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破译DNA磷硫酰化修饰基因组分布图谱
1
作者
本刊编辑部
《实验室研究与探索》
CAS
北大核心
2014年第9期I0001-I0002,共2页
DNA是生命的遗传物质,由碳、氢、氧、氮和磷五种元素组成的四种脱氧核苷酸所构成的DNA序列,储存着生物界无穷无尽的遗传信息。对DNA结构和功能的每一次全新认知,都是生命科学发展里程碑式的成果。DNA甲基化作为一种表观遗传修饰,在...
DNA是生命的遗传物质,由碳、氢、氧、氮和磷五种元素组成的四种脱氧核苷酸所构成的DNA序列,储存着生物界无穷无尽的遗传信息。对DNA结构和功能的每一次全新认知,都是生命科学发展里程碑式的成果。DNA甲基化作为一种表观遗传修饰,在生物体中具有保护遗传稳定,调控DNA复制、转录以及翻译等重要生理功能。DNA磷硫酰化修饰是近年发现的又一种新型表观遗传学生理修饰。
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关键词
dna
序列
修饰
基因
磷
硫
酰化
脱氧核苷酸
表观遗传学
图谱
组分
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职称材料
中美科学家在细菌天然DNA骨架上首次发现一种生理修饰——磷硫酰化的DNA修饰
2
《生物学教学》
北大核心
2008年第4期76-76,共1页
据搜狐网2007年10月19日援引2007年10月18日《解放日报》消息。由上海交通大学微生物代谢教育部重点实验室邓子新院士领衔的科研小组与美国麻省理工学院合作,成功完成了“细菌DNA大分子上的磷硫酰化”课题的研究,解析了DNA硫修饰精细...
据搜狐网2007年10月19日援引2007年10月18日《解放日报》消息。由上海交通大学微生物代谢教育部重点实验室邓子新院士领衔的科研小组与美国麻省理工学院合作,成功完成了“细菌DNA大分子上的磷硫酰化”课题的研究,解析了DNA硫修饰精细化学结构为“R-构象的磷硫酰化”,并发现细菌中的5种酶共同合作将硫掺入到了DNA骨架中,从而形成了细菌天然DNA骨架上的磷硫酰化修饰。
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关键词
dna
修饰
细菌
dna
磷
硫
酰化
骨架
天然
科学家
美国麻省理工学院
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职称材料
无机离子对磷硫修饰DNA的碘催化断裂反应的显著影响
3
作者
胡坤灵
汤若冰
+1 位作者
安然
梁兴国
《中国海洋大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第10期68-75,共8页
磷硫修饰DNA(PT-DNA)的断裂反应常被用于检测微生物基因组中PT-DNA的含量,但其检测准确性有待提高。本文研究了Tris-HCl、HEPES、磷酸盐等缓冲溶液和阳离子的种类、浓度对碘断裂PT-DNA的影响,提出了Tris分子参与断裂反应的机制。研究发...
磷硫修饰DNA(PT-DNA)的断裂反应常被用于检测微生物基因组中PT-DNA的含量,但其检测准确性有待提高。本文研究了Tris-HCl、HEPES、磷酸盐等缓冲溶液和阳离子的种类、浓度对碘断裂PT-DNA的影响,提出了Tris分子参与断裂反应的机制。研究发现,Tris分子能使单链PT-DNA的断裂收率从5%提升至70%以上。对于单链PT-DNA断裂,Na^(+)、Mg^(2+)和Ca^(2+)等阳离子有显著的抑制作用;而双链PT-DNA断裂基本不受上述无机阳离子的影响。当用磷酸钠缓冲溶液代替Tris-HCl时,在低盐条件下PT-DNA只能产生微弱断裂,在高盐条件下双链状态PT-DNA的断裂反而获得了显著的提升;而改用HEPES缓冲液时,无论在高盐还是低盐条件下,PT-DNA的断裂效率都很低。研究结果表明,只有Tris分子结合了PT-DNA氧化后形成的亚磺酸基团才能实现高效断裂,而阳离子可通过调节Tris分子同亚磺酸基团的结合来影响断裂收率。PT-DNA的生物学功能可能是防止弱氧化剂对DNA的破坏(包括断裂或变异),并通过氧化应激启动抗氧化机制。本研究结果还表明,核酸药物在体内可能经氧化途径代谢或脱硫后被核酸酶分解,开发磷硫修饰的核酸类药物时需要考虑这一药物的代谢因素。
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关键词
磷
硫
修饰
dna
碘氧化
核酸药物
基因保护
阳离子
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职称材料
阿维链霉菌BAC文库的构建及分析
被引量:
5
4
作者
刘家栋
王革娇
罗美中
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第5期45-50,共6页
为进一步阐明阿维菌素的生物合成路径和调控途径,提高阿维菌素的产量,采用BamHⅠ限制性内切酶酶解阿维链霉菌基因组DNA的方法,构建了阿维链霉菌的细菌人工染色体(BAC)文库。该文库共包含2 304个克隆,平均插入片段为101kb,空载率约9%,覆...
为进一步阐明阿维菌素的生物合成路径和调控途径,提高阿维菌素的产量,采用BamHⅠ限制性内切酶酶解阿维链霉菌基因组DNA的方法,构建了阿维链霉菌的细菌人工染色体(BAC)文库。该文库共包含2 304个克隆,平均插入片段为101kb,空载率约9%,覆盖了该菌基因组的25.9倍。该文库的成功构建可以为其他微生物尤其是基因组具有磷硫酰化修饰的微生物的文库构建提供参考。
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关键词
阿维链霉菌
阿维菌素
大片段
dna
细菌人工染色体(BAC)
dna的磷硫酰化修饰
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职称材料
题名
破译DNA磷硫酰化修饰基因组分布图谱
1
作者
本刊编辑部
出处
《实验室研究与探索》
CAS
北大核心
2014年第9期I0001-I0002,共2页
文摘
DNA是生命的遗传物质,由碳、氢、氧、氮和磷五种元素组成的四种脱氧核苷酸所构成的DNA序列,储存着生物界无穷无尽的遗传信息。对DNA结构和功能的每一次全新认知,都是生命科学发展里程碑式的成果。DNA甲基化作为一种表观遗传修饰,在生物体中具有保护遗传稳定,调控DNA复制、转录以及翻译等重要生理功能。DNA磷硫酰化修饰是近年发现的又一种新型表观遗传学生理修饰。
关键词
dna
序列
修饰
基因
磷
硫
酰化
脱氧核苷酸
表观遗传学
图谱
组分
分类号
Q523 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
中美科学家在细菌天然DNA骨架上首次发现一种生理修饰——磷硫酰化的DNA修饰
2
出处
《生物学教学》
北大核心
2008年第4期76-76,共1页
文摘
据搜狐网2007年10月19日援引2007年10月18日《解放日报》消息。由上海交通大学微生物代谢教育部重点实验室邓子新院士领衔的科研小组与美国麻省理工学院合作,成功完成了“细菌DNA大分子上的磷硫酰化”课题的研究,解析了DNA硫修饰精细化学结构为“R-构象的磷硫酰化”,并发现细菌中的5种酶共同合作将硫掺入到了DNA骨架中,从而形成了细菌天然DNA骨架上的磷硫酰化修饰。
关键词
dna
修饰
细菌
dna
磷
硫
酰化
骨架
天然
科学家
美国麻省理工学院
分类号
S852.4 [农业科学—基础兽医学]
X132 [环境科学与工程—环境科学]
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职称材料
题名
无机离子对磷硫修饰DNA的碘催化断裂反应的显著影响
3
作者
胡坤灵
汤若冰
安然
梁兴国
机构
中国海洋大学食品科学与工程学院
青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋药物与生物制品功能实验室
出处
《中国海洋大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第10期68-75,共8页
基金
国家重点研究发展计划项目(2019YFC1604603)
山东省自然科学基金项目(ZR2019BC096)资助。
文摘
磷硫修饰DNA(PT-DNA)的断裂反应常被用于检测微生物基因组中PT-DNA的含量,但其检测准确性有待提高。本文研究了Tris-HCl、HEPES、磷酸盐等缓冲溶液和阳离子的种类、浓度对碘断裂PT-DNA的影响,提出了Tris分子参与断裂反应的机制。研究发现,Tris分子能使单链PT-DNA的断裂收率从5%提升至70%以上。对于单链PT-DNA断裂,Na^(+)、Mg^(2+)和Ca^(2+)等阳离子有显著的抑制作用;而双链PT-DNA断裂基本不受上述无机阳离子的影响。当用磷酸钠缓冲溶液代替Tris-HCl时,在低盐条件下PT-DNA只能产生微弱断裂,在高盐条件下双链状态PT-DNA的断裂反而获得了显著的提升;而改用HEPES缓冲液时,无论在高盐还是低盐条件下,PT-DNA的断裂效率都很低。研究结果表明,只有Tris分子结合了PT-DNA氧化后形成的亚磺酸基团才能实现高效断裂,而阳离子可通过调节Tris分子同亚磺酸基团的结合来影响断裂收率。PT-DNA的生物学功能可能是防止弱氧化剂对DNA的破坏(包括断裂或变异),并通过氧化应激启动抗氧化机制。本研究结果还表明,核酸药物在体内可能经氧化途径代谢或脱硫后被核酸酶分解,开发磷硫修饰的核酸类药物时需要考虑这一药物的代谢因素。
关键词
磷
硫
修饰
dna
碘氧化
核酸药物
基因保护
阳离子
Keywords
phosphorothioate
dna
iodine oxidation
nucleic acid drug
gene protection
cation
分类号
Q819 [生物学—生物工程]
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职称材料
题名
阿维链霉菌BAC文库的构建及分析
被引量:
5
4
作者
刘家栋
王革娇
罗美中
机构
华中农业大学生命科学技术学院
出处
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第5期45-50,共6页
基金
国家自然科学基金项目(31470226)
文摘
为进一步阐明阿维菌素的生物合成路径和调控途径,提高阿维菌素的产量,采用BamHⅠ限制性内切酶酶解阿维链霉菌基因组DNA的方法,构建了阿维链霉菌的细菌人工染色体(BAC)文库。该文库共包含2 304个克隆,平均插入片段为101kb,空载率约9%,覆盖了该菌基因组的25.9倍。该文库的成功构建可以为其他微生物尤其是基因组具有磷硫酰化修饰的微生物的文库构建提供参考。
关键词
阿维链霉菌
阿维菌素
大片段
dna
细菌人工染色体(BAC)
dna的磷硫酰化修饰
Keywords
Streptomyces avermitilis
avermectins
large fragments genomic
dna
bacterial artificial chromosome(BAC)
dna
phosphorothioation
分类号
Q939.9 [生物学—微生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
破译DNA磷硫酰化修饰基因组分布图谱
本刊编辑部
《实验室研究与探索》
CAS
北大核心
2014
0
在线阅读
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职称材料
2
中美科学家在细菌天然DNA骨架上首次发现一种生理修饰——磷硫酰化的DNA修饰
《生物学教学》
北大核心
2008
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
无机离子对磷硫修饰DNA的碘催化断裂反应的显著影响
胡坤灵
汤若冰
安然
梁兴国
《中国海洋大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2022
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
4
阿维链霉菌BAC文库的构建及分析
刘家栋
王革娇
罗美中
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016
5
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职称材料
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