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通过像素值准确分析聚丙烯酰胺凝胶电泳DNA片段大小的方法
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作者 张波 刘林 +4 位作者 兰茗清 杨静 查友贵 赵婧 李成云 《云南农业大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2013年第5期741-744,共4页
利用聚丙烯酰胺凝胶电泳对PCR产物进行分离是一项基础性的、常用实验技术，但根据DNA在聚丙烯酰胺凝胶电泳上距离读出目的DNA片段大小的方法尚未见报道。本文首次探讨了DNA聚丙烯酰胺凝胶电泳条带的像素与其条带之间大小的关系，使用SPS... 利用聚丙烯酰胺凝胶电泳对PCR产物进行分离是一项基础性的、常用实验技术，但根据DNA在聚丙烯酰胺凝胶电泳上距离读出目的DNA片段大小的方法尚未见报道。本文首次探讨了DNA聚丙烯酰胺凝胶电泳条带的像素与其条带之间大小的关系，使用SPSS对条带对应的像素值和对应的条带大小进行了线性函数、二次多项式、复合函数、增长函数、对数函数、三次多项式、S型曲线、指数函数、倒数（反比例）函数、幂函数和logistic函数11种函数的拟合分析，结果表明：条带对应的像素值与其对应条带的大小相关系数均达0．950以上的函数主要有复合函数、增长函数、三次多项式、指数函数、倒数函数、幂函数和logistic函数，其中相关性最好的是logistic函数，其相关系数为0．998；而且，通过logistic函数算出的7条目标条带的测算值与实际DNA片段的值最接近，各片段大小的测算值与实际片段大小仅相差5—17bp。以上结果表明，logis．tic函数能够较准确的放映出经聚丙烯酰胺凝胶电泳后DNA的像素值与其片段大小之间的关系。这将有利于开发出电泳后直接读取DNA片段大小的软件。 展开更多
关键词 聚丙烯酰胺凝胶电泳 dna片段大小 像素 logistic函数
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