刺参基因组DNA甲基化水平及模式对温度变化的响应 被引量：2

1

作者 温争争 左闪 +5 位作者 陈梦 周红学 孙国华 冯艳微 王卫军 杨建敏 《渔业科学进展》 CSCD 北大核心 2021年第3期46-54,共9页

本研究为了探讨刺参(Apostichopus japonicus)在不同温度胁迫下的DNA甲基化水平与甲基化模式变化,利用全基因组重亚硫酸盐测序技术(WGBS)和酶联免疫吸附法(ELISA)对刺参在3个温度下(20℃、26℃和32℃)的纵肌、呼吸树、消化道和体壁4个... 本研究为了探讨刺参(Apostichopus japonicus)在不同温度胁迫下的DNA甲基化水平与甲基化模式变化,利用全基因组重亚硫酸盐测序技术(WGBS)和酶联免疫吸附法(ELISA)对刺参在3个温度下(20℃、26℃和32℃)的纵肌、呼吸树、消化道和体壁4个组织进行分析。WGBS测序结果显示,在消化道组织中,20℃、26℃和32℃温度组全基因组总甲基化水平分别为(1.70±0.01)%、(1.79±0.11)%和(1.59±0.04)%,26℃组处于休眠状态,刺参消化道基因组甲基化水平升高,而32℃组高温胁迫下,甲基化水平下降;在总甲基化位点中,CG类型是主要的甲基化修饰(96%以上),CHH和CHG位点占比较低;30%甲基化水平的甲基化位点中,CHG和CHH为本类型甲基化的最高点,且显著高于CG类型。ELISA检测结果显示,3种不同温度下,刺参呼吸树和消化道组织的甲基化水平范围为2.68%~3.29%,均高于纵肌和体壁组织;温度变化后,刺参呼吸树和消化道组织的总甲基化水平均有显著变化,而纵肌和体壁的总甲基化水平基本不变,表明DNA甲基化可能参与刺参的高温胁迫调控机制。刺参应对温度变化过程中DNA甲基化水平的研究,从表观遗传学视角解析温度升高对刺参不同组织的影响,可为丰富刺参甲基化研究内容和无脊椎动物的甲基化发生规律提供参考。 展开更多

关键词 刺参 dna甲基化水平及模式 休眠 高温胁迫 全基因组重亚硫酸盐测序技术 酶联免疫吸附

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落叶松体细胞胚胎发生过程中DNA甲基化模式变化分析 被引量：8

2

作者 魏华丽 吴涛 +4 位作者 杨文华 李万峰 张俊红 齐力旺 韩素英 《东北林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期33-37,共5页

通过MSAP技术检测落叶松体细胞胚胎发生过程中的DNA甲基化模式变化发现,体细胞胚胎发生的14个时期中,5’-CCGG-3’序列的胞嘧啶上发生重新甲基化事件最多在ABA诱导后的0.5～6 h,最少在5～7d的早期单胚阶段;而去甲基化事件发生最多的是5... 通过MSAP技术检测落叶松体细胞胚胎发生过程中的DNA甲基化模式变化发现,体细胞胚胎发生的14个时期中,5’-CCGG-3’序列的胞嘧啶上发生重新甲基化事件最多在ABA诱导后的0.5～6 h,最少在5～7d的早期单胚阶段;而去甲基化事件发生最多的是5～7 d的早期单胚阶段,最少在14～21 d的中期单胚到晚期单胚阶段。与原胚团时期相比,重新甲基化事件最多发生在ABA诱导后的5 d,最少发生在ABA诱导后的7 d;去甲基化事件发生最多是在中期单胚的14 d,最少是在ABA诱导后的2 d。说明落叶松体细胞胚胎发生过程中存在着频繁的重新甲基化和去甲基化变化,体细胞胚胎成熟阶段与原胚团阶段相比,DNA甲基化的模式变化显著。 展开更多

关键词 落叶松 体细胞胚胎发生 dna甲基化 模式变化 重新甲基化 去甲基化

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S-腺苷酰L-甲硫氨酸 (SAM)对 HL-60细胞 DNA甲基化酶活力和甲基化水平的影响(英文) 被引量：6

3

作者 白坚石 马晴 +1 位作者 王萍 何忠效 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第2期155-159,共5页

以 S-腺苷酰 - L-甲硫氨酸 (SAM)为诱导物 ,在 1 0 μmol/L最佳浓度下造成 1 6%的 HL- 60细胞分化 .HPLC检测结果表明 ,细胞基因组 DNA甲基化水平升高 .通过3H甲基同位素参入法研究细胞 DNA甲基化酶活力 ,则发现在细胞分化过程中酶活力... 以 S-腺苷酰 - L-甲硫氨酸 (SAM)为诱导物 ,在 1 0 μmol/L最佳浓度下造成 1 6%的 HL- 60细胞分化 .HPLC检测结果表明 ,细胞基因组 DNA甲基化水平升高 .通过3H甲基同位素参入法研究细胞 DNA甲基化酶活力 ,则发现在细胞分化过程中酶活力未见升高 .说明细胞基因组甲基化水平升高并不是胞内 DNA甲基化酶催化能力改变的结果 ,而是由于 SAM进入细胞提供过量甲基造成的 . 展开更多

关键词 S-腺苷酰-L-甲硫氨酸 HL-60细胞 细胞分化 dna甲基化酶 甲基化水平 酶活

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白菜DNA甲基化水平的反相离子对高效液相色谱法研究 被引量：4

4

作者 吴筱丹 王华 楼健 《理化检验（化学分册）》 CAS CSCD 北大核心 2005年第1期5-6,10,共3页

建立了反相离子对液相色谱测定白菜的DNA甲基化水平的方法。采用的色谱柱为HypersilBDSC18柱(200mm×4.0mm,5μm),以pH4.0的甲醇-5mmol·L-1庚烷磺酸钠-三乙胺(10:90:0.2,体积比)的混合液为流动相,UV检测器波长为273nm。通过测... 建立了反相离子对液相色谱测定白菜的DNA甲基化水平的方法。采用的色谱柱为HypersilBDSC18柱(200mm×4.0mm,5μm),以pH4.0的甲醇-5mmol·L-1庚烷磺酸钠-三乙胺(10:90:0.2,体积比)的混合液为流动相,UV检测器波长为273nm。通过测定DNA水样所产生的胞嘧啶和甲基胞嘧啶的含量,即可得知DNA甲基化程度。胞嘧啶和甲基胞嘧啶回收率分别为99.6%及103.3%,RSD为3.7%(日内)及5.2%(日间)。 展开更多

关键词 反相-离子对 HPLC dna 甲基化水平 白菜 胞嘧啶 甲基胞嘧啶

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不同氮水平对原产地和入侵地飞机草(Chromolaena odorata L.)DNA甲基化的影响 被引量：2

5

作者 池春玉 郭丹蒂 +4 位作者 陈曦 王锐 许志东 刘保东 丁国华 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第9期1591-1596,共6页

为探究原产地和入侵地飞机草DNA甲基化多态性的变化和氮营养水平对飞机草DNA甲基化多态性的影响,本文用水培法分别培养来自原产地墨西哥和入侵地西双版纳的飞机草(Chromolaena odorata L.),对两地飞机草进行了高氮(315 mg·L-1)、正... 为探究原产地和入侵地飞机草DNA甲基化多态性的变化和氮营养水平对飞机草DNA甲基化多态性的影响,本文用水培法分别培养来自原产地墨西哥和入侵地西双版纳的飞机草(Chromolaena odorata L.),对两地飞机草进行了高氮(315 mg·L-1)、正常(中)氮(210 mg·L-1)和低氮(105 mg·L-1)3种氮水平处理,采用MSAP(甲基化敏感扩增多态性)技术测定试材的DNA甲基化水平。结果表明,无论是原产地还是入侵地的飞机草,在高氮和低氮处理条件下均发生了DNA甲基化水平和模式的改变;且入侵地飞机草DNA甲基化水平高于原产地飞机草,飞机草DNA甲基化水平都随着氮供应水平的升高而升高。本研究为从表观遗传角度揭示外来植物的入侵机制提供依据。 展开更多

关键词 飞机草 dna甲基化 氮水平 MSAP

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基因组DNA甲基化水平与不明原因早期自然流产的相关性 被引量：10

6

作者 晁远 翁立冬 曾嵘 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第10期1498-1502,共5页

目的探讨基因组DNA甲基化水平与人不明原因早期自然流产的关系并从mRNA表达量上研究DNMT1、DNMT3A和DNMT3B在自然流产绒毛DNA甲基化中的作用。方法收集45例核型正常自然流产绒毛组织及其中33例母亲外周血和44例核型正常人工流产绒毛组... 目的探讨基因组DNA甲基化水平与人不明原因早期自然流产的关系并从mRNA表达量上研究DNMT1、DNMT3A和DNMT3B在自然流产绒毛DNA甲基化中的作用。方法收集45例核型正常自然流产绒毛组织及其中33例母亲外周血和44例核型正常人工流产绒毛组织及其中34例母亲外周血,采用高效液相色谱法(HPLC)测定基因组DNA甲基化水平并用荧光定量PCR法检测其中33例人工流产绒毛和30例自然流产绒毛DNMT mRNA的表达。结果 (1)自然流产绒毛组DNA甲基化水平低于人工流产绒毛组(P<0.01);(2)自然流产母亲组和人工流产母亲组间DNA甲基化水平差异无统计学意义(P>0.05);(3)自然流产绒毛组DNMT1和DNMT3AmRNA的表达低于人工流产绒毛组(P<0.05);(4)自然流产绒毛组DNMT3B mRNA的表达与人工流产绒毛组差异无统计学意义(P>0.05)。结论(1)人类早期自然流产中确实存在着绒毛组织基因组DNA甲基化的不足;(2)自然流产绒毛中DNA甲基化的不足可能与DNMT1和DNMT3A表达降低有关。 展开更多

关键词 基因组dna甲基化水平 自然流产 绒毛组织 外周血 dna甲基转移酶

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基于高通量测序技术检测全基因组DNA甲基化水平的方法 被引量：3

7

作者 马浪浪 梁振娟 +3 位作者 先新 罗仕文 李清超 梁黔云 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第7期45-50,共6页

DNA甲基化的研究最近几年一直是表观遗传学研究的重点。有关DNA甲基化水平检测的方法大体上有十几种,随着第二代测序技术的发展,实现了在全基因组水平上对甲基化状态进行检测。目前,基于第二代高通量测序进行全基因组DNA甲基化水平检测... DNA甲基化的研究最近几年一直是表观遗传学研究的重点。有关DNA甲基化水平检测的方法大体上有十几种,随着第二代测序技术的发展,实现了在全基因组水平上对甲基化状态进行检测。目前,基于第二代高通量测序进行全基因组DNA甲基化水平检测的方法主要有BSP-seq(亚硫酸氢盐修饰结合直接测序法)、Me DIP-seq(甲基化DNA免疫共沉淀测序法)、MBD-seq(甲基化DNA富集结合高通量测序法)。就这3种方法在原理、流程、优缺点、优化使用及后期需要用到的部分生物信息学资源等方面的研究进展作一综述,旨在为研究者在采用高通量测序方法研究DNA甲基化模式时提供一些思路。 展开更多

关键词 高通量测序技术 全基因组 dna甲基化水平 BSP-seq MeDIP-seq MBD-seq

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FTO基因DNA甲基化与乙肝疫苗免疫低/无应答水平的关系

8

作者 李嘉铃 周小婷 +5 位作者 董柏青 陈钦艳 胡莉萍 王超 苏永健 李海 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2022年第4期468-472,共5页

目的通过探讨m6A去甲基化酶FTO基因DNA甲基化与乙肝疫苗免疫低/无应答水平的关联性,为预测个体乙肝疫苗的应答水平、研发新型HepB疫苗提供科学的依据。方法采用非匹配病例对照的研究方法,招募于2014-2016年间至广西南宁市三所三级甲等... 目的通过探讨m6A去甲基化酶FTO基因DNA甲基化与乙肝疫苗免疫低/无应答水平的关联性,为预测个体乙肝疫苗的应答水平、研发新型HepB疫苗提供科学的依据。方法采用非匹配病例对照的研究方法,招募于2014-2016年间至广西南宁市三所三级甲等医院就诊的8~9月龄263例儿童(已完成乙肝免疫接种程序)作为研究对象,根据乙肝表面抗体(HBsAb)水平将抗-HBs浓度<100 mIU/mL作为观察组,抗-HBs浓度≥100 mIU/mL作为对照组。采用Methyl Target技术检测FTO基因位点的DNA甲基化水平,分析FTO基因28个位点CpG岛DNA甲基化水平与乙肝疫苗免疫应答水平的关系。结果FTO基因各基因位点的DNA甲基化水平都比较低;观察组和对照组的DNA甲基化水平在FTO_1基因222位点、FTO_2基因72位点的差异具有统计学意义;观察组FTO_1基因222位点的DNA甲基化水平高于对照组(Z=-2.38,P=0.009)。观察组FTO_2基因72位点的DNA甲基化水平高于对照组(Z=-1.71,P=0.044)。结论提示人体中FTO基因存在发生甲基化的可能,乙肝疫苗接种者低/无免疫应答水平可能受FTO_1基因222位点、FTO_2基因72位点的影响。 展开更多

关键词 FTO dna甲基化 乙肝疫苗 免疫应答水平

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DNA甲基化差异模式识别方法综述

9

作者 赵倩 张雪 +2 位作者 张彦 林正奎 孙野青 《计算机应用研究》 CSCD 北大核心 2021年第5期1281-1286,1293,共7页

目前,微阵列芯片技术和重亚硫酸氢盐测序技术贡献了大量DNA甲基化实验数据,基于不同数据产生了众多识别差异甲基化位点及差异甲基化区域的方法。为了对DNA甲基化差异模式识别方法进行梳理,首先介绍了DNA甲基化研究现状,包括DNA甲基化检... 目前,微阵列芯片技术和重亚硫酸氢盐测序技术贡献了大量DNA甲基化实验数据,基于不同数据产生了众多识别差异甲基化位点及差异甲基化区域的方法。为了对DNA甲基化差异模式识别方法进行梳理,首先介绍了DNA甲基化研究现状,包括DNA甲基化检测方法和数据类型,以及两种DNA甲基化差异模式;接着详细阐述了芯片数据的差异甲基化位点和差异甲基化区域的识别方法,并介绍了基于八种不同算法原理的测序数据的差异甲基化模式识别方法,重点阐述了各种算法的原理、应用场景以及算法的优点和局限性;最后指出了现阶段DNA甲基化差异模式识别存在的问题和未来可能的发展趋势。 展开更多

关键词 dna甲基化 甲基化差异模式 差异甲基化位点 差异甲基化区域 识别

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5-azaC对萝卜茎尖DNA甲基化和开花的影响 被引量：25

10

作者 汪炳良 李水凤 +1 位作者 曾广文 邓俭英 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期265-268,共4页

本文研究了去甲基化因子5氮杂胞苷(5azaC)对萝卜开花及幼苗茎尖DNA甲基化水平的影响。用0(对照)、0.10、0.25、0.50和1.00mmolL5azaC处理‘短叶13’萝卜种子6d,除对照外,茎尖组织DNA甲基化水平均有所降低,并与春化后茎尖组织DNA甲基化... 本文研究了去甲基化因子5氮杂胞苷(5azaC)对萝卜开花及幼苗茎尖DNA甲基化水平的影响。用0(对照)、0.10、0.25、0.50和1.00mmolL5azaC处理‘短叶13’萝卜种子6d,除对照外,茎尖组织DNA甲基化水平均有所降低,并与春化后茎尖组织DNA甲基化水平相当;茎尖组织DNA甲基化水平随着处理浓度的提高而下降。同时,5azaC处理明显促进春性品种萝卜‘短叶13’的开花。结果表明5azaC可以部分代替低温诱导萝卜开花。 展开更多

关键词 萝卜 5-azaC 花芽分化 开花 dna甲基化 茎尖 甲基化水平 萝卜种子 5-氮杂胞苷 去甲基化

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毛白杨MSAP体系优化及DNA甲基化的初步分析 被引量：6

11

作者 马开峰 张志毅 +2 位作者 王斯琪 宋跃朋 张德强 《东北林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第12期1-7,共7页

首次利用MSAP技术开展毛白杨DNA甲基化研究。在优化选择性扩增体系的基础上,对毛白杨亲子代的CCGG位点甲基化相对水平、CCGG位点胞嘧啶甲基化模式的遗传变异进行了初步分析。结果表明:①引物H/M+3、引物E+A+2、dNTP、Taq酶、预扩增产物... 首次利用MSAP技术开展毛白杨DNA甲基化研究。在优化选择性扩增体系的基础上,对毛白杨亲子代的CCGG位点甲基化相对水平、CCGG位点胞嘧啶甲基化模式的遗传变异进行了初步分析。结果表明:①引物H/M+3、引物E+A+2、dNTP、Taq酶、预扩增产物稀释倍数分别为0.03 nmol、0.03 nmol、0.20 mmol/L、1 U(或1.5U)、40倍时组成的20μL反应体系经PCR扩增后电泳,可得到品质最佳的银染谱带。②毛白杨CCGG位点甲基化相对水平约为26.75%～29.39%,CNG甲基化相对水平低于CG甲基化相对水平,子代的甲基化相对水平低于亲本的甲基化相对水平。③子代中发生遗传变异的CCGG位点数之比为1∶1。遗传自亲本的CG甲基化位点数高于遗传自亲本的CNG甲基化位点数,遗传自父本的甲基化位点数高于遗传自母本的甲基化位点数;子代甲基化位点的变异以去甲基化为主,发生CG甲基化变异的位点数与发生CNG甲基化变异的位点数之比为1∶1。 展开更多

关键词 毛白杨 甲基化敏感扩增多态性(MSAP) dna甲基化 相对水平 遗传变异

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通过影响DNA甲基化水平实现蜜蜂生殖的营养调控——蜂王与工蜂级型分化形成的分子机理

12

作者 陈璇 胡福良 《中国蜂业》 2008年第6期54-54,共1页

最近，澳大利亚科学家发现蜜蜂生殖状况的营养调控是通过影响DNA甲基化水平得以实现的，从而首次从分子水平阐释了蜜蜂表观遗传现象的原因。这一研究结果发表在2008年3月28日出版的美国《科学》杂志上。

关键词 甲基化水平 营养调控 生殖状况 dna 分子机理 蜜蜂 分化 工蜂

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DAPK基因甲基化模式在白血病诊断中的价值初步研究 被引量：3

13

作者 叶松山 刘先娟 +2 位作者 毛秉豫 杨雷 邱耕 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第3期687-692,共6页

目的:筛选抑癌基因DAPK特异的甲基化模式并评价其作为白血病诊断分型标志物的价值。方法:通过亚硫酸氢盐测序法(BSP)分析DAPK基因启动子区Cp G岛在正常人外周血白细胞和HL-60、U937及Jurkat白血病细胞株中甲基化的状态及模式,选择特异... 目的:筛选抑癌基因DAPK特异的甲基化模式并评价其作为白血病诊断分型标志物的价值。方法:通过亚硫酸氢盐测序法(BSP)分析DAPK基因启动子区Cp G岛在正常人外周血白细胞和HL-60、U937及Jurkat白血病细胞株中甲基化的状态及模式,选择特异的甲基化位点应用甲基化特异性PCR法(MSP)在白血病细胞株和患者外周血标本中验证DAPK基因异常甲基化模式诊断白血病的效能。结果:DAPK基因Cp G岛不同细胞基因组甲基化模式图谱显示,在正常细胞基因组中去甲基化程度高于白血病细胞株,各白血病细胞株甲基化模式存在差异,能找到特异的Cp G甲基化位点并应用MSP检测区分HL-60与其它3种细胞,而临床标本中MSP检测可区分急性非淋巴细胞白血病(ANLL)与其他类型白血病,其诊断的灵敏度、特异度和准确度分别为59.1%、100%和82.7%,没有发现MSP甲基化诊断与临床病理分型之间的关系。结论:DAPK基因启动子区异常甲基化模式作为白血病诊断分型的潜在肿瘤标志物之一,丰富了白血病诊断的方法,为今后寻找各类肿瘤甲基化标志物提供了思路并奠定了研究基础。 展开更多

关键词 DAPK基因甲基化模式 dna甲基化 白血病

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马氏珠母贝DNA甲基化转移酶Dnmt1的克隆及表达 被引量：1

14

作者 章佳斌 卢晓文 +2 位作者 罗少杰 焦钰 邓岳文 《广东海洋大学学报》 CAS 2019年第5期16-23,共8页

【目的】对马氏珠母贝(Pinctada martensii)DNA 甲基化转移酶1(DNA methyltransferase 1,Dnmt1)的基因全长及组织表达作分析,探究马氏珠母贝甲基转移酶Dnmt1(PmDnmt1)参与贝壳矿化调控机理。【方法】利用RACE 技术获得PmDnmt1 的cDNA ... 【目的】对马氏珠母贝(Pinctada martensii)DNA 甲基化转移酶1(DNA methyltransferase 1,Dnmt1)的基因全长及组织表达作分析,探究马氏珠母贝甲基转移酶Dnmt1(PmDnmt1)参与贝壳矿化调控机理。【方法】利用RACE 技术获得PmDnmt1 的cDNA 序列全长,并对PmDnmt1 的序列特征进行分析,同时利用逆转录-聚合酶链反应RT-PCR 技术检测马氏珠母贝不同组织中PmDnmt1 的表达情况。【结果与结论】PmDnmt1 基因cDNA 长4 818 bp,其中,开放阅读框为4 623 bp,编码1 540 个氨基酸。预测分子质量约为174.55 ku、理论等电点为5.89。结构域分析显示,PmDnmt1 具有DMAP 结合结构域、DNMT1-RFD 结构域、锌指结构、BAH 结构域和C5 胞嘧啶DNA 甲基化酶结构域等。多序列比对结果发现,Dnmt1 在不同物种间具有较高保守性。实时荧光定量PCR 分析显示PmDnmt1 在所有检测组织中均有表达,在外套膜中央膜部分的表达量最高(P<0.05)。PmDnmt1 可通过调控外套膜的DNA 甲基化修饰参与贝壳的形成。 展开更多

关键词 马氏珠母贝 dna甲基化转移酶 基因克隆 表达模式

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湿地松×洪都拉斯加勒比松及亲本DNA胞嘧啶甲基化的初步研究

15

作者 李义良 赵奋成 +7 位作者 钟岁英 林昌明 谭志强 邓乐平 李福明 吴惠姗 郭文冰 廖仿炎 《植物科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第5期716-722,共7页

以湿地松×洪都拉斯加勒比松(Pinus elliottii×P.caribaea var.hondurensis)及亲本为实验材料,采用甲基化敏感扩增多态性技术对其基因组中CCGG位点的甲基化相对水平及遗传变异模式进行了初步分析。结果表明,杂种及亲本CCGG总... 以湿地松×洪都拉斯加勒比松(Pinus elliottii×P.caribaea var.hondurensis)及亲本为实验材料,采用甲基化敏感扩增多态性技术对其基因组中CCGG位点的甲基化相对水平及遗传变异模式进行了初步分析。结果表明,杂种及亲本CCGG总甲基化相对水平介于77.74%~81.75%,CG甲基化相对水平略低于CNG甲基化水平,CG/CNG甲基化相对水平高于亲本。杂种遗传自亲本的CG与CNG甲基化位点数之比接近1∶1,遗传自母本的甲基化位点数与遗传自父本的CCGG甲基化位点数比例为1∶1;杂种产生的全新甲基化与完全去甲基化位点数之比接近7∶1,初步推测大量甲基化变异促进了杂合体的生长发育。 展开更多

关键词 dna甲基化 MSAP分析 甲基化模式 遗传变异

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狼山鸡下丘脑和卵巢组织全基因组DNA甲基化分析

16

作者 薛倩 李国辉 +7 位作者 张会永 殷建玫 周成浩 朱云芬 邢伟杰 苏一军 邹剑敏 韩威 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2021年第2期417-424,共8页

为了获得狼山鸡性腺轴组织基因组DNA甲基化水平和模式等表观遗传信息,试验采用全基因组重亚硫酸盐测序(whole genome bisulfite sequencing,WGBS)技术检测狼山鸡下丘脑和卵巢组织基因组DNA甲基化状态,分析两组织DNA甲基化水平及特异甲... 为了获得狼山鸡性腺轴组织基因组DNA甲基化水平和模式等表观遗传信息,试验采用全基因组重亚硫酸盐测序(whole genome bisulfite sequencing,WGBS)技术检测狼山鸡下丘脑和卵巢组织基因组DNA甲基化状态,分析两组织DNA甲基化水平及特异甲基化模式。结果表明,狼山鸡下丘脑和卵巢基因组整体甲基化水平分别为4.35%和3.48%,差异显著(P<0.05);下丘脑和卵巢中分别检测到6150000和10320000个甲基化胞嘧啶(mC)位点,其中mCG类型位点分别占69.99%和87.88%,下丘脑中非mCG位点占比约为卵巢中的2.5倍;与各染色体不同,两组织线粒体基因组中mCHH位点占比最高,其次是mCHG位点;卵巢基因组启动子区DNA甲基化水平极显著低于内含子和外显子区(P<0.01),极显著高于基因间区(P<0.01);下丘脑基因组启动子区DNA甲基化水平与内含子和外显子区相比差异不显著(P>0.05),却显著高于基因间区(P<0.05);下丘脑基因组各功能元件DNA甲基化水平均显著或极显著高于卵巢基因组(P<0.05;P<0.01)。综上,狼山鸡下丘脑和卵巢组织具有不同的DNA甲基化模式和特征,下丘脑中较高的非mCG位点比例可能在中枢神经系统发育中发挥重要作用,本研究结果为进一步分析鸡卵巢和下丘脑基因组DNA甲基化对其繁殖性能调控机制提供参考依据。 展开更多

关键词 狼山鸡 dna甲基化 甲基化模式 卵巢 下丘脑

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Bam HI DNA甲基化酶酶学性质的研究 被引量：1

17

作者 薛继艳 何忠效 《生物化学杂志》 CSCD 1991年第1期13-20,共8页

以Lineweave-Burk plot双倒数作图法测得该酶对底物S-腺苷酰甲硫氨酸(SAM)的K_m=7.69×10^(-6)mol/L,在1mmol/LS-腺苷酰高半胱氨酸(SAH)存在下,Ki=7.33×10^(-4)mol/L,两条直线相交于纵轴,证明SAH是该酶的竞争性抑制剂。该酶最... 以Lineweave-Burk plot双倒数作图法测得该酶对底物S-腺苷酰甲硫氨酸(SAM)的K_m=7.69×10^(-6)mol/L,在1mmol/LS-腺苷酰高半胱氨酸(SAH)存在下,Ki=7.33×10^(-4)mol/L,两条直线相交于纵轴,证明SAH是该酶的竞争性抑制剂。该酶最适pH为7.8,对热不稳定。同时还测定了该酶对不同DNA底物的专一性及盐浓度、代谢相关物’两价阳离子、某些酸根等对该酶调节性质的影响。以碘代乙酰胺修饰该酶的SH基’及用二硫苏糖醇(DTT)和巯基乙醇(MSH)保护该酶SH基所作的实验表明SH基是该酶活性中心所必需的,用高效液相色谱(HPLC)法证明该酶所甲基化的碱基为刘氏小球菌(M·L、DNA)分子中的胞嘧啶,且求得甲基化30min后所得甲基化水平为2.39％。同时也证明当用该酶将λDNA甲基化后,可使BamHI限制性核酸内切酶对甲基化后的λDNA丧失切割作用。 展开更多

关键词 米氏常数 抑制剂常数 限制一修饰系统 dna甲基化水平

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妊娠期糖尿病患者基因DNA甲基化的研究进展 被引量：4

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作者 吴丹 葛莉萍 《上海交通大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2021年第8期1120-1124,共5页

妊娠期糖尿病是指患者妊娠前糖代谢正常、妊娠期出现的糖耐量异常,表现为机体脂肪、肌肉等组织对胰岛素的敏感性降低,血糖水平异常,严重影响母体及子代健康。妊娠期糖尿病患者在产后及其子代罹患2型糖尿病及其他代谢性疾病的风险明显增... 妊娠期糖尿病是指患者妊娠前糖代谢正常、妊娠期出现的糖耐量异常,表现为机体脂肪、肌肉等组织对胰岛素的敏感性降低,血糖水平异常,严重影响母体及子代健康。妊娠期糖尿病患者在产后及其子代罹患2型糖尿病及其他代谢性疾病的风险明显增加。研究发现,表观遗传修饰如DNA甲基化参与妊娠期糖尿病的发生及母胎并发症的发生过程。在妊娠期糖尿病患者多种临床标本如胎盘、脐血、外周血与脂肪等组织中,发现多个基因的甲基化水平改变,并可通过“胎儿编程”的方式影响子代终生。该文对妊娠期糖尿病相关基因的DNA甲基化研究进展进行综述。 展开更多

关键词 妊娠期糖尿病 表观遗传修饰 dna甲基化 胎儿编程 代谢模式

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CpG甲基化与癌变原理研究 被引量：4

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作者 邓大君 《中国肺癌杂志》 CAS 2005年第3期239-242,共4页

关键词 CpG甲基化 原理研究 癌变 低甲基化 CpG位点 基因组水平 终致癌物 肿瘤细胞 高甲基化 CPG岛 形成机制 dna

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甲基化修饰与神经病理性疼痛 被引量：1

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作者 毛元元 李治松 张卫 《临床麻醉学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期88-91,共4页

神经病理性疼痛是一种由躯体感觉神经系统病变或疾病造成的疼痛,其病因多变,症状复杂,治疗效果不理想,这与其机制的复杂性有关。研究表明表观遗传调控参与神经病理性疼痛发生发展的过程[1]。甲基化修饰作为表观遗传学的重要组成部分,在... 神经病理性疼痛是一种由躯体感觉神经系统病变或疾病造成的疼痛,其病因多变,症状复杂,治疗效果不理想,这与其机制的复杂性有关。研究表明表观遗传调控参与神经病理性疼痛发生发展的过程[1]。甲基化修饰作为表观遗传学的重要组成部分,在神经病理性疼痛中发挥重要作用。本文就有关甲基化修饰在神经病理性疼痛中发挥作用的相关研究作一综述。甲基化的概念甲基化是指在底物中添加甲基集团的反应。 展开更多

关键词 神经病理性疼痛 甲基化修饰 表观遗传学 加甲基 甲基化水平 脊髓背角 组蛋白 神经损伤 dna 躯体感觉

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