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DNA微阵列数据判别的旋转森林方法 被引量:4
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作者 陈金瓯 柳青 《中国卫生统计》 CSCD 北大核心 2012年第4期525-528,534,共5页
目的探讨旋转森林算法在DNA微阵列数据分类中的应用。方法通过对四个经典基因表达数据的分析考察旋转森林的分类效果,并与其他分类器进行比较,进一步调整算法参数并研究其对分类效果产生的影响。结果旋转森林对基因表达数据有较高且稳... 目的探讨旋转森林算法在DNA微阵列数据分类中的应用。方法通过对四个经典基因表达数据的分析考察旋转森林的分类效果,并与其他分类器进行比较,进一步调整算法参数并研究其对分类效果产生的影响。结果旋转森林对基因表达数据有较高且稳定的分类准确性,除了线性变换方式和集成规模对分类性能影响较大,分类效果不随算法其他几个主要参数变化。结论旋转森林在基因表达谱数据分类中有较好的判别结果。 展开更多
关键词 旋转森林 dna微阵列数据 集成分类系统
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基于肿瘤基因表达谱的基因功能模块识别
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作者 阮晓钢 王金莲 《北京工业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第4期366-371,共6页
为了揭示肿瘤发生发展的分子机制,结合基因功能分类体系数据库(gene ontology,简称GO),采用网络分解算法对结肠癌基因表达谱数据进行了研究.研究结果表明,与结肠正常组织基因模块相比,结肠癌基因模块与细胞周期调节、抗细胞程序性死亡... 为了揭示肿瘤发生发展的分子机制,结合基因功能分类体系数据库(gene ontology,简称GO),采用网络分解算法对结肠癌基因表达谱数据进行了研究.研究结果表明,与结肠正常组织基因模块相比,结肠癌基因模块与细胞周期调节、抗细胞程序性死亡、信号转导、细胞增殖等功能类相关,由此推论结肠癌基因功能模块结构的改变导致了结肠癌的发生. 展开更多
关键词 dna微阵列数据 肿瘤 基因功能模块 结肠癌
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基于ReliefF和蚁群算法的特征基因选择方法 被引量:11
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作者 吴辰文 李晨阳 +1 位作者 郭叔瑾 闫光辉 《计算机应用研究》 CSCD 北大核心 2018年第9期2610-2613,共4页
针对高维小样本的DNA微阵列数据多分类问题,提出一种基于ReliefF和蚁群算法的特征基因选择方法(ReliefF and ant colony optimization,Re FACO)。该方法首先采用ReliefF算法评估特征权重,根据阈值筛选出无关基因;然后引入改进的蚁群算法... 针对高维小样本的DNA微阵列数据多分类问题,提出一种基于ReliefF和蚁群算法的特征基因选择方法(ReliefF and ant colony optimization,Re FACO)。该方法首先采用ReliefF算法评估特征权重,根据阈值筛选出无关基因;然后引入改进的蚁群算法,在迭代改进的过程中寻找最优基因子集;最后利用经典分类算法对维数约简后的数据分类识别。经实验证明,该方法可有效地剔除无关和冗余基因,并利用较少特征基因达到较高多分类效果。 展开更多
关键词 dna微阵列数据 RELIEFF算法 蚁群算法 特征选择
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