other methods can be also further purified with this new way. 展开更多
关键词 crude dna forest soils PURIFICATION
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A simple method for purification of genomic DNA from whole blood using Fe_3O_4/Au composite particles as a carrier 被引量:1
8
作者 Zhao Ming Zhang Xianqing +2 位作者 Wang Sen Chen Chao Cui Yali 《Journal of Medical Colleges of PLA(China)》 CAS 2009年第4期239-243,共5页
Objective: To establish a method of genomic DNA extraction from whole blood using Fe3O4/Au composite particles as a carrier. Methods: Two crucial conditions (sodium chloride concentration and amount of the magnetic... Objective: To establish a method of genomic DNA extraction from whole blood using Fe3O4/Au composite particles as a carrier. Methods: Two crucial conditions (sodium chloride concentration and amount of the magnetic particles) were optimized and 8 different human whole blood samples were used to purify genomic DNA under the optimal condition. Then agarose gel electrophoresis and polymerase cbain reaction (PCR) were performed. Results: The optimal binding condition was 1.5 mol/L NaC1/10% PEG, and the optimal amount of Fe3O4/Au composite particles was 600μg. The yields of the genomic DNA from 100μl of different whole blood samples were 2-5 μg, and the ratio of A260/A280 was in the range of 1.70-1.90. The size of genomic DNA was about 23 kb and the PCR was valid. Conclusion: The purification system using Fe3O4/Au composite microparticles has advantages in high yield, high purity, ease of operating, time saving and avoiding centrifugation. The purified sample was found to function satisfactorily in PCR amplification. 展开更多
关键词 Fe3O4/Au composite particles Genomic dna PURIFICATION Whole blood
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真核生物转录因子与DNA互作的研究方法进展
9
作者 杜晓悦 刘淑英 《动物医学进展》 北大核心 2023年第1期97-101,共5页
转录水平的调控是真核生物基因表达中的重要环节,转录因子通过识别特定的DNA序列控制染色质和转录以指导基因表达。论文对研究真核生物转录因子与DNA相互作用的传统方法和新兴技术进行阐述,传统的研究方法包括转录因子结合位点预测、双... 转录水平的调控是真核生物基因表达中的重要环节,转录因子通过识别特定的DNA序列控制染色质和转录以指导基因表达。论文对研究真核生物转录因子与DNA相互作用的传统方法和新兴技术进行阐述,传统的研究方法包括转录因子结合位点预测、双荧光素酶报告基因系统、电泳迁移率变动分析和染色质免疫共沉淀测序等,其中染色质免疫共沉淀测序是基于生物体内的研究方法,对抗体特异性要求高且试验背景较大,限制了对非模式物种的研究,对此,开发了新兴技术如DNA亲和纯化测序和染色质靶向切割与标签化试验。结合上述方法可有效进行转录因子和DNA互作分析,对研究基因转录调控机制具有重要意义。 展开更多
关键词 转录因子 dna 染色质免疫共沉淀测序 dna亲和纯化测序 染色质靶向切割与标签化
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实时荧光PCR在鉴别奶粉中掺入大豆成分的应用研究 被引量:15
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作者 岳巧云 陈定虎 +2 位作者 伍朝晖 周灼标 邱德义 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2009年第12期190-193,共4页
首次利用实时荧光PCR方法,以大豆内源参照基因lectin为指标,对奶粉中掺入豆粉等植物成分进行定性、定量分析研究。结果表明,通过正己烷抽提奶粉中的油脂,苯酚抽提奶粉中的蛋白质等处理步骤后,应用植物基因组DNA提取试剂盒能够得到高质量... 首次利用实时荧光PCR方法,以大豆内源参照基因lectin为指标,对奶粉中掺入豆粉等植物成分进行定性、定量分析研究。结果表明,通过正己烷抽提奶粉中的油脂,苯酚抽提奶粉中的蛋白质等处理步骤后,应用植物基因组DNA提取试剂盒能够得到高质量的DNA模板。实时荧光PCR反应结果表明,该方法判定奶粉中掺入植物成分的灵敏度大大提高;奶粉中掺入大豆粉或大豆制品的掺入量与实时荧光PCR扩增曲线及循环数呈良好的对应关系。实时荧光PCR法能够对奶粉中掺入的植物成分进行快速准确地定性、定量分析,可以作为市场监督和检验鉴定的可行性方法。 展开更多
关键词 奶粉 实时荧光PCR 植物蛋白成分 dna提取纯化
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基于双富集微流控技术的食品中蜡样芽孢杆菌快速检测 被引量:1
11
作者 唐璎 周春红 +3 位作者 杨晓楠 黄佳 邓展瑞 马婷婷 《中国测试》 CAS 北大核心 2023年第11期53-59,90,共8页
为实现食源性致病菌多场景即时检验,替换常规检验及快检技术中耗时的增菌培养过程,以缩短检验时间和降低实验环境及设备要求。研究以蜡样芽孢杆菌为研究对象,采用双层膜富集样品中菌体,磁珠提取纯化微量DNA的方式,取代增菌培养过程,同... 为实现食源性致病菌多场景即时检验,替换常规检验及快检技术中耗时的增菌培养过程,以缩短检验时间和降低实验环境及设备要求。研究以蜡样芽孢杆菌为研究对象,采用双层膜富集样品中菌体,磁珠提取纯化微量DNA的方式,取代增菌培养过程,同时将环介导等温扩增反应与微流控芯片相结合,有效避免扩增中气溶胶污染问题。实验结果显示:使用双富集微流控技术检测食品中蜡样芽孢杆菌,可将现行国标的检验时间由5~7 d缩短至1 h内,方法特异性良好,检出限为10 CFU/g(mL)等同于现行国标,Ct值变异系数<5%,显示重复性好。研究建立的双富集微流控技术快速检测食品中蜡样芽孢杆菌方法可实现食源性致病菌即时快速检验,为食源性致病菌引起的食品安全事件和舆情风险防控快速反应提供技术支撑。 展开更多
关键词 食源性致病菌快检 蜡样芽孢杆菌 膜富集 磁珠纯化dna 环介导等温扩增 微流控芯片
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