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磁珠法半自动提取全血基因组DNA条件的优化
被引量:
14
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作者
凌洁
王昊
+3 位作者
张帅
张丹丹
来茂德
朱益民
《浙江大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第3期320-326,共7页
目的:探讨磁珠法提取基因组DNA的影响因素,建立快速、高效、批量提取全血基因组DNA的优化方案。方法:使用磁珠法核酸自动提取系统从全血中提取基因组DNA,紫外分光光度计测定DNA浓度和纯度。采用正交试验设计分析裂解时间、全血量、磁珠...
目的:探讨磁珠法提取基因组DNA的影响因素,建立快速、高效、批量提取全血基因组DNA的优化方案。方法:使用磁珠法核酸自动提取系统从全血中提取基因组DNA,紫外分光光度计测定DNA浓度和纯度。采用正交试验设计分析裂解时间、全血量、磁珠量和乙醇浓度4个因素的主效应和全血量与裂解时间、磁珠量,裂解时间与磁珠量的二阶交互作用对所提取DNA浓度和纯度的影响。结果:裂解时间、全血量、磁珠量和乙醇浓度4个主效应对DNA浓度的影响均存在统计学差异(P<0.05),当裂解时间为15 min,全血量为100μl,磁珠量为80μl,乙醇浓度为80%时,DNA平均浓度最高。磁珠量、裂解时间和全血量的交互作用对DNA OD260/OD280的比值有影响(P=0.008和P=0.013)。当磁珠量为40μl,裂解时间为15 min,全血量为100μl时,OD260/OD280的比值较好。磁珠量和乙醇浓度影响DNA OD260/OD230的比值(P=0.017和P<0.05),磁珠量为40μl,乙醇浓度为80%时,OD260/OD230的比值更好。结论:当DNA得率优先考虑时,可以选择裂解时间15 min、全血量100μl、磁珠量80μl、乙醇浓度80%的提取条件;而对DNA纯度要求较高时,可以将磁珠量改为40μl,以获得最优DNA提取效果。
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关键词
自动化
磁石
dna/分离和提纯
血液
基因组文库
正交试验
乙醇
细胞
培养的
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职称材料
题名
磁珠法半自动提取全血基因组DNA条件的优化
被引量:
14
1
作者
凌洁
王昊
张帅
张丹丹
来茂德
朱益民
机构
浙江大学医学院流行病与卫生统计学系
浙江大学医学院病理学与病理生理学系
出处
《浙江大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第3期320-326,共7页
基金
国家科技支撑项目(2009BAI80B02)
中央高校基本科研业务费专项资金(2010QNA7022)
文摘
目的:探讨磁珠法提取基因组DNA的影响因素,建立快速、高效、批量提取全血基因组DNA的优化方案。方法:使用磁珠法核酸自动提取系统从全血中提取基因组DNA,紫外分光光度计测定DNA浓度和纯度。采用正交试验设计分析裂解时间、全血量、磁珠量和乙醇浓度4个因素的主效应和全血量与裂解时间、磁珠量,裂解时间与磁珠量的二阶交互作用对所提取DNA浓度和纯度的影响。结果:裂解时间、全血量、磁珠量和乙醇浓度4个主效应对DNA浓度的影响均存在统计学差异(P<0.05),当裂解时间为15 min,全血量为100μl,磁珠量为80μl,乙醇浓度为80%时,DNA平均浓度最高。磁珠量、裂解时间和全血量的交互作用对DNA OD260/OD280的比值有影响(P=0.008和P=0.013)。当磁珠量为40μl,裂解时间为15 min,全血量为100μl时,OD260/OD280的比值较好。磁珠量和乙醇浓度影响DNA OD260/OD230的比值(P=0.017和P<0.05),磁珠量为40μl,乙醇浓度为80%时,OD260/OD230的比值更好。结论:当DNA得率优先考虑时,可以选择裂解时间15 min、全血量100μl、磁珠量80μl、乙醇浓度80%的提取条件;而对DNA纯度要求较高时,可以将磁珠量改为40μl,以获得最优DNA提取效果。
关键词
自动化
磁石
dna/分离和提纯
血液
基因组文库
正交试验
乙醇
细胞
培养的
Keywords
Automation
MAGNETITUM
dna/
isolation & purification
Blood
Genomic library
ORTHOGONAL TEST
Ethanol
Cells,cultured
分类号
R440 [医药卫生—诊断学]
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1
磁珠法半自动提取全血基因组DNA条件的优化
凌洁
王昊
张帅
张丹丹
来茂德
朱益民
《浙江大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2012
14
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