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DNA损伤修复基因以及TS、β-tubulinⅢ在骨肉瘤中的表达及其与临床病理的关系 被引量:1
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作者 蒋平 关伟 +4 位作者 戴楠 仲召阳 毛承毅 顾咸庆 王东 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第1期61-65,共5页
目的探讨人骨肉瘤组织中DNA损伤修复基因以及TS、β-tubulinⅢ多个化疗反应相关标志物的表达谱特点,及其与临床病理的关系。方法选取50例诊断明确的骨肉瘤患者组织蜡块,运用组织芯片和免疫组化技术检测OGG1、BRCA1、RRM1、XRCC1、APE1、... 目的探讨人骨肉瘤组织中DNA损伤修复基因以及TS、β-tubulinⅢ多个化疗反应相关标志物的表达谱特点,及其与临床病理的关系。方法选取50例诊断明确的骨肉瘤患者组织蜡块,运用组织芯片和免疫组化技术检测OGG1、BRCA1、RRM1、XRCC1、APE1、ERCC1以及TS、β-tubulinⅢ8种基因在骨肉瘤组织中的表达情况。结果①OGG1、BRCA1、RRM1、XRCC1、APE1、ERCC1在骨肉瘤组织中呈阳性表达,阳性率分别为96%、94%、94%、84%、84%、74%,强阳性率为64%、76%、54%、72%、48%、2%,而TS仅有6例有弱阳性表达,β-tubulinⅢ无阳性表达。②阳性表达的基因中,仅APE1表达与骨肉瘤的组织病理类型具有相关性(P<0.05)。③等级相关分析,APE1和RRM1、APE1和OGG1、OGG1和BRCA1表达呈正相关(r=0.342、0.318、0.319,P<0.05),BRCA1和ERCC1表达呈负相关(r=-0.324,P<0.05);APE1和XRCC1、RRM1和XRCC1的表达也呈正相关(r=0.406、0.677,P<0.01)。结论骨肉瘤组织中存在多种DNA损伤修复相关基因的表达,其中部分基因的表达强弱之间具有相关性,APE1的表达强弱与肺癌病理类型有关。 展开更多
关键词 骨肉瘤 dna损伤修复基因 组织芯片 免疫组织化学
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国人卵巢癌DNA损伤修复基因突变图谱分析
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作者 叶英楠 王珂 +4 位作者 董莉 程亚楠 韩雷 张蕊 于津浦 《中国肿瘤临床》 CAS CSCD 北大核心 2022年第23期1207-1214,共8页
目的:同源重组修复(homologous recombination repair,HRR)基因BRCA1/2在卵巢癌的发生发展中起到了重要作用,相关研究比较深入,而对于其他DNA损伤修复(DNA-damage repair,DDR)基因突变在中国卵巢癌人群中的分布及其与患者临床特征之间... 目的:同源重组修复(homologous recombination repair,HRR)基因BRCA1/2在卵巢癌的发生发展中起到了重要作用,相关研究比较深入,而对于其他DNA损伤修复(DNA-damage repair,DDR)基因突变在中国卵巢癌人群中的分布及其与患者临床特征之间的关系仍缺乏详细的探讨。方法:本研究纳入2019年6月至2020年6月在天津医科大学肿瘤医院接受手术治疗的卵巢癌患者122例,收集其外周血样本和67例对应肿瘤组织标本,利用二代测序技术检测19个DDR基因的变异情况、分布特点和临床病理相关性。结果:胚系DDR基因突变主要集中在HRR基因,占80.37%,致病性和可能致病性突变全部集中在HRR基因。携带胚系HRR(germline HRR,gHRR)突变的患者较BRCA突变的更多(31.15%vs.23.77%),且呈现家族聚集现象,病理类型以浆液性腺癌为主,并与铂类药物敏感性相关。肿瘤组织层面DDR基因突变中HRR基因突变率仅次于TP53,占39.39%。检出肿瘤组织HRR(tumor HRR,tHRR)突变的患者较gHRR突变的患者多5.97%。tHRR突变患者对铂类药物治疗敏感,且复发风险更低。结论:揭示中国卵巢癌DDR基因突变特征,提示基于二代测序的DDR多基因检测可指导卵巢癌患者的精准诊疗。 展开更多
关键词 卵巢癌 dna损伤修复基因 二代测序 基因检测
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干旱胁迫棉花转录组DNA损伤修复相关基因的分析
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作者 包秋娟 张丽丽 +1 位作者 海那尔.乌拉孜巴依 张富春 《新疆农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2017年第11期1999-2005,共7页
【目的】研究干旱胁迫下,棉花DNA损伤修复基因的表达情况,从整体水平探讨棉花DNA损伤修复相关基因表达与抗旱的相关性。【方法】用2.5%PEG6000处理棉花幼苗,利用RNA-Seq技术对干旱胁迫下棉花幼苗的转录组进行测序。【结果】从棉花干旱... 【目的】研究干旱胁迫下,棉花DNA损伤修复基因的表达情况,从整体水平探讨棉花DNA损伤修复相关基因表达与抗旱的相关性。【方法】用2.5%PEG6000处理棉花幼苗,利用RNA-Seq技术对干旱胁迫下棉花幼苗的转录组进行测序。【结果】从棉花干旱胁迫响应的转录组中,筛选获得差异表达的DNA损伤修复相关基因共51个,其中差异表达的上调基因23个,差异表达的下调基因28个,干旱胁迫能够影响棉花DNA损伤修复相关基因的表达。选取4个差异基因进行生物信息学分析及qRT-PCR验证,HMGB1、rec A1、UDGs和GMP synthase基因的表达变幅有一定的差异,但基因的表达趋势一致,棉花转录组测序结果通过qRTPCR验证是可靠的。【结论】DNA损伤修复相关基因可能与干旱胁迫有一定的相关性,干旱胁迫能够影响棉花DNA损伤修复相关基因的表达。 展开更多
关键词 棉花 干旱胁迫 转录组测序 dna损伤修复相关基因 差异表达
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855例前列腺癌患者错配修复基因胚系突变临床研究 被引量:1
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作者 方邦伟 韦煜 +3 位作者 潘剑 张挺维 叶定伟 朱耀 《浙江大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期133-138,共6页
目的:了解前列腺癌患者错配修复(MMR)基因胚系致病性突变携带情况及MMR基因突变患者的临床病理特征。方法:回顾性分析复旦大学附属肿瘤医院2018至2022年收治的855例前列腺癌患者的胚系基因测序数据,根据美国医学遗传学与基因组学学会遗... 目的:了解前列腺癌患者错配修复(MMR)基因胚系致病性突变携带情况及MMR基因突变患者的临床病理特征。方法:回顾性分析复旦大学附属肿瘤医院2018至2022年收治的855例前列腺癌患者的胚系基因测序数据,根据美国医学遗传学与基因组学学会遗传突变分类标准指南、Clinvar数据库和Intervar数据库评估突变的致病性。比较MMR基因突变患者(MMR^(+)组)、携带除外MMR基因的DNA损伤修复(DDR)基因胚系致病性突变患者(DDR^(+)MMR^(-)组)、未携带DDR基因胚系致病性突变患者(DDR^(-)组)的临床病理特征及对去势治疗的反应。结果:855例前列腺癌患者中,13例(1.52%)患者纳入MMR^(+)组,其中MLH1基因突变1例,MSH2基因突变6例,MSH6基因突变4例,PMS2基因突变2例;105例(11.9%)患者纳入DDR^(+)MMR^(-)组;737例(86.2%)患者纳入DDR^(-)组。与DDR^(-)组比较,MMR^(+)组患者初诊年龄小(P<0.05)、前列腺特异性抗原(PSA)水平低(P<0.01),而在格里森评分和TMN分期方面未发现明显的差异(均P>0.05)。MMR^(+)组、DDR^(+)MMR^(-)组和DDR^(-)组进展至去势抵抗阶段的用时中位数分别为8个月(95%CI:6个月~无法估计)、16个月(95%CI:12~32个月)、24个月(95%CI:21~27个月),其中MMR^(+)组达到去势抵抗状态的时间较DDR^(+)MMR^(-)组和DDR^(-)组明显缩短(均P<0.01),而DDR^(+)MMR^(-)组与DDR^(-)组之间差异无统计学意义(P>0.05)。结论:对早发、初诊PSA水平低却伴转移或去势治疗早期耐药的前列腺癌患者推荐进行MMR基因突变检测,以便为后续治疗选择提供参考。 展开更多
关键词 前列腺癌 错配修复基因 dna损伤修复基因 胚系突变 前列腺特异性抗原
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通用转录因子2I在胶质母细胞瘤替莫唑胺化疗抵抗中的作用
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作者 周建国 姜红建 +5 位作者 朱其辉 张耿强 邓琪琳 齐玲 李凯舒 于洪泉 《吉林大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期457-464,共8页
目的:探讨通用转录因子2I(GTF2I)在胶质母细胞瘤(GBM)替莫唑胺化疗抵抗中的作用,并阐明其作用机制。方法:基于转录因子预测网站(PROMO网站),生物信息学分析GBM组织中甲基转移酶1(DNMT1)、损伤特异性DNA结合蛋白1(DDB1)、染色盒同源物5(C... 目的:探讨通用转录因子2I(GTF2I)在胶质母细胞瘤(GBM)替莫唑胺化疗抵抗中的作用,并阐明其作用机制。方法:基于转录因子预测网站(PROMO网站),生物信息学分析GBM组织中甲基转移酶1(DNMT1)、损伤特异性DNA结合蛋白1(DDB1)、染色盒同源物5(CBX5)和着色性干皮病基因组C(XPC)的共同转录因子,并基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库进行DDB1、CBX5、XPC和DNMT1与GTF2I和甲基鸟嘌呤甲基转移酶(MGMT)的相关性分析及生存分析。分别用小干扰序列(siRNA)转染并沉默人脑多形性成胶质细胞瘤T98细胞和人脑胶质瘤LN229细胞中MGMT及GTF2I的基因表达,采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)法检测上述基因的mRNA表达水平。沉默GTF2I基因后,平板克隆形成实验检测肿瘤细胞的集落形成能力,CCK-8法检测细胞对替莫唑胺的敏感性。结果:生物信息学分析,GBM组织中DDB1、CBX5、XPC和DNMT1表达水平与GTF2I表达水平呈显著正相关关系(P<0.05),与MGMT表达水平呈负相关关系(P<0.05);GTF2I表达水平与MGMT表达水平呈显著负相关关系(P<0.05)。剔除未接受替莫唑胺治疗的GBM患者的生存分析,GTF2I高表达的患者总体生存时间降低。沉默MGMT基因后,人脑胶质瘤T98细胞中GTF2I、DDB1、CBX5和XPC mRNA表达水平升高(P<0.001);沉默GTF2I基因后,人脑胶质瘤LN229细胞中MGMT mRNA表达水平升高(P<0.05),而DDB1、CBX5、XPC和DNMT1 mRNA表达水平明显降低(P<0.05或P<0.001)。平板克隆形成实验,沉默GTF2I基因前后,细胞集落形成能力比较差异无统计学意义(P=0.138);CCK-8法检测,与对照组比较,观察组细胞活力明显降低(P<0.05)。结论:转录因子GTF2I可以调控MGMT、DDB1、CBX5和XPC等关键DNA损伤修复蛋白的mRNA表达,参与GBM细胞替莫唑胺化疗抵抗,可能是GBM潜在的治疗新靶点。 展开更多
关键词 胶质母细胞瘤 替莫唑胺抵抗 通用转录因子2I 甲基鸟嘌呤甲基转移酶 关键dna损伤修复基因
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顺铂和紫杉醇对CIK细胞杀伤食管癌细胞活性的影响及其分子机制研究 被引量:19
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作者 梅家转 徐虹 +1 位作者 刘桂举 赵继智 《中国肿瘤临床》 CAS CSCD 北大核心 2015年第12期608-613,共6页
目的:研究紫杉醇、顺铂对人食管癌EC9706细胞NKG2D配体表达及CIK细胞杀伤活性的影响,探讨相关分子机制。方法:MTT法测定紫杉醇、顺铂对EC9706细胞的24 h半数抑制浓度(IC50)。流式细胞仪检测1/2 IC50浓度紫杉醇、顺铂作用前、后EC9706细... 目的:研究紫杉醇、顺铂对人食管癌EC9706细胞NKG2D配体表达及CIK细胞杀伤活性的影响,探讨相关分子机制。方法:MTT法测定紫杉醇、顺铂对EC9706细胞的24 h半数抑制浓度(IC50)。流式细胞仪检测1/2 IC50浓度紫杉醇、顺铂作用前、后EC9706细胞NKG2D配体的表达。乳酸脱氢酶释放法检测效靶比20:1、30:1时,CIK细胞对1/2 IC50浓度紫杉醇、顺铂作用前、后EC9706细胞的杀伤活性。荧光定量PCR法检测1/2 IC50浓度紫杉醇、顺铂作用EC9706细胞24 h前、后DNA损伤修复基因(ATM、ATR、CHK1、CHK2、P53)表达的变化。结果:紫杉醇、顺铂的24 h半数抑制浓度分别为10、5μg/m L。1/2 IC50浓度紫杉醇作用24 h后,EC9706细胞MICB、ULBP2、ULBP3表达均明显增强(P<0.05),MICA、ULBP1表达无显著性变化(P>0.05);1/2 IC50浓度顺铂作用24 h后,EC9706细胞MICA、MICB、ULBP2、ULBP3表达均明显增强(P<0.05),ULBP1表达无显著性变化(P>0.05)。效靶比20:1、30:1时,CIK细胞对1/2 IC50浓度紫杉醇、顺铂作用后的EC9706细胞的杀伤活性均明显增强(P<0.05)。1/2 IC50浓度紫杉醇作用24 h后,DNA损伤修复基因表达均无显著性变化(P>0.05);1/2 IC50浓度顺铂作用24 h后,ATM、ATR、CHK1、CHK2基因表达均明显增加(P<0.05),P53基因表达无显著性变化(P>0.05)。结论:顺铂、紫杉醇均可增强CIK细胞的杀伤活性,其分子机制可能与激活DNA损伤修复基因,进而增加NKG2D配体表达有关。 展开更多
关键词 食管癌 紫杉醇 顺铂 细胞因子诱导的杀伤细胞 NKG2D配体 dna损伤修复基因
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斑蝥酸钠诱导RTP801表达促进结肠癌细胞HCT116凋亡 被引量:7
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作者 张霞 关洪全 《中国医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第3期222-226,共5页
目的探讨斑蝥酸钠注射液对结肠癌细胞凋亡的影响作用及分子机制。方法通过异硫氰酸荧光素(FITC)-右旋糖酐渗透实验观察终浓度为0.1、0.25、0.5、1、2μg/m L斑蝥酸钠注射液处理24 h后对HCT116细胞凋亡的影响;分别用real-time PCR和Weste... 目的探讨斑蝥酸钠注射液对结肠癌细胞凋亡的影响作用及分子机制。方法通过异硫氰酸荧光素(FITC)-右旋糖酐渗透实验观察终浓度为0.1、0.25、0.5、1、2μg/m L斑蝥酸钠注射液处理24 h后对HCT116细胞凋亡的影响;分别用real-time PCR和Western blot方法检测终浓度为0.1、0.25、0.5、1、2μg/m L斑蝥酸钠注射液处理24 h后对促凋亡基因DNA损伤修复基因(RTP801)表达的影响;运用低氧诱导因子1α(HIF-1α)质粒和HIF-1α-si RNA转染检测HIF-1α信号通路对RTP801的影响。结果斑蝥酸钠注射液诱导单层细胞渗透性增加,FITC-右旋糖酐渗透率增高。细胞受斑蝥酸钠注射液刺激后,RTP801的m RNA和蛋白水平上调,且都呈浓度依赖性。HIF-1α质粒转染后,RTP801蛋白表达增加;加入HIF-1α-si RNA,斑蝥酸钠注射液对RTP801的上调作用降低,且FITC-右旋糖酐渗透率下降。结论斑蝥酸钠通过HIF-1α途径增加RTP801的表达,诱导结肠癌细胞HCT116凋亡。 展开更多
关键词 斑蝥酸钠 结肠癌 低氧诱导因子1Α dna损伤修复基因 凋亡
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顺铂和紫杉醇对CIK细胞杀伤肺癌A549细胞的影响及其可能的机制 被引量:2
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作者 徐虹 梅家转 《中国肿瘤生物治疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第4期443-447,共5页
目的:研究顺铂、紫杉醇分别对CIK细胞杀伤肺癌A549细胞的影响并初步探讨其可能的分子机制。方法:MTT法分别检测顺铂、紫杉醇处理A549细胞24 h的半数抑制浓度(IC50),LDH释放法检测IC50的顺铂,紫杉醇分别作用24 h对CIK细胞杀伤A549细胞能... 目的:研究顺铂、紫杉醇分别对CIK细胞杀伤肺癌A549细胞的影响并初步探讨其可能的分子机制。方法:MTT法分别检测顺铂、紫杉醇处理A549细胞24 h的半数抑制浓度(IC50),LDH释放法检测IC50的顺铂,紫杉醇分别作用24 h对CIK细胞杀伤A549细胞能力的影响;流式细胞术检测顺铂、紫杉醇作用24 h对A549细胞表面NKG2D配体(MICA、MICB、ULBP1、ULBP2、ULBP3)表达的影响,荧光定量PCR检测顺铂、紫杉醇作用对A549细胞内DNA损伤修复基因(ATM、ATR、CHK1、CHK2、P53)表达的影响。结果:顺铂和紫衫醇对A549细胞作用24 h的IC50分别为70、39μg/ml。IC50的顺铂、紫杉醇分别作用24 h后,CIK细胞对A549细胞的杀伤活性均明显增强(P<0.05);同时A549细胞表面MICA、MICB、ULBP2、ULBP3表达均明显增加(P<0.05),ULBP1表达降低(P<0.05);顺铂诱导A549细胞ATM基因表达明显增加[(3.23±1.62)×10-6vs(5.49±3.91)×10-8,P<0.05],紫杉醇诱导A549细胞P53基因表达明显增加[(14.90±5.49)×10-6vs(3.68±2.82)×10-6,P<0.05]。结论:顺铂、紫杉醇均可增强CIK细胞对A549细胞的杀伤活性,其分子机制可能与激活DNA损伤修复基因,进而增加NKG2D配体表达有关。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 顺铂 紫杉醇 CIK细胞 NKG2D配体 dna损伤修复基因
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“镜面人”保留左结肠动脉腹腔镜低位直肠癌根治术1例 被引量:1
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作者 陈江 肖天保 +2 位作者 王子卫 杨桃 何峰 《重庆医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第7期853-856,共4页
“镜面人”是指胸、腹腔内所有内脏器官的完全性反位,其解剖位置与正常人完全相反,像镜子中的影像一样。这是一种极为罕见的先天性疾病。国外文献报道,“镜面人”发病率为1/(4000~8000)[1]。有肠癌和内脏转位的患者更是罕见,反位结直肠... “镜面人”是指胸、腹腔内所有内脏器官的完全性反位,其解剖位置与正常人完全相反,像镜子中的影像一样。这是一种极为罕见的先天性疾病。国外文献报道,“镜面人”发病率为1/(4000~8000)[1]。有肠癌和内脏转位的患者更是罕见,反位结直肠癌(situs inversus colorectal cancer,SCRC)中最常见的突变基因为APC、TP53、CHEK2、MDC1、GNAQ、KRAS和SMAD4,并且DNA损伤修复基因突变的发生率很高[2]。2017年韩国Hong SK等[3]报道了1例镜面人行腹腔镜右半肝切除术,但国内相关报道极少。 展开更多
关键词 dna损伤修复基因 内脏转位 先天性疾病 镜面人 TP53 结直肠癌 反位 完全性
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